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for query gene Sde_3490 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3490  EmrB/QacA family drug resistance transporter  100 
 
 		 521 aa  1053    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0312462 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2290  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.49 
 
 		 529 aa  322  8e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.192526  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2378  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.49 
 
 		 529 aa  321  1.9999999999999998e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007760  Adeh_1573  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.78 
 
 		 529 aa  318  2e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2706  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.8 
 
 		 537 aa  275  2.0000000000000002e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.86 
 
 		 521 aa  271  2.9999999999999997e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1604  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.09 
 
 		 515 aa  268  2e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1480  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.96 
 
 		 517 aa  261  3e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.764278  n/a   
 
 
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NC_013061  Phep_4262  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.72 
 
 		 515 aa  260  5.0000000000000005e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011146  Gbem_2631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.18 
 
 		 515 aa  258  2e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.383083  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0557  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.54 
 
 		 526 aa  256  1.0000000000000001e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.362761  normal  1 
 
 
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NC_009441  Fjoh_4904  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.16 
 
 		 529 aa  253  8.000000000000001e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2635  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.12 
 
 		 520 aa  252  1e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.723891  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1374  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.56 
 
 		 517 aa  247  3e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.511847  hitchhiker  0.000280107 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3094  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.96 
 
 		 532 aa  247  3e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2019  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.69 
 
 		 524 aa  245  1.9999999999999999e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010508  Bcenmc03_0066  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.39 
 
 		 520 aa  242  1e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0048  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.35 
 
 		 520 aa  242  1e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.39 
 
 		 520 aa  242  1e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.834829  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0047  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.39 
 
 		 520 aa  242  1e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.843987  n/a   
 
 
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NC_010551  BamMC406_0046  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.77 
 
 		 520 aa  241  2e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008321  Shewmr4_2099  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.4 
 
 		 527 aa  241  2e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.710397 
 
 
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NC_008390  Bamb_0037  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.77 
 
 		 520 aa  241  2e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2224  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.68 
 
 		 526 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.264069  normal  0.72348 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5331  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.95 
 
 		 525 aa  240  4e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.797565 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3951  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.25 
 
 		 520 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.909778  normal  1 
 
 
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NC_007510  Bcep18194_A3229  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.66 
 
 		 520 aa  239  9e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.179546 
 
 
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NC_008322  Shewmr7_1875  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.4 
 
 		 527 aa  239  9e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.994657 
 
 
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NC_008639  Cpha266_0093  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.78 
 
 		 523 aa  239  1e-61  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013422  Hneap_0659  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.54 
 
 		 517 aa  237  3e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.372094  n/a   
 
 
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NC_009654  Mmwyl1_0098  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.82 
 
 		 508 aa  237  4e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.700736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0068  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.66 
 
 		 528 aa  237  5.0000000000000005e-61  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007951  Bxe_A4486  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  28.89 
 
 		 520 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000152739  hitchhiker  0.000119733 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3317  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.22 
 
 		 526 aa  232  1e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.135478 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3092  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.88 
 
 		 506 aa  231  2e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1309  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.72 
 
 		 528 aa  231  3e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.576525 
 
 
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NC_007651  BTH_I0022  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.11 
 
 		 520 aa  229  9e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.171163  n/a   
 
 
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NC_007434  BURPS1710b_0235  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.96 
 
 		 520 aa  229  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009074  BURPS668_0023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.96 
 
 		 520 aa  228  1e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009076  BURPS1106A_0023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.96 
 
 		 520 aa  229  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.636069  n/a   
 
 
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NC_008785  BMASAVP1_A3503  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.96 
 
 		 520 aa  228  2e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2770  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.96 
 
 		 520 aa  228  2e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009441  Fjoh_3377  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.11 
 
 		 516 aa  226  6e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008009  Acid345_1476  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.77 
 
 		 530 aa  226  1e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007514  Cag_0039  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.73 
 
 		 537 aa  223  4.9999999999999996e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.677272  n/a   
 
 
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NC_013132  Cpin_5006  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.06 
 
 		 513 aa  223  6e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.328138  hitchhiker  0.00378398 
 
 
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NC_013173  Dbac_2981  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.5 
 
 		 511 aa  223  7e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011060  Ppha_0063  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.81 
 
 		 539 aa  222  9.999999999999999e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009436  Ent638_3164  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.36 
 
 		 515 aa  223  9.999999999999999e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009427  Saro_3792  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.8 
 
 		 509 aa  222  1.9999999999999999e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010117  COXBURSA331_A1151  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  28.76 
 
 		 526 aa  221  3e-56  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009727  CBUD_0865  multidrug resistance protein B  28.12 
 
 		 526 aa  221  3.9999999999999997e-56  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013216  Dtox_2326  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.75 
 
