More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0968 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0968  amidohydrolase family protein  100 
 
 		 383 aa  788    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1459  amidohydrolase  79.9 
 
 		 383 aa  649    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1488  amidohydrolase  79.9 
 
 		 383 aa  649    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0910625  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0472  putative hippurate carboxypeptidase, M20D- type  35.37 
 
 		 423 aa  222  8e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0745924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3484  amidohydrolase  34.88 
 
 		 398 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00282847  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2073  amidohydrolase  32.54 
 
 		 393 aa  213  3.9999999999999995e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2319  amidohydrolase  34.96 
 
 		 386 aa  211  2e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00292059  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2687  amidohydrolase  34.28 
 
 		 397 aa  206  8e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.453314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3007  peptidase M20D, amidohydrolase  32.63 
 
 		 397 aa  205  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1096  hypothetical protein  35.71 
 
 		 400 aa  204  3e-51  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.081293 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3841  amidohydrolase  35.25 
 
 		 397 aa  204  3e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.677455 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0770  amidohydrolase  32.58 
 
 		 403 aa  203  4e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.824493 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0528  amidohydrolase  34.79 
 
 		 390 aa  202  5e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3092  hippurate hydrolase  34.29 
 
 		 397 aa  202  6e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3113  amidohydrolase  32.37 
 
 		 396 aa  202  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2748  amidohydrolase  32.11 
 
 		 396 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2111  peptidase M20D, amidohydrolase  32.55 
 
 		 398 aa  200  3.9999999999999996e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.959227  normal  0.0805645 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3456  amidohydrolase  31.35 
 
 		 388 aa  199  6e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1222  amidohydrolase  32.9 
 
 		 393 aa  199  6e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00115214  normal  0.142567 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1030  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  33.24 
 
 		 379 aa  199  7e-50  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0444  amidohydrolase  32.65 
 
 		 401 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.186163  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0453  amidohydrolase  32.65 
 
 		 401 aa  198  2.0000000000000003e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.719857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4957  amidohydrolase  34.35 
 
 		 395 aa  198  2.0000000000000003e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00657786 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1544  thermostable carboxypeptidase 1  36.18 
 
 		 381 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.192988  normal  0.0195635 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3159  peptidase M20D, amidohydrolase  32.47 
 
 		 397 aa  197  3e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3681  thermostable carboxypeptidase 1  34.5 
 
 		 381 aa  196  7e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0594  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  35.62 
 
 		 381 aa  196  8.000000000000001e-49  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00422123  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0130  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  33.15 
 
 		 401 aa  195  9e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0750166  normal  0.238012 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1324  amidohydrolase  34.23 
 
 		 410 aa  195  1e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3419  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  34.5 
 
 		 381 aa  195  1e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000697071  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4372  hippurate hydrolase  32.98 
 
 		 379 aa  195  1e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362461  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3771  thermostable carboxypeptidase 1  35.88 
 
 		 381 aa  194  2e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.406616  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0071  peptidase M20D, amidohydrolase  31.13 
 
 		 389 aa  194  2e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1188  amidohydrolase  32.98 
 
 		 387 aa  194  3e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2397  amidohydrolase  32.7 
 
 		 373 aa  194  3e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2354  amidohydrolase  32.7 
 
 		 373 aa  194  3e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5843  amidohydrolase  31.54 
 
 		 396 aa  194  3e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.575611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3350  amidohydrolase  34.68 
 
 		 388 aa  193  4e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0028515  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0570  amidohydrolase  33.79 
 
 		 392 aa  193  5e-48  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0022  amidohydrolase  31.37 
 
 		 380 aa  192  7e-48  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5626  amidohydrolase  31.54 
 
 		 399 aa  192  7e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.528848  normal  0.0552178 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5651  amidohydrolase  31.78 
 
 		 396 aa  192  8e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.146235 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3715  peptidase M20D, amidohydrolase  31.78 
 
 		 415 aa  192  8e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.410848  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4653  amidohydrolase  31.78 
 
 		 415 aa  192  8e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0295739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3382  amidohydrolase  30.83 
 
 		 402 aa  191  1e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7287  amidohydrolase  34.49 
 
 		 391 aa  191  1e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1248  amidohydrolase  31.95 
 
 		 425 aa  191  2e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.144528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4882  amidohydrolase  32.13 
 
 		 404 aa  190  2.9999999999999997e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.345507 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2871  putative hippurate hydrolase protein  31.09 
 
 		 396 aa  190  4e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000867409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3615  peptidase M20D, amidohydrolase  30.97 
 
