More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1944 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_1944  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
249 aa  487  1e-137  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1130  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  39.04 
 
 
295 aa  146  3e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1434  alpha/beta hydrolase  36.86 
 
 
261 aa  129  6e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1392  Poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  36.12 
 
 
301 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.507189  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4596  alpha/beta hydrolase fold protein  36.86 
 
 
260 aa  115  6e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5795  poly(3-hydroxyalkanoic acid) depolymerase  34.09 
 
 
285 aa  107  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.945125  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66830  poly(3-hydroxyalkanoic acid) depolymerase  34.09 
 
 
285 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0393  Poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  32.95 
 
 
284 aa  107  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.208502 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0529  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  32.83 
 
 
285 aa  107  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0460  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  32.6 
 
 
285 aa  105  7e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.434689  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3966  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  31.78 
 
 
298 aa  103  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5144  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  31.4 
 
 
285 aa  103  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5054  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  32.26 
 
 
283 aa  102  5e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5004  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  32.26 
 
 
283 aa  102  7e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4878  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  32.26 
 
 
305 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.636657 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2136  Poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  32.58 
 
 
280 aa  98.6  8e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.264144  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2383  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  32.08 
 
 
294 aa  93.6  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.38703  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2786  Alpha/beta hydrolase fold  31.47 
 
 
266 aa  82  0.000000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0115  alpha/beta hydrolase fold protein  25.69 
 
 
267 aa  71.6  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1861  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29 
 
 
371 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0337473  normal  0.0227354 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6242  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29 
 
 
371 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1837  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29 
 
 
371 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.282403  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1230  alpha/beta hydrolase fold  26.12 
 
 
261 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6602  alpha/beta hydrolase fold  26.12 
 
 
261 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.472817  normal  0.1504 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2251  Alpha/beta hydrolase fold-1  31.54 
 
 
284 aa  62  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154511  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2798  alpha/beta hydrolase fold protein  28.4 
 
 
270 aa  61.2  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7870  alpha/beta hydrolase fold protein  28.38 
 
 
250 aa  60.5  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.645188  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2832  3-oxoadipate enol-lactonase  30.71 
 
 
393 aa  60.5  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.448984  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1695  alpha/beta hydrolase fold protein  30.36 
 
 
284 aa  60.8  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.194275  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5996  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)  26.83 
 
 
260 aa  60.5  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1622  alpha/beta hydrolase fold  29.96 
 
 
284 aa  60.5  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1436  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.61 
 
 
371 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00517321 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  29.23 
 
 
272 aa  60.1  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.343862 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0737  alpha/beta hydrolase fold protein  30.11 
 
 
273 aa  59.7  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.755425  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1441  alpha/beta hydrolase fold  27.85 
 
 
267 aa  59.7  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.481122  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0636  alpha/beta hydrolase fold protein  33.87 
 
 
263 aa  59.3  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4759  alpha/beta hydrolase fold  28.27 
 
 
331 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00472864  normal  0.0179653 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5467  alpha/beta hydrolase fold protein  30.86 
 
 
273 aa  59.3  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4731  alpha/beta hydrolase fold  31.33 
 
 
287 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.807147  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3585  alpha/beta hydrolase fold  30.77 
 
 
270 aa  58.9  0.00000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  28.2 
 
 
301 aa  58.9  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2732  alpha/beta hydrolase fold  25.91 
 
 
271 aa  58.9  0.00000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1681  alpha/beta hydrolase fold  28.06 
 
 
273 aa  58.5  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0641945  normal  0.147127 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2477  Alpha/beta hydrolase fold  28.4 
 
 
289 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  29.71 
 
 
350 aa  57.4  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1863  hydrolase, alpha/beta fold family  28.57 
 
 
286 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.67904  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0220  alpha/beta hydrolase fold  27.48 
 
 
272 aa  57  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.723702 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3347  3-oxoadipate enol-lactonase  30 
 
 
391 aa  56.6  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000820278  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3776  alpha/beta hydrolase fold  30.04 
 
 
361 aa  56.2  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.904669  decreased coverage  0.00241214 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5269  alpha/beta hydrolase fold  31.14 
 
 
287 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0267  alpha/beta family hydrolase  25.93 
 
 
277 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2292  alpha/beta hydrolase fold  32.69 
 
 
275 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.288944 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5177  alpha/beta hydrolase fold  27.17 
 
 
284 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.299682  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  26.01 
 
 
287 aa  56.2  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5163  alpha/beta hydrolase fold  27.04 
 
