69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_3045 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_3045  general secretion pathway protein H  100 
 
 		 164 aa  325  2.0000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.521563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3392  general secretion pathway protein H  94.51 
 
 		 164 aa  245  2e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3107  general secretory pathway H transmembrane protein  89.17 
 
 		 165 aa  219  1.9999999999999999e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.62689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3385  general secretion pathway protein H  56.96 
 
 		 174 aa  171  5e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3222  general secretion pathway protein H  60.4 
 
 		 166 aa  167  6e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3941  general secretion pathway protein H  42.86 
 
 		 193 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4496  general secretion pathway protein H  42.11 
 
 		 193 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.818073  normal  0.141626 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0076  general secretion pathway protein H  42.11 
 
 		 189 aa  111  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.692629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0058  general secretion pathway protein H  42.86 
 
 		 210 aa  112  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3239  general secretion pathway protein H  41.83 
 
 		 189 aa  110  6e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.707083 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0013  general secretion pathway protein H  40.79 
 
 		 189 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0057  general secretion pathway protein H  40.79 
 
 		 189 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.128144  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0057  general secretion pathway protein H  40.79 
 
 		 182 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.12302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3513  general secretion pathway protein H  41.06 
 
 		 199 aa  105  3e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0047  general secretion pathway protein H  40.82 
 
 		 182 aa  105  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.909533  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2667  general secretion pathway protein H  41.06 
 
 		 199 aa  105  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.668264  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1885  general secretion pathway protein H  41.06 
 
 		 199 aa  105  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.096237  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0013  general secretion pathway protein H  41.06 
 
 		 199 aa  105  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0013  general secretion pathway protein H  41.06 
 
 		 199 aa  105  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.036848  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0012  general secretion pathway protein H  41.18 
 
 		 196 aa  105  3e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0225  general secretion pathway protein H  41.06 
 
 		 199 aa  105  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2780  general secretion pathway protein H  41.06 
 
 		 196 aa  105  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3075  general secretion pathway protein H  42.57 
 
 		 191 aa  101  5e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000021149 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3195  general secretion pathway protein H  33.56 
 
 		 150 aa  81.3  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.255687  hitchhiker  0.00307792 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55520  type II secretion system protein  34.48 
 
 		 149 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0464256 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4832  general secretion pathway protein H  44.87 
 
 		 149 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2203  general secretion pathway protein H  34.03 
 
 		 148 aa  75.5  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0134021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1074  general secretion pathway protein H  39.46 
 
 		 177 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.822718  normal  0.19806 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1897  general secretion pathway protein H  36.46 
 
 		 172 aa  65.1  0.0000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5690  general secretion pathway protein H  35.17 
 
 		 187 aa  61.2  0.000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.138037  normal  0.133551 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0924  general secretion pathway protein H  33.77 
 
 		 151 aa  58.9  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0280079  normal  0.859469 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0763  general secretion pathway protein H  37.78 
 
 		 188 aa  58.9  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.612491  normal  0.122141 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0653  general secretion pathway protein H  39.02 
 
 		 182 aa  58.2  0.00000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0219082  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0674  general secretion pathway protein H  39.02 
 
 		 182 aa  58.2  0.00000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0856392  normal  0.35732 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2922  general secretion pathway protein H  30.86 
 
 		 193 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.252681  normal  0.157804 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3420  general secretion pathway protein H  38.61 
 
 		 176 aa  50.8  0.000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000465918 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0722  putative type 4 fimbrial pilin related transmembrane protein  39 
 
 		 203 aa  47.8  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.905296 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3522  general secretion pathway protein H  29.61 
 
 		 162 aa  47.8  0.00007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0510608  normal  0.632823 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1352  general secretion pathway protein H  31.03 
 
 		 177 aa  47  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4247  general secretion pathway protein H  39.24 
 
 		 177 aa  47  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0707676 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2033  general secretion pathway protein H  37.36 
 
 		 172 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0318  general secretion pathway protein G  35.21 
 
 		 163 aa  45.4  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4587  general secretion pathway protein H  38.6 
 
 		 206 aa  44.7  0.0006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.248042  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24040  general secretion pathway outer membrane protein H precursor  37.5 
 
 		 172 aa  44.3  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0535  general secretion pathway protein H  34.25 
 
 		 155 aa  44.3  0.0007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0676  type IV pilin  36.73 
 
 		 144 aa  44.3  0.0008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.256255  normal  0.685259 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0719  type IV pilin  36.73 
 
 		 144 aa  43.9  0.0009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.464442  normal  0.176419 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0576  hypothetical protein  28.57 
 
 		 174 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0726397 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4829  HxcT pseudopilin  37.37 
 
 		 149 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0260  pilin polypeptide  38.57 
 
 		 187 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0715  pillin, putative  28.48 
 
 		 157 aa  42.4  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0392  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  30.56 
 
 		 175 aa  42  0.004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000336485  hitchhiker  0.0000000727713 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0006  general secretion pathway protein G  40.38 
 
 		 144 aa  41.6  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0815216 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0212  hypothetical protein  35.48 
 
 		 216 aa  41.6  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2390  general secretion pathway protein H  35.44 
 
 		 180 aa  42  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000294923 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1046  general secretion pathway protein G  41.67 
 
 		 144 aa  41.6  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1090  general secretion pathway protein G  41.67 
 
 		 144 aa  41.6  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.319049  normal  0.327028 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1172  hypothetical protein  35.71 
 
 		 118 aa  41.6  0.005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123806  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0385  general secretion pathway protein H  28.57 
 
 		 178 aa  41.6  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.558867 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0384  general secretion pathway protein H  31.76 
 
 		 169 aa  41.2  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.105042 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3523  general secretion pathway protein H  31.76 
 
 		 169 aa  41.2  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1049  general secretion pathway protein G  41.67 
 
 		 151 aa  41.2  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55490  HxcT pseudopilin  36.36 
 
 		 149 aa  40.8  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.04599 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4730  general secretion pathway protein H  22.22 
 
 		 193 aa  40.8  0.008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.129836  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0717  general secretion pathway protein G  41.18 
 
 		 137 aa  40.8  0.009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0718  general secretion pathway protein G  41.18 
 
 		 137 aa  40.8  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0683  general secretion pathway protein G  41.18 
 
 		 137 aa  40.8  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1360  general secretion family protein  58.06 
 
 		 114 aa  40.4  0.009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000388019  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2612  general secretion pathway protein G  53.49 
 
 		 153 aa  40.4  0.01  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.688921 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>