More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2342 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007908  Rfer_2342  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 
508 aa  1011    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.10605  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2065  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.02 
 
 
554 aa  506  9.999999999999999e-143  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.460232  normal  0.464376 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1888  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  58.7 
 
 
487 aa  498  1e-140  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2486  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.92 
 
 
504 aa  497  1e-139  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.961139  normal  0.110025 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3618  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.78 
 
 
512 aa  442  1e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0151839  normal  0.0370629 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2350  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.62 
 
 
515 aa  336  5e-91  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3286  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.03 
 
 
499 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.729026  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0990  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.42 
 
 
542 aa  250  5e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0925  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.47 
 
 
552 aa  249  1e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0364  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.79 
 
 
580 aa  247  3e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0354  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.77 
 
 
578 aa  246  4.9999999999999997e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.496762  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3609  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.48 
 
 
596 aa  246  9e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1960  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.64 
 
 
642 aa  242  1e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.741418  normal  0.0148687 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3087  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.03 
 
 
527 aa  241  2e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.823637 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2225  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.89 
 
 
583 aa  241  2e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.220406  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2507  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.77 
 
 
589 aa  241  2e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.197123  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1846  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.32 
 
 
755 aa  241  2e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.422723  normal  0.381468 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6127  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.49 
 
 
519 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0128017 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3896  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.19 
 
 
706 aa  239  1e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.337027  normal  0.882129 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3485  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.4 
 
 
573 aa  239  1e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000328178 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00054  methyl-accepting chemotaxis protein  43.49 
 
 
797 aa  238  2e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.276697  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5887  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.62 
 
 
519 aa  238  2e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.330697  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0750  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.39 
 
 
592 aa  237  4e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.318431  normal  0.0335504 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0400  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.83 
 
 
602 aa  236  8e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0817302 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4443  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.72 
 
 
630 aa  236  8e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3412  putative methyl-accepting chemotaxis I (serine chemoreceptor) transmembrane protein  47.26 
 
 
515 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.934147 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2354  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.73 
 
 
554 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.547249  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0931  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.49 
 
 
591 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.269909  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1956  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.75 
 
 
598 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0136938 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1017  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.49 
 
 
591 aa  234  3e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.696887  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4161  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.05 
 
 
628 aa  234  3e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3443  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.99 
 
 
511 aa  234  3e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.330959  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3937  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.75 
 
 
589 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3880  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.59 
 
 
557 aa  233  5e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1480  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.06 
 
 
537 aa  233  6e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.201713  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2241  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.84 
 
 
536 aa  233  6e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  unclonable  0.000000611014  hitchhiker  0.00000521325 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4062  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.24 
 
 
653 aa  232  1e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1851  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.38 
 
 
745 aa  232  1e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.195185 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0740  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.42 
 
 
565 aa  232  1e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00039  chemotaxis protein  43.52 
 
 
775 aa  232  1e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.371493  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1169  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.69 
 
 
740 aa  232  1e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3407  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.24 
 
 
653 aa  231  2e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2296  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.51 
 
 
584 aa  231  2e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.604223  normal  0.776041 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5591  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.14 
 
 
519 aa  231  2e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0660  chemotaxis sensory transducer  45.95 
 
 
586 aa  231  2e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.756829  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1600  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.91 
 
 
594 aa  231  2e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00034667 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1847  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.92 
 
 
793 aa  231  2e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.143361  normal  0.380239 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0831  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.65 
 
 
561 aa  231  2e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.236088  normal  0.180731 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0940  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.13 
 
 
546 aa  231  2e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  unclonable  0.000000958657  normal  0.647876 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5306  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.34 
 
 
565 aa  231  3e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00488588  normal  0.0415564 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1542  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.09 
 
 
566 aa  230  4e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.350049  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1600  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.82 
 
 
535 aa  230  4e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1816  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.77 
 
 
651 aa  230  5e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.700193  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0055  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.33 
 
 
628 aa  230  5e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.608397  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1453  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.35 
 
 
532 aa  230  5e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2167  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.63 
 
 
585 aa  229  6e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.38945  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4084  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.46 
 
 
511 aa  230  6e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.51282  normal  0.262349 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00043  chemotaxis protein  43.03 
 
 
705 aa  229  6e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.51691  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5410  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.08 
 
 
635 aa  230  6e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00046  chemotaxis protein  52.7 
 
 
753 aa  229  7e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0421  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.6 
 
 
618 aa  229  7e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.627209  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00047  chemotaxis protein  49.8 
 
 
733 aa  229  8e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00045  chemotaxis protein  50 
 
 
691 aa  229  9e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.505093  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2019  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.69 
 
 
567 aa  229  1e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2496  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.15 
 
 
537 aa  229  1e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000862286  decreased coverage  0.00394801 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2969  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.43 
 
 
550 aa  228  2e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0335  methyl-accepting chemotaxis protein I  43.52 
 
 
394 aa  228  2e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.809135  normal  0.684623 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3659  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.67 
 
 
550 aa  228  2e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2620  methyl-accepting chemotaxis protein  42.77 
 
 
562 aa  228  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2663  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.58 
 
 
520 aa  228  2e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0198398  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0428  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.95 
 
 
597 aa  228  2e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0769  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.3 
 
 
505 aa  227  3e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0409416  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3537  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.6 
 
 
843 aa  228  3e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1620  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.63 
 
 
559 aa  228  3e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.439493  normal  0.532508 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1029  methyl-accepting chemotaxis protein  46.64 
 
 
562 aa  227  3e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.815966  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6699  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.66 
 
 
575 aa  228  3e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.198234  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4878  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.05 
 
 
589 aa  227  3e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.506831  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1344  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.26 
 
 
536 aa  227  3e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.129873  normal  0.199885 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00041  chemotaxis protein  43.49 
 
 
752 aa  226  5.0000000000000005e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.292066  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0395  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.71 
 
 
556 aa  227  5.0000000000000005e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2457  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.56 
 
 
555 aa  226  5.0000000000000005e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.890786  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0152  methyl-accepting chemotaxis protein  46.29 
 
 
565 aa  226  6e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2152  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.06 
 
 
589 aa  226  6e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0117525 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0176  methyl-accepting chemotaxis protein  46.29 
 
 
565 aa  226  6e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1321  methyl-accepting chemotaxis protein  46.29 
 
 
565 aa  226  6e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3571  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.83 
 
 
528 aa  226  7e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.595797  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2764  methyl-accepting chemotaxis protein  46.29 
 
 
562 aa  226  7e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.627836  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0345  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.38 
 
 
547 aa  226  8e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2682  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.95 
 
 
580 aa  226  8e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3464  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.38 
 
 
551 aa  226  8e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3266  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.09 
 
 
650 aa  226  9e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.50478  hitchhiker  0.0000385615 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3618  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.37 
 
 
551 aa  226  9e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.453306  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1600  methyl-accepting chemotaxis protein III  41.12 
 
 
546 aa  226  9e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01378  methyl-accepting chemotaxis protein III, ribose and galactose sensor receptor  41.12 
 
 
546 aa  226  1e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0586  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.17 
 
 
584 aa  226  1e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2225  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.12 
 
 
546 aa  226  1e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.213228  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01390  hypothetical protein  41.12 
 
 
546 aa  226  1e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3772  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.07 
 
 
586 aa  225  1e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.167359  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3786  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  44.17 
 
 
610 aa  226  1e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0254049  normal  0.3858 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5852  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.6 
 
 
618 aa  224  2e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.217953  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>