More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_1736 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_1736  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 201 aa  414  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.544896  normal  0.157452 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1873  short chain dehydrogenase  90.05 
 
 		 201 aa  376  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2619  short chain dehydrogenase  85.07 
 
 		 201 aa  354  3.9999999999999996e-97  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0313  short chain dehydrogenase  43.43 
 
 		 199 aa  157  9e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0297  short chain dehydrogenase  43.43 
 
 		 199 aa  157  9e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4312  short chain dehydrogenase  43.3 
 
 		 199 aa  154  8e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50610  short chain dehydrogenase  42.27 
 
 		 223 aa  153  1e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0391945 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3138  short chain dehydrogenase  40.61 
 
 		 200 aa  152  2e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1238  short chain dehydrogenase  40.61 
 
 		 199 aa  151  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.945039 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05280  short chain dehydrogenase  40.51 
 
 		 200 aa  150  8e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2512  short chain dehydrogenase  41.71 
 
 		 199 aa  149  3e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.296656  normal  0.253878 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3793  short chain dehydrogenase  40.1 
 
 		 207 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4448  short chain dehydrogenase  41 
 
 		 201 aa  145  3e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3670  short chain dehydrogenase  41.62 
 
 		 208 aa  145  3e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4284  short chain dehydrogenase  41.5 
 
 		 201 aa  146  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.206363 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1664  short chain dehydrogenase  37.88 
 
 		 199 aa  145  6e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0657  short chain dehydrogenase  38.78 
 
 		 202 aa  144  1e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.769936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0613  short chain dehydrogenase  40.5 
 
 		 201 aa  144  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0886445 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0927  short chain dehydrogenase  38.19 
 
 		 200 aa  143  1e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.115438  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3331  short chain dehydrogenase  40.2 
 
 		 201 aa  141  5e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0789  short chain dehydrogenase  36.73 
 
 		 205 aa  138  4.999999999999999e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06295  short chain dehydrogenase  37.37 
 
 		 200 aa  137  1e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4883  short chain dehydrogenase  37.69 
 
 		 202 aa  137  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3200  short chain dehydrogenase  35.32 
 
 		 217 aa  136  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3526  short chain dehydrogenase  37.93 
 
 		 233 aa  136  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0150103 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5475  short chain dehydrogenase  37.69 
 
 		 202 aa  135  4e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5387  short chain dehydrogenase  37.69 
 
 		 202 aa  135  4e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.255767 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5629  short chain dehydrogenase  41.33 
 
 		 198 aa  132  3e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.973642 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2493  short chain dehydrogenase  36.22 
 
 		 200 aa  125  5e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1726  short chain dehydrogenase  35.71 
 
 		 200 aa  124  7e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2520  short chain dehydrogenase  36.73 
 
 		 199 aa  120  1.9999999999999998e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0216463  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3613  short chain dehydrogenase  31.5 
 
 		 199 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl362  short chain dehydrogenase  35.03 
 
 		 202 aa  109  3e-23  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  3.68833e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4306  short chain dehydrogenase  30.26 
 
 		 197 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1778  short chain dehydrogenase  36.22 
 
 		 202 aa  103  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6188  short chain dehydrogenase  31.16 
 
 		 198 aa  92.4  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1079  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.49 
 
 		 237 aa  73.2  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.236839  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0802  short chain dehydrogenase  25.44 
 
 		 238 aa  68.6  0.00000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.414553  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2913  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.64 
 
 		 234 aa  65.5  0.0000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.98827 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4643  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.87 
 
 		 274 aa  62.4  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1228  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.74 
 
 		 272 aa  60.5  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.178031  hitchhiker  0.00135629 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4155  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  27.32 
 
 		 243 aa  60.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0471031  normal  0.022218 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06495  oxidoreductase  30.71 
 
 		 222 aa  60.1  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2071  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.24 
 
 		 258 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.70228  normal  0.023925 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4116  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.29 
 
 		 256 aa  58.5  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.165575  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4191  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.29 
 
 		 256 aa  58.5  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4347  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.71 
 
 		 256 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.206497 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0108  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.78 
 
 		 254 aa  55.8  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0592411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.9 
 
 		 244 aa  55.5  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000616439 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3870  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.83 
 
