205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_2854 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_2854  hypothetical protein  100 
 
 
244 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.762122  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1505  protein of unknown function UPF0066  99.18 
 
 
244 aa  501  1e-141  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.410529  normal  0.659974 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3000  hypothetical protein  99.18 
 
 
244 aa  501  1e-141  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2871  hypothetical protein  99.18 
 
 
244 aa  503  1e-141  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.867889  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2516  hypothetical protein  90.98 
 
 
244 aa  471  1e-132  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.507921  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1347  hypothetical protein  90.16 
 
 
244 aa  463  1e-129  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0192591 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3151  hypothetical protein  89.75 
 
 
244 aa  456  1e-127  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1412  hypothetical protein  88.93 
 
 
244 aa  456  1e-127  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0670544 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1400  hypothetical protein  89.34 
 
 
244 aa  457  1e-127  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.381665 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2751  hypothetical protein  79.17 
 
 
262 aa  392  1e-108  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0235309  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2542  hypothetical protein  75.21 
 
 
265 aa  379  1e-104  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00464055  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2860  hypothetical protein  73.88 
 
 
256 aa  366  1e-100  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.486739  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1164  hypothetical protein  74.9 
 
 
245 aa  366  1e-100  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1440  hypothetical protein  73.55 
 
 
241 aa  356  9.999999999999999e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3241  hypothetical protein  71.07 
 
 
240 aa  347  8e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.488613  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2589  hypothetical protein  68.88 
 
 
245 aa  340  1e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2841  hypothetical protein  55.76 
 
 
248 aa  243  1.9999999999999999e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03251  hypothetical protein  53.36 
 
 
231 aa  240  2e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0891  hypothetical protein  53.3 
 
 
232 aa  239  2e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.150441  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0401  hypothetical protein  51.49 
 
 
231 aa  237  1e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000112089  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002726  hypothetical protein  53.18 
 
 
234 aa  236  2e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0430932  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1277  hypothetical protein  49.55 
 
 
251 aa  231  7.000000000000001e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.241962  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00194  hypothetical protein  50.23 
 
 
235 aa  231  8.000000000000001e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.043388  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00193  hypothetical protein  50.23 
 
 
235 aa  231  8.000000000000001e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0320479  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3407  protein of unknown function UPF0066  50.23 
 
 
235 aa  230  1e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000511594  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0202  hypothetical protein  50.23 
 
 
235 aa  230  1e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000993842  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0199  hypothetical protein  50.23 
 
 
235 aa  230  1e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0201514  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0207  hypothetical protein  50.23 
 
 
235 aa  230  1e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.9755  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3464  hypothetical protein  50.23 
 
 
235 aa  230  1e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0230966  normal  0.865335 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0189  hypothetical protein  50.23 
 
 
235 aa  229  3e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0457219  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0206  hypothetical protein  50.23 
 
 
235 aa  229  4e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0519396  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0874  protein of unknown function UPF0066  50.23 
 
 
235 aa  228  6e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0588086  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3503  protein of unknown function UPF0066  47.86 
 
 
238 aa  223  2e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0149186  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3757  hypothetical protein  47.41 
 
 
235 aa  223  3e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000000742092  normal  0.0834525 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0843  protein of unknown function UPF0066  48.48 
 
 
235 aa  223  3e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000863698  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0284  hypothetical protein  49.32 
 
 
235 aa  222  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0219827  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0270  hypothetical protein  49.32 
 
 
246 aa  222  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0768014 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0265  hypothetical protein  49.32 
 
 
246 aa  222  4.9999999999999996e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.485834  normal  0.889458 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0265  hypothetical protein  49.32 
 
 
246 aa  222  4.9999999999999996e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.391481  normal  0.222677 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0281  hypothetical protein  49.32 
 
 
246 aa  222  4.9999999999999996e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.236696 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3346  hypothetical protein  46.19 
 
 
238 aa  221  8e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00404428  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02964  hypothetical protein  50.7 
 
 
239 aa  218  6e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.888246  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3409  hypothetical protein  48.89 
 
 
235 aa  218  7e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0939148  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1092  hypothetical protein  48.89 
 
 
235 aa  218  7e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1039  hypothetical protein  48.89 
 
 
235 aa  217  1e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0011739  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3287  hypothetical protein  51.8 
 
 
238 aa  217  1e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.231288  normal  0.0827717 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0733  hypothetical protein  49.07 
 
 
235 aa  217  2e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0409036  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2362  regulator protein  47.41 
 
 
237 aa  214  8e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1186  hypothetical protein  48.96 
 
