288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1943 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1943  sporulation related protein  100 
 
 		 303 aa  589  1e-167  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.932522  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1255  rare lipoprotein A  43.28 
 
 		 320 aa  188  1e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.994921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0482  rare lipoprotein A  35.59 
 
 		 303 aa  136  5e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.241212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1056  rare lipoprotein A  43.67 
 
 		 185 aa  106  5e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0387657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3108  rare lipoprotein A  31.42 
 
 		 339 aa  97.1  3e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.66001  normal  0.467764 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4362  rare lipoprotein A  30.16 
 
 		 342 aa  89.4  6e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0440112  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4822  lipoprotein, rlpA family  30.16 
 
 		 342 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1456  rare lipoprotein A  30.85 
 
 		 322 aa  87  4e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.12367  normal  0.0142155 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0025  Rare lipoprotein A  31.9 
 
 		 279 aa  86.3  6e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.674451  normal  0.0342057 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1557  rare lipoprotein A  28.95 
 
 		 321 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000368198  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0617  rare lipoprotein A  28.32 
 
 		 332 aa  79.7  0.00000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0426495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1470  rare lipoprotein A  25.71 
 
 		 282 aa  76.3  0.0000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00612022  normal  0.287685 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4679  rare lipoprotein A  27.76 
 
 		 333 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.362563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01654  rare lipoprotein A  23.05 
 
 		 322 aa  74.3  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000527551  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0175  rare lipoprotein A  28.26 
 
 		 324 aa  74.7  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.365013  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0496  rare lipoprotein A, putative  35.29 
 
 		 224 aa  74.3  0.000000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2700  rare lipoprotein A  38.94 
 
 		 318 aa  73.9  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4857  rare lipoprotein A  28.47 
 
 		 333 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292191  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4804  rare lipoprotein A family  28.47 
 
 		 333 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3795  rare lipoprotein A  26.58 
 
 		 337 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.443521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2153  rare lipoprotein A  36.75 
 
 		 382 aa  70.9  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12090  RlpA family lipoprotein  30.86 
 
 		 341 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.751179  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0923  rare lipoprotein A  39.05 
 
 		 173 aa  69.7  0.00000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00522727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1109  putative lipoprotein  37.5 
 
 		 342 aa  69.3  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4323  rare lipoprotein A  40 
 
 		 314 aa  69.3  0.00000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0990  rare lipoprotein A family protein  30.27 
 
 		 421 aa  68.6  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4967  rare lipoprotein A  28.21 
 
 		 335 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3152  rare lipoprotein A  25.33 
 
 		 370 aa  68.6  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00554597  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0823  rare lipoprotein A  36.84 
 
 		 281 aa  68.2  0.0000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0647438  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3023  rare lipoprotein A  26.45 
 
 		 360 aa  67.4  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000107975  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2951  rare lipoprotein A  26.45 
 
 		 360 aa  66.6  0.0000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000078058  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08420  Rare lipoprotein, RlpA family  33.33 
 
 		 325 aa  66.6  0.0000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.108645  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1705  rare lipoprotein A  34.43 
 
 		 367 aa  66.2  0.0000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1807  rare lipoprotein A  34.43 
 
 		 364 aa  65.1  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.206051  hitchhiker  0.00189733 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1995  rare lipoprotein A  34.43 
 
 		 364 aa  65.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.359065  normal  0.0392025 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1199  rare lipoprotein A  27.21 
 
 		 361 aa  65.1  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.670363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1851  rare lipoprotein A  25.87 
 
 		 360 aa  65.1  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000580444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0958  rare lipoprotein A family protein  29.73 
 
 		 419 aa  65.1  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.138105  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2411  rare lipoprotein A  27.66 
 
 		 295 aa  65.5  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.670481  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2676  rare lipoprotein A  38 
 
 		 314 aa  64.3  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.36166  normal  0.127788 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2966  rare lipoprotein A  27.27 
 
 		 381 aa  63.9  0.000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.508447  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0111  rare lipoprotein A  27.11 
 
 		 333 aa  62.8  0.000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2450  rare lipoprotein A  33.12 
 
 		 171 aa  62.8  0.000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0060097  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0754  rare lipoprotein A  25.97 
 
 		 377 aa  62.8  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.169021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2228  rare lipoprotein A  37.96 
 
 		 194 aa  62.8  0.000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0680  rare lipoprotein A  26.49 
 
 		 377 aa  62.4  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000202974  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2712  rare lipoprotein A  30.69 
 
 		 314 aa  62.4  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.824805 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0740  rare lipoprotein A  26.49 
 
 		 377 aa  62.4  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.012679  normal  0.997721 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0749  rare lipoprotein A  27.45 
 
