More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4986 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_4986  transketolase central region  100 
 
 		 296 aa  568  1e-161  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.545662  hitchhiker  0.000179953 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4473  transketolase, central region  89.53 
 
 		 296 aa  489  1e-137  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0113424 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6362  Transketolase central region  61.49 
 
 		 307 aa  328  5.0000000000000004e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.465513  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4002  Transketolase central region  56.08 
 
 		 299 aa  290  2e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.226763  normal  0.146008 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5715  Transketolase central region  58.22 
 
 		 296 aa  284  2.0000000000000002e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1273  transketolase central region  53.4 
 
 		 303 aa  259  5.0000000000000005e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.257757  hitchhiker  0.0057855 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5637  transketolase subunit B  35.26 
 
 		 307 aa  110  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3397  Transketolase central region  36.59 
 
 		 298 aa  104  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1923  transketolase domain-containing protein  29.87 
 
 		 315 aa  94.7  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3382  transketolase domain-containing protein  30.8 
 
 		 314 aa  89.4  7e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2287  transketolase central region  32.69 
 
 		 305 aa  89  9e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3248  putative transketolase, C-terminal subunit  30.8 
 
 		 314 aa  88.6  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3129  transketolase domain-containing protein  36.08 
 
 		 322 aa  86.3  6e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0809  transketolase central region  34.39 
 
 		 592 aa  86.3  6e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.32467  normal  0.55266 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2126  Transketolase domain protein  28.62 
 
 		 320 aa  85.1  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.764032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1589  transketolase family protein  21.55 
 
 		 288 aa  84.3  0.000000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0910  putative transketolase, C-terminal subunit  30.18 
 
 		 310 aa  84  0.000000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2646  Transketolase domain protein  29.89 
 
 		 314 aa  82  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0477221  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3642  Transketolase central region  27.39 
 
 		 307 aa  81.3  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0180  transketolase, central region  28.77 
 
 		 162 aa  81.3  0.00000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5103  Transketolase central region  25.73 
 
 		 306 aa  80.5  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.47717 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14551  transketolase C-terminal subunit  29.49 
 
 		 304 aa  80.5  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0244  Transketolase central region  27.48 
 
 		 305 aa  80.1  0.00000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.304733  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2110  transketolase, central region  30.04 
 
 		 314 aa  79.7  0.00000000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.44874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1679  deoxyxylulose-5-phosphate synthase  35.18 
 
 		 643 aa  79.3  0.00000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.107501  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1764  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  31.43 
 
 		 626 aa  79  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0479282  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2402  transketolase, C-terminal subunit  28.93 
 
 		 310 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.730568  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1505  transketolase central region  23.57 
 
 		 314 aa  77.4  0.0000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0385912  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2800  Transketolase central region  26.49 
 
 		 320 aa  77  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3528  Transketolase central region  26.71 
 
 		 306 aa  77  0.0000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.605284  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0894  transketolase subunit B  30.89 
 
 		 314 aa  77  0.0000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0789  transketolase central region  29.06 
 
 		 314 aa  77  0.0000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1963  transketolase, C-terminal subunit  37.19 
 
 		 302 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.686485  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1058  transketolase subunit B  27.74 
 
 		 308 aa  75.9  0.0000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.847424 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1527  Transketolase central region  27.81 
 
 		 319 aa  75.5  0.0000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0407  transketolase central region  36.67 
 
 		 323 aa  75.1  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0194561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0438  transketolase central region  21.78 
 
 		 312 aa  75.1  0.000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0397028  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2032  Transketolase domain protein  33.54 
 
 		 318 aa  75.5  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.262756  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2254  Transketolase domain protein  34.18 
 
 		 318 aa  75.1  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.655402  normal  0.0447096 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1130  transketolase central region  35.83 
 
 		 336 aa  74.3  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2615  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  30.5 
 
 		 637 aa  73.9  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0207867  normal  0.922526 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1775  transketolase, central region  36.07 
 
 		 314 aa  73.9  0.000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0492  transketolase, central region  31.1 
 
 		 312 aa  73.6  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4834  transketolase central region  29.12 
 
 		 333 aa  73.2  0.000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2426  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  31.21 
 
 		 636 aa  72.8  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0796  Transketolase central region  28.75 
 
 		 316 aa  72  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2438  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  31.46 
 
 		 643 aa  71.6  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.688474  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1097  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  30.93 
 
