118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2632 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_2302  siderophore synthetase component  72.44 
 
 		 609 aa  842    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.867655  normal  0.869204 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4392  IucA/IucC  74.05 
 
 		 596 aa  875    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2632  IucA/IucC family protein  100 
 
 		 593 aa  1210    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4016  IucA/IucC family protein  51.12 
 
 		 595 aa  548  1e-154  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0306734  normal  0.343521 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3760  IucA/IucC family protein  50.68 
 
 		 594 aa  542  1e-153  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.130185 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4055  IucA/IucC family protein  49.57 
 
 		 594 aa  536  1e-151  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0250939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3522  IucA/IucC family protein  43.79 
 
 		 610 aa  462  1e-129  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1844  IucA/IucC family protein  35.99 
 
 		 602 aa  344  2.9999999999999997e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0027586  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3346  petrobactin biosynthesis protein AsbA  36.12 
 
 		 602 aa  344  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00585589  hitchhiker  0.0000000000000409747 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1983  petrobactin biosynthesis protein AsbA  35.83 
 
 		 602 aa  340  4e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0967971  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2016  petrobactin biosynthesis protein AsbA  35.32 
 
 		 602 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2796000000000001e-41 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1812  siderophore biosynthesis protein  35.32 
 
 		 602 aa  337  3.9999999999999995e-91  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000021038  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1838  siderophore biosynthesis protein  35.79 
 
 		 602 aa  336  7.999999999999999e-91  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.846084  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1981  siderophore biosynthesis protein  35.79 
 
 		 602 aa  336  7.999999999999999e-91  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.978268  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1795  siderophore biosynthesis protein  35.82 
 
 		 602 aa  334  3e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3331  IucA/IucC family protein  36.96 
 
 		 601 aa  300  6e-80  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0215  IucA/IucC family protein  35.42 
 
 		 645 aa  292  1e-77  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3334  IucA/IucC family protein  33.61 
 
 		 591 aa  288  2e-76  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0410  IucA/IucC  36.39 
 
 		 578 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.4179  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2837  IucA/IucC  31.56 
 
 		 606 aa  276  8e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.296013  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1808  IucA/IucC family protein  35.73 
 
 		 601 aa  256  6e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.653544  normal  0.276743 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3257  IucA/IucC family protein  33.48 
 
 		 584 aa  244  3.9999999999999997e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0591  siderophore biosynthesis protein  32.75 
 
 		 810 aa  239  1e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.124028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0660  IucA/IucC family protein  37.53 
 
 		 570 aa  234  4.0000000000000004e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00702947  normal  0.916687 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4056  IucA/IucC  30.81 
 
 		 672 aa  222  9.999999999999999e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.512402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3172  IucA/IucC family protein  32.06 
 
 		 818 aa  218  2e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5062  IucA/IucC family protein  33.2 
 
 		 588 aa  211  3e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00806169 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0585  IucA/IucC family protein  27.87 
 
 		 925 aa  200  7e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0175917 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0718  iron transporter  28.23 
 
 		 613 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0698719 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4783  IucA/IucC  29.14 
 
 		 610 aa  185  2.0000000000000003e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0107  IucA/IucC family protein  28.37 
 
 		 578 aa  175  2.9999999999999996e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0111  IucA/IucC family protein  28.37 
 
 		 578 aa  175  2.9999999999999996e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1814  siderophore synthetase component, IucA/IucC  26.11 
 
 		 560 aa  172  1e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00455454  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3094  iron transporter  33.04 
 
 		 584 aa  171  4e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3139  IucA/IucC family protein  26.79 
 
 		 586 aa  164  4.0000000000000004e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1113  IucA/IucC  33.26 
 
 		 608 aa  163  8.000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0947  IucA/IucC family protein  28.51 
 
 		 574 aa  163  9e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.251332  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4634  aerobactin synthase, IucA component  28.86 
 
 		 574 aa  163  9e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2971  IucA/IucC family protein  34.71 
 
 		 555 aa  161  3e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.963882 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0714  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucA  31.1 
 
 		 590 aa  160  5e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0786  IucA/IucC family protein  31.1 
 
 		 590 aa  160  5e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0922  IucA/IucC family protein  30.87 
 
 		 581 aa  160  8e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.285296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3182  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucA  28.3 
 
 		 574 aa  159  1e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00878  siderophore biosynthesis protein  31.36 
 
 		 611 aa  159  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0338478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01928  iron transporter  30.67 
 
 		 576 aa  157  5.0000000000000005e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0586  IucA/IucC  29.68 
 
 		 1148 aa  156  1e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09310  siderophore biosynthesis protein, IucA/IucC family  31.85 
 
 		 586 aa  153  8e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00047621  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8365  putative iron transport protein  32.21 
 
 		 519 aa  149  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001063  vibrioferrin amide bond forming protein PvsD  26.19 
 
 		 580 aa  144  7e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1276  IucA/IucC  27.61 
 
