203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3482 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3482  hypothetical protein  100 
 
 		 203 aa  412  1e-114  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.635062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0963  hypothetical protein  87.32 
 
 		 204 aa  341  4e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0417724 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3424  protein of unknown function DUF461  46.67 
 
 		 190 aa  149  2e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.119907 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3428  hypothetical protein  59.22 
 
 		 187 aa  125  5e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0308042  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3421  hypothetical protein  55.1 
 
 		 191 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2476  hypothetical protein  46.94 
 
 		 156 aa  100  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0418  hypothetical protein  47.57 
 
 		 185 aa  100  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.306476  normal  0.598206 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1373  protein of unknown function DUF461  49.04 
 
 		 357 aa  99.8  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0110543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1653  protein of unknown function DUF461  49.04 
 
 		 357 aa  97.8  9e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.494454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1378  hypothetical protein  48.08 
 
 		 365 aa  97.4  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0591071  decreased coverage  0.00000407941 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5301  protein of unknown function DUF461  49.04 
 
 		 319 aa  96.3  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483616  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0384  hypothetical protein  46.39 
 
 		 320 aa  95.5  5e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1578  hypothetical protein  49 
 
 		 160 aa  95.1  6e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.828878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1360  hypothetical protein  48.04 
 
 		 151 aa  94.7  7e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.399009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0058  hypothetical protein  45.1 
 
 		 342 aa  94  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4444  hypothetical protein  44.64 
 
 		 328 aa  93.6  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0512489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3432  hypothetical protein  42.86 
 
 		 145 aa  93.6  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0144838 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2890  hypothetical protein  48.15 
 
 		 166 aa  92.4  4e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.586037 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4537  hypothetical protein  46.67 
 
 		 172 aa  92.4  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.817091 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1731  protein of unknown function DUF461  45.19 
 
 		 182 aa  92  5e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.779596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1330  hypothetical protein  40.78 
 
 		 172 aa  92  5e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.318771  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0673  hypothetical protein  50.53 
 
 		 163 aa  91.7  6e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0451444  normal  0.234827 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7626  hypothetical protein  43.43 
 
 		 307 aa  92  6e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0513  protein of unknown function DUF461  46.15 
 
 		 169 aa  92  6e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6066  hypothetical protein  47.42 
 
 		 318 aa  91.7  7e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0341315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2866  hypothetical protein  43.27 
 
 		 173 aa  91.3  8e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.573109  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2594  hypothetical protein  45.19 
 
 		 175 aa  91.3  9e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.10495  normal  0.557794 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3116  hypothetical protein  47.42 
 
 		 162 aa  91.3  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283902 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5608  nuclear export factor GLE1 domain-containing protein  45.63 
 
 		 321 aa  90.1  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.514484 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0797  hypothetical protein  40.95 
 
 		 148 aa  89.7  3e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.435603  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1867  hypothetical protein  43.81 
 
 		 178 aa  89.7  3e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0951087  normal  0.135691 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3108  hypothetical protein  47.12 
 
 		 323 aa  89.4  4e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.210099  normal  0.0486377 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3707  hypothetical protein  43.14 
 
 		 160 aa  88.6  6e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1335  hypothetical protein  44.9 
 
 		 199 aa  88.2  8e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2017  hypothetical protein  45.45 
 
 		 160 aa  87.8  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2200  hypothetical protein  43.3 
 
 		 176 aa  87.4  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.276125  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1583  hypothetical protein  41.24 
 
 		 148 aa  87.8  1e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0728  hypothetical protein  45.45 
 
 		 160 aa  87.8  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0912257  normal  0.342188 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5371  hypothetical protein  46.88 
 
 		 324 aa  86.7  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.657374  normal  0.0321258 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1379  hypothetical protein  45.19 
 
 		 174 aa  87  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0158945  hitchhiker  0.0000523836 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0771  hypothetical protein  43.14 
 
 		 158 aa  86.7  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000551146 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11730  hypothetical protein  29.95 
 
 		 227 aa  85.9  3e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.259328  normal  0.299727 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1566  hypothetical protein  37.14 
 
 		 162 aa  85.9  4e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000291429  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2585  hypothetical protein  46.46 
 
 		 170 aa  85.5  5e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000482687 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1186  hypothetical protein  44.94 
 
 		 327 aa  85.5  5e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.057245  normal  0.213641 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1171  protein of unknown function DUF461  46.39 
 
 		 157 aa  84.7  7e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.247761 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0097  hypothetical protein  40 
 
 		 150 aa  84.3  9e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000166232  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3279  protein of unknown function DUF461  40 
 
 		 179 aa  84  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2089  protein of unknown function DUF461  35.59 
 
