More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2469 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2469  pantothenate synthetase  100 
 
 		 291 aa  575  1.0000000000000001e-163  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.163424  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0141  pantothenate synthetase  54.04 
 
 		 283 aa  282  6.000000000000001e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1667  pantoate--beta-alanine ligase  48.77 
 
 		 280 aa  281  7.000000000000001e-75  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1740  pantoate--beta-alanine ligase  48.77 
 
 		 280 aa  281  8.000000000000001e-75  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0901  pantoate--beta-alanine ligase  46.67 
 
 		 281 aa  273  3e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00163902  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1980  pantoate--beta-alanine ligase  45.45 
 
 		 282 aa  270  2e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0333  pantoate--beta-alanine ligase  55.26 
 
 		 278 aa  269  5e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0426  pantoate--beta-alanine ligase  50 
 
 		 283 aa  266  4e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3014  pantoate/beta-alanine ligase  48.23 
 
 		 281 aa  265  7e-70  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.207166 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0744  pantoate--beta-alanine ligase  54.72 
 
 		 278 aa  263  3e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.809915  hitchhiker  0.00112992 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0102  pantoate--beta-alanine ligase  48.74 
 
 		 282 aa  262  4e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.346263  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1571  pantoate--beta-alanine ligase  45.61 
 
 		 280 aa  262  6e-69  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0464  pantoate/beta-alanine ligase  52.67 
 
 		 281 aa  258  7e-68  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0161  pantoate--beta-alanine ligase  47.9 
 
 		 281 aa  257  1e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.253183  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1266  pantoate/beta-alanine ligase  45.16 
 
 		 289 aa  257  2e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1789  pantoate--beta-alanine ligase  47.02 
 
 		 281 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3460  pantoate--beta-alanine ligase  46.67 
 
 		 276 aa  252  4.0000000000000004e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1524  pantoate--beta-alanine ligase  44.88 
 
 		 280 aa  252  5.000000000000001e-66  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2916  pantoate--beta-alanine ligase  52.11 
 
 		 277 aa  252  6e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.011824  normal  0.110502 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1786  pantoate/beta-alanine ligase  44.37 
 
 		 281 aa  251  7e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.300346  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0728  pantoate--beta-alanine ligase  48.24 
 
 		 277 aa  251  7e-66  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.41941  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_708  pantothenate synthetase  48.59 
 
 		 277 aa  251  1e-65  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1876  pantoate/beta-alanine ligase  50.51 
 
 		 288 aa  249  5e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0830  pantoate/beta-alanine ligase  42.47 
 
 		 279 aa  248  9e-65  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0749  pantoate/beta-alanine ligase  49.47 
 
 		 289 aa  248  1e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0722466  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0084  pantoate--beta-alanine ligase  50.17 
 
 		 287 aa  247  2e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.458072 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4743  pantoate--beta-alanine ligase  47.02 
 
 		 291 aa  245  4.9999999999999997e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.16561 
 
 
-
 
NC_002936  DET0804  pantoate--beta-alanine ligase  50 
 
 		 268 aa  244  9.999999999999999e-64  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0135127  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1610  pantoate--beta-alanine ligase  45.26 
 
 		 280 aa  244  9.999999999999999e-64  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.228935  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1667  pantoate--beta-alanine ligase  41.49 
 
 		 282 aa  244  9.999999999999999e-64  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1151  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  50 
 
 		 527 aa  243  1.9999999999999999e-63  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3339  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  48.48 
 
 		 529 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0155  pantoate--beta-alanine ligase  47.48 
 
 		 282 aa  243  1.9999999999999999e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000243441  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4683  pantoate--beta-alanine ligase  46.81 
 
 		 300 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2060  pantoate--beta-alanine ligase  48.19 
 
 		 291 aa  243  3.9999999999999997e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.047141 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2079  pantoate--beta-alanine ligase  45.61 
 
 		 282 aa  241  1e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0111678  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0342  pantoate--beta-alanine ligase  41.13 
 
 		 282 aa  240  2e-62  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0329  pantoate--beta-alanine ligase  47.87 
 
 		 293 aa  240  2e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.384164  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2430  pantoate/beta-alanine ligase  48.26 
 
 		 288 aa  240  2e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.680362  normal  0.870169 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0320  pantoate--beta-alanine ligase  41.13 
 
 		 282 aa  240  2e-62  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0666  pantoate--beta-alanine ligase  47.54 
 
 		 282 aa  239  2.9999999999999997e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.232247  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0346  pantoate--beta-alanine ligase  47.87 
 
 		 293 aa  239  4e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.900978  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0426  pantoate--beta-alanine ligase  46.81 
 
 		 289 aa  238  5.999999999999999e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.188172  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3426  pantoate/beta-alanine ligase  50.93 
 
 		 294 aa  238  6.999999999999999e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1706  pantoate--beta-alanine ligase  45.26 
 
 		 283 aa  238  8e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260086  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0460  pantothenate synthetase  53.6 
 
 		 334 aa  238  8e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4723  pantoate--beta-alanine ligase  46.45 
 
 		 309 aa  237  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1012  pantoate/beta-alanine ligase  47.37 
 
 		 282 aa  237  2e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0622096 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1014  pantoate--beta-alanine ligase  52.84 
 
 		 290 aa  236  3e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2884  pantothenate synthetase  49.81 
 
