183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_07680 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_07680  ABC-type transport system involved in cytochrome c biogenesis, permease component  100 
 
 		 254 aa  515  1.0000000000000001e-145  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.679091  normal  0.236691 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05020  ABC-type transport system involved in cytochrome c biogenesis, permease component  56.96 
 
 		 246 aa  300  1e-80  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.396568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2580  cytochrome c assembly protein  51.75 
 
 		 256 aa  276  3e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.834779 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1474  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  37.3 
 
 		 230 aa  123  3e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00341992  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0981  ABC heme exporter, inner membrane subunit C  33.67 
 
 		 235 aa  123  3e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5876  cytochrome c assembly protein  34.08 
 
 		 265 aa  122  6e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.30751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2365  cytochrome c assembly protein  35.75 
 
 		 230 aa  121  8e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3129  cytochrome c assembly protein  42.57 
 
 		 228 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.291273 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1946  cytochrome c assembly protein  38.92 
 
 		 224 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.446735  normal  0.890252 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0238  cytochrome c assembly protein  33.7 
 
 		 239 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0985  cytochrome c assembly protein  31.22 
 
 		 234 aa  107  1e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.012201  hitchhiker  0.000451317 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2505  cytochrome c assembly protein  32.63 
 
 		 231 aa  105  8e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0837  cytochrome c assembly protein  35.09 
 
 		 230 aa  105  9e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2426  cytochrome c assembly protein  31.79 
 
 		 242 aa  103  4e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1852  cytochrome c assembly protein  36.13 
 
 		 319 aa  102  5e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03790  cytochrome c assembly protein  29.89 
 
 		 225 aa  100  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1955  cytochrome c assembly protein  32.42 
 
 		 254 aa  100  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.235113  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0936  cytochrome c assembly protein  42.15 
 
 		 232 aa  99.4  4e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.148761 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2302  cytochrome c assembly protein  30.65 
 
 		 230 aa  97.8  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.267194  normal  0.826102 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3568  cytochrome c assembly protein  39.1 
 
 		 321 aa  96.3  5e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3360  heme exporter protein CcmC  30.69 
 
 		 256 aa  95.5  7e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.855911  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3221  cytochrome c assembly protein  27.17 
 
 		 219 aa  93.6  3e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.119543 
 
 
-
 
NC_004310  BR0096  heme exporter protein CcmC  30.11 
 
 		 261 aa  91.7  9e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0108  heme exporter protein CcmC  26.81 
 
 		 265 aa  91.7  9e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0094  heme exporter protein CcmC  30.11 
 
 		 262 aa  91.7  1e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4369  cytochrome c assembly protein  39.85 
 
 		 321 aa  90.9  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4437  cytochrome c assembly protein  36.31 
 
 		 335 aa  90.5  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.686351 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3361  cytochrome c assembly protein  33.73 
 
 		 225 aa  90.1  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.249827 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1245  cytochrome c assembly protein  35.83 
 
 		 236 aa  89.4  5e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.695551  normal  0.514706 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0755  cytochrome c assembly protein  34.84 
 
 		 335 aa  88.6  8e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.039196 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3086  heme exporter protein CcmC  29.57 
 
 		 256 aa  88.6  8e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3741  heme exporter protein CcmC  27.16 
 
 		 253 aa  87.4  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4064  heme exporter protein CcmC  28.26 
 
 		 253 aa  87.4  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.890751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0461  heme exporter protein CcmC  30.6 
 
 		 242 aa  87.4  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.530136  normal  0.208267 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1803  ABC heme exporter, inner membrane subunit CcmC  30.05 
 
 		 242 aa  86.7  3e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2726  heme exporter protein CcmC  27.35 
 
 		 246 aa  87  3e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0449  heme exporter protein CcmC  30.05 
 
 		 244 aa  86.7  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2422  heme exporter protein CcmC  27.78 
 
 		 246 aa  86.3  4e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4191  ABC transporter membrane spanning protein (heme)  26.84 
 
 		 260 aa  85.9  6e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.897881  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3500  heme exporter protein CcmC  28.88 
 
 		 229 aa  85.1  9e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4130  heme exporter protein CcmC  29.79 
 
 		 243 aa  85.1  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.237334 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0682  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  32.78 
 
 		 234 aa  84.3  0.000000000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2719  cytochrome c assembly protein  34.38 
 
 		 320 aa  84.3  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0202  heme exporter protein CcmC  29.57 
 
 		 244 aa  83.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.375034  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2959  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  27.31 
 
 		 251 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1579  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  26.02 
 
 		 251 aa  82.8  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.9226  normal  0.734058 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1447  cytochrome c assembly protein  34.07 
 
 		 221 aa  82  0.000000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.228138 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0334  cytochrome c assembly protein  41.57 
 
 		 244 aa  82  0.000000000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1643  heme exporter protein C  26.2 
 
