More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1313 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_1313  ABC transporter related protein  100 
 
 
193 aa  392  1e-108  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.344181  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0485  ABC transporter-related protein  57.67 
 
 
189 aa  229  2e-59  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1680  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  38.74 
 
 
324 aa  134  7.000000000000001e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1049  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  36.97 
 
 
330 aa  128  5.0000000000000004e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.933184  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4004  ABC transporter-related protein  35.29 
 
 
486 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0397  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  36.54 
 
 
325 aa  122  2e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0961  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  37.44 
 
 
320 aa  123  2e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.233776  hitchhiker  0.000990289 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0142  ABC transporter, ATP-binding protein  40.93 
 
 
486 aa  122  3e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1227  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  36.45 
 
 
320 aa  121  7e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.213688 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2031  ABC transporter ATP-binding protein  31.28 
 
 
539 aa  120  9e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00115375  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2393  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  36.32 
 
 
347 aa  120  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1440  ABC transporter related  36.14 
 
 
233 aa  120  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.926008  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1469  ABC transporter related  36.14 
 
 
233 aa  120  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0083934  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1172  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  36.2 
 
 
333 aa  119  1.9999999999999998e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0077  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  36.22 
 
 
327 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.221676  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0386  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  33.33 
 
 
313 aa  119  1.9999999999999998e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00722146  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2702  ABC transporter related  35.18 
 
 
257 aa  119  3.9999999999999996e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0672  ABC transporter related  33.83 
 
 
261 aa  118  4.9999999999999996e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.92463  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5438  ABC transporter related  35.92 
 
 
247 aa  118  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.62538  hitchhiker  0.00360775 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2819  ABC transporter related  33.64 
 
 
571 aa  118  6e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.810211  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0492  ABC transporter related  36.44 
 
 
268 aa  117  7.999999999999999e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1496  ABC transporter related  34.5 
 
 
532 aa  117  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3166  ABC transporter related protein  34.78 
 
 
516 aa  117  9e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1657  nickel import ATP-binding protein NikE  36.49 
 
 
219 aa  117  9.999999999999999e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0560  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  35.14 
 
 
334 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.204279  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1617  ABC transporter-related protein  37.38 
 
 
547 aa  116  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.683358  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3794  ABC transporter related  33.98 
 
 
377 aa  116  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0749  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  34.39 
 
 
312 aa  115  3e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.760141  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0160  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  34.98 
 
 
320 aa  116  3e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0931  ABC transporter related protein  36.04 
 
 
265 aa  115  3e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6185  ABC transporter related  35.32 
 
 
285 aa  115  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0918  ABC transporter related  35 
 
 
268 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0560  ABC transporter related  40.59 
 
 
542 aa  115  3.9999999999999997e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000861738  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1327  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  34.72 
 
 
322 aa  115  3.9999999999999997e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0010224  normal  0.375909 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18750  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  32.86 
 
 
298 aa  115  3.9999999999999997e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.371793 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0896  ABC transporter related  35 
 
 
268 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1732  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  35.07 
 
 
321 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.561922  hitchhiker  0.00101303 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2020  ABC transporter related  37.1 
 
 
462 aa  115  3.9999999999999997e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.338544  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0750  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  35.51 
 
 
339 aa  115  5e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2207  ABC transporter related  36.55 
 
 
549 aa  114  6e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.252505  normal  0.194829 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3603  ABC transporter related protein  36.07 
 
 
518 aa  114  6e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.449109  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1008  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  35.68 
 
 
282 aa  114  6.9999999999999995e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.462134  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3572  ABC transporter, ATP-binding protein  34.72 
 
 
575 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0481418 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0950  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  35.68 
 
 
276 aa  114  6.9999999999999995e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2718  ABC transporter related  33.18 
 
 
249 aa  114  7.999999999999999e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4241  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, C-terminal  36.45 
 
 
322 aa  114  8.999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.28364  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1292  ABC transporter related  35.68 
 
 
282 aa  114  8.999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0488564  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5784  ABC transporter related  34.96 
 
