More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0241 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_0241  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 
119 aa  236  1e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000436096 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1535  ArsR family transcriptional regulator  81.58 
 
 
142 aa  182  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0449302 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2848  transcriptional regulator, ArsR family  76.07 
 
 
118 aa  164  5e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000188384  normal  0.0300767 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1865  transcriptional regulator, ArsR family  52.04 
 
 
105 aa  92  2e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4480  transcriptional regulator, ArsR family  52.13 
 
 
152 aa  91.3  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0251  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 
120 aa  84.7  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.947144 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1233  transcriptional regulator, ArsR family  41.12 
 
 
123 aa  77.4  0.00000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2551  regulatory protein ArsR  40.62 
 
 
111 aa  72.8  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.365475  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3867  regulatory protein ArsR  41.67 
 
 
118 aa  69.7  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.248206  normal  0.706318 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3353  ArsR family transcriptional regulator  41.67 
 
 
98 aa  70.1  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6292  transcriptional regulator, ArsR family  43.43 
 
 
116 aa  69.3  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5842  transcriptional regulator, ArsR family  37.14 
 
 
109 aa  67.8  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2053  ArsR family transcriptional regulator  41.84 
 
 
104 aa  67  0.00000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.373705 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0344  transcriptional regulator, ArsR family  44.09 
 
 
118 aa  66.6  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4541  ArsR family transcriptional regulator  37.04 
 
 
107 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4852  ArsR family transcriptional regulator  36.11 
 
 
107 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.607394  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4606  ArsR family transcriptional regulator  36.11 
 
 
107 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.325995  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4442  ArsR family transcriptional regulator  36.11 
 
 
107 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00577501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4460  ArsR family transcriptional regulator  36.11 
 
 
107 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4962  ArsR family transcriptional regulator  36.11 
 
 
107 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0995274  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4822  transcriptional regulator, ArsR family  36.11 
 
 
107 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4828  transcriptional regulator, ArsR family  36.11 
 
 
107 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4846  transcriptional regulator, ArsR family  36.11 
 
 
107 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.018293  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0414  transcriptional regulator, ArsR family  36.11 
 
 
107 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0893062  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0248  regulatory protein ArsR  40.21 
 
 
109 aa  64.3  0.0000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0900  putative regulatory protein  39 
 
 
121 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2602  ArsR family transcriptional regulator  39 
 
 
121 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2464  ArsR family transcriptional regulator  39 
 
 
121 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.889424  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0561  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
121 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.30241  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1120  transcriptional regulator, ArsR family  39.39 
 
 
112 aa  62.8  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.360075 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2988  transcriptional regulator, ArsR family  36.04 
 
 
106 aa  61.6  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11840  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 
119 aa  61.2  0.000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3790  ArsR family transcriptional regulator  35.64 
 
 
117 aa  60.8  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS04778  putative transcription regulator protein  34.51 
 
 
111 aa  60.5  0.000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05659  putative transcription regulator protein  34.51 
 
 
111 aa  60.5  0.000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10586  ArsR family transcriptional regulator  43.53 
 
 
437 aa  60.5  0.000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.4131599999999997e-27  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22920  transcriptional regulator, ArsR family  38.78 
 
 
119 aa  60.5  0.000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2213  transcriptional regulator, ArsR family  33.03 
 
 
118 aa  60.1  0.000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5830  putative transcriptional regulator, ArsR family  39.42 
 
 
128 aa  60.1  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3603  ArsR family transcriptional regulator  34.38 
 
 
107 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2069  transcriptional regulator, ArsR family  35.11 
 
 
107 aa  59.3  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.685217  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4442  ArsR family transcriptional regulator  34.38 
 
 
107 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.550147  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8897  putative transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 
109 aa  58.9  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2302  transcriptional regulator, ArsR family  35.11 
 
 
107 aa  58.9  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.640095 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3925  ArsR family transcriptional regulator  34.38 
 
 
107 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.725948  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3937  regulatory protein, ArsR  41.03 
 
 
109 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1116  ArsR family transcriptional regulator  40.19 
 
 
117 aa  59.3  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.090181 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2215  ArsR family transcriptional regulator  41.49 
 
 
111 aa  58.5  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2618  regulatory protein ArsR  30.77 
 
 
105 aa  58.2  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.656493 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0777  transcriptional regulator, ArsR family  40.48 
 
 
119 aa  57.8  0.00000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0774  ArsR family transcriptional regulator  37.78 
 
 
107 aa  57.8  0.00000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0625  ArsR family transcriptional regulator  41.41 
 
