More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0977 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0977  DNA primase  100 
 
 		 619 aa  1234    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0912  hypothetical protein  38.12 
 
 		 640 aa  435  1e-121  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.121689 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0927  DNA primase  34.78 
 
 		 653 aa  421  1e-116  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.584516  normal  0.012532 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3370  DNA primase  37.76 
 
 		 674 aa  418  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0276  DNA primase  35.96 
 
 		 660 aa  410  1e-113  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.121752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5973  DNA primase  36.38 
 
 		 703 aa  394  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.328857 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2415  DNA primase  40.55 
 
 		 601 aa  393  1e-108  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000695065  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6451  DNA primase  36.02 
 
 		 662 aa  390  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.6099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12410  DNA primase  43.37 
 
 		 599 aa  389  1e-106  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.936355  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1790  DNA primase  40.56 
 
 		 704 aa  387  1e-106  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0548  DNA primase  35.39 
 
 		 660 aa  384  1e-105  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00859761  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0586  DNA primase  38.07 
 
 		 632 aa  380  1e-104  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.284459  normal  0.746825 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1589  DNA primase  37.57 
 
 		 633 aa  374  1e-102  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.567407  normal  0.0206676 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1034  DNA primase  41.48 
 
 		 598 aa  369  1e-101  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0910  DNA primase  37.28 
 
 		 656 aa  370  1e-101  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0826  DNA primase  38.6 
 
 		 598 aa  367  1e-100  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000125124  decreased coverage  1.52163e-21 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4315  DNA primase  39.26 
 
 		 598 aa  369  1e-100  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.07467e-58 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4195  DNA primase  39.26 
 
 		 598 aa  368  1e-100  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0980784  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4043  DNA primase  39.26 
 
 		 598 aa  369  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4516  DNA primase  39.26 
 
 		 598 aa  368  1e-100  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00440133  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4427  DNA primase  39.26 
 
 		 598 aa  369  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000994887  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0896  DNA primase  38.2 
 
 		 600 aa  367  1e-100  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4410  DNA primase  38.6 
 
 		 598 aa  367  1e-100  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000156307  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4374  DNA primase  39.11 
 
 		 571 aa  365  1e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000215576  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4033  DNA primase  39.07 
 
 		 598 aa  365  1e-99  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0023967  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3090  DNA primase  44.91 
 
 		 587 aa  364  2e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4145  DNA primase  38.25 
 
 		 600 aa  365  2e-99  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00903359  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2265  DNA primase  40.79 
 
 		 595 aa  364  2e-99  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0225159  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0602  DNA primase  37.52 
 
 		 636 aa  362  8e-99  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1976  DNA primase  40.59 
 
 		 595 aa  361  2e-98  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00122543  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06600  putative DNA primase  36.31 
 
 		 657 aa  360  3e-98  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0631  DNA primase  35.01 
 
 		 630 aa  361  3e-98  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3020  DNA primase  38.91 
 
 		 598 aa  360  4e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0245497  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4048  DNA primase  41.33 
 
 		 587 aa  360  4e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.211802  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1814  DNA primase  40.56 
 
 		 673 aa  359  8e-98  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3790  DNA primase  40.69 
 
 		 582 aa  356  5.999999999999999e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1964  DNA primase  39.65 
 
 		 632 aa  355  8.999999999999999e-97  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.985881  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3695  DNA primase  38.62 
 
 		 583 aa  355  1e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0394  DNA primase  43.72 
 
 		 588 aa  355  1e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0728  DNA primase  35.24 
 
 		 631 aa  355  2e-96  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0540  DNA primase  40.76 
 
 		 604 aa  352  8.999999999999999e-96  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00398394  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2153  DNA primase  43.59 
 
 		 613 aa  351  2e-95  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1214  DNA primase  39.86 
 
 		 626 aa  350  3e-95  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.008506  normal  0.015083 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2679  DNA primase  41.41 
 
 		 604 aa  346  6e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4217  DNA primase  42.93 
 
 		 614 aa  340  5.9999999999999996e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000725747  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1014  DNA primase  40.75 
 
 		 588 aa  338  1.9999999999999998e-91  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.394769  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1313  DNA primase  40.38 
 
 		 595 aa  336  9e-91  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000743307  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3037  DNA primase  43.1 
 
 		 599 aa  333  5e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.735679 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1213  DNA primase  41.86 
 
 		 601 aa  333  8e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.140428 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1508  DNA primase, DNAG  39.57 
 
