More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4984 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012848  Rleg_4984  ABC transporter related  100 
 
 		 358 aa  724    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.718795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5863  ABC transporter related  85.47 
 
 		 358 aa  625  1e-178  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0374119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1358  ABC transporter related  46.13 
 
 		 365 aa  311  1e-83  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.181944 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4206  ABC transporter related  46.03 
 
 		 384 aa  308  9e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1056  ABC transporter related  45.28 
 
 		 384 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112143  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1018  sugar ABC transporter, ATP-binding subunit  45.01 
 
 		 384 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1016  ABC transporter related  45.75 
 
 		 384 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2431  ABC transporter related  59.38 
 
 		 342 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.435131  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0704  ABC transporter related  47.44 
 
 		 336 aa  303  4.0000000000000003e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.433646  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6366  ABC transporter related  52.94 
 
 		 339 aa  296  4e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0766362  normal  0.65033 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1153  ABC transporter related  43.05 
 
 		 381 aa  295  6e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.203038  normal  0.427796 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1295  glucose ABC transporter, ATP-binding protein  43.56 
 
 		 386 aa  295  9e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1495  ABC transporter related  46.26 
 
 		 367 aa  295  1e-78  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.407646  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1543  ABC transporter related  46.26 
 
 		 367 aa  295  1e-78  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5862  ABC transporter related  45.95 
 
 		 369 aa  295  1e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.297311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4763  ABC transporter related  46.31 
 
 		 352 aa  294  2e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.373169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1116  ABC transporter:TOBE  42.74 
 
 		 389 aa  293  2e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.110421  normal  0.561117 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5633  ABC transporter related  51.44 
 
 		 345 aa  293  2e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.20666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3768  ABC transporter related  45.79 
 
 		 351 aa  293  2e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2430  ABC transporter related  42.66 
 
 		 365 aa  294  2e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0752854  normal  0.820475 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6524  ABC transporter related  44.38 
 
 		 366 aa  293  3e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.113539 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2417  ABC transporter related  45.51 
 
 		 350 aa  293  4e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.830263  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2462  ABC transporter related  45.51 
 
 		 350 aa  293  4e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2456  ABC transporter related  45.51 
 
 		 350 aa  293  4e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.913422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6367  ABC transporter related  44.75 
 
 		 371 aa  290  2e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.114303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4367  ABC transporter-like  43.82 
 
 		 386 aa  290  2e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.201589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2340  ABC transporter  44.59 
 
 		 369 aa  290  2e-77  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0894  ABC transporter related  44.2 
 
 		 370 aa  290  3e-77  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2654  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  44.05 
 
 		 369 aa  290  3e-77  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23010  putative ATP-binding component of ABC transporter  43.01 
 
 		 386 aa  290  4e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0424351 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3684  ABC transporter related  46.05 
 
 		 355 aa  288  8e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4985  ABC transporter related  44.59 
 
 		 369 aa  287  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1942  ABC transporter ATP-binding protein  42.74 
 
 		 386 aa  287  2e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1260  ABC transporter component  43.63 
 
 		 372 aa  285  5.999999999999999e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0274  ABC transporter related  45.73 
 
 		 368 aa  285  7e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.533134 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4087  ABC transporter related  43.61 
 
 		 355 aa  284  2.0000000000000002e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.356681 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3398  ABC transporter related  43.98 
 
 		 357 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.129757 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4498  ABC transporter related protein  44.5 
 
 		 381 aa  283  3.0000000000000004e-75  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0512744  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1165  ABC transporter related  43.96 
 
 		 363 aa  282  5.000000000000001e-75  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.191612  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3526  ABC transporter related  43.58 
 
 		 356 aa  282  7.000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.457931  normal  0.0981822 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2614  ABC transporter related  45.03 
 
 		 376 aa  282  7.000000000000001e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4648  ABC transporter related protein  44.93 
 
 		 377 aa  282  7.000000000000001e-75  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1692  ABC transporter-related protein  42.46 
 
 		 355 aa  282  7.000000000000001e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.291181 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0636  ABC transporter related  45.03 
 
 		 380 aa  281  9e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1161  ABC transporter related  44.57 
 
 		 367 aa  281  2e-74  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3778  ABC transporter related  47.76 
 
 		 356 aa  280  2e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.37317  normal  0.759953 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0329  ABC transporter related  42.51 
 
 		 379 aa  279  4e-74  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.939732 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4484  ABC transporter-related protein  42.53 
 
 		 391 aa  280  4e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00113019  normal  0.0744175 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0777  ABC transporter related  44.02 
 
 		 367 aa  279  5e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.540961  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0955  ABC transporter related  43.33 
 
 		 365 aa  279  5e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.370442  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0312  ABC transporter related  42.15 
 
