More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E0755 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E0755  putative single stranded DNA-binding protein  100 
 
 		 141 aa  291  2e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0948  single-strand binding protein family  87.23 
 
 		 141 aa  257  5.0000000000000005e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4087  single-strand binding protein  65.97 
 
 		 144 aa  198  1.9999999999999998e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.98984  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1579  single-strand binding protein  64.14 
 
 		 136 aa  182  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.147873  hitchhiker  0.0000409969 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0681  single-strand binding protein family  52.78 
 
 		 131 aa  147  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0494531  decreased coverage  0.0000000451478 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0314  single-strand binding protein  37.37 
 
 		 141 aa  66.2  0.0000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000013308  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2215  single-strand binding protein  32.64 
 
 		 142 aa  65.9  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0332  single-strand binding protein  38.38 
 
 		 141 aa  65.5  0.0000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000125233  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1545  single-strand binding protein  39.29 
 
 		 166 aa  60.5  0.000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00898888  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0422  single-strand binding protein  30.65 
 
 		 140 aa  60.1  0.000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.185373  normal  0.206127 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0559  single-strand binding protein  32.63 
 
 		 171 aa  59.7  0.00000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.401041  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3307  single-strand binding protein  31 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000227913  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2137  single-strand binding protein  28.67 
 
 		 139 aa  58.5  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000567752  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2190  single-strand binding protein  29.84 
 
 		 129 aa  57.8  0.00000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0455  single-strand binding protein  34.31 
 
 		 174 aa  57.8  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00934995  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2929  single-strand binding protein  29.93 
 
 		 156 aa  57.4  0.00000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.564764  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0980  single-strand binding protein  30 
 
 		 136 aa  57  0.00000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3011  single-strand binding protein  24.5 
 
 		 156 aa  57  0.00000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2039  single-strand binding protein  31.52 
 
 		 156 aa  55.8  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0322  single-strand binding protein  31.52 
 
 		 156 aa  55.8  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2076  single-strand binding protein  31.52 
 
 		 156 aa  55.8  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0331  single-strand binding protein  31.52 
 
 		 156 aa  55.8  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23350  single-strand binding protein  31 
 
 		 133 aa  55.1  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000767815  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1124  single-strand binding protein  34.07 
 
 		 156 aa  55.1  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.228328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1729  single-stranded DNA binding protein  28.67 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2539  single-strand binding protein  26.75 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000217555  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0813  single-strand binding protein  32.35 
 
 		 180 aa  54.7  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.307719 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3545  single-strand binding protein  30.17 
 
 		 164 aa  54.7  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1260  single-strand binding protein  28.67 
 
 		 161 aa  53.9  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0616311  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2286  single-strand binding protein  31.37 
 
 		 137 aa  54.3  0.0000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.306746 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2146  single-strand binding protein  31.37 
 
 		 137 aa  54.3  0.0000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.172996  normal  0.155515 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4935  single-strand binding protein  28.08 
 
 		 137 aa  53.5  0.0000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000213626  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4354  single-strand binding protein  26.67 
 
 		 148 aa  53.5  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0414  single-strand binding protein  30 
 
 		 167 aa  53.5  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000719074  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0325  single-strand binding protein  32.63 
 
 		 160 aa  53.1  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0425  single-strand binding protein  30 
 
 		 167 aa  53.5  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000015552  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3832  single-strand binding protein  30 
 
 		 132 aa  53.1  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.381197  n/a   
 
 
-
 
NC_008770  CJJ81176_pVir0014  hypothetical protein  32.32 
 
 		 152 aa  53.5  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2186  single-strand binding protein  28.06 
 
 		 138 aa  53.1  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000035303  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0045  single-stranded DNA-binding protein  26.89 
 
 		 169 aa  52.8  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0674  single-strand binding protein  29.73 
 
 		 136 aa  52.4  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000262978  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2020  single-strand binding protein  33.33 
 
 		 126 aa  52  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00175419  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0774  single-strand binding protein  27.03 
 
 		 160 aa  52  0.000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1019  single-strand binding protein  33.33 
 
 		 176 aa  52  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0415033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0688  single-strand binding protein  31 
 
 		 140 aa  51.2  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.682205  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3416  single-strand binding protein  30 
 
 		 164 aa  51.6  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000139016  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0779  single-strand binding protein  28.57 
 
 		 147 aa  51.6  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3401  single-strand binding protein  26.35 
 
 		 151 aa  51.2  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.413025  normal  0.54881 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3289  single-strand binding protein  29 
 
 		 119 aa  50.8  0.000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2388  single-strand binding protein  31.68 
 
 		 138 aa  50.8  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.875154 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0637  single-strand binding protein  25.18 
 
 		 133 aa  50.4  0.000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000000900407  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4066  single-strand binding protein  32.63 
 
