More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_6111 on replicon NC_011370
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011370  Rleg2_6111  flavin reductase domain protein FMN-binding  100 
 
 		 374 aa  775    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.575038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2873  LysR family transcriptional regulator  43 
 
 		 299 aa  187  3e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.243483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2360  transcriptional regulator, LysR family  43 
 
 		 299 aa  186  4e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.612222  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2873  LysR family transcriptional regulator  42.79 
 
 		 294 aa  181  2e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.119961  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0999  LysR family transcriptional regulator  43.69 
 
 		 296 aa  179  7e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.165129  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1650  LysR family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 301 aa  176  7e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.281092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1474  LysR family transcriptional regulator  42.23 
 
 		 295 aa  176  8e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1925  LysR family transcriptional regulator  38.73 
 
 		 296 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.851659  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1415  flavin reductase-like, FMN-binding  49.01 
 
 		 172 aa  160  4e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0331151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3755  flavin reductase-like, FMN-binding  48.34 
 
 		 154 aa  156  4e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1554  transcriptional regulator, LysR family  38.12 
 
 		 309 aa  156  7e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.15921 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1883  transcriptional regulator, LysR family  38.12 
 
 		 309 aa  154  2e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0687382  normal  0.7379 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2298  flavin reductase domain-containing protein  47.44 
 
 		 226 aa  155  2e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1544  flavin reductase-like, FMN-binding  44.72 
 
 		 174 aa  153  4e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.917406  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0150  transcriptional regulator, LysR family  38.73 
 
 		 307 aa  152  5.9999999999999996e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0132  LysR family transcriptional regulator  38.73 
 
 		 302 aa  152  8.999999999999999e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2988  transcriptional regulator, LysR family  38.31 
 
 		 300 aa  152  1e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.8288  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2625  flavin reductase domain-containing protein  44.97 
 
 		 175 aa  151  2e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4270  transcriptional regulator, LysR family  38.68 
 
 		 296 aa  151  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5582  LysR family transcriptional regulator  36.82 
 
 		 300 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.651433  hitchhiker  0.00527291 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26010  Transcriptional regulator, LysR family  36.41 
 
 		 307 aa  150  3e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.446207  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2109  LysR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 301 aa  150  5e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00408036  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2579  LysR family transcriptional regulator  38.92 
 
 		 295 aa  150  5e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0667256 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1443  transcriptional regulator, LysR family  37.2 
 
 		 299 aa  149  8e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.181358  normal  0.808865 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1379  transcriptional regulator, LysR family  37.2 
 
 		 299 aa  149  9e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.884009  normal  0.119976 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2581  transcriptional regulator, LysR family  39.07 
 
 		 312 aa  149  9e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4718  LysR family transcriptional regulator  36.32 
 
 		 300 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0423403 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3186  flavin reductase domain-containing protein  44.65 
 
 		 226 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.528706  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6597  transcriptional regulator, LysR family  38.92 
 
 		 295 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0290538  normal  0.188655 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3649  LysR family transcriptional regulator  36.32 
 
 		 300 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5026  LysR family transcriptional regulator  36.1 
 
 		 302 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.508806  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2006  flavin reductase domain-containing protein  44.65 
 
 		 203 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1316  flavin reductase domain-containing protein  44.65 
 
 		 226 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2295  flavin reductase domain-containing protein  44.65 
 
 		 226 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0452  LysR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 295 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3799  LysR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 300 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.353569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3059  flavin reductase domain-containing protein  45.81 
 
 		 228 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1029  flavin reductase domain-containing protein  44.65 
 
 		 226 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.736467  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4248  LysR family transcriptional regulator  37.2 
 
 		 308 aa  147  3e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05312  transcription regulator protein  36.02 
 
 		 294 aa  147  3e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.57895  normal  0.489476 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3038  LysR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 321 aa  147  3e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.674473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0805  transcriptional regulator, LysR family  38 
 
 		 297 aa  147  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1306  transcriptional regulator, LysR family  36.45 
 
 		 296 aa  147  4.0000000000000006e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.383591  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3607  LysR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 330 aa  146  5e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.594453 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3228  LysR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 318 aa  146  5e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.075069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1224  LysR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 311 aa  146  6e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.246305  normal  0.012159 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1644  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  38.69 
 
