More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_1674 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1674  FAD linked oxidase domain protein  100 
 
 
468 aa  969    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0159335  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4667  FAD linked oxidase domain protein  93.59 
 
 
469 aa  899    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.526864 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3554  hypothetical protein  83.23 
 
 
468 aa  803    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0329887  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1380  FAD linked oxidase domain protein  58.63 
 
 
468 aa  526  1e-148  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.221073  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1475  FAD linked oxidase-like  55.34 
 
 
468 aa  490  1e-137  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3682  FAD linked oxidase-like  49.1 
 
 
451 aa  402  1e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1443  FAD linked oxidase domain protein  47.07 
 
 
443 aa  388  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1414  FAD linked oxidase domain protein  47.07 
 
 
443 aa  388  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5295  FAD linked oxidase domain protein  46.85 
 
 
446 aa  386  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1268  hypothetical protein  48.84 
 
 
448 aa  382  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.76462  normal  0.796012 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2034  FAD linked oxidase domain protein  46.91 
 
 
462 aa  365  1e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0807703  normal  0.594146 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1715  FAD linked oxidase domain-containing protein  47.14 
 
 
462 aa  362  6e-99  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.131468  normal  0.62537 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1368  FAD linked oxidase-like  47.21 
 
 
446 aa  359  7e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0179747 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1099  FAD linked oxidase domain protein  46.68 
 
 
456 aa  353  4e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.160498  normal  0.70916 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3873  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.79 
 
 
459 aa  333  4e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.132225  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3051  FAD linked oxidase-like  40.09 
 
 
469 aa  332  8e-90  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.89467  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5135  FAD linked oxidase domain protein  43.27 
 
 
454 aa  328  1.0000000000000001e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.949399  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4761  FAD linked oxidase domain protein  42.66 
 
 
457 aa  325  1e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.19101  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0567  hypothetical protein  39.46 
 
 
449 aa  310  4e-83  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.806895  decreased coverage  0.0060454 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3144  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.57 
 
 
463 aa  310  4e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.720764  normal  0.256061 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0798  putative FAD linked oxidase  36.23 
 
 
474 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19871  FAD/FMN-containing dehydrogenase  37.16 
 
 
459 aa  266  5.999999999999999e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0370705 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0855  hypothetical protein  37.65 
 
 
449 aa  258  1e-67  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1537  hypothetical protein  38.34 
 
 
452 aa  251  2e-65  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.90174  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13511  FAD/FMN-containing dehydrogenase  36.57 
 
 
443 aa  244  3e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0869  FAD/FMN-containing dehydrogenase  35.19 
 
 
450 aa  243  7e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17231  FAD/FMN-containing dehydrogenase  34.95 
 
 
450 aa  240  5e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14641  FAD/FMN-containing dehydrogenase  35.68 
 
 
451 aa  239  8e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14891  FAD/FMN-containing dehydrogenase  35.56 
 
 
452 aa  238  2e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15021  FAD/FMN-containing dehydrogenase  35.14 
 
 
450 aa  233  5e-60  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.244066  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1399  FAD/FMN-containing dehydrogenase  34.46 
 
 
451 aa  229  7e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.150639  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17300  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  28.25 
 
 
454 aa  139  2e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0304649  normal  0.13811 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1737  hypothetical protein  37.79 
 
 
1024 aa  107  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.522031  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2134  hypothetical protein  35.23 
 
 
1024 aa  107  4e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1821  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.74 
 
 
409 aa  103  5e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.778953  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1980  FAD linked oxidase domain protein  31.49 
 
 
411 aa  103  6e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0562  FAD linked oxidase domain protein  34.86 
 
 
466 aa  103  7e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0727  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.38 
 
 
989 aa  101  3e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0988  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  23.86 
 
 
475 aa  99.4  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0857891  hitchhiker  0.00240363 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0310  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  26.73 
 
 
466 aa  95.5  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0305  glycolate oxidase subunit-like protein ysfC  32.7 
 
 
466 aa  95.5  2e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3296  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.99 
 
 
473 aa  94.4  4e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0160978  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1082  hypothetical protein  32.02 
 
 
1015 aa  92  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2037  FAD linked oxidase domain protein  26.35 
 
 
503 aa  92.4  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.159157  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1462  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.89 
 
 
457 aa  92  2e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0953  FAD linked oxidase-like protein  32.43 
 
 
474 aa  91.3  4e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5704  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.39 
 
 
458 aa  90.5  5e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.715855  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1013  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  24.89 
 
 
466 aa  90.9  5e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2926  FAD linked oxidase-like protein  33.51 
 