 		 579 aa  220  5e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000685947  hitchhiker  0.0026086 
 
 
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NC_009708  YpsIP31758_3202  multidrug resistance protein B  30.53 
 
 		 511 aa  220  6e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010465  YPK_3339  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.53 
 
 		 511 aa  220  6e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010159  YpAngola_A3461  multidrug resistance protein B  30.53 
 
 		 511 aa  220  6e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.611803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3742  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.12 
 
 		 544 aa  220  6e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0155097  normal  0.299705 
 
 
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NC_011769  DvMF_1099  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31 
 
 		 519 aa  219  7.999999999999999e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.051717 
 
 
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NC_013730  Slin_2690  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.07 
 
 		 519 aa  219  1e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.558216  normal  0.47793 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.07 
 
 		 514 aa  218  1e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2689  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.93 
 
 		 511 aa  219  1e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0761069  normal  1 
 
 
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NC_007512  Plut_0054  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.31 
 
 		 539 aa  218  2.9999999999999998e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007973  Rmet_1624  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.12 
 
 		 532 aa  217  2.9999999999999998e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.594249  normal  1 
 
 
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NC_011080  SNSL254_A3015  multidrug resistance protein B  29.55 
 
 		 512 aa  216  7e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.551844  hitchhiker  0.000631147 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4411  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.47 
 
 		 537 aa  216  8e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011083  SeHA_C2998  multidrug resistance protein B  29.32 
 
 		 512 aa  216  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.958299  hitchhiker  0.000766816 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2963  multidrug resistance protein B  29.32 
 
 		 512 aa  216  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00759012 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1842  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.29 
 
 		 516 aa  215  1.9999999999999998e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2932  multidrug resistance protein B  29.57 
 
 		 512 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.576129  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2184  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  28.29 
 
 		 514 aa  215  1.9999999999999998e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.208618  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2221  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.43 
 
 		 511 aa  214  2.9999999999999995e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0708866 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1607  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.75 
 
 		 535 aa  214  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.798645  hitchhiker  0.000105098 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1290  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.2 
 
 		 512 aa  212  1e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010498  EcSMS35_2517  multidrug resistance protein Y  28.2 
 
 		 512 aa  212  1e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007650  BTH_II1077  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.07 
 
 		 523 aa  212  1e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0476678  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1879  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.07 
 
 		 523 aa  212  1e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000219002  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1302  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.2 
 
 		 512 aa  212  1e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3744  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.32 
 
 		 511 aa  212  1e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.171868 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2653  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  28.2 
 
 		 512 aa  212  1e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1797  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  29.67 
 
 		 503 aa  211  2e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02541  multidrug efflux system protein  28.34 
 
 		 512 aa  211  2e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.812517  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0998  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.34 
 
 		 512 aa  211  2e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.614852  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2822  multidrug resistance protein B  28.34 
 
 		 512 aa  211  2e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.292864  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3331  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.23 
 
 		 511 aa  212  2e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0816524  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2969  multidrug resistance protein B  28.34 
 
 		 512 aa  211  2e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.116055  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0857  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.74 
 
 		 510 aa  212  2e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02506  hypothetical protein  28.34 
 
 		 512 aa  211  2e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.781266  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2736  multidrug resistance protein Y  28 
 
 		 512 aa  211  2e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.416223  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1474  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.67 
 
 		 510 aa  211  2e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.942704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.34 
 
 		 512 aa  211  2e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0123748 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3931  multidrug resistance protein B  28.34 
 
 		 512 aa  211  2e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.168353  normal  0.641954 
 
 
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NC_010498  EcSMS35_2808  multidrug resistance protein B  28.34 
 
 		 512 aa  211  3e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.001171  hitchhiker  0.00961991 
 
 
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NC_010512  Bcenmc03_6155  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30 
 
 		 530 aa  210  5e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.963451  normal  0.19124 
 
 
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NC_013421  Pecwa_3487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.49 
 
 		 511 aa  210  6e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008060  Bcen_1282  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30 
 
 		 530 aa  210  6e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.139522  n/a   
 
 
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NC_008544  Bcen2424_6549  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30 
 
 		 530 aa  210  6e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.984668  normal  1 
 
 
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NC_010581  Bind_2025  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.71 
 
 		 526 aa  209  8e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011312  VSAL_I2017  MFS transporter  26.95 
 
 		 534 aa  209  9e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.775296  n/a   
 
 
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NC_007435  BURPS1710b_A0372  multidrug resistance protein  31.68 
 
 		 528 aa  209  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00361578  n/a   
 
 
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NC_007435  BURPS1710b_A2096  multidrug resistance protein  31.68 
 
 		 528 aa  209  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000633213  n/a   
 
 
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