297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_B0094 on replicon NC_011092
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011092  SeSA_B0094  resolvase  100 
 
 		 245 aa  475  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.86084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0037  resolvase  99.59 
 
 		 245 aa  473  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.489197  normal  0.472165 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3355  resolvase domain-containing protein  85.17 
 
 		 301 aa  377  1e-104  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0978291  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6519  resolvase  76.47 
 
 		 283 aa  310  2e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0571  resolvase domain-containing protein  37.32 
 
 		 210 aa  127  2.0000000000000002e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0298  resolvase, putative  40.49 
 
 		 205 aa  125  6e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0054  resolvase domain-containing protein  37.44 
 
 		 213 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4402  resolvase domain-containing protein  37.44 
 
 		 213 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4246  Resolvase domain protein  38.97 
 
 		 205 aa  117  9.999999999999999e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_03  resolvase  37.76 
 
 		 209 aa  117  1.9999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_44  putative resolvase  36.73 
 
 		 211 aa  116  3.9999999999999997e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0377389  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4455  resolvase domain-containing protein  36.04 
 
 		 203 aa  115  5e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2180  resolvase domain-containing protein  35.61 
 
 		 212 aa  115  6e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.52939  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4266  resolvase domain-containing protein  35.96 
 
 		 231 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000000000120246  unclonable  5.20349e-19 
 
 
-
 
NC_009516  PsycPRwf_2397  resolvase domain-containing protein  36.23 
 
 		 210 aa  114  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01413  resolvase, putative  34.5 
 
 		 207 aa  114  1.0000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4355  Resolvase domain protein  35.68 
 
 		 200 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4460  Resolvase domain protein  36.04 
 
 		 209 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4562  resolvase domain-containing protein  36.04 
 
 		 209 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.338072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4386  resolvase domain-containing protein  35.53 
 
 		 209 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0024  resolvase, putative  36.02 
 
 		 206 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000663819  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0021  resolvase, putative  35.55 
 
 		 221 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00853796  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4161  Resolvase domain  35.5 
 
 		 206 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001518  resolvase  38.95 
 
 		 204 aa  108  8.000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000153211  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0123  putative resolvase  35.32 
 
 		 206 aa  107  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  6.922970000000001e-26 
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0078  TnpR  34.33 
 
 		 220 aa  106  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.569126 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4666  resolvase domain-containing protein  33.85 
 
 		 202 aa  106  3e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000148612  normal  0.936039 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4343  Resolvase domain protein  33.85 
 
 		 202 aa  106  3e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000112202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4408  resolvase domain-containing protein  33.85 
 
 		 202 aa  106  3e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000545957  normal  0.0701498 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0873  Resolvase domain protein  37.38 
 
 		 206 aa  105  5e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1306  resolvase domain-containing protein  36.36 
 
 		 205 aa  105  5e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.92579  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1801  resolvase domain-containing protein  33.5 
 
 		 228 aa  105  5e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.118365 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0950  resolvase domain-containing protein  33.18 
 
 		 207 aa  105  7e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3278  resolvase domain-containing protein  36.87 
 
 		 208 aa  105  8e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.312644  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3590  resolvase domain protein  35.44 
 
 		 208 aa  104  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000308956 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0077  resolvase family site-specific recombinase  34.67 
 
 		 211 aa  102  8e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.349046  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4533  resolvase domain-containing protein  32.68 
 
 		 214 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3979  resolvase domain-containing protein  35.75 
 
 		 208 aa  96.7  3e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6887  resolvase domain-containing protein  36.36 
 
 		 210 aa  92  8e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2559  resolvase-like protein  33.95 
 
 		 222 aa  91.3  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.22678 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2477  resolvase-like protein  29.9 
 
 		 198 aa  82.8  0.000000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.131622  normal  0.782919 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3124  resolvase domain-containing protein  31.79 
 
 		 194 aa  79  0.00000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0904767  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1132  Resolvase domain  36.94 
 
 		 184 aa  77  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0719  resolvase domain-containing protein  30.15 
 
 		 197 aa  75.9  0.0000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000179161 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1711  integrative genetic element Gsu5, resolvase  34.36 
 
 		 190 aa  75.5  0.0000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316952  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4084  resolvase domain-containing protein  32.69 
 
 		 188 aa  73.9  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.236689  normal  0.0346573 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2946  resolvase domain-containing protein  30.81 
 
 		 188 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0986415  normal  0.227448 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2179  resolvase domain-containing protein  30.81 
 
 		 188 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0190993  hitchhiker  0.0022624 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01209  bacteriocin production protein  32.34 
 
 		 198 aa  69.3  0.00000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000702686  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2582  resolvase domain-containing protein  32.16 
 
 		 185 aa  68.9  0.00000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0088  resolvase domain-containing protein  31.18 
 