 
299 aa  114  8.999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0699295 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2576  ABC transporter related protein  35.03 
 
 
601 aa  113  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0615694 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08340  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  36.08 
 
 
264 aa  114  1.0000000000000001e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.571186  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2072  ABC transporter related  33.86 
 
 
467 aa  114  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.873816  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3261  ABC transporter related protein  36.41 
 
 
554 aa  114  1.0000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2386  peptide ABC transporter  33.03 
 
 
536 aa  113  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6688  ABC transporter related  36.87 
 
 
299 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.157267  normal  0.337888 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6641  ABC transporter related  34.34 
 
 
542 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.274459 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4026  ABC transporter related  34.63 
 
 
557 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3533  ABC transporter related  33.33 
 
 
255 aa  114  1.0000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.815881 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0426  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  37.39 
 
 
321 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3018  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  36.07 
 
 
335 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0242657  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4564  dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  35.98 
 
 
322 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0403  ABC transporter related  37.37 
 
 
550 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4454  ABC transporter related  35.22 
 
 
619 aa  113  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00023315 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0810  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  34.58 
 
 
322 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.342361 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1147  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATPase subunit  35.58 
 
 
336 aa  112  2.0000000000000002e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.314064 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4008  ABC transporter related  35.16 
 
 
255 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0857  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  36.84 
 
 
558 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1252  ABC transporter related  33.8 
 
 
251 aa  112  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1555  ABC transporter related protein  34.52 
 
 
593 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.148644  normal  0.0147945 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5657  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  34.8 
 
 
333 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.991753 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0838  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  35.75 
 
 
324 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0346  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  35.48 
 
 
572 aa  112  3e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34890  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  35.38 
 
 
289 aa  112  3e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5169  ABC transporter related  35.44 
 
 
247 aa  112  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.309766 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0143  peptide/opine/nickel ABC transporter ATPase  32.99 
 
 
579 aa  112  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.18152 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0402  ABC transporter related  35.94 
 
 
374 aa  112  3e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0245246  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0562  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  34.83 
 
 
323 aa  112  3e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00149525 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2322  ABC transporter related  35.53 
 
 
255 aa  112  4.0000000000000004e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.888289 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5119  ABC transporter ATP-binding protein  36.2 
 
 
324 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58470  ABC transporter ATP-binding protein  36.2 
 
 
324 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.868458  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0734  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  34.45 
 
 
251 aa  112  5e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1340  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like protein  33.33 
 
 
342 aa  111  5e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.801873 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00740  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  31.51 
 
 
578 aa  111  5e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1182  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  35 
 
 
333 aa  112  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.637692  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0463  ABC transporter related  31.07 
 
 
249 aa  111  6e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.724781  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1883  ABC transporter related  34.48 
 
 
258 aa  111  6e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.179514  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2456  ABC transporter related  34.34 
 
 
566 aa  111  6e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2116  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  34.1 
 
 
553 aa  111  7.000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.498075  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12490  Oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding component  34.67 
 
 
322 aa  111  7.000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0971633  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4299  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  34.39 
 
 
322 aa  111  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.566558  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0845  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  34.69 
 
 
358 aa  111  7.000000000000001e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.692378  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3599  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  33.83 
 
 
327 aa  111  7.000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5788  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  36.56 
 
 
328 aa  111  7.000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00267087 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0045  hypothetical protein  33.82 
 
 
207 aa  111  7.000000000000001e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.372013 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1864  ABC transporter related  35.96 
 
 
205 aa  111  8.000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2072  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  37.37 
 
 
348 aa  111  8.000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0237279  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4427  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  31.17 
 
 
649 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0985  ABC transporter related protein  35.35 
 
 
607 aa  111  8.000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.674675  normal  0.337897 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3965  ABC transporter related  36.36 
 
 
251 aa  111  8.000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.27436  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0751  ABC transporter related  35.18 
 
 
557 aa  111  8.000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3812  ABC transporter related  33.16 
 
 
462 aa  110  9e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>