 
235 aa  207  9e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.203291 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1742  hypothetical protein  48.42 
 
 
231 aa  202  4e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20260  hypothetical protein  47.96 
 
 
231 aa  202  5e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.675197 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0222  hypothetical protein  45.37 
 
 
240 aa  201  6e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00354115  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1189  hypothetical protein  47.98 
 
 
232 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.7243  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1220  hypothetical protein  47.96 
 
 
230 aa  199  3e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.420343  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4227  hypothetical protein  48.42 
 
 
230 aa  198  5e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.940222 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2686  hypothetical protein  41.52 
 
 
249 aa  199  5e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.468068  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4020  hypothetical protein  46.44 
 
 
231 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0012325 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1705  hypothetical protein  47 
 
 
234 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.19397 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2065  hypothetical protein  45 
 
 
241 aa  195  7e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.587882  normal  0.151601 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2853  hypothetical protein  43.33 
 
 
239 aa  194  8.000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00329387  hitchhiker  0.000000086947 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4023  hypothetical protein  47.75 
 
 
239 aa  192  5e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1388  hypothetical protein  47.96 
 
 
230 aa  191  8e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.767988  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38460  hypothetical protein  44.17 
 
 
240 aa  186  3e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2812  hypothetical protein  48.37 
 
 
251 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2822  heat shock protein DnaJ-like  43.23 
 
 
233 aa  179  2.9999999999999997e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000736424 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1915  hypothetical protein  46.19 
 
 
263 aa  178  8e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000031787  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2344  protein of unknown function UPF0066  41.77 
 
 
231 aa  169  5e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.183412  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0110  protein of unknown function UPF0066  45.89 
 
 
228 aa  165  5e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0888  hypothetical protein  35.77 
 
 
280 aa  161  9e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.346736  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1534  hypothetical protein  37.66 
 
 
280 aa  161  1e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0746722  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2238  protein of unknown function UPF0066  41.58 
 
 
233 aa  154  1e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39681  predicted protein  39.76 
 
 
336 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0134522  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1338  protein of unknown function UPF0066  40.27 
 
 
172 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000553044 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2411  hypothetical protein  40.94 
 
 
182 aa  109  3e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.543009  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2886  protein of unknown function UPF0066  38.26 
 
 
196 aa  107  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3030  protein of unknown function UPF0066  38.93 
 
 
172 aa  105  5e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000046144  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10437  predicted protein  43.45 
 
 
142 aa  103  3e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31759  predicted protein  33.47 
 
 
286 aa  102  5e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.330463  normal  0.0179546 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2646  hypothetical protein  35.8 
 
 
167 aa  94.4  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0989  protein of unknown function UPF0066  42.22 
 
 
164 aa  90.9  2e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000019612  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0337  hypothetical protein  36.36 
 
 
183 aa  90.1  3e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0758106  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0258  hypothetical protein  40.14 
 
 
163 aa  87  2e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2475  protein of unknown function UPF0066  39.26 
 
 
294 aa  85.9  5e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0340  hypothetical protein  36.3 
 
 
145 aa  85.9  6e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.634355  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1018  protein of unknown function UPF0066  36.15 
 
 
171 aa  83.6  0.000000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0552  hypothetical protein  36.76 
 
 
162 aa  83.2  0.000000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1584  protein of unknown function UPF0066  36.73 
 
 
166 aa  82  0.000000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.467198  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1885  hypothetical protein  35.21 
 
 
167 aa  82  0.000000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0470  hypothetical protein  34.87 
 
 
166 aa  81.3  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0817214  normal  0.048877 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0270  hypothetical protein  35.19 
 
 
160 aa  81.6  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.460305  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_002936  DET1613  hypothetical protein  38.94 
 
 
147 aa  80.9  0.00000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2088  hypothetical protein  33.74 
 
 
183 aa  80.9  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000161748  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4082  protein of unknown function UPF0066  34.27 
 
 
166 aa  79.7  0.00000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0362  protein of unknown function UPF0066  33.33 
 
 
155 aa  79.3  0.00000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1889  protein of unknown function UPF0066  31.9 
 
 
164 aa  79  0.00000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1968  hypothetical protein  42.98 
 
 
155 aa  78.6  0.00000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00329257  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2049  hypothetical protein  38.89 
 
 
157 aa  77  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0141829  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1228  protein of unknown function UPF0066  34.46 
 
 
161 aa  77.4  0.0000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2483  protein of unknown function UPF0066  33.33 
 
 
175 aa  77.8  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.279264 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2266  protein of unknown function UPF0066  33.33 
 
 
167 aa  77  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.864742  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>