163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_0948 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_0948  single-strand binding protein family  100 
 
 		 141 aa  290  6e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0755  putative single stranded DNA-binding protein  87.23 
 
 		 141 aa  257  5.0000000000000005e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4087  single-strand binding protein  65.97 
 
 		 144 aa  194  2.0000000000000003e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.98984  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1579  single-strand binding protein  68.28 
 
 		 136 aa  189  1e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.147873  hitchhiker  0.0000409969 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0681  single-strand binding protein family  51.05 
 
 		 131 aa  142  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0494531  decreased coverage  0.0000000451478 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0422  single-strand binding protein  30.65 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.185373  normal  0.206127 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0314  single-strand binding protein  35.35 
 
 		 141 aa  59.3  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000013308  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0559  single-strand binding protein  30.43 
 
 		 171 aa  58.9  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.401041  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0332  single-strand binding protein  36 
 
 		 141 aa  58.9  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000125233  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2190  single-strand binding protein  29.84 
 
 		 129 aa  56.6  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0322  single-strand binding protein  29 
 
 		 156 aa  55.1  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2039  single-strand binding protein  29 
 
 		 156 aa  55.1  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0331  single-strand binding protein  29 
 
 		 156 aa  55.1  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2076  single-strand binding protein  29 
 
 		 156 aa  55.1  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3011  single-strand binding protein  23.18 
 
 		 156 aa  55.1  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4935  single-strand binding protein  27.78 
 
 		 137 aa  54.7  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000213626  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2215  single-strand binding protein  31 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0045  single-stranded DNA-binding protein  26.89 
 
 		 169 aa  53.9  0.0000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3416  single-strand binding protein  30 
 
 		 164 aa  53.5  0.0000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000139016  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2539  single-strand binding protein  26.09 
 
 		 150 aa  53.1  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000217555  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23350  single-strand binding protein  30 
 
 		 133 aa  53.5  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000767815  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0980  single-strand binding protein  26.76 
 
 		 136 aa  52.8  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3307  single-strand binding protein  27 
 
 		 140 aa  52.8  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000227913  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2929  single-strand binding protein  26.39 
 
 		 156 aa  52.4  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.564764  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3545  single-strand binding protein  26.76 
 
 		 164 aa  51.6  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0414  single-strand binding protein  29 
 
 		 167 aa  52  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000719074  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0425  single-strand binding protein  29 
 
 		 167 aa  52  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000015552  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0674  single-strand binding protein  27.88 
 
 		 136 aa  52  0.000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000262978  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2286  single-strand binding protein  30.36 
 
 		 137 aa  51.2  0.000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.306746 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2146  single-strand binding protein  30.36 
 
 		 137 aa  51.2  0.000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.172996  normal  0.155515 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0020  single-strand binding protein  27.59 
 
 		 150 aa  50.4  0.000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1595  single-strand DNA-binding protein  29.47 
 
 		 129 aa  50.4  0.000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000620191  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1545  single-strand binding protein  32.58 
 
 		 166 aa  50.1  0.000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00898888  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3832  single-strand binding protein  31.48 
 
 		 132 aa  50.1  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.381197  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3401  single-strand binding protein  27.03 
 
 		 151 aa  50.1  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.413025  normal  0.54881 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0455  single-strand binding protein  33.65 
 
 		 174 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00934995  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5600  single-stranded DNA-binding protein  23.53 
 
 		 170 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0046868  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0637  single-strand binding protein  25.77 
 
 		 133 aa  49.3  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000000900407  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4354  single-strand binding protein  26.47 
 
 		 148 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0633  single-stranded DNA-binding protein  27.97 
 
 		 172 aa  48.9  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000194148  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1677  single-strand binding protein  29.9 
 
 		 168 aa  48.9  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000004529  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0129  single-strand binding protein  31.37 
 
 		 154 aa  48.5  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000140231  normal  0.824498 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0688  single-strand binding protein  30 
 
 		 140 aa  48.9  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.682205  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2502  single-stranded DNA-binding protein  24.1 
 
 		 166 aa  48.5  0.00003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000142179  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3289  single-strand binding protein  27 
 
 		 119 aa  48.5  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1527  single-strand binding protein  26.85 
 
 		 152 aa  48.5  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.52347  normal  0.0316845 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2137  single-strand binding protein  25.17 
 
 		 139 aa  48.1  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000567752  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0813  single-strand binding protein  29.41 
 
 		 180 aa  48.1  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.307719 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1690  single-strand binding protein  22.92 
 
 		 137 aa  47.8  0.00005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2915  single-strand binding protein  26.73 
 
 		 148 aa  47.8  0.00005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000223705  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5624  single-stranded DNA-binding protein  23.35 
 