 
117 aa  57.8  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.906206 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0602  regulatory protein ArsR  37.23 
 
 
123 aa  57.8  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3347  transcriptional regulator, ArsR family  34.65 
 
 
115 aa  57.8  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.226308  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2811  transcriptional regulator, ArsR family  35.05 
 
 
330 aa  57.4  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377915  normal  0.0677625 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1109  ArsR family transcriptional regulator  31.87 
 
 
106 aa  57.4  0.00000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00776839  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1976  ArsR family transcriptional regulator  33.68 
 
 
104 aa  57  0.00000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0087105 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3302  ArsR family transcriptional regulator  34.38 
 
 
107 aa  57  0.00000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.402945 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0349  transcriptional regulator, ArsR family  40.24 
 
 
119 aa  56.6  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3297  transcriptional regulator, ArsR family  36.13 
 
 
268 aa  56.2  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.481478  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4277  transcriptional regulator, ArsR family  30.77 
 
 
108 aa  56.2  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1684  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 
104 aa  56.2  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.366307  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3050  transcriptional regulator, ArsR family  29.29 
 
 
106 aa  55.5  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.157425 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2299  ArsR family transcriptional regulator  41.98 
 
 
115 aa  55.5  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4878  transcriptional regulator, TrmB  45.59 
 
 
109 aa  56.2  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2161  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
111 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4310  transcriptional regulator, TrmB  39.51 
 
 
118 aa  56.2  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0416057  normal  0.35783 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1802  ArsR family transcriptional regulator  35.48 
 
 
116 aa  55.8  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.35409  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2692  ArsR family transcriptional regulator  45.59 
 
 
250 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0598068  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3818  ArsR family transcriptional regulator  33 
 
 
107 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.365616  normal  0.735015 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2736  ArsR family transcriptional regulator  45.59 
 
 
250 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.341929  normal  0.257848 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0693  regulatory protein, ArsR  39.33 
 
 
110 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0273557 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2722  ArsR family transcriptional regulator  45.59 
 
 
250 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.180734  normal  0.430326 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3902  regulatory protein, ArsR  43.59 
 
 
109 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.894762 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2454  ArsR family transcriptional regulator  33.66 
 
 
115 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4133  regulatory protein ArsR  32.22 
 
 
106 aa  55.1  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2829  regulatory protein, ArsR  27.66 
 
 
108 aa  55.1  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00161963  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2149  regulatory protein, ArsR  28.72 
 
 
108 aa  55.5  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4060  ArsR family transcriptional regulator  37.23 
 
 
104 aa  55.1  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.525402  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0357  transcriptional regulator  33.33 
 
 
112 aa  55.5  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.228653  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3489  ArsR family transcriptional regulator  35.56 
 
 
107 aa  55.5  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.656263 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2621  ArsR family transcriptional regulator  34.04 
 
 
107 aa  54.7  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.136975  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0482  regulatory protein ArsR  34.69 
 
 
108 aa  55.1  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2050  ArsR family transcriptional regulator  32.63 
 
 
104 aa  54.7  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.824329  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3981  helix-turn-helix, type 11  30.3 
 
 
107 aa  54.7  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1533  ArsR family transcriptional regulator  34.02 
 
 
104 aa  54.3  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.188631  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3921  transcriptional regulator, ArsR family  38.64 
 
 
105 aa  54.3  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0529731  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4502  regulatory protein ArsR  32.98 
 
 
107 aa  54.3  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.329127 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12026  transcriptional regulator  43.21 
 
 
118 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000227381  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0489  transcriptional regulator, ArsR family  30.3 
 
 
107 aa  54.3  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.686455  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5727  transcriptional regulator, ArsR family  37.63 
 
 
111 aa  54.3  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.513261  normal  0.813202 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0828  transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 
113 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.196547  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7744  transcriptional regulator, ArsR family  27.62 
 
 
113 aa  54.3  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4658  ArsR family transcriptional regulator  35.11 
 
 
107 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2300  transcriptional regulator, ArsR family  36.59 
 
 
99 aa  54.3  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.290076  hitchhiker  0.000322902 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0484  regulatory protein ArsR  36.36 
 
 
109 aa  53.9  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.491743 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4542  regulatory protein ArsR  41.89 
 
 
111 aa  53.9  0.0000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.436444 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4571  regulatory protein ArsR  43.24 
 
 
168 aa  53.5  0.0000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0539  transcriptional regulator, ArsR family  40.74 
 
 
124 aa  53.5  0.0000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6785  ArsR family transcriptional regulator  32.99 
 
 
104 aa  53.5  0.0000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0336525 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>