84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_3173 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_3173  hypothetical protein  100 
 
 		 245 aa  457  9.999999999999999e-129  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0558  hypothetical protein  74.9 
 
 		 243 aa  329  3e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0510  hypothetical protein  71.67 
 
 		 247 aa  321  6e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3616  hypothetical protein  71.67 
 
 		 247 aa  320  9.000000000000001e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.632032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3441  hypothetical protein  71.67 
 
 		 247 aa  320  9.999999999999999e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0614  hypothetical protein  70.83 
 
 		 247 aa  320  9.999999999999999e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4058  hypothetical protein  69.58 
 
 		 247 aa  315  5e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4043  hypothetical protein  69.46 
 
 		 244 aa  308  4e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0534  hypothetical protein  71.67 
 
 		 247 aa  306  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0518  hypothetical protein  68.33 
 
 		 246 aa  304  7e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0562  protein of unknown function DUF81  71.25 
 
 		 247 aa  303  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3778  hypothetical protein  71.25 
 
 		 247 aa  303  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0558  hypothetical protein  70.83 
 
 		 247 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3553  hypothetical protein  69.96 
 
 		 246 aa  295  7e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.767129  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0613  hypothetical protein  71.62 
 
 		 244 aa  293  2e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0620  hypothetical protein  72.88 
 
 		 244 aa  289  3e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1263  membrane protein  45.38 
 
 		 242 aa  178  5.999999999999999e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05889  hypothetical protein  42.67 
 
 		 240 aa  168  9e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1803  hypothetical protein  42.04 
 
 		 242 aa  166  4e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.426487  normal  0.0717892 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000279  hypothetical protein  42.02 
 
 		 240 aa  166  4e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0189  hypothetical protein  41.63 
 
 		 240 aa  162  3e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3856  hypothetical protein  34.93 
 
 		 241 aa  140  1.9999999999999998e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.497532  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22430  protein of unknown function DUF81  35.77 
 
 		 238 aa  129  5.0000000000000004e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.745875  normal  0.877077 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0416  hypothetical protein  35.56 
 
 		 242 aa  125  6e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  0.0000000286057  normal  0.0207815 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0033  protein of unknown function DUF81  34.3 
 
 		 241 aa  120  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.37483 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1706  hypothetical protein  34.93 
 
 		 243 aa  115  5e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0821668  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1751  protein of unknown function DUF81  33.89 
 
 		 240 aa  112  6e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.138812  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1019  hypothetical protein  34.76 
 
 		 240 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.132736  normal  0.524557 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4346  hypothetical protein  34.67 
 
 		 251 aa  109  4.0000000000000004e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0440  hypothetical protein  34.98 
 
 		 239 aa  107  1e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.871963  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2275  hypothetical protein  35.96 
 
 		 235 aa  107  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.188651 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2849  protein of unknown function DUF81  35.38 
 
 		 261 aa  106  3e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1919  hypothetical protein  29.11 
 
 		 268 aa  94.4  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.28526  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3303  hypothetical protein  29.66 
 
 		 257 aa  94.4  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5062  hypothetical protein  31.34 
 
 		 241 aa  93.6  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.254511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2191  hypothetical protein  31.51 
 
 		 243 aa  87.8  2e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.496448 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0676  hypothetical protein  26.99 
 
 		 236 aa  82  0.000000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119238  normal  0.11063 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4529  hypothetical protein  26.36 
 
 		 235 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4204  hypothetical protein  34.97 
 
 		 174 aa  80.9  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4254  hypothetical protein  37.56 
 
 		 245 aa  75.5  0.0000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.600925 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1591  protein of unknown function DUF81  29.8 
 
 		 247 aa  72  0.000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0129546  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2292  hypothetical protein  27.32 
 
 		 249 aa  69.3  0.00000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.353248  normal  0.347992 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0136  hypothetical protein  28.95 
 
 		 262 aa  68.6  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0115  protein of unknown function DUF81  29 
 
 		 262 aa  65.5  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.117057  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3658  hypothetical protein  25.96 
 
 		 241 aa  59.3  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2380  hypothetical protein  32.42 
 
 		 240 aa  58.9  0.00000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.333988 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15250  hypothetical protein  32.88 
 
 		 260 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.206346  hitchhiker  0.0000000000944272 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3844  hypothetical protein  30.54 
 
 		 235 aa  57  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1940  hypothetical protein  30.71 
 
 		 284 aa  56.6  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000335524  normal  0.789392 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1342  hypothetical protein  32.42 
 
 		 260 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0354  protein of unknown function DUF81  27.23 
 
 		 239 aa  56.2  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1687  hypothetical protein  24.68 
 
 		 241 aa  55.5  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3833  protein of unknown function DUF81  30 
 
 		 267 aa  54.7  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1898  protein of unknown function DUF81  27.71 
 
 		 247 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1149  protein of unknown function DUF81  27.51 
 
 		 297 aa  52  0.000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.702872 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1041  protein of unknown function DUF81  26.14 
 
 		 241 aa  52  0.00001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0163787  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1485  hypothetical protein  30.81 
 
 		 255 aa  49.3  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1716  hypothetical protein  24.38 
 
 		 241 aa  48.9  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1495  membrane protein  24.26 
 
 		 241 aa  49.3  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4756  hypothetical protein  28.83 
 
 		 251 aa  48.5  0.00009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1504  membrane protein  23.97 
 
 		 241 aa  48.1  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000123127  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1649  hypothetical protein  23.97 
 
 		 241 aa  48.1  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1530  hypothetical protein  23.97 
 
 		 241 aa  48.1  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1943  hypothetical protein  28.44 
 
 		 247 aa  47.4  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1535  hypothetical protein  24.35 
 
 		 241 aa  47.8  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.671723  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2202  hypothetical protein  25.46 
 
 		 251 aa  47  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0392424  normal  0.159254 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0936  putative integral membrane protein  32.45 
 
 		 278 aa  46.2  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2506  hypothetical protein  34.27 
 
 		 239 aa  45.8  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.000601102  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0300  hypothetical protein  31.52 
 
 		 248 aa  45.1  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000467082 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2375  protein of unknown function DUF81  27.91 
 
 		 251 aa  45.4  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1794  hypothetical protein  25 
 
 		 241 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4590  hypothetical protein  32.49 
 
 		 255 aa  44.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0205  protein of unknown function DUF81  27.78 
 
 		 254 aa  44.3  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.670843 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4163  hypothetical protein  25.85 
 
 		 246 aa  43.9  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2748  hypothetical protein  22.22 
 
 		 272 aa  44.3  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1317  protein of unknown function DUF81  28.57 
 
 		 263 aa  43.9  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1737  hypothetical protein  24.27 
 
 		 241 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.593381  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2505  hypothetical protein  29.06 
 
 		 245 aa  43.9  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00117063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0506  hypothetical protein  31.58 
 
 		 244 aa  43.1  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0953317  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0211  hypothetical protein  32.35 
 
 		 258 aa  42.7  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.963682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0530  hypothetical protein  29.7 
 
 		 261 aa  42.7  0.005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2931  hypothetical protein  23.87 
 
 		 240 aa  42.4  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1828  hypothetical protein  27.63 
 
 		 247 aa  42.4  0.007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.501819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0977  hypothetical protein  26.44 
 
 		 244 aa  42.4  0.007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000649549 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>