More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1082 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1082  geranyltranstransferase  100 
 
 		 293 aa  595  1e-169  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1580  polyprenyl synthetase  68.94 
 
 		 293 aa  400  9.999999999999999e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.211276  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1613  polyprenyl synthetase  68.94 
 
 		 293 aa  400  9.999999999999999e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000880061  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0250  Polyprenyl synthetase  48.49 
 
 		 297 aa  268  5e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2320  Polyprenyl synthetase  52.06 
 
 		 297 aa  263  2e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0831  farnesyl-diphosphate synthase  47.35 
 
 		 295 aa  237  2e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000171972  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1417  polyprenyl synthetase  46.33 
 
 		 296 aa  237  2e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.430266  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1076  polyprenyl synthetase  44.17 
 
 		 294 aa  236  3e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00179719  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1257  Polyprenyl synthetase  47.84 
 
 		 295 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00136441  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3026  Polyprenyl synthetase  44.09 
 
 		 295 aa  233  3e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0608  Polyprenyl synthetase  44.95 
 
 		 307 aa  232  4.0000000000000004e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.887352 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1902  Polyprenyl synthetase  45.02 
 
 		 294 aa  230  2e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.267224  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2439  Polyprenyl synthetase  45.55 
 
 		 290 aa  226  4e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.097508  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1081  polyprenyl synthetase  46.62 
 
 		 300 aa  225  6e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.168923  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0681  polyprenyl synthetase  51.57 
 
 		 299 aa  225  7e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11761  polyprenyl synthetase  45.28 
 
 		 299 aa  224  1e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11601  polyprenyl synthetase  46.04 
 
 		 300 aa  224  1e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15151  polyprenyl synthetase  51.57 
 
 		 299 aa  224  1e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.423714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3491  Polyprenyl synthetase  51.26 
 
 		 290 aa  223  2e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000932682  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0156  Polyprenyl synthetase  43.16 
 
 		 309 aa  223  2e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0152  Polyprenyl synthetase  43.16 
 
 		 309 aa  223  2e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00117274  hitchhiker  0.00332618 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11751  polyprenyl synthetase  45.28 
 
 		 300 aa  223  3e-57  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2704  farnesyl-diphosphate synthase  45.28 
 
 		 309 aa  222  7e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000153186  normal  0.671867 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09331  polyprenyl synthetase  49.33 
 
 		 306 aa  221  9e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.47365 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11191  polyprenyl synthetase  42.55 
 
 		 300 aa  221  9.999999999999999e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.646183 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4198  geranyltranstransferase  47.01 
 
 		 296 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.116270000000001e-26 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4082  geranyltranstransferase  47.01 
 
 		 296 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3920  geranyltranstransferase  47.01 
 
 		 296 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00628392  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3931  geranyltranstransferase  47.01 
 
 		 296 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4402  geranyltranstransferase  47.01 
 
 		 296 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.137146  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4251  geranyltranstransferase  47.01 
 
 		 296 aa  220  3e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0195367  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4308  geranyltranstransferase  47.01 
 
 		 296 aa  220  3e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000458101  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0972  Polyprenyl synthetase  46.72 
 
 		 320 aa  219  3.9999999999999997e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23311  normal  0.31243 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0946  geranyltranstransferase  46.64 
 
 		 296 aa  217  2e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.228897  hitchhiker  0.0000625392 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4288  geranyltranstransferase  46.64 
 
 		 296 aa  216  2e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.185381  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0776  farnesyl-diphosphate synthase  45.97 
 
 		 301 aa  216  2.9999999999999998e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4173  farnesyl-diphosphate synthase  50.67 
 
 		 316 aa  216  2.9999999999999998e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16632  normal  0.522672 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17563  predicted protein  45.1 
 
 		 312 aa  216  4e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0164113  normal  0.0513256 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3212  geranyltranstransferase  41.98 
 
 		 299 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000111364 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1049  farnesyl-diphosphate synthase  41.26 
 
 		 294 aa  214  9.999999999999999e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0934  geranyltranstransferase  43.8 
 
 		 298 aa  213  1.9999999999999998e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.298715  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2871  polyprenyl synthetase  47.57 
 
 		 297 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.369696  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4030  polyprenyl synthetase  46.64 
 
 		 297 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0332417  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0926  farnesyl-diphosphate synthase  45.45 
 
 		 301 aa  213  3.9999999999999995e-54  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.19869  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2755  farnesyl-diphosphate synthase  39.41 
 
 		 299 aa  211  7.999999999999999e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1025  polyprenyl synthetase  42.57 
 
 		 295 aa  211  1e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2074  geranyltranstransferase  46.55 
 
 		 290 aa  211  1e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00203562  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1788  geranyltranstransferase  44.9 
 
 		 290 aa  211  1e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.188169  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2437  polyprenyl synthetase  41.18 
 
 		 298 aa  209  3e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19000  farnesyltranstransferase  42.51 
 
 		 337 aa  207  1e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.916261  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1538  polyprenyl synthetase  48.68 
 