 		 636 aa  70.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.124796  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0280  Transketolase central region  30.13 
 
 		 310 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.741894  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0983  deoxyxylulose-5-phosphate synthase  29.39 
 
 		 624 aa  71.2  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.288267  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2033  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  31.56 
 
 		 636 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.720268  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1628  transketolase, C-terminal subunit  34.71 
 
 		 303 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.750747  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2655  transketolase, C-terminal subunit  34.71 
 
 		 303 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2568  transketolase domain-containing protein  34.71 
 
 		 303 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.974177  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1404  transketolase, C-terminal subunit  34.71 
 
 		 303 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.108594  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1792  transketolase subunit B  31.87 
 
 		 310 aa  70.5  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0510195  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2481  transketolase domain protein  29.31 
 
 		 317 aa  70.5  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.120495  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2130  transketolase, C-terminal subunit  34.71 
 
 		 303 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.963697  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3184  transketolase, C-terminal subunit  34.71 
 
 		 303 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2569  transketolase domain protein  29.31 
 
 		 317 aa  70.5  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.126502  normal  0.742091 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2515  transketolase domain-containing protein  34.71 
 
 		 303 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0444  Transketolase central region  37.78 
 
 		 636 aa  70.1  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0697  transketoloase, C half  33.65 
 
 		 104 aa  70.1  0.00000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.837924  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2526  transketolase domain protein  29.31 
 
 		 317 aa  70.1  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.508569 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3878  transketolase, central region  35.2 
 
 		 342 aa  70.1  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.733485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2581  transketolase domain-containing protein  29.31 
 
 		 317 aa  70.5  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.230809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2689  transketolase domain-containing protein  29.31 
 
 		 317 aa  70.5  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.423567 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6295  Transketolase central region  28.28 
 
 		 332 aa  70.1  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0365  transketolase central region  23.05 
 
 		 312 aa  69.7  0.00000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.556876  normal  0.0129681 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0265  Transketolase central region  29.49 
 
 		 310 aa  69.7  0.00000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00214892 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2827  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  30 
 
 		 635 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6781  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  29.63 
 
 		 653 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.772471  hitchhiker  0.0000939262 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0200  transketolase, C-terminal subunit  26.28 
 
 		 309 aa  68.6  0.0000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0300  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  31.48 
 
 		 628 aa  68.2  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.533137  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1430  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  33.52 
 
 		 643 aa  68.6  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0817623 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0711  Transketolase central region  25.08 
 
 		 315 aa  68.6  0.0000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00000202012  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09721  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  31.48 
 
 		 628 aa  68.6  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.274515 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2842  transketolase subunit B  28.74 
 
 		 317 aa  68.2  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.837175  normal  0.299247 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3648  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  26.98 
 
 		 634 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2875  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  30.04 
 
 		 632 aa  67.8  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4486  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  26.98 
 
 		 646 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3879  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  26.98 
 
 		 646 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.155835 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1225  deoxyxylulose-5-phosphate synthase  30.58 
 
 		 636 aa  68.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0333  Transketolase central region  29.38 
 
 		 322 aa  67.8  0.0000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1554  transketolase central region  21.82 
 
 		 312 aa  68.2  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0600642  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1157  deoxyxylulose-5-phosphate synthase  30.58 
 
 		 636 aa  68.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4820  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  27.16 
 
 		 646 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0817  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  30 
 
 		 639 aa  67  0.0000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.64849  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2221  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  31.91 
 
 		 636 aa  66.6  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3948  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  29.41 
 
 		 632 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1852  deoxyxylulose-5-phosphate synthase  30.37 
 
 		 640 aa  67  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0671  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  27.53 
 
 		 643 aa  66.2  0.0000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0293  putative transketolase, C-terminal subunit  30.06 
 
 		 314 aa  66.2  0.0000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0288  transketolase  30.06 
 
 		 314 aa  66.2  0.0000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000211069  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1878  transketolase subunit B  27.46 
 
 		 312 aa  65.9  0.0000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0969  transketolase, central region  25.09 
 
 		 306 aa  65.9  0.0000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86113  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0958  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  34.59 
 
 		 591 aa  65.5  0.0000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00233267  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3250  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  26.6 
 
 		 646 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0235548 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3776  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  26.6 
 
 		 634 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.495759  normal  0.0534173 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0905  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  24.81 
 
 		 617 aa  65.5  0.000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>