More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2953 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2953  MscS mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 331 aa  654    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3310  MscS mechanosensitive ion channel  39.15 
 
 		 289 aa  129  6e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.026322  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23390  MscS Mechanosensitive ion channel  37.91 
 
 		 299 aa  129  7.000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350298  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0082  MscS mechanosensitive ion channel  31.75 
 
 		 303 aa  120  3e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0423997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2396  MscS mechanosensitive ion channel  34.76 
 
 		 283 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000120764  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2980  mechanosensitive ion channel family protein  28.79 
 
 		 286 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3421  MscS Mechanosensitive ion channel  28.99 
 
 		 299 aa  110  3e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0306302  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0039  hypothetical protein  28.96 
 
 		 291 aa  109  8.000000000000001e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2511  MscS mechanosensitive ion channel  33.2 
 
 		 282 aa  108  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.399769  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2658  mechanosensitive ion channel family protein  28.41 
 
 		 286 aa  108  1e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0115442  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0435  MscS mechanosensitive ion channel  34.95 
 
 		 288 aa  107  2e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1247  MscS Mechanosensitive ion channel  33.66 
 
 		 370 aa  108  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3550  MscS Mechanosensitive ion channel  32.34 
 
 		 294 aa  108  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2935  MscS Mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 		 282 aa  100  3e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.863949  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0420  hypothetical protein  32.63 
 
 		 293 aa  97.4  3e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.387203  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0409  hypothetical protein  32.63 
 
 		 293 aa  97.4  3e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0214224  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3355  MscS Mechanosensitive ion channel  31.53 
 
 		 278 aa  96.3  7e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5330  mechanosensitive ion channel family protein  29.85 
 
 		 293 aa  95.9  9e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.368223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5158  mechanosensitive ion channel family protein  29.85 
 
 		 293 aa  95.9  9e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5726  mechanosensitive ion channel family protein  29.85 
 
 		 293 aa  95.9  9e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0727395  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5587  mechanosensitive ion channel family protein  29.85 
 
 		 293 aa  95.9  9e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000187397 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5174  mechanosensitive ion channel family protein  31.68 
 
 		 293 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4017  MscS mechanosensitive ion channel  32.18 
 
 		 285 aa  95.1  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5628  mechanosensitive ion channel family protein  31.68 
 
 		 293 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0177271  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5604  mechanosensitive ion channel family protein  31.68 
 
 		 293 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0082714  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5331  mechanosensitive ion channel family protein  31.68 
 
 		 293 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0115523  hitchhiker  0.00000270411 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5664  mechanosensitive ion channel family protein  31.68 
 
 		 293 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.11477  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5270  MscS mechanosensitive ion channel  30.69 
 
 		 285 aa  93.6  4e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0190  small-conductance mechanosensitive channel  30.98 
 
 		 263 aa  93.6  4e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0410  MscS Mechanosensitive ion channel  30.04 
 
 		 372 aa  92.8  7e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.486058 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3024  MscS Mechanosensitive ion channel  29.6 
 
 		 309 aa  92.4  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1378  MscS mechanosensitive ion channel  31.82 
 
 		 342 aa  90.5  4e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.586081  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0499  mechanosensitive ion channel  31.63 
 
 		 321 aa  89.4  8e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.979826 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11820  small-conductance mechanosensitive channel  28.99 
 
 		 336 aa  89.4  8e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.139296 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24600  small-conductance mechanosensitive channel  33.16 
 
 		 337 aa  89  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.503052  normal  0.13458 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4450  MscS mechanosensitive ion channel  33.63 
 
 		 334 aa  89  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0602  MscS mechanosensitive ion channel  31.53 
 
 		 568 aa  89  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0823902  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0540  MscS Mechanosensitive ion channel  31.38 
 
 		 582 aa  89  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3373  MscS Mechanosensitive ion channel  34.16 
 
 		 528 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2729  MscS Mechanosensitive ion channel  34.16 
 
 		 528 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0104  hypothetical protein  33.53 
 
 		 280 aa  87  4e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0511133  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3531  MscS Mechanosensitive ion channel  31 
 
 		 356 aa  86.7  5e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.902273 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0571  MscS Mechanosensitive ion channel  27.42 
 
 		 260 aa  85.9  9e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000639441  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6682  MscS mechanosensitive ion channel  32.83 
 
 		 293 aa  85.1  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5312  MscS mechanosensitive ion channel  31.75 
 
 		 454 aa  84.3  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.262454  normal  0.518656 
 
 
-
 
NC_002936  DET1579  mechanosensitive ion channel family protein  28.9 
 
 		 455 aa  84  0.000000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.397271  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1412  MscS Mechanosensitive ion channel  27.56 
 
 		 550 aa  84.3  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0610  hypothetical protein  29.82 
 
 		 599 aa  84  0.000000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1324  MscS mechanosensitive ion channel  28.1 
 
 		 458 aa  84  0.000000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00452452  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1691  small-conductance mechanosensitive channel  40.58 
 
 		 290 aa  84  0.000000000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1535  MscS Mechanosensitive ion channel  30.82 
 
