86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_1747 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_1747  small-conductance mechanosensitive channel-like protein  100 
 
 		 187 aa  369  1e-101  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.346445 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5251  small-conductance mechanosensitive channel-like protein  53.44 
 
 		 226 aa  203  2e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.144523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3252  small-conductance mechanosensitive channel-like protein  51.09 
 
 		 222 aa  181  4.0000000000000006e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.309546 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2605  small-conductance mechanosensitive channel-like protein  51.09 
 
 		 222 aa  181  6e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0949581  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2944  hypothetical protein  52.17 
 
 		 197 aa  172  1.9999999999999998e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0723144  normal  0.746698 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3051  hypothetical protein  48.09 
 
 		 208 aa  152  4e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.129241 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0290  hypothetical protein  49.71 
 
 		 179 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1202  small-conductance mechanosensitive channel-like protein  55.11 
 
 		 245 aa  143  2e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00500241 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0197  hypothetical protein  49.12 
 
 		 195 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0218  hypothetical protein  49.12 
 
 		 195 aa  139  3e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.485558  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0221  hypothetical protein  48.54 
 
 		 195 aa  137  7e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5477  hypothetical protein  44.57 
 
 		 193 aa  137  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.730703 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5996  hypothetical protein  50.59 
 
 		 192 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69330  hypothetical protein  50.59 
 
 		 192 aa  131  5e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0139  hypothetical protein  45.03 
 
 		 197 aa  128  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0051  hypothetical protein  45.61 
 
 		 197 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3136  hypothetical protein  38.01 
 
 		 199 aa  84  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.785317 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0229  Small-conductance mechanosensitive channel-like protein  30.17 
 
 		 222 aa  75.5  0.0000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.727419  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0787  hypothetical protein  30.18 
 
 		 176 aa  71.2  0.000000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1265  small-conductance mechanosensitive channel  28.81 
 
 		 190 aa  63.5  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.455732 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1549  hypothetical protein  28.81 
 
 		 190 aa  63.5  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2956  hypothetical protein  26.43 
 
 		 176 aa  60.1  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01752  putative mechanosensitive channel protein (MscS family)  25.81 
 
 		 328 aa  52  0.000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.249612  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0614  hypothetical protein  27.22 
 
 		 211 aa  51.2  0.000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.431847 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2989  Ricin B lectin  27.4 
 
 		 474 aa  50.1  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000129425 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0520  hypothetical protein  32.56 
 
 		 179 aa  50.1  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3024  MscS Mechanosensitive ion channel  29.81 
 
 		 282 aa  49.7  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000332583  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4090  MscS mechanosensitive ion channel  26.82 
 
 		 349 aa  50.4  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0258  hypothetical protein  30.93 
 
 		 200 aa  50.1  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1036  putative mechanosensitive ion channel protein  32.41 
 
 		 534 aa  49.7  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4184  small-conductance mechanosensitive channel  30 
 
 		 184 aa  49.7  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0381  hypothetical protein  29.66 
 
 		 189 aa  49.3  0.00003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3043  hypothetical protein  32.56 
 
 		 178 aa  48.9  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.103752  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2755  MscS mechanosensitive ion channel:conserved TM helix  27.07 
 
 		 276 aa  48.9  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.661967 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2109  MscS Mechanosensitive ion channel  28.19 
 
 		 306 aa  47.8  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07084  hypothetical protein  24.83 
 
 		 199 aa  45.8  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0599  MscS mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 		 329 aa  45.4  0.0004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.316898 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0790  hypothetical protein  32.14 
 
 		 183 aa  45.4  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0597866 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1188  MscS mechanosensitive ion channel  26.32 
 
 		 267 aa  45.4  0.0005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.765639  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2128  MscS mechanosensitive ion channel  22 
 
 		 270 aa  45.1  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1124  MscS Mechanosensitive ion channel  26.59 
 
 		 345 aa  45.1  0.0006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.745547  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0540  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  25.61 
 
 		 173 aa  45.1  0.0006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000231888  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00718  hypothetical protein  31.58 
 
 		 207 aa  44.7  0.0007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.737648  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3929  MscS mechanosensitive ion channel  27.56 
 
