More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E4087 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E4087  single-strand binding protein  100 
 
 		 144 aa  295  1e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.98984  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0755  putative single stranded DNA-binding protein  65.97 
 
 		 141 aa  198  1.9999999999999998e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0948  single-strand binding protein family  65.97 
 
 		 141 aa  194  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1579  single-strand binding protein  67.89 
 
 		 136 aa  157  4e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.147873  hitchhiker  0.0000409969 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0681  single-strand binding protein family  66.06 
 
 		 131 aa  154  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0494531  decreased coverage  0.0000000451478 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0559  single-strand binding protein  36.84 
 
 		 171 aa  66.2  0.0000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.401041  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0674  single-strand binding protein  31.08 
 
 		 136 aa  62.8  0.000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000262978  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2929  single-strand binding protein  32.65 
 
 		 156 aa  59.3  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.564764  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3416  single-strand binding protein  30.46 
 
 		 164 aa  58.2  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000139016  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3307  single-strand binding protein  33 
 
 		 140 aa  57  0.00000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000227913  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2076  single-strand binding protein  34.78 
 
 		 156 aa  56.2  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3832  single-strand binding protein  35.19 
 
 		 132 aa  56.2  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.381197  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2039  single-strand binding protein  34.78 
 
 		 156 aa  56.2  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0331  single-strand binding protein  34.78 
 
 		 156 aa  56.2  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0322  single-strand binding protein  34.78 
 
 		 156 aa  56.2  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2140  single-strand binding protein  34 
 
 		 160 aa  55.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0840686 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3545  single-strand binding protein  31.9 
 
 		 164 aa  55.1  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0422  single-strand binding protein  30.08 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.185373  normal  0.206127 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2746  single-strand binding protein  31 
 
 		 154 aa  54.7  0.0000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2539  single-strand binding protein  31.85 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000217555  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2215  single-strand binding protein  32 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0774  single-strand binding protein  27.92 
 
 		 160 aa  53.9  0.0000007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23350  single-strand binding protein  33 
 
 		 133 aa  53.5  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000767815  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0980  single-strand binding protein  32 
 
 		 136 aa  53.1  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1869  single-strand binding protein  29.9 
 
 		 129 aa  53.1  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0314  single-strand binding protein  32.32 
 
 		 141 aa  52.8  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000013308  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2780  single-strand binding protein  28.28 
 
 		 155 aa  52.8  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0425  single-strand binding protein  32 
 
 		 167 aa  52  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000015552  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3011  single-strand binding protein  30 
 
 		 156 aa  52.4  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1545  single-strand binding protein  36.05 
 
 		 166 aa  52.8  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00898888  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0332  single-strand binding protein  33.33 
 
 		 141 aa  52.8  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000125233  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5572  single-strand binding protein  31 
 
 		 184 aa  52.4  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4935  single-strand binding protein  29.53 
 
 		 137 aa  52.4  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000213626  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0414  single-strand binding protein  32 
 
 		 167 aa  52  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000719074  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0868  single-stranded DNA-binding protein  30.77 
 
 		 165 aa  52  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.949427  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09200  single-stranded DNA-binding protein  30.77 
 
 		 165 aa  52  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0140345  normal  0.797582 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0538  single-stranded DNA-binding protein  31 
 
 		 182 aa  51.2  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0779  single-strand binding protein  32.38 
 
 		 147 aa  51.2  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2146  single-strand binding protein  30.39 
 
 		 137 aa  51.2  0.000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.172996  normal  0.155515 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3289  single-strand binding protein  33 
 
 		 119 aa  51.2  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4136  single-strand binding protein  30.07 
 
 		 165 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00257705  normal  0.135122 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0500  single-stranded DNA-binding protein  31 
 
 		 186 aa  51.2  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06540  single-stranded DNA-binding protein  26.51 
 
 		 167 aa  51.2  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0610132  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2837  single-stranded DNA-binding protein  31 
 
 		 187 aa  51.2  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0731757  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0637  single-strand binding protein  28.87 
 
 		 133 aa  51.2  0.000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000000900407  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2695  single-stranded DNA-binding protein  31 
 
 		 186 aa  51.2  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.284268 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2286  single-strand binding protein  30.39 
 
 		 137 aa  51.2  0.000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.306746 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6544  single-strand binding protein  31 
 
 		 188 aa  50.8  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6107  single-stranded DNA-binding protein  31 
 
 		 184 aa  50.8  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.603331 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2190  single-strand binding protein  29.27 
 