 		 593 aa  332  2e-89  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.083335  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3522  DNA primase  35.6 
 
 		 596 aa  329  1.0000000000000001e-88  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.884792  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1978  DNA primase  41.5 
 
 		 601 aa  328  2.0000000000000001e-88  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2517  DNA primase  44.79 
 
 		 617 aa  327  3e-88  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.986794  normal  0.570872 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1128  DNA primase  33.27 
 
 		 598 aa  325  1e-87  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0012752  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3050  DNA primase  39.6 
 
 		 584 aa  325  1e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.233907  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2463  Fis family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 604 aa  321  3e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0623  DNA primase  44.63 
 
 		 605 aa  318  2e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0313  DNA primase  40.53 
 
 		 578 aa  318  2e-85  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166585 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5148  DNA primase  39.05 
 
 		 655 aa  317  4e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.932917 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1100  DNA primase  42.31 
 
 		 614 aa  317  4e-85  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0719  DNA primase  39.12 
 
 		 663 aa  317  4e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2268  DNA primase  39.72 
 
 		 587 aa  316  9.999999999999999e-85  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46990  DNA primase  40.93 
 
 		 638 aa  314  1.9999999999999998e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1295  DNA primase  39.31 
 
 		 686 aa  315  1.9999999999999998e-84  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.830099  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1625  DNA primase  40 
 
 		 599 aa  315  1.9999999999999998e-84  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.947875 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07530  DNA primase  39.78 
 
 		 664 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.412597 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0323  DNA primase  39.34 
 
 		 579 aa  314  2.9999999999999996e-84  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.119133 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0388  DNA primase  40.67 
 
 		 660 aa  313  5.999999999999999e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0422  DNA primase  40.67 
 
 		 660 aa  313  7.999999999999999e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1042  DNA primase  39.78 
 
 		 666 aa  313  7.999999999999999e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.118792  normal  0.884554 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4814  DNA primase  40.62 
 
 		 660 aa  312  1e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0538  DNA primase  38.98 
 
 		 652 aa  312  1e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4640  DNA primase  39.41 
 
 		 651 aa  312  1e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.625681 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0419  DNA primase  40.81 
 
 		 660 aa  312  1e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1136  DNA primase  37.86 
 
 		 544 aa  312  1e-83  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000106361  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2387  DNA primase  43.81 
 
 		 565 aa  311  2e-83  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.38837 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0491  DNA primase  40.3 
 
 		 599 aa  311  2e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.34781  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2058  DNA primase  41.06 
 
 		 592 aa  310  5.9999999999999995e-83  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.507155  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0717  DNA primase  40.61 
 
 		 656 aa  309  9e-83  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.261682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0975  DNA primase  40.26 
 
 		 613 aa  309  1.0000000000000001e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4297  DNA primase  38.62 
 
 		 640 aa  309  1.0000000000000001e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.624136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0326  DNA primase  36.1 
 
 		 539 aa  309  1.0000000000000001e-82  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0044  DNA primase  40.72 
 
 		 574 aa  307  4.0000000000000004e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.723286  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1175  DNA primase  40.94 
 
 		 682 aa  306  7e-82  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.00198747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1275  DNA primase  39.57 
 
 		 629 aa  305  2.0000000000000002e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1620  DNA primase  38.26 
 
 		 605 aa  305  2.0000000000000002e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0393306  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1654  DNA primase  38.26 
 
 		 605 aa  305  2.0000000000000002e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000285307  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4027  DNA primase  38.07 
 
 		 663 aa  302  1e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.570104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3836  DNA primase  37.71 
 
 		 646 aa  302  1e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0564656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3785  DNA primase  37.71 
 
 		 646 aa  302  1e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1932  DNA primase  42.52 
 
 		 648 aa  301  2e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0456378  hitchhiker  0.00240757 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1699  DNA primase  39.95 
 
 		 645 aa  300  4e-80  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04097  DNA primase  39.26 
 
 		 582 aa  300  4e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1727  DNA primase  45.81 
 
 		 611 aa  300  4e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1190  DNA primase  42.79 
 
 		 631 aa  300  5e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0735  DNA primase  37.61 
 
 		 675 aa  300  6e-80  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.898255 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1799  DNA primase  40.61 
 
 		 616 aa  300  7e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1807  DNA primase  39.76 
 
 		 576 aa  300  7e-80  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000348842  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1895  DNA primase  45.1 
 
 		 573 aa  299  9e-80  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.158344  normal  0.0137969 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3790  DNA primase  37.58 
 
 		 640 aa  298  2e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>