More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_6187 on replicon NC_011370
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1059  ParB domain protein nuclease  51.06 
 
 		 685 aa  639    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1222  nuclease  51.57 
 
 		 706 aa  696    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3060  ParB domain protein nuclease  54.27 
 
 		 714 aa  715    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.658709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6187  ParB domain protein nuclease  100 
 
 		 711 aa  1446    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00276297 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6053  nuclease  50.07 
 
 		 694 aa  636    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2781  ParB domain protein nuclease  54.1 
 
 		 714 aa  728    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2858  nuclease  57.76 
 
 		 709 aa  750    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0970138 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0380  ParB family protein  50.71 
 
 		 713 aa  654    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0730  nuclease  51.64 
 
 		 734 aa  673    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.232794  normal  0.968585 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3567  ParB-like nuclease  53.39 
 
 		 703 aa  727    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3920  ParB-like nuclease  53.41 
 
 		 703 aa  721    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4579  parB-like partition protein  58.05 
 
 		 687 aa  740    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.914169  normal  0.147919 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3031  nuclease  54.8 
 
 		 712 aa  709    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.578661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4923  parB-like partition protein  72.31 
 
 		 706 aa  1040    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.953106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2659  hypothetical protein  49.37 
 
 		 713 aa  641    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.603455  normal  0.436395 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4146  ParB-like nuclease  60.52 
 
 		 717 aa  845    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0488845  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4594  putative plasmid stabilization protein  58.96 
 
 		 696 aa  819    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.473967  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0538  ParB family protein  54.87 
 
 		 714 aa  733    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3513  nuclease  51.57 
 
 		 706 aa  696    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.557046 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0571  parB-like partition protein  54.78 
 
 		 687 aa  731    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.462321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0771  nuclease  57.19 
 
 		 708 aa  751    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1541  parB-like partition proteins  51.85 
 
 		 708 aa  682    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.79146  normal  0.0178306 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4025  parB-like partition protein  57.49 
 
 		 687 aa  729    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.934499  normal  0.037787 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8287  ParB domain protein nuclease  50.79 
 
 		 709 aa  628  1e-178  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.246382  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0192  ParB family protein  49.64 
 
 		 703 aa  622  1e-177  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2123  hypothetical protein  47.09 
 
 		 717 aa  612  1e-173  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3151  hypothetical protein  46.21 
 
 		 716 aa  590  1e-167  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.258373  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2520  ParB-like nuclease  47.31 
 
 		 694 aa  587  1e-166  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.216239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5564  ParB domain protein nuclease  46.32 
 
 		 759 aa  566  1e-160  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0978774 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3333  putative plasmid stabilization protein  51.96 
 
 		 577 aa  552  1e-156  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3819  hypothetical protein  45.33 
 
 		 723 aa  547  1e-154  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1474  ParB family protein  49.83 
 
 		 577 aa  517  1.0000000000000001e-145  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.430156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7409  hypothetical protein  48.36 
 
 		 546 aa  506  9.999999999999999e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2859  ParB-like nuclease  42.68 
 
 		 726 aa  488  1e-136  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3808  nuclease  42.9 
 
 		 694 aa  483  1e-135  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.310263 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3672  nuclease  40.39 
 
 		 715 aa  481  1e-134  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7711  hypothetical protein  45.93 
 
 		 582 aa  478  1e-133  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320471 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2346  putative DNA-binding protein  48.94 
 
 		 536 aa  465  1e-129  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.598568  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7310  putative ParB-like nuclease  43.54 
 
 		 528 aa  397  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0315  nuclease  36.59 
 
 		 636 aa  351  3e-95  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0550  parB-like partition protein  37.56 
 
 		 615 aa  350  5e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4602  parB-like partition protein  35.76 
 
 		 654 aa  314  2.9999999999999996e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.469215  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2465  ParB-like nuclease  34.4 
 
 		 658 aa  310  5e-83  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9896  transcriptional regulator  35.99 
 
 		 645 aa  306  1.0000000000000001e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2733  nuclease  35.26 
 
 		 688 aa  302  2e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.905416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3033  ParB family protein  35.26 
 
 		 688 aa  302  2e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.391676 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1245  ParB family protein  36.36 
 
 		 683 aa  301  4e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.034848 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31190  hypothetical protein  35.94 
 
 		 684 aa  301  4e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000126349  unclonable  1.05034e-21 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2322  nuclease  36.41 
 
 		 682 aa  298  2e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2640  ParB family protein  35.86 
 
 		 690 aa  297  5e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.587748  normal  0.035821 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0680  nuclease  35.53 
 
