228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1685 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_1685  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
859 aa  1745    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.159285 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7635  glycosyl transferase group 1  35.33 
 
 
507 aa  255  3e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.212629  normal  0.696625 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1689  glycosyl transferase group 1  38.67 
 
 
540 aa  253  1e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.224017  hitchhiker  0.00115774 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1690  glycosyl transferase, group 1  37.03 
 
 
517 aa  250  8e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.539973  normal  0.752628 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1691  glycosyl transferase, group 1  36.78 
 
 
550 aa  249  2e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.389067 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1687  glycosyl transferase group 1  38.54 
 
 
519 aa  241  5e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00440693 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7642  glycosyl transferase group 1  34.82 
 
 
516 aa  232  2e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2080  glycosyl transferase, group 1  36.23 
 
 
447 aa  211  4e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.371281  normal  0.082698 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7643  hypothetical protein  36.13 
 
 
503 aa  202  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4643  glycosyl transferase group 1  32.6 
 
 
518 aa  199  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.39122  normal  0.263686 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7644  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
545 aa  195  4e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.939663  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09040  glycosyltransferase  39.57 
 
 
861 aa  185  4.0000000000000006e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.892968  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08660  glycosyltransferase  34.44 
 
 
484 aa  130  9.000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.773029 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1385  glycosyl transferase group 1  25.37 
 
 
415 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.011099 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7646  hypothetical protein  32.13 
 
 
420 aa  110  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1854  glycosyl transferase group 1  36.29 
 
 
377 aa  103  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1295  glycosyl transferase group 1  26.68 
 
 
522 aa  90.1  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0960  glycosyl transferase, group 1  27.55 
 
 
430 aa  87.4  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5367  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.68 
 
 
432 aa  84.7  0.000000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5518  group 1 family glycosyl transferase  24.68 
 
 
432 aa  84.3  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0525  phosphatidylserine decarboxylase proenzyme  30.92 
 
 
204 aa  82  0.00000000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5126  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.54 
 
 
424 aa  79.3  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0756  glycosyl transferase group 1  27.88 
 
 
445 aa  79.3  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.621398  hitchhiker  0.000561624 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0584  glycosyl transferase group 1  23.72 
 
 
373 aa  77.8  0.0000000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.83028  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0958  glycosyl transferase, group 1  27.34 
 
 
401 aa  77.4  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4972  glycosyl transferase, group 1; lipopolysaccharide O antigen biosynthesis protein  27.41 
 
 
433 aa  76.6  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1825  glycosyl transferase group 1  25.24 
 
 
353 aa  75.5  0.000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0354  glycosyl transferase group 1  27.6 
 
 
381 aa  71.2  0.00000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7648  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 
388 aa  70.5  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4468  glycosyl transferase group 1  27.57 
 
 
457 aa  67.4  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2518  glycosyl transferase group 1  29.95 
 
 
411 aa  67  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.377974  normal  0.0256247 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1494  glycosyl transferase group 1  32.74 
 
 
399 aa  66.6  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0529  DedA family protein  26.28 
 
 
428 aa  65.5  0.000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2141  glycosyltransferase  24.04 
 
 
416 aa  65.1  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00102383  normal  0.405566 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1562  glycosyl transferase, group 1  27.36 
 
 
463 aa  64.3  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.515981 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0143  hypothetical protein  24.62 
 
 
369 aa  63.9  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0148  capsular polysaccharide synthesis enzyme Cap5I  24.62 
 
 
369 aa  63.9  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4272  glycosyl transferase group 1  25.35 
 
 
390 aa  63.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2781  a-glycosyltransferase  23.1 
 
 
378 aa  63.5  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.27166  normal  0.140971 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4332  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
390 aa  62.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.112045 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0634  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.59 
 
 
398 aa  61.6  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.888697  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1996  glycosyl transferase group 1  27.98 
 
 
367 aa  61.6  0.00000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0691436 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0612  glycosyl transferase group 1  27.51 
 
 
378 aa  59.7  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1920  glycosyl transferase, group 1  26.95 
 
 
481 aa  59.7  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1032  glycosyl transferase group 1  26.07 
 
 
390 aa  60.1  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2375  glycosyl transferase group 1  25.4 
 
 
415 aa  60.1  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6507  glycosyl transferase group 1  26.85 
 
 
383 aa  60.1  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.961113  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1114  glycosyltransferase (group I)  23.98 
 
 
404 aa  59.3  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  26.09 
 
 
453 aa  59.3  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2414  glycosyl transferase group 1 family protein  28.41 
 
 
360 aa  58.9  0.0000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2253  hypothetical protein  22.82 
 
