93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_1456 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_1456  hypothetical protein  100 
 
 		 198 aa  397  9.999999999999999e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.32928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2748  DoxX family protein  78.45 
 
 		 198 aa  295  2e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.505798 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2495  DoxX family protein  77.6 
 
 		 197 aa  294  7e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.640487  hitchhiker  0.00764206 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2305  DoxX family protein  78.02 
 
 		 202 aa  293  1e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0149049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1799  DoxX family protein  78.09 
 
 		 197 aa  292  2e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.534282  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2375  DoxX family protein  77.05 
 
 		 197 aa  291  3e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.65179  normal  0.888641 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1832  DoxX family protein  74.86 
 
 		 197 aa  286  1e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.174691  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1531  DoxX family protein  75.14 
 
 		 197 aa  286  1e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2479  DoxX family protein  78.65 
 
 		 197 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1807  DoxX family protein  78.09 
 
 		 197 aa  281  3.0000000000000004e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1846  DoxX family protein  78.09 
 
 		 197 aa  280  9e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1739  DoxX family protein  79.75 
 
 		 196 aa  274  6e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2710  hypothetical protein  75.66 
 
 		 197 aa  269  2e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1890  DoxX family protein  78.21 
 
 		 195 aa  263  1e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2316  DoxX  75 
 
 		 196 aa  246  2e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1616  DoxX  59.47 
 
 		 216 aa  232  2.0000000000000002e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21600  hypothetical protein  61.17 
 
 		 196 aa  226  2e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1556  DoxX family protein  69.33 
 
 		 199 aa  221  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.783773  normal  0.0736532 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01645  DoxX  59.24 
 
 		 204 aa  219  1.9999999999999999e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0455186  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1839  hypothetical protein  61.71 
 
 		 196 aa  217  1e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.780129  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2586  DoxD-like family protein  48.29 
 
 		 232 aa  177  5.999999999999999e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1803  integral membrane protein  30.81 
 
 		 144 aa  67.4  0.0000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000242993  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3092  hypothetical protein  28.98 
 
 		 147 aa  67.4  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3268  DoxX family protein  39.29 
 
 		 198 aa  57.4  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1174  DoxX family protein  39.6 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1790  DoxX  33.09 
 
 		 134 aa  54.3  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.146919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4189  DoxX family protein  40 
 
 		 164 aa  53.5  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1376  DoxX family protein  44.44 
 
 		 143 aa  53.5  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.813801 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2086  DoxX family protein  38.04 
 
 		 149 aa  52  0.000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07631  hypothetical protein  36.73 
 
 		 185 aa  51.6  0.000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0159355 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0907  DoxX family protein  37.14 
 
 		 147 aa  51.6  0.000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0131  hypothetical protein  36.73 
 
 		 185 aa  51.6  0.000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2290  hypothetical protein  28.24 
 
 		 144 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0467  DoxX family protein  34.09 
 
 		 148 aa  51.2  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1058  membrane protein  35.29 
 
 		 172 aa  51.2  0.00001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.533713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2441  DoxX family protein  52.94 
 
 		 144 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.630068  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1774  DoxD-like family protein  29.21 
 
 		 148 aa  50.4  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0191  hypothetical protein  34.83 
 
 		 133 aa  50.1  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0173  hypothetical protein  34.83 
 
 		 133 aa  50.1  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00275718  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27070  hypothetical protein  37.08 
 
 		 144 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.814369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0022  hypothetical protein  28.33 
 
 		 146 aa  50.1  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1744499999999998e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3790  DoxX family protein  39.24 
 
 		 181 aa  50.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.459957 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15461  hypothetical protein  34.69 
 
 		 183 aa  49.7  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.414315  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15611  hypothetical protein  34.34 
 
 		 183 aa  49.7  0.00003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0237618  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5222  DoxX family protein  37.11 
 
 		 144 aa  49.7  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1770  DoxD-like family protein  40.86 
 
 		 148 aa  49.3  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1457  hypothetical protein  33.33 
 
