166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3686 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_3686  cytochrome C family protein  100 
 
 		 314 aa  652    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0227  cytochrome c family protein  78.73 
 
 		 316 aa  533  1e-150  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0231  cytochrome C family protein  79.22 
 
 		 316 aa  525  1e-148  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1402  cytochrome c family protein  75.8 
 
 		 316 aa  502  1e-141  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2820  cytochrome C family protein  74.33 
 
 		 312 aa  488  1e-137  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3130  cytochrome C family protein  75.16 
 
 		 317 aa  489  1e-137  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.849943  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0352  cytochrome c family protein  75.49 
 
 		 317 aa  488  1e-137  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.101331 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2925  cytochrome c family protein  71.7 
 
 		 315 aa  477  1e-133  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2230  cytochrome C family protein  69.67 
 
 		 309 aa  458  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0468166  decreased coverage  0.000802637 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3675  cytochrome C family protein  69.08 
 
 		 315 aa  457  1e-127  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0268  cytochrome C family protein  68.85 
 
 		 314 aa  455  1e-127  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1427  decaheme cytochrome c  65.72 
 
 		 318 aa  449  1e-125  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1777  decaheme cytochrome c MtrA  66.14 
 
 		 333 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2511  cytochrome C family protein  65.2 
 
 		 329 aa  437  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.115309  hitchhiker  0.00672893 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2579  cytochrome C family protein  65.52 
 
 		 329 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.069167  normal  0.0206665 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1611  cytochrome C family protein  64.58 
 
 		 333 aa  435  1e-121  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.173927  normal  0.248798 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2677  cytochrome C family protein  64.89 
 
 		 329 aa  435  1e-121  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.376662  normal  0.0163011 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2766  cytochrome C family protein  64.58 
 
 		 333 aa  436  1e-121  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0218266  hitchhiker  0.000000422231 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1577  cytochrome C family protein  64.58 
 
 		 333 aa  435  1e-121  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000354628  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1588  cytochrome C family protein  64.26 
 
 		 333 aa  432  1e-120  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00373932  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3126  cytochrome C family protein  65.26 
 
 		 333 aa  427  1e-119  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00631921  hitchhiker  0.0000243395 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1477  cytochrome C family protein  63.72 
 
 		 334 aa  427  1e-119  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000779097  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1524  cytochrome c family protein  63.66 
 
 		 333 aa  429  1e-119  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.462693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1207  decaheme cytochrome c MtrA  62.97 
 
 		 326 aa  426  1e-118  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0298799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2526  cytochrome C family protein  63.47 
 
 		 329 aa  426  1e-118  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2638  cytochrome C family protein  61.92 
 
 		 329 aa  419  1e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.838087  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2699  cytochrome C family protein  64.15 
 
 		 328 aa  414  9.999999999999999e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.840713  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1616  cytochrome C family protein  59.93 
 
 		 321 aa  392  1e-108  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.093642  normal  0.713619 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1593  cytochrome C family protein  59.93 
 
 		 321 aa  392  1e-108  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000481816  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1582  cytochrome C family protein  59.93 
 
 		 321 aa  391  1e-108  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000911408  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2761  cytochrome C family protein  59.61 
 
 		 319 aa  390  1e-107  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.309572  hitchhiker  0.000367908 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2506  cytochrome C family protein  57.64 
 
 		 321 aa  390  1e-107  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.365224  hitchhiker  0.00105775 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2574  cytochrome C family protein  57.64 
 
 		 321 aa  390  1e-107  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.448859  hitchhiker  0.00699839 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2672  cytochrome C family protein  57.64 
 
 		 321 aa  389  1e-107  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.655979  normal  0.0486911 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2519  cytochrome C family protein  60.2 
 
 		 322 aa  390  1e-107  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.589751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1530  cytochrome c family protein  61.64 
 
 		 321 aa  389  1e-107  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.892773  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1782  decaheme cytochrome c MtrD  59.53 
 
 		 306 aa  385  1e-106  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2692  cytochrome C family protein  58.15 
 
 		 319 aa  384  1e-105  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1213  decaheme cytochrome c MtrD  60.2 
 
 		 318 aa  381  1e-105  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.766107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2149  cytochrome c family protein  59.93 
 
 		 304 aa  357  9.999999999999999e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0950345  normal  0.491991 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1305  cytochrome c family protein  57.84 
 
 		 310 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000952698 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4360  decaheme cytochrome c  49 
 
 		 304 aa  297  1e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003777  decaheme cytochrome c MtrA  45.06 
 
 		 326 aa  289  4e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3859  cytochrome C family protein  51.42 
 
 		 287 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00158078  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0361  decaheme cytochrome c MtrA  49.68 
 
 		 286 aa  280  3e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.162857  hitchhiker  0.000223849 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0397  cytochrome C family protein  38.7 
 