 		 181 aa  50.8  0.000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1527  single-strand binding protein  29.13 
 
 		 152 aa  50.4  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.52347  normal  0.0316845 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3411  single-strand binding protein  31.58 
 
 		 181 aa  50.4  0.000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0856708  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0020  single-strand binding protein  26.72 
 
 		 150 aa  50.1  0.00001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02950  single stranded DNA-binding protein  31.58 
 
 		 165 aa  49.7  0.00001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.0000000248223  hitchhiker  6.12072e-47 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1129  single-stranded DNA-binding protein  27.78 
 
 		 154 aa  49.7  0.00001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0688352  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0056  single-strand binding protein  28.47 
 
 		 142 aa  50.1  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000253861  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2845  single-strand binding protein  26.26 
 
 		 156 aa  48.9  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.101348  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2140  single-strand binding protein  29 
 
 		 160 aa  48.9  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0840686 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2466  single-strand binding protein  26.26 
 
 		 156 aa  48.9  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.34674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4669  single-strand binding protein  28.19 
 
 		 159 aa  49.3  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.309237  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2703  single-strand binding protein  25.83 
 
 		 175 aa  49.7  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2128  single-stranded DNA-binding protein  22.76 
 
 		 141 aa  49.3  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1595  single-strand binding protein  27.08 
 
 		 184 aa  48.9  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11550  single stranded DNA-binding protein  29.05 
 
 		 147 aa  48.5  0.00003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0161241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4963  single-strand binding protein  29.91 
 
 		 166 aa  48.5  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2382  single-stranded DNA-binding protein  28.04 
 
 		 176 aa  48.5  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.226437  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0633  single-stranded DNA-binding protein  26.81 
 
 		 172 aa  48.5  0.00003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000194148  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4966  single-strand binding protein  28.47 
 
 		 137 aa  48.5  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.875066 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1566  single-stranded DNA-binding protein  28.81 
 
 		 163 aa  48.5  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.365454  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3137  single-strand binding protein  28 
 
 		 114 aa  48.5  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.560759  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6613  single-stranded DNA-binding protein  29.59 
 
 		 158 aa  48.5  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4713  single-strand binding protein  29 
 
 		 187 aa  48.5  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0044  single-strand binding protein  33.7 
 
 		 137 aa  48.1  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.139232  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1677  single-strand binding protein  30.11 
 
 		 168 aa  48.1  0.00004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000004529  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1690  single-strand binding protein  23.29 
 
 		 137 aa  48.1  0.00004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1863  single-strand binding protein  27.97 
 
 		 166 aa  48.1  0.00004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.621974 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3728  single-strand binding protein  26.75 
 
 		 167 aa  48.1  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0825596  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2151  single-strand binding protein  23.4 
 
 		 139 aa  47.8  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0255  single-strand binding protein  22.7 
 
 		 139 aa  47.8  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5233  single-strand binding protein/primosomal replication protein n  27.62 
 
 		 108 aa  47.8  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.596941 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01781  single-stranded DNA-binding protein  28.78 
 
 		 128 aa  47.8  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2096  single-strand binding protein  27.72 
 
 		 161 aa  47.8  0.00005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000179273  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0640  single-strand binding protein  29.57 
 
 		 236 aa  47.8  0.00005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.021198  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3665  single-strand binding protein  30.53 
 
 		 180 aa  47.8  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000121761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2915  single-strand binding protein  26.73 
 
 		 148 aa  47.8  0.00005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000223705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0880  single-strand binding protein  28.26 
 
 		 142 aa  47.4  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.717763  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0129  single-strand binding protein  25.16 
 
 		 154 aa  47.4  0.00006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000140231  normal  0.824498 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3753  single-strand binding protein  29.57 
 
 		 234 aa  47.8  0.00006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000011541  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0556  single-strand binding protein  29.57 
 
 		 234 aa  47.8  0.00006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00736875  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0581  single-strand binding protein  29.57 
 
 		 234 aa  47.8  0.00006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00543875  normal  0.0620215 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0587  single-strand binding protein  29.57 
 
 		 236 aa  47.4  0.00006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0173283  normal  0.785333 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2502  single-stranded DNA-binding protein  27.52 
 
 		 166 aa  47.4  0.00006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000142179  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0864  single-strand binding protein  28.26 
 
 		 142 aa  47.4  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2393  single-strand binding protein  25.42 
 
 		 150 aa  47.8  0.00006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000094495  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2184  single-strand binding protein  28.42 
 
 		 160 aa  47.4  0.00006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5600  single-stranded DNA-binding protein  25.15 
 
 		 170 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0046868  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0107  single-strand binding protein  25.16 
 
 		 165 aa  47.4  0.00007  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0655467  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0200  single-strand binding protein  23.4 
 
 		 139 aa  47.4  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>