78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A0681 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011094  SeSA_A0681  single-strand binding protein family  100 
 
 		 131 aa  274  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0494531  decreased coverage  0.0000000451478 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1579  single-strand binding protein  56.62 
 
 		 136 aa  155  2e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.147873  hitchhiker  0.0000409969 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4087  single-strand binding protein  66.06 
 
 		 144 aa  154  3e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.98984  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0755  putative single stranded DNA-binding protein  52.78 
 
 		 141 aa  147  4e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0948  single-strand binding protein family  51.05 
 
 		 141 aa  142  2e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0066  single-stranded DNA-binding protein  30.22 
 
 		 150 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1729  single-stranded DNA binding protein  28.06 
 
 		 149 aa  52.4  0.000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2746  single-strand binding protein  27.4 
 
 		 154 aa  49.7  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2146  single-strand binding protein  29.41 
 
 		 137 aa  48.5  0.00003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.172996  normal  0.155515 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2286  single-strand binding protein  29.41 
 
 		 137 aa  48.5  0.00003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.306746 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1823  single-strand DNA binding protein  26.53 
 
 		 158 aa  48.5  0.00003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000500943  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6544  single-strand binding protein  29.47 
 
 		 188 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0370  single-stranded DNA-binding protein  25.85 
 
 		 158 aa  48.1  0.00004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  4.28253e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6107  single-stranded DNA-binding protein  29.47 
 
 		 184 aa  47.4  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.603331 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0538  single-stranded DNA-binding protein  29.47 
 
 		 182 aa  47.4  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1260  single-strand binding protein  28.03 
 
 		 161 aa  47.4  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0616311  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2837  single-stranded DNA-binding protein  29.47 
 
 		 187 aa  47.4  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0731757  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5572  single-strand binding protein  30.53 
 
 		 184 aa  47.4  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2695  single-stranded DNA-binding protein  29.47 
 
 		 186 aa  47.4  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.284268 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0500  single-stranded DNA-binding protein  29.47 
 
 		 186 aa  47.4  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2845  single-strand binding protein  27.7 
 
 		 156 aa  47  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.101348  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2466  single-strand binding protein  27.7 
 
 		 156 aa  47  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.34674  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3093  single-stranded DNA-binding protein  29.47 
 
 		 199 aa  47  0.00009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.254201  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2957  single-stranded DNA-binding protein  29.47 
 
 		 192 aa  47  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.602343  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0611  single-stranded DNA-binding protein  29.47 
 
 		 184 aa  47  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0596  single-stranded DNA-binding protein  29.47 
 
 		 179 aa  47  0.00009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0061  single-stranded DNA-binding protein  29.47 
 
 		 196 aa  47  0.00009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1529  single-stranded DNA-binding protein  29.47 
 
 		 192 aa  47  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0781  single-stranded DNA-binding protein  29.47 
 
 		 185 aa  47  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.391635  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4966  single-strand binding protein  27.91 
 
 		 137 aa  46.6  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.875066 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2215  single-strand binding protein  26.76 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0980  single-strand binding protein  28 
 
 		 136 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2777  single-stranded DNA-binding protein  28.42 
 
 		 184 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.450674  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0559  single-strand binding protein  27.5 
 
 		 171 aa  46.2  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.401041  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0056  single-stranded DNA-binding protein  27.61 
 
 		 175 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.564154 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2163  single-stranded DNA-binding protein  28.42 
 
 		 184 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2788  single-stranded DNA-binding protein  28.42 
 
 		 183 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.481192 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1569  single-strand binding protein  25.71 
 
 		 164 aa  45.4  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.285989  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0341  single-stranded DNA-binding protein  26.32 
 
 		 172 aa  44.7  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4106  single-stranded DNA-binding protein  27.37 
 
 		 177 aa  44.7  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0611  single-stranded DNA-binding protein  27.37 
 
 		 179 aa  44.7  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0353597 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0051  single-stranded DNA-binding protein  28.22 
 
 		 175 aa  44.3  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.772758  normal  0.0108774 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1545  single-strand binding protein  34.57 
 
 		 166 aa  43.9  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00898888  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0044  single-strand binding protein  30.47 
 
 		 137 aa  43.9  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.139232  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3307  single-strand binding protein  28 
 
 		 140 aa  43.9  0.0007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000227913  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0422  single-strand binding protein  25.83 
 
 		 140 aa  43.9  0.0008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.185373  normal  0.206127 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0637  single-strand binding protein  27.07 
 
 		 133 aa  43.9  0.0008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000000900407  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3165  single-strand binding protein/primosomal replication protein n  30 
 
 		 129 aa  43.5  0.0009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.140371 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0674  single-strand binding protein  28.57 
 
 		 136 aa  43.5  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000262978  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0140  single-strand binding protein  25.71 
 
 		 164 aa  42.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0369  single-stranded DNA-binding protein  26.32 
 
 		 181 aa  42.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1566  single-stranded DNA-binding protein  30.33 
 
 		 163 aa  42.4  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.365454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008770  CJJ81176_pVir0014  hypothetical protein  29.06 
 
 		 152 aa  42.7  0.002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1690  single-strand binding protein  25.71 
 
 		 137 aa  42.4  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1132  single-stranded DNA-binding protein  28.72 
 
 		 209 aa  42.4  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0979  single-strand binding protein  31.46 
 
 		 140 aa  42.4  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0301  single-stranded DNA-binding protein  29.17 
 
 		 120 aa  42.4  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2190  single-strand binding protein  25.83 
 
 		 129 aa  42.7  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0002  single-stranded DNA-binding protein  25.83 
 
 		 175 aa  42.4  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0759  single-strand binding protein  25.17 
 
 		 151 aa  42.4  0.002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4105  single-strand binding protein  26.28 
 
 		 181 aa  42.7  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.512282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0332  single-strand binding protein  28.28 
 
 		 141 aa  42  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000125233  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0868  single-stranded DNA-binding protein  28.41 
 
 		 165 aa  41.6  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.949427  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2293  single-strand binding protein  30.43 
 
 		 155 aa  41.6  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06540  single-stranded DNA-binding protein  29.55 
 
 		 167 aa  41.6  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0610132  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4136  single-strand binding protein  25.53 
 
 		 165 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00257705  normal  0.135122 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09200  single-stranded DNA-binding protein  28.41 
 
 		 165 aa  41.6  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0140345  normal  0.797582 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0325  single-strand binding protein  26.6 
 
 		 160 aa  41.2  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0107  single-strand binding protein  31.71 
 
 		 165 aa  41.2  0.005  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0655467  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3411  single-strand binding protein  30.53 
 
 		 181 aa  41.2  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0856708  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3391  single-strand binding protein  28.42 
 
 		 222 aa  40.8  0.006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1527  single-strand binding protein  25.35 
 
 		 152 aa  40.8  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.52347  normal  0.0316845 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0314  single-strand binding protein  28.28 
 
 		 141 aa  40.8  0.007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000013308  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0315  single-stranded DNA-binding protein  25.26 
 
 		 181 aa  40.4  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4066  single-strand binding protein  29.47 
 
 		 181 aa  40  0.009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4185  single-strand binding protein  25.47 
 
 		 170 aa  40  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0045  single-stranded DNA-binding protein  28.07 
 
 		 169 aa  40  0.01  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2929  single-strand binding protein  30.69 
 
 		 156 aa  40  0.01  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.564764  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>