 		 299 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.265526 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3626  cytochrome C family protein  36.76 
 
 		 299 aa  205  8e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1402  double CXXCH motif-containing protein  36.06 
 
 		 317 aa  204  1e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0638375 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4082  hypothetical protein  39.49 
 
 		 307 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0556738  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2381  cytochrome C family protein  41.6 
 
 		 315 aa  197  2.0000000000000003e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.300688  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0817  cytochrome C family protein  39.3 
 
 		 540 aa  193  3e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2960  cytochrome  39.01 
 
 		 577 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.992406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1744  cytochrome c family protein  33.96 
 
 		 337 aa  186  5e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.740978 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1228  cytochrome c family protein  32.73 
 
 		 337 aa  178  1e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0933631  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3118  cytochrome C family protein  34.84 
 
 		 334 aa  175  7e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1144  cytochrome C family protein  35.54 
 
 		 334 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2291  cytochrome C family protein  33.69 
 
 		 335 aa  162  9e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2203  cytochrome c family protein  37.07 
 
 		 363 aa  154  2e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3828  multiheme cytochrome  36.12 
 
 		 307 aa  139  7.999999999999999e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.326628 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2583  cytochrome C family protein  28.46 
 
 		 259 aa  109  6e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2495  cytochrome c family protein  31.56 
 
 		 646 aa  102  7e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1836  cytochrome C family protein  31.06 
 
 		 658 aa  89  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3218  cytochrome c family protein  30.92 
 
 		 480 aa  82.8  0.000000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0562793  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3068  cytochrome c family protein  28.27 
 
 		 650 aa  80.5  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3166  cytochrome C family protein  28.57 
 
 		 650 aa  79  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3261  cytochrome C family protein  28.17 
 
 		 656 aa  77  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1124  cytochrome C family protein  26.27 
 
 		 658 aa  77  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.932844  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1995  cytochrome C family protein  29.39 
 
 		 658 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.279857  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2759  cytochrome C family protein  31.9 
 
 		 449 aa  72.8  0.000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2494  cytochrome c family protein  25.62 
 
 		 434 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0615  hypothetical protein  33.59 
 
 		 154 aa  69.7  0.00000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0934  cytochrome C family protein  26.9 
 
 		 337 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3831  cytochrome C family protein  34.78 
 
 		 358 aa  67.4  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3156  hypothetical protein  32.84 
 
 		 154 aa  67  0.0000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3915  cytochrome C family protein  34.78 
 
 		 358 aa  66.6  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0747  multiheme cytochrome  25.61 
 
 		 487 aa  66.6  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.568299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3775  cytochrome c family protein  34.06 
 
 		 384 aa  66.2  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.172971  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3163  cytochrome C family protein  28.77 
 
 		 442 aa  66.6  0.0000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1837  cytochrome C family protein  27.55 
 
 		 429 aa  65.1  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1125  cytochrome C family protein  25.21 
 
 		 426 aa  63.9  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.4798  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2902  hypothetical protein  33.08 
 
 		 153 aa  63.2  0.000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1996  cytochrome C family protein  26.59 
 
 		 427 aa  62.8  0.000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0405741  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0615  cytochrome c family protein  30.24 
 
 		 362 aa  60.8  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.131648  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3260  cytochrome C family protein  27.45 
 
 		 436 aa  60.8  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3067  cytochrome c family protein  27.94 
 
 		 436 aa  60.8  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3764  formate-dependent nitrite reductase  30.3 
 
 		 154 aa  60.8  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3962  formate-dependent nitrite reductase  30.3 
 
 		 154 aa  60.8  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3165  cytochrome C family protein  27.45 
 
 		 436 aa  60.8  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3837  formate-dependent nitrite reductase  30.53 
 
 		 154 aa  60.5  0.00000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0518  hypothetical protein  33.6 
 
 		 156 aa  59.7  0.00000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3840  cytochrome C family protein  25.99 
 
 		 331 aa  59.3  0.00000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000859924  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3518  cytochrome C family protein  29.25 
 
 		 331 aa  57.8  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000517887 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2734  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  28.87 
 
 		 189 aa  57  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0313  formate-dependent nitrite reductase  32.56 
 
 		 154 aa  56.2  0.0000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3563  hypothetical protein  29.69 
 
 		 166 aa  56.2  0.0000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4592  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  28.21 
 
 		 188 aa  55.8  0.0000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4533  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  28.21 
 
 		 188 aa  55.8  0.0000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3956  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  28.21 
 
 		 188 aa  55.8  0.0000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.975829 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2713  cytochrome b subunit of formate dehydrogenase-like  25.9 
 
 		 658 aa  55.8  0.0000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.151641  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3921  cytochrome c nitrite reductase, pentaheme subunit  28.21 
 
 		 188 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>