More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0589 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0589  glycosidases-like  100 
 
 		 705 aa  1451    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.361866  normal  0.0110561 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0549  alpha amylase catalytic region  45.4 
 
 		 537 aa  446  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0553  alpha amylase catalytic region  45 
 
 		 537 aa  443  1e-123  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4138  alpha amylase catalytic region  44.49 
 
 		 541 aa  438  1e-121  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0433199 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0520  Alpha amylase  44.97 
 
 		 537 aa  431  1e-119  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4246  alpha amylase catalytic region  37.07 
 
 		 593 aa  281  3e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.286976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0014  alpha amylase, catalytic region  37.39 
 
 		 595 aa  273  6e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.328102 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4288  alpha amylase catalytic region  34.72 
 
 		 588 aa  252  2e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.240212  normal  0.162413 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0356  alpha amylase, catalytic region  32.04 
 
 		 564 aa  246  9.999999999999999e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.171609  normal  0.628947 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4258  alpha amylase catalytic region  32.48 
 
 		 541 aa  240  6.999999999999999e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.256991  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4127  Alpha amylase, catalytic region  32.28 
 
 		 545 aa  239  1e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4280  alpha amylase catalytic region  32.49 
 
 		 541 aa  238  2e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10330  trehalose synthase  30.6 
 
 		 588 aa  237  6e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.163589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4096  trehalose synthase  30.92 
 
 		 1139 aa  231  4e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.981031  normal  0.0225037 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3679  trehalose synthase-like  32.46 
 
 		 574 aa  230  6e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4101  trehalose synthase  30.26 
 
 		 610 aa  229  1e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1728  trehalose synthase  30.23 
 
 		 585 aa  229  1e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2418  trehalose synthase  30.78 
 
 		 591 aa  229  2e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.482185  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0835  alpha amylase catalytic region  30.96 
 
 		 549 aa  228  3e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1096  trehalose synthase  30.22 
 
 		 587 aa  227  6e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00646319 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03668  alpha-amylase family protein  30.67 
 
 		 1101 aa  226  1e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3205  alpha amylase catalytic region  34.36 
 
 		 583 aa  224  3e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00323479  normal  0.589076 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1051  trehalose synthase  31.64 
 
 		 572 aa  225  3e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.828904  normal  0.512672 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2014  trehalose synthase  30.77 
 
 		 551 aa  224  6e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0107  alpha amylase catalytic region  30.77 
 
 		 543 aa  222  1.9999999999999999e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0636933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0678  trehalose synthase  31.03 
 
 		 556 aa  222  1.9999999999999999e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.026654  normal  0.804097 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3310  alpha amylase, catalytic region  30.34 
 
 		 575 aa  221  3.9999999999999997e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1808  trehalose synthase  30.57 
 
 		 571 aa  220  5e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0813826  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3002  trehalose synthase-like  31.15 
 
 		 572 aa  220  7e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.205935  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3202  trehalose synthase  31.15 
 
 		 572 aa  219  1e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169478  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4167  alpha amylase catalytic region  29.18 
 
 		 574 aa  219  1e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.718668  hitchhiker  0.00459901 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3101  trehalose synthase  31.15 
 
 		 553 aa  219  1e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.729849  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0874  trehalose synthase  30.71 
 
 		 591 aa  219  2e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.847656  normal  0.214789 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0867  alpha amylase catalytic region  31.24 
 
 		 558 aa  219  2e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1070  alpha-glucosidase  29.69 
 
 		 551 aa  218  2.9999999999999998e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.297332  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1630  trehalose synthase  30.72 
 
 		 562 aa  218  2.9999999999999998e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.325402 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8141  trehalose synthase  30.38 
 
 		 567 aa  218  2.9999999999999998e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1784  trehalose synthase  30.86 
 
 		 1102 aa  218  2.9999999999999998e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2859  trehalose synthase  30.38 
 
 		 577 aa  218  2.9999999999999998e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2968  trehalose synthase  30.51 
 
 		 553 aa  218  4e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05183  hypothetical protein  29.74 
 
 		 1160 aa  217  5.9999999999999996e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0584538  normal  0.396388 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6087  trehalose synthase  30.68 
 
 		 1137 aa  217  7e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0830562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1251  Alpha amylase, catalytic region  30.02 
 
 		 561 aa  217  7e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1331  trehalose synthase-like  30.68 
 
 		 1137 aa  217  7e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1336  trehalose synthase  30.1 
 
 		 567 aa  217  7e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0738  trehalose synthase  29.26 
 
 		 598 aa  217  7e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.197847  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6498  trehalose synthase  30.68 
 
 		 1137 aa  217  7e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.388171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6807  trehalose synthase  29.53 
 
 		 1088 aa  216  9e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267695  normal  0.5618 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14740  alpha amylase  30.62 
 
 		 515 aa  216  9.999999999999999e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0597647  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09530  trehalose synthase  30.63 
 