 		 684 aa  142  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3750  IucA/IucC family protein  31.51 
 
 		 599 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2677  IucA/IucC family protein  27.9 
 
 		 628 aa  138  3.0000000000000003e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.211511  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6952  IucA/IucC family protein  29.28 
 
 		 1153 aa  130  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2584  IucA/IucC  27.66 
 
 		 594 aa  124  5e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0652267  decreased coverage  0.000722878 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1652  siderophore synthase  26.75 
 
 		 588 aa  87.8  5e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0949  IucA/IucC family protein  28.44 
 
 		 577 aa  82  0.00000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09330  siderophore biosynthesis protein, IucA/IucC family  30.55 
 
 		 592 aa  81.6  0.00000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0934837  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0920  IucA/IucC family protein  24.66 
 
 		 582 aa  80.9  0.00000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.185756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3092  IucA/IucC family siderophore biosynthesis protein  26.83 
 
 		 587 aa  80.1  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.941769  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0888  IucA/IucC family protein  24.55 
 
 		 720 aa  77.8  0.0000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2212  hypothetical protein  22.74 
 
 		 656 aa  75.5  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2251  hypothetical protein  22.74 
 
 		 656 aa  75.5  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0712  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  26.13 
 
 		 582 aa  75.1  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0192  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  26.13 
 
 		 582 aa  75.1  0.000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000752976 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0784  IucA/IucC family protein  26.13 
 
 		 582 aa  75.1  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3180  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  24.35 
 
 		 580 aa  74.7  0.000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4632  aerobactin synthase, IucC component  24.61 
 
 		 580 aa  74.3  0.000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0108  IucA/IucC family protein  24.07 
 
 		 592 aa  68.9  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0112  IucA/IucC family protein  24.07 
 
 		 592 aa  68.9  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0181  IucA/IucC family protein  29.64 
 
 		 655 aa  67  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0174  IucA/IucC family protein  29.55 
 
 		 655 aa  67  0.0000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1781  hypothetical protein  21.26 
 
 		 653 aa  65.5  0.000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.478071  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3523  IucA/IucC family protein  26.52 
 
 		 615 aa  64.3  0.000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3734  IucA/IucC family protein  24.77 
 
 		 563 aa  64.3  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0245205  normal  0.144633 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2587  IucA/IucC  24.42 
 
 		 619 aa  64.3  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.296644  hitchhiker  0.00946712 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001065  vibrioferrin amide bond forming protein PvsB  26.52 
 
 		 610 aa  64.3  0.000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1812  siderophore synthetase component, IucA/IucC  21.21 
 
 		 578 aa  63.2  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3733  IucA/IucC family protein  27.5 
 
 		 557 aa  62.4  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0935352  normal  0.031282 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2631  IucA/IucC family protein  26.88 
 
 		 577 aa  62.4  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1813  siderophore biosynthesis protein  22.64 
 
 		 610 aa  61.6  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00844264  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2970  IucA/IucC family protein  28.31 
 
 		 546 aa  61.6  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1839  siderophore biosynthesis protein  22.64 
 
 		 610 aa  61.6  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1796  siderophore biosynthesis protein  21.8 
 
 		 610 aa  61.6  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1982  siderophore biosynthesis protein  22.64 
 
 		 612 aa  61.6  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2017  petrobactin biosynthesis protein AsbB  22.64 
 
 		 610 aa  61.6  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0614699999999996e-42 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4017  IucA/IucC family protein  27.09 
 
 		 991 aa  61.2  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0297482  normal  0.327782 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01930  vibrioferrin biosynthesis protein PvsB  26.73 
 
 		 600 aa  60.8  0.00000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1779  hypothetical protein  21.97 
 
 		 585 aa  60.8  0.00000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.762831  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0407  IucA/IucC  27.32 
 
 		 601 aa  60.1  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.27175  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2301  siderophore synthetase component  24.36 
 
 		 562 aa  58.9  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.800261 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4056  IucA/IucC family protein  26.01 
 
 		 998 aa  59.3  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.88864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0720  hypothetical protein  25.18 
 
 		 640 aa  58.5  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.72234  normal  0.53813 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3345  petrobactin biosynthesis protein AsbB  21.32 
 
 		 612 aa  58.5  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0268839  hitchhiker  0.0000000000000416803 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2674  IucA/IucC family protein  24.08 
 
 		 618 aa  57.4  0.0000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.247069  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4393  IucA/IucC  23.75 
 
 		 577 aa  56.2  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5060  IucA/IucC family protein  25.82 
 
 		 615 aa  55.8  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00130311 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3255  IucA/IucC family protein  23.35 
 
 		 621 aa  55.5  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1984  petrobactin biosynthesis protein AsbB  19.58 
 
 		 612 aa  55.5  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.216331  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1845  IucA/IucC family protein  21.22 
 
 		 613 aa  54.3  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.330256  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3328  IucA/IucC family protein  24.14 
 
 		 614 aa  54.3  0.000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.935658 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>