More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_2652 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009632  SaurJH1_2652  hypothetical protein  100 
 
 		 273 aa  559  1e-158  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2598  hypothetical protein  100 
 
 		 273 aa  559  1e-158  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6636  NmrA family protein  29.23 
 
 		 297 aa  140  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6482  NmrA family protein  31.9 
 
 		 315 aa  137  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2191  NmrA family protein  29.45 
 
 		 290 aa  134  9.999999999999999e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.913826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4065  NmrA family protein  30.04 
 
 		 298 aa  133  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3810  NmrA family protein  34.39 
 
 		 284 aa  132  6e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00082597  normal  0.691187 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1488  NmrA family protein  31.09 
 
 		 300 aa  131  9e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1468  NmrA family protein  28.37 
 
 		 306 aa  115  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.524569 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2401  NmrA family protein  29.07 
 
 		 298 aa  114  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.242645  hitchhiker  0.000749924 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0420  NmrA family protein  27.73 
 
 		 226 aa  112  5e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2288  NmrA family protein  28.06 
 
 		 450 aa  112  7.000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3888  NmrA family protein  26.86 
 
 		 305 aa  109  6e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.203916  normal  0.414288 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2282  NmrA family protein  28.23 
 
 		 319 aa  107  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0388  NmrA family protein  27.27 
 
 		 303 aa  105  7e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.012562 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3361  NmrA family protein  28.11 
 
 		 300 aa  104  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.180689  normal  0.118404 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0529  NmrA family protein  25 
 
 		 304 aa  102  9e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.616457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2828  NmrA family protein  28.33 
 
 		 305 aa  100  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2074  NmrA family protein  24.12 
 
 		 286 aa  97.4  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2189  NmrA family protein  24.64 
 
 		 293 aa  95.5  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00531075  normal  0.451733 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04630  conserved hypothetical protein  26.86 
 
 		 311 aa  93.6  3e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.361856  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0821  hypothetical protein  25.3 
 
 		 326 aa  93.2  4e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.107577  unclonable  0.0000119354 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2364  NmrA family protein  26.32 
 
 		 307 aa  93.2  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000211111  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6340  NmrA family protein  29.01 
 
 		 287 aa  90.1  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04608  NmrA family transcriptional regulator, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G06920)  26.97 
 
 		 309 aa  89.4  6e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.113865  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4033  NmrA family protein  27.1 
 
 		 293 aa  89.4  6e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.027293  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1169  NADPH-dependent reductase  25.08 
 
 		 336 aa  88.6  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.437818  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2481  NmrA family protein  24.55 
 
 		 290 aa  88.2  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1673  NmrA family protein  28.74 
 
 		 290 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.491569  normal  1 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00760  conserved hypothetical protein  26.51 
 
 		 294 aa  86.3  5e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.041622  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1991  NmrA family protein  28.35 
 
 		 290 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6433  NmrA-like  26.84 
 
 		 287 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6668  NmrA family protein  26.84 
 
 		 287 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0183081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6266  NmrA family protein  26.84 
 
 		 287 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0469029 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0547  NmrA family protein  27.71 
 
 		 287 aa  84  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3410  NmrA family protein  27.56 
 
 		 295 aa  84.7  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.11403  normal  0.0133757 
 
 
-
 
NC_006691  CNF03580  conserved hypothetical protein  34.64 
 
 		 288 aa  84  0.000000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0471673  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0817  NmrA family protein  27.91 
 
 		 289 aa  83.6  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01600  conserved hypothetical protein  23.83 
 
 		 318 aa  80.5  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.561734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0390  NADPH-dependent reductase  26.4 
 
 		 345 aa  80.9  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0157595  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2575  NmrA family protein  27.13 
 
 		 295 aa  80.9  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4112  NmrA family protein  27.03 
 
 		 293 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0200  NmrA family protein  28.77 
 
 		 281 aa  79  0.00000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.352919  normal  0.33471 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0874  NmrA family protein  25.1 
 
 		 317 aa  78.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0766  NmrA family protein  25.33 
 
 		 317 aa  76.6  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0676287  normal  0.883458 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04620  hypothetical protein  22.71 
 
 		 309 aa  76.3  0.0000000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.599307  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2993  NmrA family protein  25.64 
 
 		 306 aa  76.3  0.0000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0106693  normal  0.0973127 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2208  NmrA family protein  29.8 
 