 		 275 aa  61.6  0.00000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0714634  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1466  rare lipoprotein A  34.43 
 
 		 279 aa  62  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.515787 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1353  rare lipoprotein A  27.45 
 
 		 275 aa  61.6  0.00000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.582482  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2012  rare lipoprotein A  32.86 
 
 		 312 aa  62.4  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.127741  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3111  rare lipoprotein A  34.43 
 
 		 315 aa  62  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.829805  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1011  rare lipoprotein A  25.85 
 
 		 352 aa  61.2  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3338  sugar fermentation stimulation protein  32.64 
 
 		 297 aa  61.2  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000024991  normal  0.0181355 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1548  rare lipoprotein A  32.84 
 
 		 290 aa  61.2  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0674  rare lipoprotein A  27.45 
 
 		 266 aa  61.6  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.391975  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1971  rare lipoprotein A  38.89 
 
 		 323 aa  60.8  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2087  rare lipoprotein A  33.88 
 
 		 169 aa  60.5  0.00000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1179  rare lipoprotein A  30.81 
 
 		 375 aa  60.5  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00815633  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0241  rare lipoprotein A  27.8 
 
 		 381 aa  60.5  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.812141  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0928  lipoprotein A family protein  39.73 
 
 		 206 aa  60.5  0.00000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4106  hypothetical protein  34.21 
 
 		 283 aa  60.5  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.322542  normal  0.202617 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1486  rare lipoprotein A  39.73 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.72104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2474  rare lipoprotein A  37.04 
 
 		 195 aa  60.1  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.379574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4319  rare lipoprotein A  42.86 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.617805 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0545  rare lipoprotein A  36 
 
 		 341 aa  60.1  0.00000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3653  rare lipoprotein A  40.24 
 
 		 175 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.582784  normal  0.812873 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2075  rare lipoprotein A  28.02 
 
 		 424 aa  59.7  0.00000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1386  rare lipoprotein A  24.48 
 
 		 415 aa  59.7  0.00000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.166682  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1090  rare lipoprotein A  27.89 
 
 		 388 aa  59.7  0.00000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.499967  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1294  rare lipoprotein A  29.25 
 
 		 346 aa  59.3  0.00000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.347531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0721  rare lipoprotein A  26.74 
 
 		 362 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000475341  normal  0.474734 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0265  rare lipoprotein A  34.87 
 
 		 286 aa  58.5  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0973741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2701  rare lipoprotein A  27.13 
 
 		 312 aa  58.5  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0696  rare lipoprotein A  38.46 
 
 		 270 aa  58.5  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0618  rare lipoprotein A  27.13 
 
 		 362 aa  58.5  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00356673  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2993  rare lipoprotein A  26.74 
 
 		 362 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000212264  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2030  RlpA family lipoprotein  33.71 
 
 		 261 aa  58.2  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000777021  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1506  rare lipoprotein A  36.72 
 
 		 442 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0428333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0988  rare lipoprotein A  34 
 
 		 280 aa  58.2  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000365675  normal  0.010381 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1053  rare lipoprotein A  34 
 
 		 280 aa  58.2  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000568388  hitchhiker  0.00641376 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0992  rare lipoprotein A  34 
 
 		 280 aa  58.2  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000257721  normal  0.149582 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0798  rare lipoprotein A  25.97 
 
 		 377 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00108325  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00602  minor lipoprotein  26.74 
 
 		 362 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0208162  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1165  rare lipoprotein A  43.4 
 
 		 283 aa  57  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0653  rare lipoprotein A  26.74 
 
 		 362 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000226966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2633  rare lipoprotein A  40 
 
 		 257 aa  57.4  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0685  rare lipoprotein A  26.74 
 
 		 362 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.7076e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00591  hypothetical protein  26.74 
 
 		 362 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0164207  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0658  rare lipoprotein A  26.74 
 
 		 362 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000302889  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2845  rare lipoprotein A  23.89 
 
 		 311 aa  57.4  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000926657  hitchhiker  0.0000043303 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1579  rare lipoprotein A  33.62 
 
 		 408 aa  57.8  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00357969  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2856  rare lipoprotein A  29.49 
 
 		 154 aa  56.6  0.0000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1268  rare lipoprotein A  25.33 
 
 		 284 aa  57  0.0000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.149494  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1940  rare lipoprotein A  27.38 
 
 		 163 aa  57  0.0000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0315  rare lipoprotein A  26.38 
 
 		 394 aa  57  0.0000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3390  rare lipoprotein A  36.28 
 
 		 474 aa  57  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.728179 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3699  rare lipoprotein A  36.28 
 
 		 455 aa  57  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2872  rare lipoprotein A  39.29 
 
 		 281 aa  56.6  0.0000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232155  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>