More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0251 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_0251  ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 
267 aa  539  9.999999999999999e-153  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000273  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2076  ABC transporter, ATP-binding protein  80.52 
 
 
267 aa  443  1e-123  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000172805  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2830  ABC transporter related  51.7 
 
 
267 aa  281  6.000000000000001e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1947  ABC transporter related  50.94 
 
 
264 aa  281  1e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.477016  normal  0.349831 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1748  ABC transporter related  50.94 
 
 
264 aa  281  1e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3143  ABC transporter-related protein  50.94 
 
 
264 aa  280  1e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.288919  normal  0.982216 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0323  hypothetical protein  51.89 
 
 
264 aa  278  8e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0704987  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2163  ABC transporter related  50 
 
 
264 aa  276  2e-73  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.573773 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1463  ABC transporter related  51.32 
 
 
264 aa  274  1.0000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.466344  hitchhiker  0.000000593097 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1504  ABC transporter related  50.94 
 
 
264 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1111  ABC transporter, ATPase subunit  53.39 
 
 
260 aa  273  3e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4313  ABC transporter related  51.32 
 
 
264 aa  272  4.0000000000000004e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.887716  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1118  ABC transporter, ATPase subunit  52.96 
 
 
270 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.505252  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2586  ABC transporter related protein  51.14 
 
 
262 aa  271  9e-72  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000199395  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0075  ABC transporter related  52.99 
 
 
282 aa  271  1e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2854  ABC transporter related protein  51.52 
 
 
264 aa  270  2e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3142  ABC transporter, ATP-binding protein  49.43 
 
 
264 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0690  ABC transport system ATP-binding protein  49.43 
 
 
264 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.553471  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1477  ABC transporter, ATP-binding protein  49.43 
 
 
264 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0111  ABC transporter, ATP-binding protein  49.43 
 
 
264 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2905  ABC transporter, ATP-binding protein  49.43 
 
 
264 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0524  ABC transporter, ATP-binding protein  49.43 
 
 
264 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1313  ABC transporter related  50.57 
 
 
264 aa  269  4e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0442  ABC transporter, ATP-binding protein  49.43 
 
 
264 aa  268  5e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0762699  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4551  ABC transporter related  52.45 
 
 
264 aa  268  5e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000329769  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1209  ABC transporter-related protein  49.43 
 
 
264 aa  268  5e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0487778 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1571  ABC transporter related  52.08 
 
 
265 aa  268  7e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.865643  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0507  ABC transporter, ATP-binding protein  49.43 
 
 
264 aa  268  8e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03830  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  49.05 
 
 
263 aa  268  8.999999999999999e-71  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3721  ABC transporter related  49.81 
 
 
264 aa  267  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1601  ABC transporter related  50.2 
 
 
264 aa  266  2e-70  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.81737 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14370  putative ABC-transporter ATP-binding component  50.94 
 
 
264 aa  266  2e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6159  ABC transporter, ATPase subunit  49.06 
 
 
264 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.395057 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1275  ABC transporter ATP-binding protein  50.57 
 
 
264 aa  265  5.999999999999999e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0474  ABC transporter related  49.06 
 
 
264 aa  264  1e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.753612  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1475  ABC transporter related protein  48.86 
 
 
265 aa  264  1e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2840  ABC transporter related  48.68 
 
 
264 aa  263  2e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0659  ABC transporter related  48.3 
 
 
264 aa  263  2e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.548438  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2216  ABC transporter related  48.68 
 
 
264 aa  263  2e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.315955  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2829  ABC transporter related  48.68 
 
 
264 aa  263  2e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0235677  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1437  ABC transporter, ATPase subunit  49.8 
 
 
264 aa  263  3e-69  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.432186 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19970  ABC transporter related  48.86 
 
 
265 aa  263  3e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0719287  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0725  ABC transporter related protein  46.79 
 
 
265 aa  262  4e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.129055  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4044  ABC transporter related  48.68 
 
 
264 aa  262  4.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1087  ABC transporter related  48.3 
 
 
264 aa  261  6e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1714  ABC transporter related  49.41 
 
 
264 aa  261  1e-68  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0481461  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0738  ABC transporter related  47.35 
 
 
265 aa  260  1e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000124437 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1738  ABC transporter ATP-binding protein  49.43 
 
 
264 aa  259  2e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.924585  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2040  ABC transporter-related protein  48.48 
 
 
264 aa  258  6e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0865072 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002972  ABC transporter ATP-binding protein  46.97 
 
