More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1684 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_0094  ABC sorbitol/mannitol transporter, ATPase subunit  92.17 
 
 		 332 aa  638    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1730  ABC transporter related  92.47 
 
 		 332 aa  640    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.072502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1684  ABC transporter related  100 
 
 		 332 aa  680    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.980555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2355  ABC transporter related  75.3 
 
 		 333 aa  525  1e-148  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.297181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2905  ABC transporter related  76.67 
 
 		 334 aa  512  1e-144  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.125819 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0428  ABC transporter related  75.45 
 
 		 334 aa  508  1e-143  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.370162  normal  0.644909 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3749  ABC transporter related  73.19 
 
 		 332 aa  504  9.999999999999999e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3447  ABC transporter related  72.89 
 
 		 332 aa  505  9.999999999999999e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0971  ABC transporter related  74.24 
 
 		 334 aa  506  9.999999999999999e-143  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.103941 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3780  ABC transporter related  72.59 
 
 		 332 aa  504  9.999999999999999e-143  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.567955  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3796  ABC transporter related  72.59 
 
 		 332 aa  501  1e-141  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.680907 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4842  ABC transporter related  74.4 
 
 		 332 aa  501  1e-141  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4178  ABC transporter related  72.89 
 
 		 332 aa  496  1e-139  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0491577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3570  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sorbitol/mannitol)  71.9 
 
 		 332 aa  495  1e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2460  ABC transporter related  72.29 
 
 		 336 aa  492  9.999999999999999e-139  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.596122 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4119  ABC transporter related  68.98 
 
 		 338 aa  476  1e-133  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.430229  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0918  putative ABC transporter, ATP-binding protein  69.97 
 
 		 335 aa  465  9.999999999999999e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.574216  normal  0.941858 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3550  ABC transporter related  61.14 
 
 		 333 aa  432  1e-120  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3400  ABC transporter related  61.75 
 
 		 336 aa  421  1e-117  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0521  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  60.24 
 
 		 333 aa  418  1e-116  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0208904  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0454  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  60.54 
 
 		 333 aa  420  1e-116  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.804917  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2710  ABC transporter related  61.4 
 
 		 333 aa  421  1e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2902  ABC transporter related  59.64 
 
 		 333 aa  411  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2642  ABC transporter related  59.64 
 
 		 334 aa  409  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00146176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1287  ABC transporter related  60.53 
 
 		 338 aa  405  1.0000000000000001e-112  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5605  ABC transporter related  61.23 
 
 		 325 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.73396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4471  ABC transporter related  56.82 
 
 		 367 aa  397  1e-109  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.571235  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0307  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  57.96 
 
 		 333 aa  391  1e-108  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.216758  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3302  ABC transporter-related protein  60.86 
 
 		 334 aa  392  1e-108  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2943  ABC transporter related  58.26 
 
 		 333 aa  394  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.141837  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2637  ABC transporter-like  55.43 
 
 		 372 aa  388  1e-107  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.290922  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6535  ABC transporter related  58.46 
 
 		 325 aa  389  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0162268 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0282  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  57.66 
 
 		 333 aa  389  1e-107  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.911621  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34370  putative ATP-binding component of ABC maltose/mannitol transporter  54.7 
 
 		 370 aa  385  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0529926  normal  0.319042 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3809  ABC transporter related  56.02 
 
 		 342 aa  385  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2038  ABC transporter related  54.97 
 
 		 370 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0539483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0462  ABC transporter related  56.42 
 
 		 365 aa  384  1e-105  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27370  ATP-binding protein of mannitol ABC transporter  55.43 
 
 		 369 aa  384  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6094  ABC transporter related  58.26 
 
 		 333 aa  381  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5494  ABC transporter related  57.66 
 
 		 341 aa  380  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0266048 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4975  ABC transporter related  51.98 
 
 		 359 aa  375  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.485856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2437  ABC transporter:TOBE  53.37 
 
 		 368 aa  376  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.274742  hitchhiker  0.00997212 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2922  maltose/mannitol ABC transporter ATP-binding protein  53.59 
 
 		 370 aa  377  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0305281  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4439  ABC transporter related  57.67 
 
 		 333 aa  375  1e-103  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0195171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0022  ABC transporter related  56.06 
 
 		 342 aa  377  1e-103  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.51164  normal  0.326326 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1353  ABC transporter related  55.93 
 
 		 344 aa  372  1e-102  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.275168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5741  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  55.31 
 
 		 365 aa  374  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2007  ABC transporter related  53.89 
 
 		 367 aa  369  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5760  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  54.52 
 
 		 372 aa  368  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7338  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  54.22 
 
