More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1273 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_2134  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  60.56 
 
 		 647 aa  752    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.208796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1273  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  100 
 
 		 648 aa  1325    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.804783  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0105  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  54.53 
 
 		 635 aa  664    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0006  DNA gyrase, B subunit  52.52 
 
 		 650 aa  627  1e-178  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000273734  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0094  DNA gyrase, B subunit  49.77 
 
 		 636 aa  606  9.999999999999999e-173  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000129942  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0094  DNA gyrase, B subunit  49.77 
 
 		 636 aa  605  9.999999999999999e-173  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000363706  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1393  DNA gyrase, B subunit  49.06 
 
 		 628 aa  595  1e-169  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0015  DNA gyrase, B subunit  49.84 
 
 		 644 aa  595  1e-169  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000155334 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0007  DNA gyrase subunit B  49.15 
 
 		 640 aa  593  1e-168  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.630363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0130  DNA gyrase, B subunit  49.85 
 
 		 636 aa  590  1e-167  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.95821  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2717  DNA gyrase, B subunit  49.77 
 
 		 649 aa  587  1e-166  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1547  DNA gyrase, B subunit  50.87 
 
 		 635 aa  582  1.0000000000000001e-165  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00189026  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0029  DNA topoisomerase IV subunit B  49.16 
 
 		 653 aa  583  1.0000000000000001e-165  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0671  DNA gyrase, B subunit  49.13 
 
 		 627 aa  584  1.0000000000000001e-165  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.958816  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf800  DNA gyrase subunit B  48.37 
 
 		 647 aa  585  1.0000000000000001e-165  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0005  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  47.89 
 
 		 633 aa  582  1.0000000000000001e-165  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0015  DNA gyrase, B subunit  48.98 
 
 		 644 aa  583  1.0000000000000001e-165  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000401037  normal  0.862842 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0005  DNA gyrase subunit B  51.88 
 
 		 640 aa  578  1e-164  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00215329  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0009  DNA gyrase subunit B  49.84 
 
 		 633 aa  580  1e-164  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000695632  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11740  DNA gyrase, B subunit  47.2 
 
 		 637 aa  579  1e-164  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00171708  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00060  DNA gyrase, B subunit  48.53 
 
 		 642 aa  578  1e-164  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0029  DNA gyrase, B subunit  49.38 
 
 		 637 aa  581  1e-164  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2748  DNA gyrase, B subunit  47.7 
 
 		 637 aa  578  1e-164  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000339515  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0177  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  47.82 
 
 		 641 aa  579  1e-164  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.724108  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0005  DNA gyrase subunit B  52.04 
 
 		 640 aa  576  1.0000000000000001e-163  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0007  DNA gyrase, B subunit  48.75 
 
 		 634 aa  578  1.0000000000000001e-163  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000328066  unclonable  0.0000000130354 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2376  DNA gyrase subunit B  49.84 
 
 		 641 aa  578  1.0000000000000001e-163  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0006  DNA gyrase, B subunit  48.84 
 
 		 642 aa  573  1.0000000000000001e-162  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.965796  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0719  DNA topoisomerase IV subunit B  45.62 
 
 		 649 aa  573  1.0000000000000001e-162  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0419  DNA gyrase subunit B  46.09 
 
 		 632 aa  570  1e-161  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0006  DNA gyrase, B subunit  47.35 
 
 		 647 aa  570  1e-161  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00060  DNA gyrase subunit B  47.9 
 
 		 654 aa  569  1e-161  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0159442  normal  0.243862 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0036  DNA gyrase subunit B  48.9 
 
 		 643 aa  570  1e-161  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0016  DNA gyrase, B subunit  48.91 
 
 		 649 aa  568  1e-160  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00028541  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0015  DNA gyrase, B subunit  48.44 
 
 		 643 aa  568  1e-160  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00473367  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0005  DNA gyrase subunit B  48.27 
 
 		 644 aa  565  1e-160  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.375435  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0051  DNA gyrase, B subunit  48.28 
 
 		 640 aa  568  1e-160  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00050  DNA gyrase subunit B  48.84 
 
 		 645 aa  566  1e-160  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0377504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0005  DNA gyrase, B subunit  47.17 
 
 		 644 aa  565  1.0000000000000001e-159  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00336478  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2805  DNA gyrase subunit B  47.17 
 
 		 633 aa  564  1.0000000000000001e-159  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.035041  hitchhiker  0.00161489 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0006  DNA gyrase, B subunit  49.62 
 
 		 649 aa  564  1.0000000000000001e-159  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0005  DNA gyrase, B subunit  49.53 
 
 		 636 aa  563  1.0000000000000001e-159  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0820  DNA gyrase, B subunit  47.24 
 
 		 644 aa  558  1e-158  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.929877  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1109  hypothetical protein  45.87 
 
 		 651 aa  559  1e-158  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.432981 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0010  DNA gyrase, B subunit  48.2 
 
 		 644 aa  561  1e-158  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000291276  normal  0.113655 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1044  DNA gyrase, B subunit  44.89 
 
 		 675 aa  560  1e-158  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.248456 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0005  DNA gyrase, B subunit  48.6 
 
 		 635 aa  561  1e-158  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1048  DNA gyrase, B subunit  45.22 
 
 		 665 aa  558  1e-158  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.903378  normal  0.436385 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0523  DNA topoisomerase IV subunit B  46.63 
 
 		 642 aa  557  1e-157  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl006  DNA gyrase subunit B  47.83 
 
 		 635 aa  555  1e-157  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0005  DNA gyrase, B subunit  45.95 
 