 		 259 aa  55.5  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2087  short chain dehydrogenase  27.59 
 
 		 245 aa  55.5  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.319948  normal  0.613238 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4560  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.97 
 
 		 241 aa  54.3  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.84586  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1106  short chain dehydrogenase  27.12 
 
 		 240 aa  53.1  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.256004  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0211  short chain dehydrogenase  27.12 
 
 		 240 aa  53.1  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0327074  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0953  short chain dehydrogenase  27.12 
 
 		 240 aa  53.1  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0551  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.18 
 
 		 259 aa  53.9  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0259011  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1548  short chain dehydrogenase  27.12 
 
 		 240 aa  53.1  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6298  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.01 
 
 		 271 aa  53.9  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.1246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1020  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  27.98 
 
 		 246 aa  53.1  0.000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0122832  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0336  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.62 
 
 		 248 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3110  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.56 
 
 		 246 aa  53.1  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1701  short chain dehydrogenase  27.12 
 
 		 240 aa  52.8  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.553815  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1880  short chain dehydrogenase  27.12 
 
 		 270 aa  52.8  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0386097  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4098  short chain dehydrogenase  23.39 
 
 		 265 aa  52.4  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.474708 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1727  short chain dehydrogenase  27.12 
 
 		 240 aa  52.8  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.169393  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1110  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  27.38 
 
 		 246 aa  52.4  0.000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0266  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  21.74 
 
 		 264 aa  52  0.000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.537752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1471  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 194 aa  52.4  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000473762 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3603  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.39 
 
 		 249 aa  52  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2533  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.87 
 
 		 243 aa  52  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2324  short chain dehydrogenase  28.07 
 
 		 245 aa  51.6  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1522  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 254 aa  51.6  0.000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0490038  normal  0.520511 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0266  putative short-chain dehydrogenase  27.5 
 
 		 248 aa  52  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06640  short-chain alcohol dehydrogenase like protein  25.25 
 
 		 309 aa  51.6  0.000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2025  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.15 
 
 		 288 aa  51.6  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000209901 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.12 
 
 		 262 aa  51.6  0.000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.469065 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1661  glucose 1-dehydrogenase  24.74 
 
 		 268 aa  51.6  0.000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.218295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2206  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.84 
 
 		 254 aa  51.2  0.000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0824665  hitchhiker  0.00853535 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4238  short chain dehydrogenase  25 
 
 		 268 aa  51.2  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1730  dehydrogenase/reductase oxidoreductase protein  34.91 
 
 		 256 aa  51.2  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5596  short chain dehydrogenase  23.81 
 
 		 265 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.329102 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2524  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  21.9 
 
 		 254 aa  50.8  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.16188  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5613  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.87 
 
 		 288 aa  50.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.207761 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3663  short chain dehydrogenase  23.81 
 
 		 265 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2090  short chain dehydrogenase  27.2 
 
 		 259 aa  51.2  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2299  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25 
 
 		 248 aa  51.2  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.158563 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1370  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.95 
 
 		 271 aa  51.2  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4704  short chain dehydrogenase  23.81 
 
 		 265 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000843868  normal  0.155835 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4750  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.43 
 
 		 288 aa  50.8  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.306467  normal  0.765133 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4264  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.52 
 
 		 252 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.281349  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1331  short chain dehydrogenase  22.81 
 
 		 265 aa  50.1  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4563  short chain dehydrogenase  22.67 
 
 		 265 aa  50.1  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00447639  hitchhiker  0.00143466 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7064  short chain dehydrogenase  25 
 
 		 265 aa  50.1  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.282667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1392  short chain dehydrogenase  26.52 
 
 		 237 aa  50.4  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.663645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5771  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.18 
 
 		 248 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.997672 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.37 
 
 		 247 aa  50.4  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00790972  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1352  short chain dehydrogenase  26.52 
 
 		 204 aa  50.1  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.297804  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1592  short chain dehydrogenase  25.56 
 
 		 236 aa  50.1  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.512946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0977  short chain dehydrogenase  22.81 
 
 		 265 aa  50.1  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.423513  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0314  short chain dehydrogenase  22.81 
 
 		 265 aa  50.1  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.265928  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>