128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2498 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2498  tryptophan halogenase, putative  100 
 
 		 501 aa  1047    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2143  tryptophan halogenase  47 
 
 		 512 aa  486  1e-136  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0261967  normal  0.0242357 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2724  tryptophan halogenase  47.69 
 
 		 510 aa  480  1e-134  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.262395  normal  0.0424923 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2828  tryptophan halogenase  48.08 
 
 		 498 aa  466  9.999999999999999e-131  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000300055  hitchhiker  0.0040734 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3937  tryptophan halogenase  46.26 
 
 		 502 aa  464  1e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.792717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1290  tryptophan halogenase  51.12 
 
 		 503 aa  464  1e-129  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0275906 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1114  tryptophan halogenase  46.57 
 
 		 502 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.650107  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1882  tryptophan halogenase  46.36 
 
 		 501 aa  455  1e-127  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0761286  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1866  tryptophan halogenase  46.36 
 
 		 501 aa  457  1e-127  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3700  putative tryptophan halogenase  47.4 
 
 		 494 aa  454  1.0000000000000001e-126  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3938  tryptophan halogenase  45.18 
 
 		 505 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2138  tryptophan halogenase  46.06 
 
 		 501 aa  453  1.0000000000000001e-126  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.903949  normal  0.0562186 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3734  putative tryptophan halogenase  45.29 
 
 		 496 aa  449  1e-125  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1104  hypothetical protein  47.27 
 
 		 740 aa  450  1e-125  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.181023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0740  tryptophan halogenase  46.28 
 
 		 505 aa  451  1e-125  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.726405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4289  tryptophan halogenase  47.27 
 
 		 492 aa  449  1e-125  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.737452  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1096  tryptophan halogenase, putative  46.95 
 
 		 498 aa  446  1.0000000000000001e-124  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000328239  normal  0.607723 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03613  tryptophan halogenase  47.29 
 
 		 509 aa  447  1.0000000000000001e-124  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3277  tryptophan halogenase  47.97 
 
 		 510 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2721  tryptophan halogenase  43.17 
 
 		 507 aa  447  1.0000000000000001e-124  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0000284489  normal  0.0465531 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2734  tryptophan halogenase  46.37 
 
 		 504 aa  447  1.0000000000000001e-124  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.816599 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1140  tryptophan halogenase  44.35 
 
 		 500 aa  448  1.0000000000000001e-124  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1842  tryptophan halogenase  46.87 
 
 		 505 aa  447  1.0000000000000001e-124  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00202997  hitchhiker  0.000756616 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3936  tryptophan halogenase  42.83 
 
 		 511 aa  442  1e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3228  tryptophan halogenase  45.78 
 
 		 511 aa  442  1e-123  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2030  tryptophan halogenase  45.36 
 
 		 497 aa  443  1e-123  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1309  tryptophan halogenase  44.42 
 
 		 495 aa  443  1e-123  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1121  tryptophan halogenase  44.69 
 
 		 503 aa  442  1e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1176  tryptophan halogenase  44.9 
 
 		 503 aa  444  1e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3181  tryptophan halogenase  44.9 
 
 		 503 aa  444  1e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.025127 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1209  tryptophan halogenase  44.9 
 
 		 503 aa  445  1e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.312484  normal  0.925152 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2733  tryptophan halogenase  43.67 
 
 		 505 aa  441  9.999999999999999e-123  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2208  tryptophan halogenase  44.38 
 
 		 502 aa  433  1e-120  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0422503  hitchhiker  0.00145511 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1839  tryptophan halogenase  44.27 
 
 		 501 aa  432  1e-120  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.703806  hitchhiker  0.00201458 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1853  tryptophan halogenase  45.75 
 
 		 497 aa  431  1e-119  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.930503 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2144  tryptophan halogenase  42.54 
 
 		 504 aa  431  1e-119  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0060883  normal  0.0489946 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2064  tryptophan halogenase  43.2 
 
 		 500 aa  425  1e-118  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0180513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0918  tryptophan halogenase  43.44 
 
 		 503 aa  422  1e-117  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1840  tryptophan halogenase  43.15 
 
 		 506 aa  420  1e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.105646  hitchhiker  0.00205784 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2723  tryptophan halogenase  41.58 
 
 		 509 aa  417  9.999999999999999e-116  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.189353  normal  0.019057 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2037  tryptophan halogenase  44.31 
 
 		 499 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.112783  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3278  tryptophan halogenase  46.02 
 
 		 518 aa  418  9.999999999999999e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.943732 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0992  putative tryptophan halogenase  43.18 
 
 		 496 aa  414  1e-114  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.259329  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01880  putative tryptophan halogenase  42.25 
 
 		 506 aa  414  1e-114  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.198232  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1401  IspG protein  44.04 
 
 		 496 aa  413  1e-114  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041365 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2301  tryptophan halogenase  43.71 
 
 		 499 aa  413  1e-114  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.315145  normal  0.236324 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1786  tryptophan halogenase  43.31 
 
