201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2135 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2135  mevalonate kinase  100 
 
 		 314 aa  622  1e-177  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1736  mevalonate kinase  80.19 
 
 		 316 aa  489  1e-137  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2461  mevalonate kinase  60.97 
 
 		 314 aa  341  8e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4315  mevalonate kinase  49.35 
 
 		 313 aa  282  5.000000000000001e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0454  mevalonate kinase  32.44 
 
 		 310 aa  157  3e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0891  mevalonate kinase  38.69 
 
 		 322 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1385  mevalonate kinase  33.22 
 
 		 310 aa  145  6e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2395  mevalonate kinase  32.25 
 
 		 303 aa  142  7e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000672574  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1100  mevalonate kinase  30.03 
 
 		 306 aa  138  1e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.979552  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1421  mevalonate kinase  31.29 
 
 		 301 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.238571  hitchhiker  0.00767711 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1326  mevalonate kinase, putative  35.62 
 
 		 292 aa  125  1e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0418302  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1033  mevalonate kinase  26.67 
 
 		 322 aa  124  2e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0598  mevalonate kinase  32.78 
 
 		 286 aa  124  2e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0476  mevalonate kinase  34.38 
 
 		 321 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0915  mevalonate kinase  33.1 
 
 		 316 aa  120  3.9999999999999996e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00806632  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1124  mevalonate kinase  29.33 
 
 		 276 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0681  mevalonate kinase  30.84 
 
 		 290 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3409  mevalonate kinase  35.6 
 
 		 347 aa  116  5e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.147326  normal  0.133481 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0613  mevalonate kinase  30.38 
 
 		 306 aa  114  3e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0628  mevalonate kinase  30.38 
 
 		 306 aa  114  3e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2213  mevalonate kinase  33.01 
 
 		 289 aa  113  4.0000000000000004e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2604  mevalonate kinase  32.15 
 
 		 327 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.395275  normal  0.323877 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40742  mevalonate kinase  28.09 
 
 		 432 aa  109  7.000000000000001e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0150941 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0315  mevalonate kinase  27.72 
 
 		 313 aa  108  1e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2002  mevalonate kinase  35.38 
 
 		 356 aa  105  7e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.360358  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2890  mevalonate kinase  32.62 
 
 		 289 aa  105  8e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00676748  normal  0.719721 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0966  mevalonate kinase  32.19 
 
 		 336 aa  105  9e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.104962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0439  mevalonate kinase  34.39 
 
 		 328 aa  102  6e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.289557  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0238  mevalonate kinase  29.65 
 
 		 306 aa  98.2  2e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2376  mevalonate kinase  29.68 
 
 		 289 aa  95.1  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0503385  normal  0.266518 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_53929  mevalonate kinase  28.04 
 
 		 490 aa  94.7  2e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.323174  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1829  mevalonate kinase  31.63 
 
 		 338 aa  94.4  2e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.516533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1653  mevalonate kinase  31.1 
 
 		 314 aa  94  3e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1358  mevalonate kinase  26.95 
 
 		 314 aa  93.6  4e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03869  mevalonate kinase (AFU_orthologue; AFUA_4G07780)  26.27 
 
 		 735 aa  92.4  8e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.105428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1323  mevalonate kinase  28.89 
 
 		 309 aa  92  1e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.516434  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0312  mevalonate kinase  30.3 
 
 		 400 aa  89.7  5e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0669992 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2541  mevalonate kinase  32.54 
 
 		 328 aa  88.6  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1602  mevalonate kinase  26.15 
 
 		 316 aa  87  4e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0123084  normal  0.126865 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1338  mevalonate kinase  25.27 
 
 		 317 aa  85.9  9e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.332068  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0721  mevalonate kinase  28.67 
 
 		 313 aa  85.5  0.000000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00059401  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0579  GHMP kinase  25 
 
 		 361 aa  85.1  0.000000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.0000000000495739  decreased coverage  0.000433765 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0258  mevalonate kinase  24.91 
 
 		 317 aa  85.1  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0620  phosphomevalonate kinase  28.67 
 
 		 313 aa  85.5  0.000000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.373049  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0580  mevalonate kinase  26.09 
 
 		 317 aa  84.7  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.761954  normal  0.0461716 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1934  galactokinase  30.37 
 
 		 349 aa  82.8  0.000000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.210895 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0467  mevalonate kinase  28.85 
 
 		 314 aa  82.8  0.000000000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.250256  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0708  mevalonate kinase  25.25 
 
 		 297 aa  82  0.00000000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1835  mevalonate kinase  28.98 
 