 		 549 aa  44.3  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3322  hypothetical protein  30.23 
 
 		 181 aa  44.3  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0804  hypothetical protein  30.23 
 
 		 181 aa  44.3  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.445531 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0613  MscS mechanosensitive ion channel  24.5 
 
 		 547 aa  43.9  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000873032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3219  hypothetical protein  30.23 
 
 		 181 aa  44.3  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1640  mechanosensitive ion channel  25.61 
 
 		 173 aa  43.9  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0204845  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3803  MscS mechanosensitive ion channel  27.56 
 
 		 549 aa  44.7  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.717222  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1797  mechanosensitive ion channel  24.04 
 
 		 561 aa  44.3  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.433096  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3747  MscS Mechanosensitive ion channel  27.56 
 
 		 549 aa  44.3  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2985  hypothetical protein  30.43 
 
 		 351 aa  44.3  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0299284  normal  0.0305677 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001007  small-conductance mechanosensitive channel  27.38 
 
 		 197 aa  44.3  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2842  MscS mechanosensitive ion channel  29.6 
 
 		 369 aa  43.1  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2865  MscS Mechanosensitive ion channel  27.78 
 
 		 545 aa  43.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3910  hypothetical protein  25.53 
 
 		 301 aa  43.5  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3231  MscS Mechanosensitive ion channel  27.78 
 
 		 545 aa  43.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.371413 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12023  hypothetical protein  21.6 
 
 		 181 aa  43.1  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4382  MscS mechanosensitive ion channel  28.37 
 
 		 262 aa  43.1  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.496887  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0417  hypothetical protein  32.74 
 
 		 194 aa  43.5  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000101281  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0091  MscS mechanosensitive ion channel  26.97 
 
 		 267 aa  43.1  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4338  MscS mechanosensitive ion channel  25.17 
 
 		 533 aa  43.5  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0730  MscS mechanosensitive ion channel  27.63 
 
 		 267 aa  43.1  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.506108  normal  0.245277 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1350  hypothetical protein  24.16 
 
 		 292 aa  43.5  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.136839  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0949  MscS Mechanosensitive ion channel  30.5 
 
 		 273 aa  43.1  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0843  MscS mechanosensitive ion channel  34.31 
 
 		 324 aa  42.4  0.004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1320  MscS Mechanosensitive ion channel  20.93 
 
 		 300 aa  42.4  0.004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.23225 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3635  hypothetical protein  24.82 
 
 		 181 aa  42.4  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0852  hypothetical protein  24.82 
 
 		 181 aa  42.4  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002898  small-conductance mechanosensitive channel  25.7 
 
 		 532 aa  42.4  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.341732  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3512  hypothetical protein  24.82 
 
 		 181 aa  42.4  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0899  hypothetical protein  24.82 
 
 		 181 aa  42.4  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3441  hypothetical protein  24.82 
 
 		 181 aa  42.4  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3145  mechanosensitive ion channel  28.04 
 
 		 544 aa  42  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.187903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0360  MscS mechanosensitive ion channel  31.72 
 
 		 393 aa  42  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1709  small conductance mechanosensitive channel  31.72 
 
 		 494 aa  42.4  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0466336 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3468  MscS mechanosensitive ion channel  26.85 
 
 		 550 aa  42  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0562  MscS mechanosensitive ion channel  26.85 
 
 		 551 aa  42  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0561  MscS mechanosensitive ion channel  26.85 
 
 		 551 aa  42  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0583  MscS Mechanosensitive ion channel  28.71 
 
 		 308 aa  41.6  0.007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.330876  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1504  conserved hypothetical integral membrane protein, mechanosensitive ion channel family  25 
 
 		 624 aa  41.6  0.007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2331  MscS mechanosensitive ion channel  23.46 
 
 		 307 aa  41.6  0.007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0340157  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0457  MscS mechanosensitive ion channel  27.62 
 
 		 277 aa  41.6  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0935  MscS Mechanosensitive ion channel  39.39 
 
 		 484 aa  40.8  0.01  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0444  MscS mechanosensitive ion channel  22.76 
 
 		 540 aa  41.2  0.01  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>