 
272 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.365318  normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5020  3-oxoadipate enol-lactonase  28 
 
 
256 aa  55.8  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.42347 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4262  esterase/lipase/thioesterase  34.75 
 
 
262 aa  55.8  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4136  alpha/beta hydrolase fold  34.75 
 
 
262 aa  55.8  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5253  arylesterase, putative  27.04 
 
 
272 aa  55.5  0.0000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0337  alpha/beta hydrolase fold  29.96 
 
 
261 aa  55.5  0.0000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0245494  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2405  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.63 
 
 
369 aa  55.8  0.0000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0222007  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0351  alpha/beta hydrolase fold  27.91 
 
 
283 aa  55.5  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.825015  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37050  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  32.46 
 
 
285 aa  55.5  0.0000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.557179 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3143  alpha/beta hydrolase fold  28.83 
 
 
309 aa  55.5  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.03403  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0643  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase  27.23 
 
 
267 aa  55.1  0.0000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3546  3-oxoadipate enol-lactonase  32.35 
 
 
251 aa  55.5  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0975813  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1673  alpha/beta hydrolase fold protein  28.81 
 
 
267 aa  55.5  0.0000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.114563 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2974  3-oxoadipate enol-lactonase  27.42 
 
 
260 aa  55.1  0.0000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.108542  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3016  3-oxoadipate enol-lactonase  27.42 
 
 
260 aa  55.1  0.0000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.352868  normal  0.357434 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2328  alpha/beta hydrolase fold protein  27.64 
 
 
270 aa  54.7  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.674989  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3605  alpha/beta hydrolase fold  23.93 
 
 
284 aa  55.1  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.753861  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1255  alpha/beta hydrolase fold  24.4 
 
 
334 aa  55.1  0.000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000653812  decreased coverage  0.00236014 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1070  4-carboxymuconolactone decarboxylase / 3-oxoadipate enol-lactonase  30.29 
 
 
397 aa  54.7  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0857204 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2696  alpha/beta hydrolase fold  26.7 
 
 
312 aa  54.7  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1039  alpha/beta hydrolase fold protein  27.2 
 
 
277 aa  54.3  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4206  3-oxoadipate enol-lactonase  27.35 
 
 
268 aa  54.7  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0111  alpha/beta hydrolase fold  26.25 
 
 
287 aa  53.9  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2526  alpha/beta hydrolase fold  32.69 
 
 
275 aa  54.3  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0648  alpha/beta hydrolase fold protein  27.85 
 
 
226 aa  53.9  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0281045 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4321  alpha/beta hydrolase fold  33.04 
 
 
280 aa  53.9  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0798376 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13198  peroxidase  25.28 
 
 
286 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.285642 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  25.36 
 
 
314 aa  53.9  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5083  3-oxoadipate enol-lactonase  31.67 
 
 
260 aa  54.3  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0592  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.03 
 
 
368 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1086  alpha/beta hydrolase fold protein  27.68 
 
 
241 aa  54.7  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6652  alpha/beta hydrolase fold  25.56 
 
 
278 aa  53.5  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.451286 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0531  alpha/beta hydrolase fold  29.32 
 
 
264 aa  53.1  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0176995 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7714  alpha/beta hydrolase fold protein  33.84 
 
 
286 aa  53.1  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37110  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  29.33 
 
 
268 aa  53.1  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5227  alpha/beta hydrolase fold protein  27.27 
 
 
233 aa  52.8  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.968895  normal  0.10834 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3664  alpha/beta hydrolase fold protein  26.92 
 
 
350 aa  53.1  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1826  alpha/beta hydrolase fold  38.1 
 
 
285 aa  53.1  0.000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.363916  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2323  alpha/beta hydrolase fold protein  29.39 
 
 
260 aa  52.8  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.262735  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3606  alpha/beta hydrolase fold  34.17 
 
 
265 aa  52.8  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000510854 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5507  alpha/beta hydrolase fold  24.12 
 
 
269 aa  52.8  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00124996 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1470  alpha/beta hydrolase fold protein  28.23 
 
 
315 aa  52.4  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1053  alpha/beta hydrolase fold protein  25.11 
 
 
286 aa  52.4  0.000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.73231  normal  0.291985 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2283  3-oxoadipate enol-lactonase  37.97 
 
 
263 aa  52  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal  0.256435 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1000  alpha/beta hydrolase fold  29.79 
 
 
285 aa  52  0.000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000731693  hitchhiker  0.000000950161 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0367  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
207 aa  52  0.000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.775873  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>