102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0361 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0361  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 313 aa  631  1e-180  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0886527  normal  0.763423 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2416  Radical SAM domain protein  35.99 
 
 		 328 aa  215  9.999999999999999e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1142  radical SAM domain-containing protein  40.21 
 
 		 310 aa  209  5e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1638  radical SAM domain-containing protein  39.12 
 
 		 313 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00824164  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2341  Radical SAM domain protein  38.93 
 
 		 330 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.109673 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2486  GTP-binding protein Obg/CgtA  36.08 
 
 		 680 aa  199  6e-50  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2049  radical SAM domain-containing protein  40.36 
 
 		 319 aa  198  1.0000000000000001e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0454  radical SAM domain-containing protein  35.88 
 
 		 312 aa  198  1.0000000000000001e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.383393  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2156  radical SAM family protein  40.97 
 
 		 313 aa  197  3e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0336  hypothetical protein  38.31 
 
 		 319 aa  191  1e-47  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.300886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0808  radical SAM domain-containing protein  39.27 
 
 		 320 aa  191  1e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11060  Radical SAM domain protein  39.57 
 
 		 239 aa  191  2e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00221485  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1179  radical SAM domain-containing protein  36.99 
 
 		 331 aa  190  2.9999999999999997e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.143255 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1223  Radical SAM domain protein  38.53 
 
 		 237 aa  185  8e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00674183 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1848  radical SAM domain-containing protein  38.13 
 
 		 310 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1559  Radical SAM domain protein  44.81 
 
 		 316 aa  183  3e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0969548  hitchhiker  0.000892375 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0108  radical SAM domain-containing protein  47.17 
 
 		 295 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1460  Elongator protein 3/MiaB/NifB  41.56 
 
 		 312 aa  182  9.000000000000001e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1531  radical SAM domain-containing protein  37.04 
 
 		 308 aa  181  1e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.652201  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0912  Radical SAM domain protein  42.92 
 
 		 314 aa  179  4.999999999999999e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.883819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0688  MoaA/NifB/PqqE family protein  37.68 
 
 		 312 aa  179  7e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.110468  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1667  Radical SAM domain protein  37.55 
 
 		 321 aa  177  2e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.332302  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0538  radical SAM domain-containing protein  36.15 
 
 		 329 aa  175  7e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.111503  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1962  radical SAM domain-containing protein  42.52 
 
 		 323 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0458  Radical SAM domain protein  34.58 
 
 		 332 aa  173  2.9999999999999996e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0991  Radical SAM domain protein  36.96 
 
 		 311 aa  169  4e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0322  radical SAM domain-containing protein  31.83 
 
 		 364 aa  169  6e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.44863  normal  0.156857 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0633  radical SAM family protein  33.09 
 
 		 310 aa  166  5e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000656593  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04120  Radical SAM domain protein  33.01 
 
 		 311 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0562  radical SAM domain-containing protein  42.38 
 
 		 311 aa  164  3e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1155  Radical SAM domain protein  41.55 
 
 		 319 aa  163  3e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1404  radical SAM domain-containing protein  43.38 
 
 		 320 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.937371  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3462  radical SAM domain-containing protein  43.26 
 
 		 313 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0316  Radical SAM domain protein  34.93 
 
 		 303 aa  162  8.000000000000001e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1586  hypothetical protein  40.47 
 
 		 326 aa  157  2e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3606  radical SAM domain-containing protein  51.25 
 
 		 244 aa  154  1e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1012  signal recognition particle protein  35.09 
 
 		 304 aa  154  1e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1760  radical SAM domain-containing protein  45.28 
 
 		 323 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.265975  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0538  Radical SAM domain protein  30.07 
 
 		 303 aa  149  8e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00127188  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1472  radical SAM domain-containing protein  33.58 
 
 		 300 aa  144  1e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0530  conserved hypothetical protein, putative radical SAM domain protein  32.09 
 
 		 302 aa  144  1e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2377  Radical SAM domain protein  31.21 
 
 		 365 aa  142  6e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0482  radical SAM domain-containing protein  31.11 
 
 		 300 aa  142  8e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.992471  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1149  radical SAM family Fe-S protein  29.3 
 
 		 326 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2043  Radical SAM domain protein  39.9 
 
 		 267 aa  141  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1380  radical SAM domain-containing protein  30.74 
 
 		 300 aa  140  3e-32  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0828  Fe-S oxidoreductase  31.54 
 
 		 326 aa  139  7.999999999999999e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.389597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1270  radical SAM domain-containing protein  31.85 
 
 		 300 aa  139  7.999999999999999e-32  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1259  radical SAM domain-containing protein  30.74 
 
