63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2071 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2071  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 		 471 aa  962    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.170531  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6130  extracellular solute-binding protein family 1  34.13 
 
 		 448 aa  266  5e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.307957  normal  0.305862 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0503  extracellular solute-binding protein  35.09 
 
 		 443 aa  265  1e-69  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000478191  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6542  extracellular solute-binding protein family 1  34.64 
 
 		 448 aa  263  6e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.162087 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1174  extracellular solute-binding protein  35.31 
 
 		 502 aa  255  9e-67  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5250  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  28.93 
 
 		 457 aa  172  1e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.467726  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1345  extracellular solute-binding protein family 1  28.37 
 
 		 456 aa  167  4e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.021804  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4126  extracellular solute-binding protein family 1  30.25 
 
 		 456 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.738673  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0984  extracellular solute-binding protein  23.27 
 
 		 392 aa  67.4  0.0000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000118485  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0966  extracellular solute-binding protein  23.27 
 
 		 392 aa  66.6  0.0000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000011003  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  23.23 
 
 		 431 aa  65.1  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1991  extracellular solute-binding protein  23.13 
 
 		 455 aa  65.9  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.603432  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2378  extracellular solute-binding protein  20.43 
 
 		 451 aa  64.3  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.612639  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2652  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, maltose/maltodextrin-binding protein  21.63 
 
 		 408 aa  59.7  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3132  maltose ABC transporter periplasmic protein  19.78 
 
 		 395 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0559599  normal  0.0111617 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0854  extracellular solute-binding protein family 1  22.61 
 
 		 398 aa  57.8  0.0000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.124504  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1552  extracellular solute-binding protein  21.91 
 
 		 391 aa  55.8  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000398035  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6265  extracellular solute-binding protein family 1  22.85 
 
 		 443 aa  56.2  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2338  maltose-binding periplasmic protein precursor  20.45 
 
 		 408 aa  55.5  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0203  extracellular solute-binding protein family 1  23.95 
 
 		 441 aa  55.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.346278  normal  0.123927 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1020  extracellular solute-binding protein  22.59 
 
 		 459 aa  55.1  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000124434  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2310  extracellular solute-binding protein family 1  24.22 
 
 		 425 aa  54.7  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000523246  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0712  extracellular solute-binding protein family 1  21.13 
 
 		 397 aa  55.1  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.518168  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17020  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  30.11 
 
 		 431 aa  53.9  0.000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00301962  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2315  extracellular solute-binding protein  22.66 
 
 		 455 aa  53.9  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.271919 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2297  extracellular solute-binding protein  26.98 
 
 		 422 aa  53.9  0.000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1614  extracellular solute-binding protein  21.65 
 
 		 391 aa  52.8  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000159886  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0669  extracellular solute-binding protein  22.69 
 
 		 439 aa  52.8  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1105  extracellular solute-binding protein family 1  26.51 
 
 		 443 aa  52.4  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.698754  normal  0.0706181 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15380  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  21.03 
 
 		 465 aa  51.6  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.479356  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0747  extracellular solute-binding protein  24.66 
 
 		 433 aa  50.8  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0354  extracellular solute-binding protein  20.27 
 
 		 419 aa  50.8  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.188589  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0213  twin-arginine translocation pathway signal  23.21 
 
 		 446 aa  50.1  0.00009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001328  maltose/maltodextrin ABC transporter substrate binding periplasmic protein MalE  17.73 
 
 		 392 aa  50.1  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05214  maltose ABC transporter periplasmic protein  17.45 
 
 		 416 aa  48.5  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2108  extracellular solute-binding protein family 1  20.71 
 
 		 430 aa  48.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.553068 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2303  extracellular solute-binding protein family 1  22.88 
 
 		 480 aa  48.1  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.316955  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1099  extracellular solute-binding protein  23.33 
 
 		 457 aa  47.8  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1181  extracellular solute-binding protein  24.84 
 
 		 413 aa  47.8  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000595288  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5151  extracellular solute-binding protein family 1  18.48 
 
 		 400 aa  47.8  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.385349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2305  extracellular solute-binding protein  30.36 
 
 		 459 aa  47  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0744  extracellular solute-binding protein  21.92 
 
 		 432 aa  47  0.0007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0587531  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0596  extracellular solute-binding protein  20.26 
 
 		 390 aa  47  0.0008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00439649  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15040  extracellular solute-binding protein family 1  26.09 
 
 		 458 aa  46.2  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.751229  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0294  maltose ABC transporter periplasmic protein  18.46 
 
 		 406 aa  45.8  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.491527  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0922  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  23.73 
 
 		 447 aa  45.4  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.755265  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0348  extracellular solute-binding protein family 1  20.05 
 
 		 419 aa  45.1  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  19.79 
 
 		 411 aa  45.1  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3106  ABC transporter, substrate binding periplasmic component  21.28 
 
 		 408 aa  44.7  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0829  extracellular solute-binding protein family 1  28.81 
 
 		 465 aa  44.3  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.308126 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3325  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  26.52 
 
 		 422 aa  44.7  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.264788 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1104  hypothetical protein  28.22 
 
 		 467 aa  44.3  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.229225  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0045  extracellular solute-binding protein family 1  26.38 
 
 		 414 aa  44.3  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.713374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1380  extracellular solute-binding protein family 1  22.64 
 
 		 453 aa  44.3  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.031146 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05420  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.44 
 
 		 438 aa  44.3  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0143899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0192  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  28.49 
 
 		 463 aa  44.3  0.005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.245721  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1762  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  26.19 
 
 		 438 aa  43.9  0.006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.0000740157  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4488  extracellular solute-binding protein family 1  21.89 
 
 		 434 aa  43.9  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.395657  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1979  extracellular solute-binding protein family 1  23.66 
 
 		 542 aa  43.9  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7695  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  21.83 
 
 		 435 aa  43.5  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.397837  normal  0.53163 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20470  extracellular solute-binding protein family 1  21.7 
 
 		 406 aa  43.5  0.008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000403753  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4267  extracellular solute-binding protein family 1  23.31 
 
 		 400 aa  43.5  0.008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1085  extracellular solute-binding protein family 1  22.4 
 
 		 451 aa  43.5  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.474529 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>