 		 302 aa  145  8.000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1403  flavin reductase domain-containing protein  45.16 
 
 		 228 aa  145  9e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3269  transcriptional regulator, LysR family  38.19 
 
 		 303 aa  145  9e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0672409  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2389  LysR family transcriptional regulator  36.1 
 
 		 297 aa  145  1e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0163  LysR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 294 aa  145  2e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.132005  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0948  transcriptional regulator, LysR family  36.79 
 
 		 296 aa  145  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0146  LysR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 294 aa  145  2e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2252  transcriptional regulator, LysR family  37.69 
 
 		 296 aa  143  4e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2126  LysR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 301 aa  143  5e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.665122 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4253  transcriptional regulator, LysR family  34.6 
 
 		 294 aa  143  6e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.944931 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4141  transcriptional regulator, LysR family  34.6 
 
 		 294 aa  143  6e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2059  flavin reductase-like, FMN-binding  41.83 
 
 		 170 aa  142  6e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000000136887  normal  0.155549 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0174  LysR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 304 aa  142  7e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6978  transcriptional regulator, LysR family  35.75 
 
 		 311 aa  142  9e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4350  LysR substrate-binding  35.98 
 
 		 317 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.596165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6037  LysR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 310 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.933642  normal  0.0797948 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1313  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 302 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4752  transcriptional regulator, LysR family  35.51 
 
 		 317 aa  139  1e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.229004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7247  transcriptional regulator, LysR family  34.17 
 
 		 296 aa  139  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.179007  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2062  transcriptional regulator, LysR family  36.45 
 
 		 322 aa  139  1e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.435121  normal  0.841238 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1423  transcriptional regulator, LysR family  34.95 
 
 		 315 aa  138  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4637  transcriptional regulator  31.68 
 
 		 298 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52920  transcriptional regulator  31.68 
 
 		 298 aa  136  5e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.134426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3890  transcriptional regulator, LysR family  34 
 
 		 296 aa  134  3e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3598  LysR substrate-binding  34 
 
 		 297 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6962  LysR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 305 aa  133  5e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5234  LysR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 314 aa  133  6e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.748961  normal  0.502228 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3395  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 321 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0602491  normal  0.492377 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1196  DNA-binding transcriptional regulatory transcription regulator protein  34.16 
 
 		 306 aa  132  6.999999999999999e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.491334  normal  0.623909 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5095  LysR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 308 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.2375 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4490  LysR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 298 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1132  transcriptional regulator, LysR family  34.65 
 
 		 304 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.534175 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4274  transcriptional regulator, LysR family  33.5 
 
 		 297 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.614973 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4032  LysR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 298 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.304156  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1307  transcriptional regulator, LysR family  31.84 
 
 		 295 aa  131  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.262852  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3044  LysR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 306 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2733  LysR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 289 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0391194 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4874  transcriptional regulator, LysR family  35.51 
 
 		 316 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.106591 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6614  LysR family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 305 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3339  LysR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 298 aa  130  5.0000000000000004e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.173943  normal  0.644256 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1387  LysR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 296 aa  129  7.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.123084  normal  0.109055 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4109  flavin reductase domain-containing protein  44.08 
 
 		 162 aa  129  8.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3424  LysR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 302 aa  129  9.000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2558  LysR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 303 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.551192  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46470  LysR family regulatory protein  33.17 
 
 		 305 aa  128  1.0000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1040  transcriptional regulator, LysR family  33.66 
 
 		 304 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.98585 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6858  flavin reductase-like, FMN-binding  41.86 
 
 		 175 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.798449 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1243  LysR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 298 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.115332  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4903  transcriptional regulator, LysR family  34.31 
 
 		 301 aa  127  3e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.163298  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1614  LysR family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 294 aa  127  3e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.513483  hitchhiker  0.0000854951 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4645  transcriptional regulator, LysR family  32.84 
 
 		 300 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0270127  normal  0.686665 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4856  LysR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 297 aa  126  5e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0305285 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4045  LysR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 300 aa  126  6e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.603685 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0853  flavin reductase domain-containing protein  41.55 
 
 		 185 aa  124  2e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>