 		 294 aa  207  1e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000356422  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2618  farnesyl-diphosphate synthase  43.43 
 
 		 305 aa  207  2e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0818  Polyprenyl synthetase  38.05 
 
 		 309 aa  206  3e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.238069 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1456  farnesyl-diphosphate synthase  40.22 
 
 		 299 aa  206  3e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.292762  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1513  farnesyl-diphosphate synthase  46.05 
 
 		 297 aa  206  4e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1500  polyprenyl synthetase  37.82 
 
 		 327 aa  205  6e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1697  farnesyl-diphosphate synthase  40.42 
 
 		 297 aa  204  1e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.110898 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2894  Polyprenyl synthetase  38.3 
 
 		 292 aa  204  1e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1746  farnesyl-diphosphate synthase  36.46 
 
 		 306 aa  201  9e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.302231 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06510  farnesyl-diphosphate synthase  49.57 
 
 		 296 aa  201  9.999999999999999e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000111006  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1926  farnesyl-diphosphate synthase  50.22 
 
 		 296 aa  201  9.999999999999999e-51  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0833  farnesyl-diphosphate synthase  42.31 
 
 		 299 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0162065  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1181  farnesyl-diphosphate synthase  44.8 
 
 		 290 aa  199  3.9999999999999996e-50  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00529094  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1916  Polyprenyl synthetase  40.97 
 
 		 294 aa  199  3.9999999999999996e-50  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0739  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  41.44 
 
 		 296 aa  199  5e-50  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.396283  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1004  Polyprenyl synthetase  44.36 
 
 		 299 aa  198  7e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000588963  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2404  polyprenyl synthetase  41.85 
 
 		 297 aa  198  9e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0620494  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7621  farnesyl-diphosphate synthase  44.07 
 
 		 307 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0290776  normal  0.578843 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2586  Polyprenyl synthetase  40.96 
 
 		 296 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0968269  normal  0.362813 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1089  geranyltranstransferase  45.39 
 
 		 300 aa  196  3e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2435  geranyltranstransferase  38.91 
 
 		 293 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.408518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0516  polyprenyl synthetase  43.4 
 
 		 308 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.472432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0413  geranyltranstransferase  43.15 
 
 		 294 aa  196  4.0000000000000005e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.058519  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0497  polyprenyl synthetase  43.83 
 
 		 308 aa  195  8.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.385542  normal  0.0104009 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1668  geranyltranstransferase (farnesyldiphosphate synthase)  44.31 
 
 		 296 aa  194  1e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000016201  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3432  farnesyl-diphosphate synthase  40.53 
 
 		 315 aa  194  1e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1264  Polyprenyl synthetase  36.81 
 
 		 297 aa  194  2e-48  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3372  polyprenyl synthetase  36.77 
 
 		 298 aa  194  2e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1182  geranyltranstransferase, farnesyl diphosphate synthase  48.37 
 
 		 290 aa  194  2e-48  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1423  Polyprenyl synthetase  40.21 
 
 		 300 aa  192  5e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.37451  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1765  geranyltranstransferase  41.85 
 
 		 297 aa  192  6e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316781  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2770  polyprenyl synthetase  43.48 
 
 		 293 aa  192  6e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.409346 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004257  octaprenyl-diphosphate synthase/dimethylallyltransferase/geranyltranstransferase/ geranylgeranyl pyrophosphate synthetase  40.07 
 
 		 294 aa  192  6e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0623  polyprenyl synthetase  42.55 
 
 		 308 aa  192  6e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.226314  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2183  Polyprenyl synthetase  39.86 
 
 		 297 aa  192  8e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000465843  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1276  polyprenyl synthetase  39.02 
 
 		 293 aa  191  1e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0835849  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0945  farnesyl-diphosphate synthase  39.27 
 
 		 306 aa  191  1e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2990  polyprenyl synthetase  43.09 
 
 		 293 aa  191  2e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0298794  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2176  polyprenyl synthetase  43.48 
 
 		 297 aa  191  2e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000107352  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0313  polyprenyl synthetase  41.7 
 
 		 321 aa  190  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.732711 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2512  polyprenyl synthetase  40.47 
 
 		 335 aa  191  2e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0498  geranyltranstransferase, putative  44.96 
 
 		 290 aa  190  2.9999999999999997e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1935  farnesyl-diphosphate synthase  40.14 
 
 		 297 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1526  geranyltranstransferase  39.02 
 
 		 293 aa  189  4e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2037  polyprenyl synthetase  38.7 
 
 		 296 aa  189  4e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0888  geranyltranstransferase  41.98 
 
 		 299 aa  189  4e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0904  farnesyl-diphosphate synthase  42.25 
 
 		 296 aa  189  4e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0525  Polyprenyl synthetase  42.98 
 
 		 308 aa  189  5e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0462  geranyltranstransferase  41.98 
 
 		 299 aa  189  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0483  geranyltranstransferase  41.98 
 
 		 299 aa  189  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.351097  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>