 
264 aa  257  1e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0212  ABC transporter, ATP-binding protein  47.19 
 
 
265 aa  256  2e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.272765  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3065  ABC transporter related  47.92 
 
 
264 aa  254  7e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1951  ABC transporter related  46.79 
 
 
264 aa  252  5.000000000000001e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.168978  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0630  ABC transporter related  48.29 
 
 
263 aa  251  9.000000000000001e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.764744  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0621  ABC transporter, ATP-binding protein  49.59 
 
 
245 aa  249  4e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.183641  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0865  ABC transporter related  46.59 
 
 
264 aa  248  6e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0823  ABC transporter ATP-binding protein  44.94 
 
 
267 aa  246  3e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0106274 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2104  ABC transporter component  47.1 
 
 
264 aa  246  4e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0049  ABC transporter, ATP-binding protein  44.7 
 
 
264 aa  244  9.999999999999999e-64  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1976  ABC transporter, ATP-binding protein  45.45 
 
 
264 aa  244  9.999999999999999e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.333354  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2056  ABC transporter, ATP-binding protein  45.45 
 
 
264 aa  243  1.9999999999999999e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02938  hypothetical protein  46.59 
 
 
264 aa  243  1.9999999999999999e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2869  ABC transporter related  44.74 
 
 
265 aa  241  1e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2862  ABC transporter related protein  47.81 
 
 
270 aa  237  1e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1945  ABC transporter related  44.14 
 
 
264 aa  236  4e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.446826  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1819  ABC transporter related  47.2 
 
 
254 aa  234  1.0000000000000001e-60  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000182766  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2362  ABC transporter related protein  43.89 
 
 
261 aa  231  8.000000000000001e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000588091  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1504  ABC transporter related  44.7 
 
 
296 aa  231  9e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0269  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  45.38 
 
 
256 aa  225  6e-58  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.43348  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2225  ABC transporter related  44.22 
 
 
257 aa  224  1e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0489859  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0260  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  47.2 
 
 
254 aa  224  1e-57  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0044  ABC transporter related  45.74 
 
 
251 aa  221  9.999999999999999e-57  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0207  ABC transporter related protein  46.8 
 
 
262 aa  220  1.9999999999999999e-56  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1187  ABC transporter, ATP-binding protein  43.82 
 
 
253 aa  219  5e-56  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.708158  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1153  ABC transporter ATP-binding protein  45.6 
 
 
252 aa  219  5e-56  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0266393  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0077  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  46.96 
 
 
251 aa  216  5e-55  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1100  ABC transporter related  39.33 
 
 
242 aa  178  9e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1919  ABC transporter related  35.78 
 
 
244 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.831773  normal  0.256849 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0935  ABC transporter-related protein  36.64 
 
 
247 aa  135  7.000000000000001e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.132872  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0303  ABC transporter related  35.34 
 
 
243 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5462  ABC transporter-like  34.05 
 
 
245 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1271  ABC transporter related  36.32 
 
 
329 aa  129  3e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0543066 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1504  ABC transporter related  33.6 
 
 
257 aa  129  5.0000000000000004e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5248  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  32.76 
 
 
244 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0295  ABC transporter  33.19 
 
 
244 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1314  ABC transporter related  35.62 
 
 
329 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.159195  normal  0.508 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0910  ABC transporter related  34.48 
 
 
243 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.19269  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3310  ABC transporter related  34.85 
 
 
247 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3187  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  34.85 
 
 
248 aa  126  3e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3326  ABC transporter related  34.85 
 
 
248 aa  126  3e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24380  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  33.2 
 
 
275 aa  126  3e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.446861  normal  0.0741452 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1025  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  33.88 
 
 
667 aa  126  4.0000000000000003e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.129474 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3446  purine catabolism protein PucG  34.44 
 
 
506 aa  126  4.0000000000000003e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3594  ABC transporter related  36.41 
 
 
266 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.258671  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0446  ABC transporter related  33.47 
 
 
242 aa  126  5e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4923  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  34.8 
 
 
668 aa  125  6e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.502071 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0130  ABC-type phosphate/phosphonate transport system, ATPase component  35.83 
 
 
261 aa  125  7e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000163104  hitchhiker  0.00000028065 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0208  ABC transporter-related protein  33.33 
 
 
245 aa  125  8.000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3466  ABC transporter related protein  34.44 
 
 
247 aa  125  8.000000000000001e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1722  ABC transporter ATP-binding protein  35.04 
 
 
329 aa  125  9e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.109279 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>