 		 182 aa  49.3  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01610  hypothetical protein  37.65 
 
 		 123 aa  48.5  0.00006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.186029  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6046  DoxX family protein  35.71 
 
 		 137 aa  48.5  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.392213 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15211  hypothetical protein  36.67 
 
 		 188 aa  48.1  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.869968  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02099  putative membrane DoxD-like family protein  27.87 
 
 		 151 aa  47.8  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0678079  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3635  DoxX family protein  40.23 
 
 		 131 aa  47.8  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176177  hitchhiker  0.000433315 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3022  DoxX family protein  44.44 
 
 		 153 aa  47.8  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.43506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1389  hypothetical protein  41.05 
 
 		 146 aa  47.8  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0236091 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4592  DoxX family protein  32.86 
 
 		 174 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0566  hypothetical protein  46.81 
 
 		 145 aa  47  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00681752  normal  0.504746 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4226  DoxX family protein  30.71 
 
 		 173 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0529  DoxX  30.61 
 
 		 164 aa  46.2  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.494405 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0957  membrane protein  37.78 
 
 		 172 aa  46.6  0.0003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.699944  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4019  DoxX  36.36 
 
 		 144 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.394883  normal  0.482629 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3319  hypothetical protein  41.49 
 
 		 147 aa  45.8  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2112  DoxX family protein  33.57 
 
 		 171 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.733626 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2820  DoxX family protein  30.56 
 
 		 148 aa  45.1  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3021  DoxX family protein  34.38 
 
 		 133 aa  45.4  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.867125  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1292  DoxX family protein  40.43 
 
 		 147 aa  45.1  0.0008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0246117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1221  DoxX family protein  40.43 
 
 		 147 aa  45.1  0.0008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.806219  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0540  DoxX family protein  30.53 
 
 		 154 aa  44.7  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2953  DoxX  35.16 
 
 		 147 aa  44.7  0.0009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1303  DoxX family protein  29.25 
 
 		 173 aa  44.3  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.279966 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4623  DoxX family protein  34.12 
 
 		 139 aa  44.3  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000208807  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0526  DoxX family protein  33.67 
 
 		 154 aa  44.3  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0354  DoxX  30.59 
 
 		 127 aa  44.3  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.388731  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1222  DoxX family protein  40.43 
 
 		 147 aa  44.7  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3051  DoxX family protein  37.36 
 
 		 136 aa  43.5  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.127697 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6351  DoxX family protein  35.79 
 
 		 141 aa  43.5  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5400  DoxX family protein  35.71 
 
 		 137 aa  43.5  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0358694  normal  0.0708806 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0136  hypothetical protein  34.69 
 
 		 145 aa  43.9  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.636829  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4045  DoxX family protein  33.33 
 
 		 135 aa  43.1  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0512358 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0782  DoxX  31.32 
 
 		 149 aa  43.1  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1273  DoxX  31.11 
 
 		 150 aa  43.1  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.346263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1677  DoxX  35.87 
 
 		 149 aa  43.9  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14324  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0221  hypothetical protein  42.39 
 
 		 148 aa  43.9  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1637  DoxX  33.33 
 
 		 137 aa  42.7  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00123238  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1426  hypothetical protein  37.37 
 
 		 149 aa  42.7  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.165574 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7619  DoxX  33.33 
 
 		 137 aa  42.7  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0190  DoxX  32.99 
 
 		 145 aa  42.4  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000463146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4083  DoxX  34.02 
 
 		 173 aa  42  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4159  DoxX family protein  34.02 
 
 		 173 aa  42  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.273208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4313  DoxX family protein  34.02 
 
 		 173 aa  42  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.514901 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2995  DoxX family protein  32.56 
 
 		 143 aa  41.6  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00203576  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3706  DoxX family protein  32.14 
 
 		 137 aa  41.6  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1934  DoxX family protein  41.27 
 
 		 155 aa  41.2  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.467271  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3837  SURF4 domain-containing protein  41.27 
 
 		 137 aa  41.2  0.01  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  normal  0.973533 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>