 		 199 aa  67.8  0.0000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223955  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0216  transposon resolvase  32.84 
 
 		 199 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.159168 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0687  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  30.58 
 
 		 200 aa  67.8  0.0000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.731539  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0222  transposon resolvase  31.34 
 
 		 199 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000952158 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1006  Resolvase domain protein  32.14 
 
 		 189 aa  65.9  0.0000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1807  resolvase domain-containing protein  30.65 
 
 		 201 aa  65.5  0.0000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.261116  unclonable  0.00000000603181 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1355  resolvase-like protein  27.55 
 
 		 190 aa  65.5  0.0000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.141663 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0206  transposon resolvase  33.33 
 
 		 169 aa  65.1  0.0000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000314886 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3678  Resolvase domain  34.36 
 
 		 190 aa  64.7  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134045  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1052  Resolvase domain  33.13 
 
 		 186 aa  65.1  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20410  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  31.22 
 
 		 194 aa  64.3  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0661103 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5093  resolvase domain-containing protein  33.33 
 
 		 201 aa  63.5  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.993134 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0204  transposon resolvase  30.35 
 
 		 191 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000159954 
 
 
-
 
NC_008263  CPR_A0002  resolvase  30 
 
 		 190 aa  62.4  0.000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141759  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0039  resolvase  28.8 
 
 		 181 aa  62  0.000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0293678  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0037  transposon Tn21 resolvase  32.05 
 
 		 205 aa  62  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.335597 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3670  resolvase domain-containing protein  31.77 
 
 		 185 aa  61.2  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1615  resolvase family site-specific recombinase  46.74 
 
 		 197 aa  60.8  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5396  resolvase domain-containing protein  29.32 
 
 		 180 aa  60.5  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.859533  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2355  Resolvase domain protein  28.64 
 
 		 186 aa  60.5  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.230305  normal  0.6636 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1206  Resolvase domain protein  33.12 
 
 		 186 aa  60.1  0.00000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1494  resolvase-like protein  30.98 
 
 		 186 aa  59.7  0.00000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.493325 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3982  resolvase domain-containing protein  31.65 
 
 		 201 aa  58.9  0.00000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.364011  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0631  resolvase domain-containing protein  31.65 
 
 		 201 aa  58.9  0.00000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2033  resolvase domain-containing protein  29.17 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.188765  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2322  resolvase domain-containing protein  31.01 
 
 		 186 aa  58.9  0.00000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3928  resolvase domain-containing protein  27.89 
 
 		 191 aa  58.5  0.00000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.272515  hitchhiker  0.0000753359 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0053  transposon Tn21 resolvase  31.41 
 
 		 186 aa  58.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.509225 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2095  Resolvase domain protein  29.23 
 
 		 203 aa  58.2  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6187  resolvase-like protein  30.43 
 
 		 186 aa  58.2  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0984609  hitchhiker  0.0000107923 
 
 
-
 
NC_008264  CPR_B0006  resolvase  30.61 
 
 		 189 aa  58.2  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00548662  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4319  resolvase domain-containing protein  31.41 
 
 		 186 aa  58.2  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1326  resolvase domain-containing protein  31.09 
 
 		 180 aa  58.2  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4488  DNA-invertase  33.12 
 
 		 187 aa  58.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.258493  normal  0.0155508 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1403  resolvase domain-containing protein  29.3 
 
 		 185 aa  58.2  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7006  hypothetical protein  33 
 
 		 183 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2680  resolvase domain-containing protein  31.21 
 
 		 185 aa  57  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4228  resolvase family site-specific recombinase  37 
 
 		 187 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.623835  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4081  resolvase domain-containing protein  28.5 
 
 		 199 aa  57.8  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0381075 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3876  resolvase domain-containing protein  28.5 
 
 		 199 aa  57.8  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.3792 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4489  Resolvase domain protein  31.1 
 
 		 186 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000146883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4473  serine-based site-specific recombinase activity TnpR  31.85 
 
 		 186 aa  57.8  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0992302  decreased coverage  0.00348712 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4599  serine-based site-specific recombinase activity TnpR  31.85 
 
 		 186 aa  57.8  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000321893  hitchhiker  0.00456228 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15430  putative resolvase, essential for transposition  31.85 
 
 		 186 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  7.34084e-16  unclonable  6.55355e-22 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3829  resolvase domain-containing protein  31.21 
 
 		 185 aa  57  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3846  resolvase domain-containing protein  31.21 
 
 		 185 aa  57  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.40246  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4352  Resolvase domain protein  31.1 
 
 		 186 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00813261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1914  resolvase domain-containing protein  31.21 
 
 		 185 aa  57  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1256  resolvase domain-containing protein  31.21 
 
 		 185 aa  57  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.249423  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3680  resolvase domain-containing protein  28.5 
 
 		 199 aa  57.8  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>