 
386 aa  58.9  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0192058  hitchhiker  0.00258376 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2234  glycosyl transferase, group 1  27.53 
 
 
380 aa  58.5  0.0000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1144  glycosyl transferase group 1  28.4 
 
 
386 aa  58.5  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.157277  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0654  glycosyl transferase group 1  27.47 
 
 
392 aa  57.8  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.871092  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1195  hypothetical protein  32.8 
 
 
420 aa  57  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.291365  normal  0.75436 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1678  glycosyl transferase, group 1  26.73 
 
 
373 aa  57.4  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2445  glycosyl transferase group 1  28.67 
 
 
375 aa  57.4  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0294  glycosyl transferase, group 1  28.14 
 
 
413 aa  56.6  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3307  glycosyl transferase, group 1  23.89 
 
 
392 aa  57  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.322102 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3605  glycosyl transferase, group 1  27.78 
 
 
405 aa  57  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.1788 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0088  glycosyl transferase group 1  26.71 
 
 
369 aa  56.2  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.323047  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3504  glycosyl transferase group 1  25.2 
 
 
400 aa  56.2  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.0009700000000003e-28 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3120  glycosyl transferase, group 1  25.32 
 
 
372 aa  55.8  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2715  glycosyl transferase group 1  27.93 
 
 
375 aa  56.2  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0136  glycosyl transferase, group 1  28.03 
 
 
417 aa  55.8  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3904  glycosyl transferase group 1  26.71 
 
 
374 aa  55.1  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0152  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.94 
 
 
403 aa  55.1  0.000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1963  glycosyl transferase group 1  26.92 
 
 
409 aa  55.1  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1351  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.22 
 
 
390 aa  55.1  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3439  glycosyl transferase group 1  24.8 
 
 
400 aa  54.7  0.000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.359579  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0137  glycosyl transferase, group 1  23.05 
 
 
411 aa  54.7  0.000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0776455  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1243  glycosyl transferase group 1  21.32 
 
 
366 aa  54.7  0.000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.160132  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5856  putative glycosyl transferase  31.75 
 
 
420 aa  54.3  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1604  glycosyl transferase, group 1  23.98 
 
 
385 aa  53.9  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6558  glycosyl transferase group 1  26.09 
 
 
458 aa  53.5  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02010  glycosyltransferase  28.57 
 
 
389 aa  53.5  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.472903  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0620  hypothetical protein  29.6 
 
 
437 aa  53.5  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.583449  decreased coverage  0.00968427 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0418  hypothetical protein  36.99 
 
 
462 aa  53.1  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.510346  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2160  glycosyl transferase group 1  29.76 
 
 
517 aa  53.5  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28310  glycosyltransferase  24.91 
 
 
417 aa  53.1  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0640064  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30010  hypothetical protein  30.26 
 
 
416 aa  52.8  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.255646  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2226  hypothetical protein  26.52 
 
 
418 aa  52.4  0.00004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2772  glycosyl transferase, group 1  24.19 
 
 
463 aa  52  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0611  glycosyl transferase, family 1  26.51 
 
 
440 aa  52.4  0.00004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1306  glycosyl transferase group 1  26.4 
 
 
422 aa  52.4  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.622401  normal  0.676262 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2959  glycosyl transferase group 1  27.21 
 
 
398 aa  52  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000811696 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5685  UDP-galactopyranose mutase  26.58 
 
 
783 aa  52  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.649144  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1201  WbwZ  22.57 
 
 
369 aa  51.6  0.00006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4204  glycosyl transferase, group 1  27.78 
 
 
398 aa  51.6  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.186805  normal  0.199136 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4294  glycosyl transferase group 1  26.36 
 
 
405 aa  51.6  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.458687 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1050  glycosyl transferase group 1  22.62 
 
 
349 aa  51.6  0.00007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.806851  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1131  glycosyl transferase group 1  25.12 
 
 
904 aa  51.6  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.845699  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3950  glycosyl transferase group 1  25.24 
 
 
372 aa  51.2  0.00007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5066  glycosyl transferase group 1  32.28 
 
 
375 aa  51.2  0.00008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0580  glycosyl transferase, group 1  31.08 
 
 
417 aa  50.8  0.00009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2238  putative glycosyl transferase, group 1  25.66 
 
 
409 aa  50.4  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.180955 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3903  hypothetical protein  20.51 
 
 
405 aa  50.4  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2340  glycosyl transferase, group 1  29.17 
 
 
397 aa  50.4  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.107482  normal  0.0271805 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1624  glycosyl transferase group 1  26.63 
 
 
414 aa  50.8  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  26.54 
 
 
410 aa  50.4  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>