 		 686 aa  556  1e-157  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.217672  normal  0.192252 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0006  DNA gyrase, B subunit  47.33 
 
 		 648 aa  555  1e-157  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000466462  hitchhiker  0.000000932752 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2173  DNA topoisomerase IV subunit B  47.63 
 
 		 678 aa  557  1e-157  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0007  DNA gyrase, B subunit  47.14 
 
 		 642 aa  556  1e-157  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000235506  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0403  DNA gyrase, B subunit  44.95 
 
 		 659 aa  553  1e-156  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0006  DNA gyrase subunit B  49.61 
 
 		 661 aa  553  1e-156  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.60604  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2676  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  46.14 
 
 		 638 aa  555  1e-156  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000429732  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2317  DNA topoisomerase IV subunit B  46.34 
 
 		 683 aa  552  1e-156  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0966  DNA gyrase, B subunit  47.37 
 
 		 650 aa  554  1e-156  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0087  DNA gyrase subunit B  45.31 
 
 		 650 aa  552  1e-156  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3685  DNA gyrase, B subunit  46.65 
 
 		 636 aa  551  1e-156  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.50658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0005  DNA gyrase, B subunit  47.45 
 
 		 642 aa  550  1e-155  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00050  DNA gyrase subunit B  47.81 
 
 		 648 aa  551  1e-155  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000300089  hitchhiker  0.00265407 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0006  DNA gyrase subunit B  49.22 
 
 		 638 aa  549  1e-155  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0006  DNA gyrase subunit B  49.06 
 
 		 638 aa  548  1e-155  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0005  DNA gyrase, B subunit  47.25 
 
 		 633 aa  549  1e-155  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3316  DNA topoisomerase IV subunit B  47.5 
 
 		 647 aa  549  1e-155  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.492562  normal  0.69961 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3440  DNA topoisomerase IV subunit B  47.41 
 
 		 685 aa  549  1e-155  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.910743 
 
 
-
 
NC_002950  PG1702  DNA gyrase, B subunit  46.42 
 
 		 654 aa  548  1e-154  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.118209 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3119  DNA topoisomerase IV subunit B  47.41 
 
 		 701 aa  548  1e-154  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0006  DNA gyrase, B subunit  47.13 
 
 		 657 aa  548  1e-154  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0640432  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0132  DNA gyrase, B subunit  48.99 
 
 		 637 aa  546  1e-154  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.312038  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4195  DNA gyrase, B subunit  46.8 
 
 		 653 aa  545  1e-154  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00698411 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0047  DNA gyrase, B subunit  46.8 
 
 		 645 aa  548  1e-154  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109606 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0006  DNA gyrase subunit B  46.15 
 
 		 695 aa  543  1e-153  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000061906 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0008  DNA gyrase, B subunit  47.6 
 
 		 719 aa  543  1e-153  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.107754  hitchhiker  0.00597045 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1653  DNA topoisomerase IV subunit B  46.11 
 
 		 685 aa  545  1e-153  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.0034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0005  DNA gyrase subunit B  49.06 
 
 		 640 aa  543  1e-153  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3980  DNA topoisomerase IV subunit B  46.54 
 
 		 687 aa  542  1e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1003  DNA topoisomerase IV subunit B  46.97 
 
 		 686 aa  544  1e-153  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.674809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1091  DNA topoisomerase IV subunit B  46.73 
 
 		 659 aa  543  1e-153  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1413  DNA gyrase subunit B  45.25 
 
 		 652 aa  545  1e-153  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.805897  normal  0.136461 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0007  DNA gyrase, B subunit  47.75 
 
 		 648 aa  543  1e-153  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000647413 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0004  DNA gyrase subunit B  47.01 
 
 		 642 aa  543  1e-153  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0005  DNA gyrase, B subunit  50 
 
 		 637 aa  545  1e-153  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0004  DNA gyrase, B subunit  46.24 
 
 		 642 aa  541  9.999999999999999e-153  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3307  DNA topoisomerase IV subunit B  47.55 
 
 		 684 aa  539  9.999999999999999e-153  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4352  DNA topoisomerase IV subunit B  46.94 
 
 		 682 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.494271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0006  DNA gyrase, B subunit  47.33 
 
 		 635 aa  540  9.999999999999999e-153  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.98095 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_4  DNA gyrase, B subunit  46.61 
 
 		 642 aa  541  9.999999999999999e-153  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0133  DNA gyrase subunit B  47.57 
 
 		 655 aa  541  9.999999999999999e-153  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.879154  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0087  DNA gyrase subunit B  47.34 
 
 		 655 aa  540  9.999999999999999e-153  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0862  DNA gyrase, B subunit  47.09 
 
 		 652 aa  541  9.999999999999999e-153  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00557988 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5315  DNA gyrase subunit B  48.98 
 
 		 640 aa  538  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.021698  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0006  DNA gyrase subunit B  47.8 
 
 		 647 aa  538  9.999999999999999e-153  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.195447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0984  DNA gyrase subunit B  48.31 
 
 		 651 aa  541  9.999999999999999e-153  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4757  DNA topoisomerase IV subunit B  46.2 
 
 		 678 aa  539  9.999999999999999e-153  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.125119 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0005  DNA gyrase subunit B  47.81 
 
 		 666 aa  539  9.999999999999999e-153  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0306  DNA gyrase, B subunit  48.47 
 
 		 643 aa  539  9.999999999999999e-153  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.337431  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0006  DNA gyrase B subunit  46.69 
 
 		 656 aa  540  9.999999999999999e-153  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.381905 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>