 		 129 aa  50.8  0.000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4013  single-stranded DNA-binding protein  31.78 
 
 		 164 aa  50.8  0.000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20288  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0045  single-stranded DNA-binding protein  29.31 
 
 		 169 aa  50.4  0.000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3401  single-strand binding protein  27.59 
 
 		 151 aa  49.7  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.413025  normal  0.54881 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3093  single-stranded DNA-binding protein  31 
 
 		 199 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.254201  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0611  single-stranded DNA-binding protein  31 
 
 		 184 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0781  single-stranded DNA-binding protein  31 
 
 		 185 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.391635  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0864  single-strand binding protein  33.7 
 
 		 142 aa  49.7  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1529  single-stranded DNA-binding protein  31 
 
 		 192 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0880  single-strand binding protein  33.7 
 
 		 142 aa  49.7  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.717763  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2957  single-stranded DNA-binding protein  31 
 
 		 192 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.602343  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0596  single-stranded DNA-binding protein  31 
 
 		 179 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0061  single-stranded DNA-binding protein  31 
 
 		 196 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1260  single-strand binding protein  27.89 
 
 		 161 aa  49.7  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0616311  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2788  single-stranded DNA-binding protein  30 
 
 		 183 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.481192 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1527  single-strand binding protein  29 
 
 		 152 aa  48.9  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.52347  normal  0.0316845 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5600  single-stranded DNA-binding protein  31.78 
 
 		 170 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0046868  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0450  single-strand binding protein  29.7 
 
 		 152 aa  49.3  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000062046  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5326  single-stranded DNA-binding protein  31.78 
 
 		 173 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105946  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5154  single-stranded DNA-binding protein  31.78 
 
 		 173 aa  49.3  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000326746  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5071  single-strand binding protein  29.29 
 
 		 186 aa  48.9  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.836187 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0369  single-stranded DNA-binding protein  32.63 
 
 		 181 aa  48.9  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5583  single-stranded DNA-binding protein  31.78 
 
 		 173 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12199e-16 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3411  single-strand binding protein  29.66 
 
 		 146 aa  49.3  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2163  single-stranded DNA-binding protein  30 
 
 		 184 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5661  single-stranded DNA-binding protein  31.78 
 
 		 173 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000522021  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2777  single-stranded DNA-binding protein  30 
 
 		 184 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.450674  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5266  single-stranded DNA-binding protein  31.78 
 
 		 173 aa  49.3  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000287682  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3773  single-strand binding protein  29.67 
 
 		 146 aa  49.3  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000302253  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3951  single-strand binding protein  30.77 
 
 		 161 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.290115  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3808  single-strand binding protein  30.77 
 
 		 163 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.39281  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4106  single-stranded DNA-binding protein  29.59 
 
 		 177 aa  48.1  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0450  single-strand binding protein  28 
 
 		 188 aa  48.1  0.00004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.544035  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0611  single-stranded DNA-binding protein  29.59 
 
 		 179 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0353597 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3865  single-strand binding protein  30.77 
 
 		 161 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.672811  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3137  single-strand binding protein  33 
 
 		 114 aa  48.1  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.560759  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2915  single-strand binding protein  30.39 
 
 		 148 aa  47.8  0.00005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000223705  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5624  single-stranded DNA-binding protein  31.75 
 
 		 169 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000012759  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5170  single-stranded DNA-binding protein  33.06 
 
 		 172 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00247541  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0483  single-strand binding protein  29.47 
 
 		 156 aa  47.8  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5722  single-stranded DNA-binding protein  33.06 
 
 		 172 aa  47.8  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000060973  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3926  single-strand binding protein  32.38 
 
 		 156 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1595  single-strand binding protein  30.21 
 
 		 184 aa  47.8  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0325  single-strand binding protein  30.85 
 
 		 160 aa  47.8  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0025  single-strand binding protein  29 
 
 		 185 aa  47.4  0.00006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.326087  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1729  single-stranded DNA binding protein  26.85 
 
 		 149 aa  47.4  0.00006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5335  single-stranded DNA-binding protein  33.06 
 
 		 172 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000380691  hitchhiker  0.000000431686 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0255  single-strand binding protein  24.31 
 
 		 139 aa  47.4  0.00007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0581  single-strand binding protein  31.3 
 
 		 234 aa  47.4  0.00007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00543875  normal  0.0620215 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0640  single-strand binding protein  31.3 
 
 		 236 aa  47.4  0.00007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.021198  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3876  single-strand binding protein  30 
 
 		 162 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.611448  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>