 		 337 aa  84  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0284947  normal  0.321233 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4676  hypothetical protein  43.14 
 
 		 168 aa  84.3  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.742423  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1654  protein of unknown function DUF461  44.23 
 
 		 174 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.230933  normal  0.946268 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2687  hypothetical protein  42.2 
 
 		 149 aa  84  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25020  DUF461 family hypothetical protein  41.41 
 
 		 184 aa  83.2  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0137  hypothetical protein  46.6 
 
 		 162 aa  83.2  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0768491 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1601  hypothetical protein  39.42 
 
 		 160 aa  83.2  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.375381  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1625  hypothetical protein  39.42 
 
 		 160 aa  83.2  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2255  hypothetical protein  41.11 
 
 		 170 aa  83.2  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.347507  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1571  hypothetical protein  39.42 
 
 		 160 aa  83.6  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.100166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2424  hypothetical protein  40.95 
 
 		 174 aa  83.2  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0361451  normal  0.0654459 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1887  nuclear export factor GLE1  34.75 
 
 		 338 aa  82.8  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.145629  normal  0.0275179 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3239  hypothetical protein  42 
 
 		 160 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00124495  hitchhiker  0.00000947918 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0722  hypothetical protein  42 
 
 		 160 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000048039  hitchhiker  0.00157605 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0765  hypothetical protein  40.2 
 
 		 161 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000429985  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04841  hypothetical protein  38.1 
 
 		 155 aa  82.4  0.000000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3425  hypothetical protein  44.86 
 
 		 265 aa  82  0.000000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.130437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1330  hypothetical protein  39.58 
 
 		 158 aa  82  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3335  hypothetical protein  46.07 
 
 		 162 aa  81.6  0.000000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0452404  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0923  TerC protein  39.85 
 
 		 143 aa  81.3  0.000000000000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000173903  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0872  phosphomannomutase  39.13 
 
 		 140 aa  81.3  0.000000000000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0054  hypothetical protein  37.25 
 
 		 334 aa  80.9  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0054  hypothetical protein  37.37 
 
 		 351 aa  80.9  0.00000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.840539  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1952  hypothetical protein  41.75 
 
 		 163 aa  81.3  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0750  hypothetical protein  41 
 
 		 160 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000400952  normal  0.044131 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15120  hypothetical protein  39.58 
 
 		 158 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0842048  hitchhiker  0.000317485 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0778  hypothetical protein  41.18 
 
 		 160 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000798625  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3907  hypothetical protein  42 
 
 		 160 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4130  hypothetical protein  39.39 
 
 		 160 aa  80.5  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0361721  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3581  hypothetical protein  41.18 
 
 		 160 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000271819  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0810  hypothetical protein  41.18 
 
 		 160 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00181969  normal  0.227448 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5007  protein of unknown function DUF461  38.61 
 
 		 202 aa  79.7  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0803  protein of unknown function DUF461  41.18 
 
 		 160 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000315548  hitchhiker  0.000000000835288 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0691  hypothetical protein  43.16 
 
 		 158 aa  79.3  0.00000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001589  copper metallochaperone  39.8 
 
 		 157 aa  79  0.00000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00860885  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1996  hypothetical protein  43 
 
 		 154 aa  78.6  0.00000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000352963 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0679  hypothetical protein  44.9 
 
 		 150 aa  78.6  0.00000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0702  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1994  hypothetical protein  40 
 
 		 161 aa  78.6  0.00000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000011396 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05561  hypothetical protein  39.8 
 
 		 158 aa  78.2  0.00000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3566  hypothetical protein  42.45 
 
 		 159 aa  78.2  0.00000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000659278  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0174  hypothetical protein  44.66 
 
 		 158 aa  77.8  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.181733  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2103  protein of unknown function DUF461  42.27 
 
 		 165 aa  77.8  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1374  protein of unknown function DUF461  40.38 
 
 		 181 aa  77.4  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.0071254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0598  hypothetical protein  37.1 
 
 		 159 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.338306  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2380  hypothetical protein  42.86 
 
 		 160 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.179232  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1458  protein of unknown function DUF461  43 
 
 		 138 aa  76.3  0.0000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0519  hypothetical protein  46.74 
 
 		 174 aa  76.3  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1893  hypothetical protein  46.15 
 
 		 162 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2158  hypothetical protein  41.18 
 
 		 168 aa  75.9  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.594619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4208  hypothetical protein  28.22 
 
 		 168 aa  75.9  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.438596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3051  hypothetical protein  42.72 
 
 		 159 aa  75.5  0.0000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.259622  normal  0.692441 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2688  hypothetical protein  41.18 
 
 		 159 aa  75.1  0.0000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0504943  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>