 		 296 aa  236  4e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.411032  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9160  Pantoate--beta-alanine ligase  51.13 
 
 		 285 aa  236  4e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0670  pantoate--beta-alanine ligase  50.18 
 
 		 296 aa  236  5.0000000000000005e-61  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.187156 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1525  pantoate-beta-alanine ligase  41.34 
 
 		 283 aa  235  8e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.102611  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1239  pantoate--beta-alanine ligase  45.96 
 
 		 279 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000121643 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4282  pantoate/beta-alanine ligase  46.64 
 
 		 539 aa  232  4.0000000000000004e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0476  pantoate--beta-alanine ligase  43.16 
 
 		 281 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03551  pantothenate synthetase  43.97 
 
 		 282 aa  232  7.000000000000001e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4981  pantoate/beta-alanine ligase  49.82 
 
 		 289 aa  231  9e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0199543  normal  0.96569 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0323  pantoate--beta-alanine ligase  49.47 
 
 		 301 aa  230  2e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2846  pantoate--beta-alanine ligase  46.44 
 
 		 289 aa  230  2e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.664683  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4462  pantoate/beta-alanine ligase  47.1 
 
 		 280 aa  230  2e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0117  pantoate/beta-alanine ligase  45.58 
 
 		 279 aa  229  3e-59  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4487  pantoate/beta-alanine ligase  50.37 
 
 		 287 aa  229  4e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0160  pantoate--beta-alanine ligase  47.3 
 
 		 304 aa  229  4e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3320  pantothenate synthetase  48.58 
 
 		 290 aa  228  7e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5340  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  44 
 
 		 526 aa  228  8e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2606  pantoate/beta-alanine ligase  48.95 
 
 		 288 aa  227  2e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3011  pantoate--beta-alanine ligase  44.76 
 
 		 279 aa  227  2e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4565  pantoate--beta-alanine ligase  46.67 
 
 		 287 aa  227  2e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0650903 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4812  pantoate--beta-alanine ligase  45.77 
 
 		 286 aa  227  2e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.257734  normal  0.0230056 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0369  pantoate--beta-alanine ligase  43.51 
 
 		 283 aa  227  2e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.397358 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1321  pantoate--beta-alanine ligase  48.08 
 
 		 284 aa  226  3e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0313852  normal  0.753592 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0039  pantothenate synthetase  46.91 
 
 		 289 aa  226  3e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4700  pantoate--beta-alanine ligase  46.32 
 
 		 287 aa  226  4e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.497355  hitchhiker  0.000822225 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4557  pantoate/beta-alanine ligase  45.28 
 
 		 280 aa  226  4e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.146553  normal  0.699914 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4699  pantoate--beta-alanine ligase  46.32 
 
 		 287 aa  225  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.021644  hitchhiker  0.00466856 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0241  pantoate--beta-alanine ligase  44.06 
 
 		 281 aa  226  5.0000000000000005e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.139282  normal  0.640321 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1643  pantoate--beta-alanine ligase  45.61 
 
 		 283 aa  225  6e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.966928  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2117  pantoate--beta-alanine ligase  42.35 
 
 		 282 aa  225  6e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1109  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  47.19 
 
 		 511 aa  224  1e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3932  pantoate--beta-alanine ligase  42.96 
 
 		 283 aa  224  1e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.341637  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0042  pantoate--beta-alanine ligase  44.16 
 
 		 273 aa  224  1e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000112642  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1634  pantoate--beta-alanine ligase  44.56 
 
 		 283 aa  223  2e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.366242 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2788  pantothenate synthetase  47.2 
 
 		 282 aa  223  2e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0565  pantothenate synthetase  48.59 
 
 		 286 aa  223  2e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.194299  hitchhiker  0.0000000964689 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1507  pantoate/beta-alanine ligase  43.01 
 
 		 280 aa  223  3e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1829  pantoate--beta-alanine ligase  46.82 
 
 		 283 aa  223  3e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2952  pantothenate synthase  45.64 
 
 		 281 aa  223  3e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.215567  normal  0.0184604 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2096  pantoate/beta-alanine ligase  48.68 
 
 		 302 aa  222  4e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.985614 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0964  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  46.21 
 
 		 534 aa  223  4e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.955795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0090  pantoate/beta-alanine ligase  47.65 
 
 		 273 aa  223  4e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.8293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1370  pantoate--beta-alanine ligase  43.01 
 
 		 273 aa  223  4e-57  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1702  pantoate--beta-alanine ligase  50 
 
 		 283 aa  222  6e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.238045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1080  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  47.19 
 
 		 511 aa  222  6e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0733  pantoate--beta-alanine ligase  46.26 
 
 		 287 aa  222  6e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.536898  hitchhiker  0.0000595497 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0436  pantoate/beta-alanine ligase  46.15 
 
 		 273 aa  221  9e-57  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3003  pantoate--beta-alanine ligase  51.89 
 
 		 279 aa  221  9.999999999999999e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0849834 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8383  pantoate/beta-alanine ligase  46.77 
 
 		 288 aa  220  1.9999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.857994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35550  pantoate--beta-alanine ligase  47.42 
 
 		 302 aa  220  1.9999999999999999e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0479281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1498  pantoate--beta-alanine ligase  46.15 
 
 		 281 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00126611  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>