 		 363 aa  279  5e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.982046  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0364  ABC transporter related  44.59 
 
 		 365 aa  279  5e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.915388 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0163  ABC transporter related  44.05 
 
 		 369 aa  279  6e-74  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3323  ABC transporter related  45.22 
 
 		 354 aa  279  7e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.89405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0207  ABC transporter related  44.35 
 
 		 375 aa  278  8e-74  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.91298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1240  ABC transporter related  45.13 
 
 		 360 aa  278  9e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5634  ABC transporter related  44.92 
 
 		 367 aa  278  1e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.21087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3693  ABC transporter related  42.5 
 
 		 357 aa  278  1e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.402658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1031  ABC transporter related  43.36 
 
 		 371 aa  278  1e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.865528  normal  0.0793172 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2096  ABC transporter related  44.57 
 
 		 354 aa  277  2e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00542123 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3126  ABC transporter related  43.85 
 
 		 359 aa  277  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4322  ABC transporter related protein  41.23 
 
 		 378 aa  277  2e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.253328  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4747  ABC transporter related  46 
 
 		 356 aa  276  3e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.155462 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3980  ABC transporter related  42.35 
 
 		 405 aa  276  3e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1177  ABC transporter related  44.48 
 
 		 356 aa  276  3e-73  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.675733  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4054  ABC transporter related  42.35 
 
 		 405 aa  276  3e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.955986 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3994  ABC transporter related  42.35 
 
 		 405 aa  276  3e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.73747  normal  0.280943 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5712  ABC transporter related  44.13 
 
 		 355 aa  276  5e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.268173 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1050  ABC transporter related  45.45 
 
 		 356 aa  276  5e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.125219  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0283  ABC transporter related  43.73 
 
 		 353 aa  276  6e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.157903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0365  ABC transporter related protein  44.57 
 
 		 374 aa  275  7e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.343115  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5360  ABC transporter related  44.13 
 
 		 356 aa  275  7e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.220389  normal  0.603091 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3783  ABC transporter related  43.75 
 
 		 371 aa  275  7e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.256147  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1485  ABC transporter related  44.02 
 
 		 371 aa  275  8e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.223537  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1803  ABC transporter related  44.09 
 
 		 370 aa  275  1.0000000000000001e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000191731  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1821  ABC transporter related  44.74 
 
 		 382 aa  275  1.0000000000000001e-72  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3448  ABC sugar transporter, ATPase subunit  43.17 
 
 		 371 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0130307  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5221  ABC transporter related  46.93 
 
 		 381 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.533287  normal  0.501993 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0409  putative maltose ABC transportor  41.62 
 
 		 365 aa  275  1.0000000000000001e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1586  ABC transporter related  42.9 
 
 		 355 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3943  ABC transporter related  42.9 
 
 		 403 aa  275  1.0000000000000001e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.39994  normal  0.0172807 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4499  ABC transporter related protein  44.09 
 
 		 381 aa  274  1.0000000000000001e-72  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0578082  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2640  ABC transporter related  42.7 
 
 		 349 aa  274  2.0000000000000002e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0268682  normal  0.013734 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1098  ABC transporter related  42 
 
 		 352 aa  274  2.0000000000000002e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5338  ABC transporter related  44.51 
 
 		 355 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.708738  normal  0.0411085 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0254  ABC transporter related  44.29 
 
 		 353 aa  273  3e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2893  ABC transporter related  44.85 
 
 		 353 aa  273  3e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.401174  normal  0.250176 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2139  ABC transporter related  43.09 
 
 		 384 aa  273  3e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724946  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4290  ABC transporter related  46.22 
 
 		 360 aa  273  3e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.439892  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2427  ABC transporter related  44.99 
 
 		 372 aa  273  3e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4666  ABC transporter related  44.86 
 
 		 356 aa  273  3e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.47492 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0135  ABC transporter-related protein  43.85 
 
 		 350 aa  273  4.0000000000000004e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.370225 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1537  ABC transporter related  42.62 
 
 		 355 aa  273  4.0000000000000004e-72  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0442847  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0064  ABC transporter related  41.37 
 
 		 380 aa  273  4.0000000000000004e-72  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1094  ABC transporter related  44.75 
 
 		 356 aa  273  5.000000000000001e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.910142  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1702  ABC transporter related  42.18 
 
 		 359 aa  273  5.000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0892  ABC transporter-related protein  43.98 
 
 		 357 aa  273  5.000000000000001e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2142  ABC transporter related  41.64 
 
 		 365 aa  272  6e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0488971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3961  ABC transporter related  44.66 
 
 		 354 aa  272  6e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.565548  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2865  ABC transporter related  44.01 
 
 		 373 aa  272  6e-72  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>