 		 169 aa  47.4  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000012759  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4013  single-stranded DNA-binding protein  24.39 
 
 		 164 aa  47.4  0.00006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20288  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1729  single-stranded DNA binding protein  24.31 
 
 		 149 aa  47  0.00008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0774  single-strand binding protein  24.52 
 
 		 160 aa  47  0.00009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5326  single-stranded DNA-binding protein  23.7 
 
 		 173 aa  47  0.00009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105946  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5154  single-stranded DNA-binding protein  23.7 
 
 		 173 aa  47  0.00009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000326746  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5661  single-stranded DNA-binding protein  23.7 
 
 		 173 aa  47  0.00009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000522021  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5583  single-stranded DNA-binding protein  23.7 
 
 		 173 aa  47  0.00009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12199e-16 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2140  single-strand binding protein  28 
 
 		 160 aa  46.6  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0840686 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02950  single stranded DNA-binding protein  31.58 
 
 		 165 aa  46.6  0.0001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.0000000248223  hitchhiker  6.12072e-47 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0864  single-strand binding protein  27 
 
 		 142 aa  47  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0880  single-strand binding protein  27 
 
 		 142 aa  47  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.717763  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1694  single-stranded DNA-binding protein  26.57 
 
 		 148 aa  46.6  0.0001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5266  single-stranded DNA-binding protein  23.7 
 
 		 173 aa  46.6  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000287682  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0025  single-strand binding protein  26 
 
 		 185 aa  45.4  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.326087  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4669  single-strand binding protein  26.17 
 
 		 159 aa  45.8  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.309237  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2977  single-strand binding protein  26.72 
 
 		 150 aa  46.2  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000497709  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2655  single-strand binding protein  26.72 
 
 		 150 aa  46.2  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000211835  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0166  single-strand binding protein  25 
 
 		 136 aa  45.8  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000052118  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1869  single-strand binding protein  27.84 
 
 		 129 aa  45.8  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5170  single-stranded DNA-binding protein  23.53 
 
 		 172 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00247541  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5722  single-stranded DNA-binding protein  23.53 
 
 		 172 aa  45.4  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000060973  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5335  single-stranded DNA-binding protein  23.53 
 
 		 172 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000380691  hitchhiker  0.000000431686 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2128  single-stranded DNA-binding protein  24 
 
 		 141 aa  45.4  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1705  single-strand binding protein  26 
 
 		 135 aa  45.4  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  4.17313e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1019  single-strand binding protein  30.77 
 
 		 176 aa  45.1  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0415033  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1321  single-strand binding protein  26 
 
 		 135 aa  45.4  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000443248  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2281  single-strand binding protein  26 
 
 		 135 aa  45.4  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134741  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4963  single-strand binding protein  28.97 
 
 		 166 aa  45.1  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2020  single-strand binding protein  30.39 
 
 		 126 aa  44.7  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00175419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2746  single-strand binding protein  24 
 
 		 154 aa  45.1  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008770  CJJ81176_pVir0014  hypothetical protein  22.88 
 
 		 152 aa  44.7  0.0004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1260  single-strand binding protein  26.57 
 
 		 161 aa  44.7  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0616311  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1586  single-stranded DNA-binding protein (SSB) (helix-destabilizingprotein)  24.79 
 
 		 188 aa  44.7  0.0004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3137  single-strand binding protein  26 
 
 		 114 aa  44.7  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.560759  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5233  single-strand binding protein/primosomal replication protein n  27.18 
 
 		 108 aa  44.3  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.596941 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0044  single-strand binding protein  32.61 
 
 		 137 aa  44.7  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.139232  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4110  single-strand binding protein  28.12 
 
 		 192 aa  44.3  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000157926  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0570  single-strand binding protein  27.37 
 
 		 140 aa  44.3  0.0006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.802144  hitchhiker  0.00395946 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0450  single-strand binding protein  25.22 
 
 		 152 aa  44.3  0.0006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000062046  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5911  single-strand binding protein  27.18 
 
 		 157 aa  43.9  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4066  single-strand binding protein  28 
 
 		 181 aa  43.9  0.0008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0180  single-stranded DNA-binding protein  25 
 
 		 131 aa  43.5  0.0009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2151  single-strand binding protein  21.99 
 
 		 139 aa  42.7  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1132  single-stranded DNA-binding protein  23.02 
 
 		 209 aa  43.5  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1350  single-strand binding protein  23.08 
 
 		 134 aa  43.5  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000023456  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5572  single-strand binding protein  26.53 
 
 		 184 aa  43.5  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6544  single-strand binding protein  25.51 
 
 		 188 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2288  single-strand binding protein  26.73 
 
 		 159 aa  42.7  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1124  single-strand binding protein  28.12 
 
 		 156 aa  43.5  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.228328  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>