 		 507 aa  415  1e-114  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2084  tryptophan halogenase  43.71 
 
 		 499 aa  411  1e-113  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4092  tryptophan halogenase  44.47 
 
 		 497 aa  410  1e-113  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.683477 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1607  tryptophan halogenase  41.72 
 
 		 505 aa  406  1.0000000000000001e-112  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2807  tryptophan halogenase, putative  41.78 
 
 		 503 aa  406  1.0000000000000001e-112  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000313891 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1889  tryptophan halogenase  41.9 
 
 		 504 aa  394  1e-108  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.140819  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1094  allophanate hydrolase subunit 2  41.09 
 
 		 515 aa  394  1e-108  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.631655  normal  0.20774 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02202  tryptophan halogenase  42.94 
 
 		 497 aa  393  1e-108  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02802  tryptophan halogenase  41.87 
 
 		 523 aa  390  1e-107  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0182  tryptophan halogenase  44.67 
 
 		 502 aa  382  1e-105  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.736989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3817  tryptophan halogenase  40.89 
 
 		 497 aa  365  1e-100  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.270075  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0807  tryptophan halogenase  36.23 
 
 		 499 aa  323  3e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.466418  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0588  response regulator receiver domain-containing protein  33.19 
 
 		 502 aa  268  2e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.917971  decreased coverage  0.00918466 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0803  tryptophan halogenase  34.18 
 
 		 506 aa  260  3e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2885  tryptophan halogenase PrnA  31.7 
 
 		 538 aa  259  8e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2733  tryptophan halogenase PrnA  31.7 
 
 		 538 aa  258  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1436  tryptophan halogenase  36.56 
 
 		 499 aa  258  2e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.333804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1115  tryptophan halogenase  31.7 
 
 		 538 aa  257  4e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1139  tryptophan halogenase  34.62 
 
 		 508 aa  255  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.340428  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1079  tryptophan halogenase  34.43 
 
 		 508 aa  254  3e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.488063  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1409  tryptophan halogenase  35.61 
 
 		 501 aa  253  6e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2945  tryptophan halogenase  36.19 
 
 		 501 aa  253  6e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1939  tryptophan halogenase  34.48 
 
 		 517 aa  252  1e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6983  tryptophan halogenase  31.52 
 
 		 538 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.448897  normal  0.89609 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1400  tryptophan halogenase  35.44 
 
 		 503 aa  251  2e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.879236  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3216  tryptophan halogenase  34.24 
 
 		 505 aa  251  2e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.64533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0297  tryptophan halogenase  33.66 
 
 		 532 aa  251  2e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.427874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1113  tryptophan halogenase  37.04 
 
 		 508 aa  249  1e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6706  tryptophan halogenase  31.66 
 
 		 537 aa  248  2e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.810576 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5264  tryptophan halogenase  31.09 
 
 		 538 aa  248  2e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2406  tryptophan halogenase  34.5 
 
 		 514 aa  247  4e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.699378  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4005  formylmethionine deformylase  33.12 
 
 		 498 aa  246  8e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.182317 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4726  tryptophan halogenase  30.71 
 
 		 538 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1209  tryptophan halogenase  33.27 
 
 		 508 aa  243  9e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.311625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1841  tryptophan halogenase  31.17 
 
 		 481 aa  242  1e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.132292  hitchhiker  0.00068545 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1098  tryptophan halogenase  37.82 
 
 		 508 aa  241  2e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1365  tryptophan halogenase  31.21 
 
 		 529 aa  239  5.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0939  tryptophan halogenase  35.1 
 
 		 507 aa  239  5.999999999999999e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.220698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1395  tryptophan halogenase  31.21 
 
 		 529 aa  239  1e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3685  tryptophan halogenase  34.89 
 
 		 527 aa  238  2e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1604  tryptophan halogenase  34.29 
 
 		 513 aa  237  3e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2546  tryptophan halogenase  31.27 
 
 		 517 aa  237  5.0000000000000005e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0296  tryptophan halogenase  32.88 
 
 		 524 aa  233  5e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.628963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3561  tryptophan halogenase  32.68 
 
 		 522 aa  233  5e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2391  tryptophan halogenase, putative  31.78 
 
 		 526 aa  233  6e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000100477 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0915  tryptophan halogenase  34.75 
 
 		 505 aa  233  6e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1262  tryptophan halogenase, putative  31.66 
 
 		 524 aa  232  9e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.69859  hitchhiker  0.00000259242 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1312  tryptophan halogenase  31.02 
 
 		 525 aa  232  1e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2707  tryptophan halogenase  32.18 
 
 		 515 aa  230  4e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1964  tryptophan halogenase  34.02 
 
 		 531 aa  230  4e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03900  putative tryptophan halogenase  31.6 
 
 		 522 aa  230  5e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1212  tryptophan halogenase  31.58 
 
 		 543 aa  228  1e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.381407 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3699  putative tryptophan halogenase  32.85 
 
 		 514 aa  228  2e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1306  tryptophan halogenase  33.88 
 
 		 507 aa  227  4e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.85539 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>