 		 616 aa  216  9.999999999999999e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0126858  normal  0.324704 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3687  alpha amylase, catalytic region  31.27 
 
 		 540 aa  216  9.999999999999999e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7033  glycoside hydrolase family protein  29.7 
 
 		 1138 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.160404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6073  trehalose synthase  30.43 
 
 		 604 aa  216  1.9999999999999998e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.887339  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5528  alpha amylase catalytic region  31.87 
 
 		 545 aa  215  1.9999999999999998e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.283745  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6321  trehalose synthase  30.14 
 
 		 1137 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0765728  normal  0.0985799 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5591  trehalose synthase  30.14 
 
 		 1137 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00664495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0862  trehalose synthase  28.47 
 
 		 598 aa  214  3.9999999999999995e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2353  alpha amylase domain-containing protein  29.63 
 
 		 1110 aa  214  3.9999999999999995e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.544253  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0672  alpha amylase, catalytic region  29.41 
 
 		 533 aa  214  3.9999999999999995e-54  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.227468 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0315  trehalose synthase-like protein  29.58 
 
 		 1121 aa  214  3.9999999999999995e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5490  trehalose synthase  29.92 
 
 		 1136 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.984156  hitchhiker  0.000243022 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3077  alpha amylase catalytic region  31.37 
 
 		 535 aa  214  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3584  trehalose synthase  31.17 
 
 		 601 aa  214  4.9999999999999996e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1296  trehalose synthase  28.99 
 
 		 583 aa  214  4.9999999999999996e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.13842  normal  0.98704 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0921  alpha amylase  30.6 
 
 		 568 aa  214  4.9999999999999996e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0194055 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1675  alpha amylase catalytic region  29.8 
 
 		 499 aa  214  4.9999999999999996e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5268  alpha amylase catalytic region  30.98 
 
 		 540 aa  213  7e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2022  trehalose synthase  30.02 
 
 		 1142 aa  213  7.999999999999999e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113086 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4164  trehalose synthase  29.48 
 
 		 1100 aa  213  9e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6822  trehalose synthase  30.69 
 
 		 1154 aa  213  1e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.615207 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7546  trehalose synthase  29.56 
 
 		 1088 aa  213  1e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.455626  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1816  trehalose synthase  30.06 
 
 		 1105 aa  213  1e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.482452 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2862  putative trehalose synthase  29.77 
 
 		 1154 aa  213  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0821  alpha amylase family protein  29.62 
 
 		 1131 aa  212  2e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.145364  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1106  trehalose synthase  29.48 
 
 		 1123 aa  212  2e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1404  Alpha amylase, catalytic region  29.74 
 
 		 1100 aa  212  2e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1340  trehalose synthase/putative maltokinase  30.1 
 
 		 1131 aa  212  2e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2160  trehalose synthase-like  29.84 
 
 		 1112 aa  212  2e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4051  trehalose synthase  28.88 
 
 		 1164 aa  212  2e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0534  trehalose synthase/putative maltokinase  30.1 
 
 		 1131 aa  212  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2828  trehalose synthase  29.67 
 
 		 548 aa  212  2e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1544  alpha-glucosidase  29.62 
 
 		 1131 aa  212  2e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0621  trehalose synthase/putative maltokinase  30.1 
 
 		 1131 aa  212  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1567  trehalose synthase/putative maltokinase  30.1 
 
 		 1131 aa  212  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3938  trehalose synthase  28.88 
 
 		 1164 aa  212  2e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.278548 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0358  alpha amylase catalytic region  30.26 
 
 		 550 aa  211  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.404275 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0352  alpha amylase catalytic region  29.61 
 
 		 554 aa  211  3e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00857994  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0584  trehalose synthase  30.14 
 
 		 606 aa  211  4e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1110  trehalose synthase  29.1 
 
 		 1102 aa  211  4e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.531245 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4059  trehalose synthase  30.17 
 
 		 1106 aa  211  5e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0248  trehalose synthase  29.76 
 
 		 682 aa  211  5e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1172  alpha amylase domain-containing protein  30.18 
 
 		 1095 aa  211  5e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2446  putative trehalose synthase  29.69 
 
 		 1102 aa  211  5e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.500894  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1784  trehalose synthase  30.17 
 
 		 1106 aa  211  5e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0687531  normal  0.178352 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3658  trehalose synthase  30.17 
 
 		 1106 aa  211  5e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.100309  hitchhiker  0.000190821 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1980  trehalose synthase  30.2 
 
 		 1109 aa  210  7e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0525025  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3679  trehalose synthase-like  29.75 
 
 		 1099 aa  210  8e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2294  trehalose synthase  29.28 
 
 		 1100 aa  210  8e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00139705  decreased coverage  0.000000883241 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4392  trehalose synthase  29.35 
 
 		 1152 aa  210  9e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.21351 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2303  alpha amylase catalytic region  32.74 
 
 		 448 aa  209  1e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.190789 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>