 		 250 aa  81.3  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.961001  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0366  heme exporter protein CcmC  28.27 
 
 		 244 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.522899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0321  heme exporter protein CcmC  32.07 
 
 		 234 aa  80.5  0.00000000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0889077  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2649  heme exporter protein CcmC  26.56 
 
 		 247 aa  80.5  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00358111  normal  0.0120286 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4058  cytochrome c heme exporter protein  27.08 
 
 		 259 aa  80.9  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.804839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0043  heme exporter protein CcmC  29.34 
 
 		 246 aa  80.1  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30430  cytochrome c-type biogenesis protein  27.39 
 
 		 250 aa  79.7  0.00000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0522  heme exporter protein CcmC  27.85 
 
 		 244 aa  79.3  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.897478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0411  heme exporter protein CcmC  28.49 
 
 		 243 aa  79  0.00000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2279  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  26.52 
 
 		 250 aa  79  0.00000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0320  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  29.03 
 
 		 243 aa  78.6  0.00000000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2852  heme exporter protein CcmC  25.63 
 
 		 270 aa  78.2  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.494334  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0946  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  26.52 
 
 		 250 aa  77.4  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3413  heme exporter protein CcmC  26.94 
 
 		 248 aa  77.4  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5342  heme exporter protein CcmC  29.65 
 
 		 265 aa  77  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0038  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  28.69 
 
 		 239 aa  76.6  0.0000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.56272  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0372  ABC heme exporter, inner membrane subunit CcmC  25.61 
 
 		 249 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00201909 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2835  heme exporter protein CcmC  29.29 
 
 		 268 aa  76.6  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0929159  normal  0.105221 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02126  heme exporter subunit  25.32 
 
 		 245 aa  76.3  0.0000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1460  heme exporter protein CcmC  25.32 
 
 		 245 aa  76.3  0.0000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2347  heme exporter protein C  25.32 
 
 		 245 aa  76.3  0.0000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.700588 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02085  hypothetical protein  25.32 
 
 		 245 aa  76.3  0.0000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.903399  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0742  heme exporter protein C  25.32 
 
 		 245 aa  76.3  0.0000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.248881  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3336  heme exporter protein C  25.32 
 
 		 245 aa  76.3  0.0000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2337  heme exporter protein C  25.32 
 
 		 245 aa  76.3  0.0000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2498  heme exporter protein C  25.32 
 
 		 245 aa  76.3  0.0000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1451  heme exporter protein CcmC  25.32 
 
 		 245 aa  76.3  0.0000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1853  heme exporter protein C  26.09 
 
 		 243 aa  75.9  0.0000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.024303  normal  0.648082 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3245  ABC transporter permease  26.74 
 
 		 240 aa  75.5  0.0000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1685  heme exporter protein CcmC  26.67 
 
 		 271 aa  75.5  0.0000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2642  heme exporter protein CcmC  28.93 
 
 		 268 aa  75.5  0.0000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3651  heme exporter protein CcmC  27.03 
 
 		 254 aa  75.5  0.0000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.763216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3840  cytochrome c assembly protein  33.08 
 
 		 240 aa  75.5  0.0000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3391  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  25.33 
 
 		 267 aa  75.1  0.0000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3894  heme exporter protein CcmC  27.57 
 
 		 255 aa  75.1  0.0000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00141709  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4325  heme exporter protein CcmC  27.57 
 
 		 255 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.102702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1387  heme exporter protein CcmC  28.88 
 
 		 242 aa  75.1  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.411459  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3660  heme exporter protein CcmC  26.18 
 
 		 254 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.38552  hitchhiker  0.00533118 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45350  heme exporter protein CcmC  25.11 
 
 		 252 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0229  heme exporter protein CcmC  24.78 
 
 		 248 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.052714  normal  0.0591217 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0226  heme exporter protein CcmC  24.78 
 
 		 248 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0392942  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4026  heme exporter protein CcmC  24.78 
 
 		 248 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.205609  hitchhiker  0.00000231937 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1542  heme exporter protein CcmC  27.57 
 
 		 255 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3850  heme exporter protein CcmC  25.11 
 
 		 252 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.218387  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03133  hypothetical protein  28.38 
 
 		 247 aa  74.7  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2612  heme exporter protein CcmC  28.79 
 
 		 268 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.342181 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0226  heme exporter protein CcmC  24.35 
 
 		 248 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0290205  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0340  heme exporter protein CcmC  30.51 
 
 		 236 aa  73.6  0.000000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.855173  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002843  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  27.95 
 
 		 247 aa  73.2  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2789  heme exporter protein CcmC  26.25 
 
 		 251 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.396306  normal  0.546965 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4768  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  24.46 
 
 		 263 aa  72.8  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03072  heme exporter protein C  26.4 
 
 		 260 aa  72.8  0.000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>