 		 397 aa  190  4e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0273  amidohydrolase  33.87 
 
 		 395 aa  190  4e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0152  amidohydrolase  31.94 
 
 		 396 aa  190  4e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.468392  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1918  amidohydrolase family protein  32.79 
 
 		 372 aa  189  5e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0175  amidohydrolase  33.25 
 
 		 386 aa  190  5e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0994894  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3705  thermostable carboxypeptidase 1  33.7 
 
 		 381 aa  188  2e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0066  amidohydrolase  32.24 
 
 		 390 aa  188  2e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2147  amidohydrolase  33.33 
 
 		 398 aa  187  3e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3698  M20/M25/M40 family peptidase  35.42 
 
 		 381 aa  186  5e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0172  amidohydrolase  32.32 
 
 		 388 aa  186  5e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6364  amidohydrolase  33.07 
 
 		 395 aa  186  6e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.557183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31131  predicted protein  31.63 
 
 		 443 aa  186  7e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3523  peptidase M20D, amidohydrolase  31.47 
 
 		 385 aa  186  8e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00484515  normal  0.807548 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0220  amidohydrolase  32.55 
 
 		 385 aa  186  8e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1689  amidohydrolase  34.59 
 
 		 385 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6435  peptidase M20D, amidohydrolase  32.27 
 
 		 395 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6670  amidohydrolase  32.27 
 
 		 395 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28190  amidohydrolase  32.09 
 
 		 378 aa  184  2.0000000000000003e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000108977  normal  0.832169 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6268  amidohydrolase  32.27 
 
 		 395 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.843577  normal  0.0558872 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6067  amidohydrolase  32.27 
 
 		 395 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1431  amidohydrolase  31.79 
 
 		 396 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00950334  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0545  amidohydrolase  34.74 
 
 		 400 aa  184  3e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.502241  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5519  amidohydrolase  33.6 
 
 		 396 aa  184  3e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.5258  normal  0.111633 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3175  amidohydrolase  34.55 
 
 		 394 aa  184  3e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0333  amidohydrolase  32.07 
 
 		 401 aa  183  4.0000000000000006e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1020  peptidase M20D, amidohydrolase  33.33 
 
 		 407 aa  183  4.0000000000000006e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0205344 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3609  amidohydrolase  31.22 
 
 		 387 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.752392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2454  amidohydrolase  30.56 
 
 		 394 aa  183  5.0000000000000004e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1415  amidohydrolase family protein  31.04 
 
 		 398 aa  183  5.0000000000000004e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.486637  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3340  amidohydrolase  35.83 
 
 		 394 aa  182  7e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1764  amidohydrolase  35.65 
 
 		 389 aa  182  9.000000000000001e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0190  amidohydrolase family protein  33.33 
 
 		 389 aa  182  1e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0261019  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4094  peptidase M20D, amidohydrolase  32.53 
 
 		 392 aa  181  1e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.665516  normal  0.883146 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1211  amidohydrolase  30.25 
 
 		 384 aa  181  1e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.108173  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3992  amidohydrolase  32.2 
 
 		 385 aa  181  1e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0613  amidohydrolase  30.48 
 
 		 400 aa  182  1e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2758  amidohydrolase  32.26 
 
 		 393 aa  181  2e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.00285471  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1044  amidohydrolase  31.38 
 
 		 408 aa  181  2e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000210114  unclonable  0.00000194036 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0572  amidohydrolase  32.41 
 
 		 391 aa  180  2.9999999999999997e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.176394  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0586  amidohydrolase  32.41 
 
 		 391 aa  180  2.9999999999999997e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0493  amidohydrolase  33.15 
 
 		 391 aa  180  2.9999999999999997e-44  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.642244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5073  amidohydrolase  32.11 
 
 		 387 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.546308  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3897  amidohydrolase  31.13 
 
 		 387 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00269559 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2487  amidohydrolase  34.42 
 
 		 398 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.373186  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1330  amidohydrolase  32.52 
 
 		 407 aa  180  2.9999999999999997e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3955  amidohydrolase  31.22 
 
 		 412 aa  179  4.999999999999999e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.393946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4183  amidohydrolase  32.2 
 
 		 385 aa  180  4.999999999999999e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2091  amidohydrolase  32.79 
 
 		 373 aa  179  5.999999999999999e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1225  amidohydrolase family protein  30.42 
 
 		 398 aa  179  5.999999999999999e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0413476  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1813  peptidase M20D, amidohydrolase  31.81 
 
 		 388 aa  179  7e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.301487  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5199  hippurate hydrolase  29.66 
 
 		 403 aa  179  9e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>