 		 316 aa  74.7  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01819  conserved hypothetical protein  26.58 
 
 		 343 aa  72.8  0.000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.520002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0235  NmrA family protein  30.82 
 
 		 292 aa  72.8  0.000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.19532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5164  NmrA family protein  28.82 
 
 		 321 aa  72.4  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000496465 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2879  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.1 
 
 		 530 aa  72.4  0.000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10751  hypothetical protein  25.41 
 
 		 345 aa  72.4  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0490933  normal  0.0263054 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1676  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.24 
 
 		 296 aa  72  0.000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0074  NmrA family protein  25.89 
 
 		 300 aa  70.9  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6212  NmrA family protein  27.66 
 
 		 289 aa  70.5  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.427571  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4428  NmrA family protein  23.25 
 
 		 312 aa  69.7  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.183796  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3166  NmrA family protein  27.73 
 
 		 273 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2558  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  25.45 
 
 		 291 aa  68.6  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3759  NmrA family protein  24.71 
 
 		 292 aa  68.6  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.791935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2674  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.71 
 
 		 211 aa  68.2  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.172224  normal  0.0331815 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2693  NmrA family protein  28.57 
 
 		 292 aa  67.8  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.142856  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3020  hypothetical protein  28.96 
 
 		 289 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.375622  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3675  NmrA-like  24.19 
 
 		 315 aa  67.8  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.12291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0293  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.52 
 
 		 212 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.572416  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2058  NmrA family protein  23.28 
 
 		 506 aa  67.4  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.584993  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1079  NmrA family protein  25.81 
 
 		 294 aa  67  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.153764 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1958  NmrA family protein  28.28 
 
 		 284 aa  67.4  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.190624  normal  0.373159 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1072  NmrA family protein  24.32 
 
 		 288 aa  66.2  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.07166  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0483  NmrA family protein  23.42 
 
 		 295 aa  66.2  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1322  NmrA family protein  25 
 
 		 513 aa  64.7  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.180223  normal  0.0774954 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5281  NmrA family protein  24.35 
 
 		 290 aa  65.5  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3935  NmrA family protein  25.69 
 
 		 288 aa  65.1  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00694182 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0236  hypothetical protein  23.28 
 
 		 538 aa  64.3  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3563  NmrA-like  26.55 
 
 		 291 aa  63.9  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22520  hypothetical protein  28.76 
 
 		 351 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000139034  hitchhiker  0.0000222268 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4897  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.34 
 
 		 333 aa  63.2  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4447  NmrA family protein  24.59 
 
 		 364 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5657  NmrA family protein  23.08 
 
 		 286 aa  62  0.000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1213  NmrA family protein  32.89 
 
 		 273 aa  62  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.423436  normal  0.352226 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3022  NmrA family protein  25.11 
 
 		 280 aa  62  0.000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.589818  normal  0.26374 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7197  NmrA family protein  27.86 
 
 		 285 aa  62  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0403  NmrA family protein  28 
 
 		 287 aa  62  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07641  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  21.15 
 
 		 316 aa  62  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.497854  hitchhiker  0.00491457 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2079  NmrA family protein  23.88 
 
 		 605 aa  61.2  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3007  NmrA-like protein  24.1 
 
 		 280 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.543476  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3053  NmrA family protein  24.1 
 
 		 280 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4686  NmrA family protein  27.27 
 
 		 274 aa  60.5  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.742277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1635  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.52 
 
 		 325 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.862088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36580  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  26.34 
 
 		 282 aa  60.1  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4905  NmrA family protein  26.62 
 
 		 327 aa  60.1  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.554615 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7062  NmrA family protein  26.82 
 
 		 512 aa  60.1  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1710  NmrA family protein  22.62 
 
 		 280 aa  59.7  0.00000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.835703  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5325  NmrA family protein  32.16 
 
 		 286 aa  59.7  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.260355  normal  0.558765 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6609  NmrA family protein  24.78 
 
 		 310 aa  58.9  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5254  NmrA-like protein  27.61 
 
 		 320 aa  58.9  0.00000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5343  NmrA family protein  27.61 
 
 		 320 aa  58.9  0.00000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.663839  normal  0.467747 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5261  NmrA family protein  31.54 
 
 		 271 aa  58.2  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5449  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  27.27 
 
 		 274 aa  58.5  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0124495  normal  0.101659 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.22 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.146647  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>