 
500 aa  89.4  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1998  oxidoreductase, FAD-binding  32.8 
 
 
460 aa  88.6  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0173  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.94 
 
 
485 aa  89  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.155859  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02320  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  26.79 
 
 
485 aa  89  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.26997  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3304  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.55 
 
 
490 aa  87  6e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.563604  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1313  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  31.64 
 
 
469 aa  87  6e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.130987  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2496  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  28.98 
 
 
499 aa  86.7  8e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5491  glycolate oxidase subunit GlcD  34.74 
 
 
499 aa  86.7  9e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.187915  hitchhiker  0.000688169 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2902  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.51 
 
 
497 aa  86.3  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.495619  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2889  FAD linked oxidase domain protein  26.91 
 
 
1000 aa  85.9  0.000000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1234  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.8 
 
 
459 aa  86.3  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2159  glycolate oxidase subunit GlcD  33.51 
 
 
499 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.251033 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4938  glycolate oxidase subunit GlcD  34.74 
 
 
499 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.408162  normal  0.0595953 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3555  glycolate oxidase, subunit GlcD  32.98 
 
 
499 aa  85.9  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3331  glycolate oxidase subunit GlcD  32.46 
 
 
499 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000167182 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2306  glycolate oxidase subunit GlcD  34.04 
 
 
499 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.354077  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2494  FAD linked oxidase domain protein  25.41 
 
 
472 aa  85.1  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0997  FAD linked oxidase domain protein  31.82 
 
 
498 aa  84.7  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2219  glycolate oxidase subunit GlcD  29.91 
 
 
499 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.165204  hitchhiker  0.00964982 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3978  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.02 
 
 
497 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0945147 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2483  FAD linked oxidase domain protein  27.94 
 
 
459 aa  84.7  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.203046  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1893  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  31.17 
 
 
481 aa  85.1  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0132  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.14 
 
 
472 aa  84.3  0.000000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2581  FAD linked oxidase  25.11 
 
 
497 aa  84.3  0.000000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.209325 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2514  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.02 
 
 
501 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1142  FAD linked oxidase-like protein  23.58 
 
 
1015 aa  84.3  0.000000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00601773  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0720  FAD linked oxidase domain protein  33.02 
 
 
497 aa  84  0.000000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.732845 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2540  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.3 
 
 
464 aa  84  0.000000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00114883  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0369  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.47 
 
 
468 aa  84  0.000000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.388764  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2018  glycolate oxidase subunit GlcD  33.71 
 
 
499 aa  84  0.000000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.252442  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2664  putative D-lactate dehydrogenase (cytochrome) oxidoreductase protein  29.02 
 
 
472 aa  83.6  0.000000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.829393  normal  0.501651 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2666  glycolate oxidase FAD-linked subunit oxidoreductase  32.46 
 
 
497 aa  83.6  0.000000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.530486  normal  0.344368 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0033  glycolate oxidase subunit GlcD  34.04 
 
 
499 aa  83.2  0.000000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2652  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.11 
 
 
497 aa  83.6  0.000000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0510945 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2924  FAD linked oxidase-like protein  32.8 
 
 
495 aa  83.2  0.000000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.469068  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0495  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  31.78 
 
 
496 aa  82.4  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2120  putative D-lactate dehydrogenase (cytochrome), FAD/FMN-containing oxidoreductase  26.34 
 
 
457 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.312623  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3745  glycolate oxidase subunit GlcD  33.71 
 
 
499 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.337857  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1501  glycolate oxidase, GlcD subunit  30.98 
 
 
484 aa  82.4  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0901528  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1781  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.28 
 
 
501 aa  81.6  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6392  glycolate oxidase subunit GlcD  32.63 
 
 
499 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3536  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  30.69 
 
 
463 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2202  glycolate oxidase subunit GlcD  32.8 
 
 
499 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1773  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.57 
 
 
457 aa  82.4  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3315  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  33.7 
 
 
496 aa  81.6  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.422643  hitchhiker  0.00320306 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3820  FAD linked oxidase-like  31.58 
 
 
497 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0635309  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0650  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.11 
 
 
497 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3204  FAD linked oxidase-like  32.54 
 
 
497 aa  81.6  0.00000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2410  FAD linked oxidase-like  26.55 
 
 
474 aa  81.6  0.00000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0409  FAD linked oxidase domain protein  31.02 
 
 
472 aa  81.3  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0624  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.11 
 
 
497 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.864789  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2900  FAD linked oxidase domain protein  29.55 
 
 
472 aa  81.6  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>