 		 310 aa  82  0.00000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.782527 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01740  cystathionine beta-lyase, putative  26.27 
 
 		 900 aa  80.9  0.00000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1599  mevalonate kinase  27.45 
 
 		 315 aa  78.2  0.0000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.309754  normal  0.998273 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1732  GHMP kinase  24.92 
 
 		 349 aa  75.1  0.000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1812  mevalonate kinase  27.18 
 
 		 289 aa  75.5  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1114  GHMP kinase  25 
 
 		 382 aa  74.3  0.000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0722  putative phopshomevalonate kinase  25.23 
 
 		 340 aa  73.9  0.000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000190894  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14320  galactokinase  27.78 
 
 		 389 aa  74.3  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0775  mevalonate kinase  26.01 
 
 		 356 aa  72.4  0.000000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1733  GHMP kinase  24.73 
 
 		 295 aa  72  0.00000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0621  mevalonate kinase  24.92 
 
 		 340 aa  72  0.00000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.132017  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2022  hypothetical protein  22.42 
 
 		 293 aa  71.6  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0617  GHMP kinase  27.2 
 
 		 333 aa  71.6  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.170003  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2017  hypothetical protein  22.42 
 
 		 293 aa  70.9  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2045  mevalonate kinase  30.97 
 
 		 330 aa  70.9  0.00000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.558295  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1768  galactokinase  26.91 
 
 		 385 aa  70.9  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.862041  normal  0.168773 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0646  mevalonate kinase  23.86 
 
 		 319 aa  70.5  0.00000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.199793  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2815  galactokinase  26.97 
 
 		 359 aa  70.1  0.00000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.113081 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0554  galactokinase  26.05 
 
 		 403 aa  70.1  0.00000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2819  galactokinase  24.62 
 
 		 395 aa  69.3  0.00000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1677  galactokinase  28.49 
 
 		 400 aa  69.3  0.00000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000114591 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0892  galactokinase  27.24 
 
 		 391 aa  68.9  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0958973 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1464  galactokinase  29.15 
 
 		 394 aa  68.6  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.10348  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0316  GHMP kinase  27.17 
 
 		 359 aa  68.2  0.0000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1938  galactokinase  24.4 
 
 		 369 aa  67.4  0.0000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.491701  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4110  galactokinase  26.22 
 
 		 356 aa  66.6  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2481  galactokinase  28.71 
 
 		 348 aa  64.3  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.883324  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10631  galactokinase  25.95 
 
 		 363 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00193784  normal  0.94952 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1161  galactokinase  27.55 
 
 		 401 aa  64.3  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.415843  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2387  galactokinase  26.22 
 
 		 372 aa  64.3  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2152  galactokinase  23.46 
 
 		 358 aa  63.5  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0969  galactokinase  24.85 
 
 		 392 aa  63.5  0.000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.003784  normal  0.261209 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1233  galactokinase  27 
 
 		 395 aa  62  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000254056 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4019  galactokinase  25.9 
 
 		 357 aa  60.5  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1197  galactokinase  21.35 
 
 		 405 aa  60.8  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.765458  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1195  galactokinase  22.22 
 
 		 380 aa  60.8  0.00000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2885  galactokinase  22.69 
 
 		 382 aa  60.1  0.00000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2017  galactokinase  22.44 
 
 		 387 aa  60.1  0.00000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.126452  normal  0.999808 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0776  galactokinase  25.36 
 
 		 355 aa  60.1  0.00000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0780  galactokinase  22.69 
 
 		 382 aa  60.1  0.00000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2905  galactokinase  22.69 
 
 		 382 aa  60.1  0.00000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0784  galactokinase  22.69 
 
 		 382 aa  60.1  0.00000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0860  galactokinase  22.69 
 
 		 382 aa  60.1  0.00000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.048492  normal  0.889348 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1411  galactokinase  22.22 
 
 		 383 aa  59.3  0.00000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2945  galactokinase  22.22 
 
 		 383 aa  59.3  0.00000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2857  galactokinase  22.22 
 
 		 383 aa  59.3  0.00000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1291  galactokinase  21.51 
 
 		 383 aa  59.3  0.00000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.68588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2085  galactokinase  22.58 
 
 		 385 aa  58.5  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.351225  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0678  galactokinase  22.36 
 
 		 382 aa  58.9  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2212  galactokinase  24.23 
 
 		 399 aa  57.8  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.180846  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0811  galactokinase  22.31 
 
 		 382 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3271  galactokinase  22.78 
 
 		 388 aa  58.5  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.6391  hitchhiker  0.00131566 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>