 		 681 aa  295  1e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2943  nuclease  35.85 
 
 		 683 aa  293  8e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.24471  normal  0.819404 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1870  ParB domain protein nuclease  35.94 
 
 		 684 aa  291  3e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2612  ParB domain protein nuclease  35.81 
 
 		 679 aa  283  9e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1277  ParB domain protein nuclease  34.94 
 
 		 689 aa  273  9e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0467  nuclease  33.82 
 
 		 687 aa  272  1e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6194  nuclease  31.85 
 
 		 751 aa  271  4e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0926146  normal  0.731953 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1478  ParB family protein  35.06 
 
 		 680 aa  268  2.9999999999999995e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2078  ParB domain protein nuclease  35.02 
 
 		 677 aa  266  8e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3534  ParB domain protein nuclease  35.46 
 
 		 687 aa  263  6e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2219  ParB-like nuclease  32.78 
 
 		 667 aa  254  5.000000000000001e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.488609  normal  0.287852 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4159  nuclease  34.15 
 
 		 679 aa  249  1e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.841229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2572  ParB family protein  34.04 
 
 		 765 aa  247  4.9999999999999997e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.306816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3740  nuclease  34.51 
 
 		 692 aa  244  5e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6483  ParB domain protein nuclease  33.28 
 
 		 740 aa  242  1e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.656524  normal  1 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5399  ParB domain protein nuclease  31.96 
 
 		 623 aa  242  2e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.883883  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6935  nuclease  32.32 
 
 		 709 aa  234  5e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0146149  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0477  putative ParB-like nuclease  33.54 
 
 		 754 aa  230  6e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.487335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0428  parB-like partition proteins  32.26 
 
 		 662 aa  229  1e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.62662  normal  0.628869 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2198  ParB family protein  31.86 
 
 		 662 aa  228  3e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0776578  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3089  hypothetical protein  47.77 
 
 		 369 aa  228  4e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.762612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1781  putative plasmid stabilization protein  32.76 
 
 		 727 aa  227  7e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.901173 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2347  ParB-like nuclease  70.06 
 
 		 156 aa  217  5e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.107377  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3925  parB-like partition protein  29.89 
 
 		 690 aa  201  3e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0139  ParB domain-containing protein  28.64 
 
 		 669 aa  197  5.000000000000001e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000818484 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5262  ParB family protein  27.08 
 
 		 729 aa  179  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4410  ParB domain protein nuclease  27.86 
 
 		 626 aa  178  3e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.902867 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4417  nuclease  27.86 
 
 		 626 aa  178  3e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000853947  decreased coverage  0.00344778 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4600  nuclease  27.86 
 
 		 626 aa  178  3e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000283413  normal  0.96805 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4956  nuclease  63.58 
 
 		 172 aa  172  3e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.457337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4579  nuclease  27.39 
 
 		 624 aa  170  8e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0158793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7403  putative chromosome partitioning protein parB  69.35 
 
 		 133 aa  170  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.933804 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4477  ParB domain protein nuclease  26.96 
 
 		 624 aa  169  1e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000629481  normal  0.555503 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0031  ParB family partitioning protein  26.6 
 
 		 624 aa  169  2e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.264156  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1468  putative plasmid stabilization protein  67.77 
 
 		 129 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.449955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3327  putative plasmid stabilization protein  67.77 
 
 		 129 aa  163  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4994  ParB domain protein nuclease  37.93 
 
 		 380 aa  162  3e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00893638  normal  0.0336784 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4525  ParB domain protein nuclease  26.64 
 
 		 624 aa  162  3e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00810942  normal  0.619487 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0054  ParB-like partition protein  26.25 
 
 		 654 aa  160  7e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.737762 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0024  plasmid partition protein B  27.45 
 
 		 654 aa  160  1e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0053  ParB-like partition protein  26.25 
 
 		 652 aa  155  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.172926  hitchhiker  0.000557548 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0068  plasmid partition protein B  26.1 
 
 		 652 aa  155  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.878087 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2617  hypothetical protein  44.66 
 
 		 597 aa  150  8e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5200  nuclease  32.72 
 
 		 595 aa  144  4e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3345  nuclease  37.68 
 
 		 603 aa  135  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.166956  normal  0.0526297 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3609  ParB family protein  38.41 
 
 		 606 aa  134  5e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2258  nuclease  38.41 
 
 		 607 aa  134  6e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0720626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4273  nuclease  25.98 
 
 		 670 aa  133  1.0000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4015  parB-like partition protein  30.48 
 
 		 660 aa  131  4.0000000000000003e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1660  ParB family protein  38.41 
 
 		 389 aa  130  6e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.295778  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>