 		 300 aa  138  8.999999999999999e-32  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1455  radical SAM domain-containing protein  33.05 
 
 		 308 aa  136  5e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3775  Radical SAM domain protein  36.06 
 
 		 266 aa  133  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4632  radical SAM family protein  37.5 
 
 		 270 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.453222  normal  0.0698866 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1039  radical SAM domain-containing protein  24.41 
 
 		 231 aa  91.3  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0813206  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1292  hypothetical protein  26.8 
 
 		 291 aa  61.6  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.187698  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1057  radical SAM domain-containing protein  26.89 
 
 		 354 aa  53.9  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.828068 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1943  radical SAM family protein  26.95 
 
 		 267 aa  52.4  0.000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.545667  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0182  radical SAM family protein  22.12 
 
 		 369 aa  52  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3345  radical SAM domain-containing protein  26.6 
 
 		 338 aa  50.8  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0084  tRNA-modifying enzyme  24.76 
 
 		 351 aa  50.1  0.00005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2552  radical SAM family protein  25.54 
 
 		 340 aa  50.1  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2206  tRNA-modifying enzyme  23.67 
 
 		 358 aa  50.1  0.00005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.543832 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0630  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.43 
 
 		 370 aa  49.7  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1109  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.43 
 
 		 370 aa  49.7  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.038115  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1068  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.43 
 
 		 370 aa  49.3  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.194583  normal  0.0439082 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0240  Radical SAM domain protein  23.96 
 
 		 340 aa  48.9  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.548206  normal  0.016979 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1476  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.24 
 
 		 299 aa  47.8  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2194  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.98 
 
 		 370 aa  46.6  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0734508  normal  0.0502298 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2553  radical SAM family protein  25.63 
 
 		 341 aa  46.2  0.0007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0951  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.36 
 
 		 338 aa  46.2  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0855  hypothetical protein  30.6 
 
 		 278 aa  45.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  6.94924e-18  unclonable  0.0000000890564 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2919  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.34 
 
 		 370 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00151708  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4316  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  27.37 
 
 		 338 aa  45.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.904735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0985  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.98 
 
 		 370 aa  45.8  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.637479  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0911  radical SAM domain-containing protein  30.83 
 
 		 497 aa  45.4  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1529  tRNA-modifying enzyme  21.27 
 
 		 341 aa  45.4  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000116298 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0989  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.98 
 
 		 370 aa  45.8  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.197702  normal  0.914992 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0205  Radical SAM domain protein  25.62 
 
 		 340 aa  45.4  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0667932  normal  0.157312 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1124  Fe-S oxidoreductases  26.88 
 
 		 338 aa  45.1  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1670  radical SAM domain-containing protein  27.47 
 
 		 339 aa  45.1  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0387663  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0904  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.84 
 
 		 373 aa  44.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0102552  normal  0.0824176 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0882  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.99 
 
 		 323 aa  44.7  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0308  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  23.85 
 
 		 328 aa  44.3  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0853  radical SAM domain-containing protein  24.37 
 
 		 332 aa  43.9  0.003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.796243 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0866  tRNA-modifying enzyme  22.64 
 
 		 380 aa  44.3  0.003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0969  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.7 
 
 		 373 aa  44.3  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.112196  normal  0.243717 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3073  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.02 
 
 		 330 aa  43.9  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.342071  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1016  tRNA-modifying enzyme  28.87 
 
 		 351 aa  43.9  0.004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.486708  hitchhiker  0.000502438 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0952  Radical SAM domain protein  31.93 
 
 		 437 aa  43.9  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00605498  hitchhiker  0.00000184095 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2838  tRNA-modifying enzyme  23.42 
 
 		 306 aa  43.1  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0197785 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1440  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.93 
 
 		 347 aa  43.1  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.160949  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2450  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.88 
 
 		 359 aa  43.1  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4810  pyruvate formate-lyase-activating enzyme  28.42 
 
 		 243 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1689  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.09 
 
 		 376 aa  43.1  0.007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.243646 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2556  radical SAM family protein  21.51 
 
 		 337 aa  42.7  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1017  Radical SAM domain protein  22.35 
 
 		 335 aa  42.7  0.007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.677632  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0416  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.19 
 
 		 341 aa  42.7  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.315113  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0538  tRNA-modifying enzyme  24.4 
 
 		 311 aa  42.7  0.008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.412175  normal  0.423488 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0817  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.42 
 
 		 370 aa  42.7  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00537332  normal  0.704127 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1280  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.22 
 
 		 332 aa  42.4  0.009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.412863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3369  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.38 
 
 		 329 aa  42.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.986754 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>