 		 332 aa  368  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.016848  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5155  ABC transporter related protein  54.87 
 
 		 395 aa  369  1e-101  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.766387 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4322  ABC transporter related protein  53.24 
 
 		 378 aa  370  1e-101  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.253328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0494  ABC transporter related  54.6 
 
 		 369 aa  369  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0952416  decreased coverage  0.000489409 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1888  ABC transporter related  54.04 
 
 		 359 aa  365  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.2512 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3127  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  52.5 
 
 		 371 aa  367  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.507344  normal  0.0367052 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5080  ABC transporter related  54.08 
 
 		 368 aa  368  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.199927 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1981  ABC transporter related  53.76 
 
 		 368 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114074  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1357  ABC transporter related  58.05 
 
 		 349 aa  365  1e-100  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.237797  normal  0.591825 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2591  ABC transporter related  53.76 
 
 		 368 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0994309  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2913  ABC transporter for sugar/spermidine/putrescine/iron/thiamine ATP-binding protein  53.5 
 
 		 366 aa  365  1e-100  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.129164 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5360  ABC transporter related  53.52 
 
 		 368 aa  366  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0987368  normal  0.364959 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2615  ABC transporter related  53.2 
 
 		 369 aa  364  1e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3906  ABC transporter related  53.41 
 
 		 361 aa  363  2e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.294989 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3776  ABC transporter related  52.39 
 
 		 360 aa  363  2e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.429106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3242  ABC transporter related  53.95 
 
 		 369 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.260305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3143  ABC transporter related protein  50.96 
 
 		 379 aa  362  6e-99  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.27093  normal  0.0973127 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1702  ABC transporter related  53.76 
 
 		 359 aa  361  8e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0724  ABC sugar transporter, ATPase subunit  52.73 
 
 		 369 aa  361  9e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0847542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3948  ABC sugar transporter, ATPase subunit  53.2 
 
 		 373 aa  360  1e-98  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.32305  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3157  ABC transporter related  54.82 
 
 		 331 aa  360  1e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.161419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3324  ABC transporter related  55.34 
 
 		 359 aa  361  1e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3645  hypothetical protein  54.37 
 
 		 374 aa  361  1e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.563408  normal  0.0436872 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5922  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  52.37 
 
 		 369 aa  360  2e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0706  ABC transporter related  52.19 
 
 		 369 aa  359  3e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.860798  normal  0.259574 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0789  ABC transporter  52.78 
 
 		 362 aa  359  4e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0359  ABC transporter related  53.89 
 
 		 362 aa  359  5e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.348394 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0283  ABC transporter related  58.49 
 
 		 353 aa  358  6e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.157903  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1111  ABC transporter related  53.78 
 
 		 345 aa  358  8e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3618  ABC transporter related  57.05 
 
 		 361 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2639  ABC transporter related  52.37 
 
 		 369 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.716845  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2507  ABC transporter related  52.37 
 
 		 369 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0382888  normal  0.462927 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3851  ABC transporter related  53.2 
 
 		 375 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4348  ABC transporter related  53.39 
 
 		 358 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00012327 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0337  maltose/mannitol ABC transporter, ATP-binding protein, putative  53.31 
 
 		 370 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.111228  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0183  ABC transporter related  52.29 
 
 		 359 aa  356  2.9999999999999997e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3941  ABC transporter related  53.71 
 
 		 357 aa  356  2.9999999999999997e-97  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.254931 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4342  ABC transporter related  52.1 
 
 		 366 aa  356  2.9999999999999997e-97  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.949394 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0636  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  53.31 
 
 		 370 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.275932  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2470  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  53.31 
 
 		 370 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0243761  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0877  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  53.31 
 
 		 370 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0084  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  53.31 
 
 		 370 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.145989  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1040  ABC sugar transporter, ATP-binding protein  53.31 
 
 		 370 aa  355  3.9999999999999996e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1250  ABC transporter related  55.69 
 
 		 351 aa  356  3.9999999999999996e-97  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.440423 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0880  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  53.31 
 
 		 388 aa  355  3.9999999999999996e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3912  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  51.53 
 
 		 369 aa  355  5e-97  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.31471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0380  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  51.53 
 
 		 369 aa  355  5e-97  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0699  maltose/mannitol ABC transporter, ATP-binding protein, putative  53.06 
 
 		 370 aa  355  5e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0308  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  51.53 
 
 		 369 aa  355  5e-97  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0575052  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2011  ABC transporter ATP-binding protein  52.91 
 
 		 361 aa  355  5.999999999999999e-97  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0583753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5686  ABC transporter related  52.51 
 
 		 377 aa  355  5.999999999999999e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.661701  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>