 		 336 aa  83.6  0.000000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.20239  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1631  MscS mechanosensitive ion channel  32.03 
 
 		 414 aa  83.6  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.697444 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2054  MscS Mechanosensitive ion channel  31.09 
 
 		 350 aa  83.2  0.000000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.553207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1916  MscS mechanosensitive ion channel  34.38 
 
 		 308 aa  83.6  0.000000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.944422 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1456  mechanosensitive ion channel protein  27.78 
 
 		 455 aa  83.2  0.000000000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000389307  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1580  MscS mechanosensitive ion channel  31.53 
 
 		 319 aa  82.4  0.000000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1609  MscS mechanosensitive ion channel  31.53 
 
 		 319 aa  82.4  0.000000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1634  MscS mechanosensitive ion channel  31.53 
 
 		 319 aa  82.4  0.000000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.112948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3455  MscS Mechanosensitive ion channel  32.24 
 
 		 320 aa  81.6  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.739809  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1224  MscS Mechanosensitive ion channel  33.12 
 
 		 838 aa  81.3  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13121  transmembrane protein  38.52 
 
 		 308 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.609452 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1398  MscS Mechanosensitive ion channel  32.69 
 
 		 266 aa  80.9  0.00000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1100  MscS Mechanosensitive ion channel  32.91 
 
 		 341 aa  80.9  0.00000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0753115  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4634  MscS Mechanosensitive ion channel  27.06 
 
 		 334 aa  80.9  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0333987  normal  0.045581 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7354  mechanosensitive ion channel  31.65 
 
 		 337 aa  80.1  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2421  hypothetical protein  27.65 
 
 		 295 aa  79.7  0.00000000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0349242  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2189  MscS mechanosensitive ion channel  32.42 
 
 		 821 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.744699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1154  MscS mechanosensitive ion channel  28.67 
 
 		 442 aa  79.7  0.00000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3994  hypothetical protein  32.47 
 
 		 792 aa  79.7  0.00000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.535307  normal  0.386715 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3024  MscS Mechanosensitive ion channel  31.6 
 
 		 344 aa  79.3  0.00000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3624  MscS mechanosensitive ion channel  32.97 
 
 		 822 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.749548 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0128  MscS mechanosensitive ion channel  32.07 
 
 		 275 aa  79  0.00000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4463  MscS mechanosensitive ion channel  32.97 
 
 		 822 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.141403  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3903  MscS mechanosensitive ion channel  32.97 
 
 		 822 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3376  MscS mechanosensitive ion channel  29.53 
 
 		 271 aa  79  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0228253  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0846  mechanosensitive ion channel protein MscS  29.76 
 
 		 537 aa  79  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11550  small-conductance mechanosensitive channel  26.99 
 
 		 316 aa  78.6  0.0000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09010  small-conductance mechanosensitive channel  29.55 
 
 		 298 aa  77.8  0.0000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0427247  normal  0.0153093 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1912  MscS mechanosensitive ion channel  32.12 
 
 		 325 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.476783  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1136  MscS Mechanosensitive ion channel  26.36 
 
 		 325 aa  78.6  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1895  small-conductance mechanosensitive ion channel  31.44 
 
 		 787 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0950  MscS mechanosensitive ion channel  30.83 
 
 		 787 aa  77.8  0.0000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1833  MscS mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 		 394 aa  77.4  0.0000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0544  MscS mechanosensitive ion channel  31.44 
 
 		 787 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4680  MscS mechanosensitive ion channel  34.32 
 
 		 837 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3536  MscS mechanosensitive ion channel  31.55 
 
 		 388 aa  77  0.0000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0901  MscS Mechanosensitive ion channel  32.28 
 
 		 766 aa  77  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3962  MscS mechanosensitive ion channel  28.65 
 
 		 538 aa  76.6  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000243935  hitchhiker  0.0037815 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7342  MscS Mechanosensitive ion channel  33.57 
 
 		 342 aa  76.6  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00546474 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1514  MscS mechanosensitive ion channel  30.51 
 
 		 836 aa  76.3  0.0000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.767095  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1801  MscS Mechanosensitive ion channel  31.14 
 
 		 335 aa  76.3  0.0000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0940  MscS Mechanosensitive ion channel  31.4 
 
 		 293 aa  76.3  0.0000000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.285938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1188  MscS Mechanosensitive ion channel  27.5 
 
 		 549 aa  76.3  0.0000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3911  MscS mechanosensitive ion channel  35.95 
 
 		 367 aa  76.3  0.0000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4901  MscS Mechanosensitive ion channel  29.8 
 
 		 301 aa  76.3  0.0000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4477  MscS mechanosensitive ion channel  32.72 
 
 		 772 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0181  MscS mechanosensitive ion channel  36.97 
 
 		 707 aa  74.3  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0266  small-conductance mechanosensitive channel-like  28.57 
 
 		 505 aa  75.1  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0068339 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2167  MscS Mechanosensitive ion channel  28.88 
 
 		 228 aa  74.7  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000258413 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2612  MscS mechanosensitive ion channel  33.95 
 
 		 273 aa  73.9  0.000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>