110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1713 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_1713  hypothetical protein  100 
 
 		 945 aa  1920    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.436521  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4079  hypothetical protein  43.28 
 
 		 885 aa  672    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.299167  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0875  hypothetical protein  33.23 
 
 		 893 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0421546 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4080  hypothetical protein  34.19 
 
 		 936 aa  419  9.999999999999999e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000183317  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3371  hypothetical protein  33.56 
 
 		 895 aa  412  1e-113  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.94917  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2292  hypothetical protein  32.2 
 
 		 782 aa  380  1e-104  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2299  hypothetical protein  47.47 
 
 		 809 aa  362  2e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4083  hypothetical protein  30.68 
 
 		 826 aa  143  1.9999999999999998e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0344261  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1580  decaheme cytochrome c MtrF  22.88 
 
 		 639 aa  131  7.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0766819  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2216  hypothetical protein  29.86 
 
 		 898 aa  125  5e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.352223  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1187  hypothetical protein  23.67 
 
 		 778 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1731  multiheme cytochrome  28.83 
 
 		 898 aa  120  7.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1658  hypothetical protein  28.83 
 
 		 898 aa  121  7.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.131846  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3200  hypothetical protein  28.08 
 
 		 820 aa  119  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2603  hypothetical protein  23.63 
 
 		 742 aa  106  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.430741  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0910  hypothetical protein  22.28 
 
 		 731 aa  105  5e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.688824 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3251  hypothetical protein  23.22 
 
 		 788 aa  103  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1578  decaheme cytochrome c  27.11 
 
 		 650 aa  98.6  5e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000205402  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1612  decaheme cytochrome c  27.33 
 
 		 650 aa  98.6  5e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0130523  normal  0.2896 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2676  decaheme cytochrome c  26.64 
 
 		 650 aa  97.1  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000503474  normal  0.0214929 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2765  decaheme cytochrome c  26.88 
 
 		 650 aa  97.1  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00105295  hitchhiker  0.000000731399 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2636  decaheme cytochrome c  27.12 
 
 		 724 aa  95.9  3e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1244  hypothetical protein  24.9 
 
 		 742 aa  96.3  3e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0505071  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3098  hypothetical protein  26.05 
 
 		 789 aa  95.5  5e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1780  decaheme cytochrome c MtrF  26.64 
 
 		 639 aa  93.6  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1589  decaheme cytochrome c  26.65 
 
 		 650 aa  94  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000235795  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6275  decaheme c-type cytochrome, OmcA/MtrC family  28.18 
 
 		 741 aa  93.2  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.772817 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1345  multiheme cytochrome  24.85 
 
 		 742 aa  93.2  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1268  hypothetical protein  24.89 
 
 		 789 aa  92.8  3e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.487663  hitchhiker  0.00130496 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2576  decaheme cytochrome c MtrF  26.59 
 
 		 639 aa  90.9  9e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.134423  decreased coverage  0.00876105 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2578  decaheme cytochrome c  26.14 
 
 		 650 aa  90.9  1e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00427395  decreased coverage  0.00803379 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3108  hypothetical protein  25.87 
 
 		 788 aa  89.7  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2674  decaheme cytochrome c MtrF  25.88 
 
 		 639 aa  89  4e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0899912  normal  0.105553 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2508  decaheme cytochrome c MtrF  25.66 
 
 		 639 aa  87  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00292179  decreased coverage  0.000509076 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2524  decaheme cytochrome c  25.98 
 
 		 725 aa  84  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000418395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1208  decaheme cytochrome c  26.5 
 
 		 656 aa  83.2  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.474569  normal  0.550051 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2694  decaheme cytochrome c MtrF  28.98 
 
 		 640 aa  83.2  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1591  decaheme cytochrome c MtrF  23.76 
 
 		 639 aa  80.5  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000158979  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1478  decaheme cytochrome c  25.4 
 
 		 663 aa  80.5  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000254716  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2680  decaheme cytochrome c  29.63 
 
 		 762 aa  80.1  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.463028  unclonable  0.0000643351 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1614  decaheme cytochrome c MtrF  23.54 
 
 		 639 aa  80.1  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0474266  normal  0.168927 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2228  decaheme cytochrome c  25.15 
 
 		 755 aa  79.3  0.0000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.236086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2763  decaheme cytochrome c MtrF  23.9 
 
 		 639 aa  79.3  0.0000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0120659  hitchhiker  0.0000444921 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1659  decaheme cytochrome c  29.26 
 
 		 758 aa  78.6  0.0000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3466  hypothetical protein  21.63 
 
 		 785 aa  79  0.0000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.724503 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1528  decaheme cytochrome c MtrF  28.45 
 
 		 646 aa  78.2  0.0000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2696  hypothetical protein  24.27 
 
 		 822 aa  77.4  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1211  decaheme cytochrome c MtrF  27.98 
 
 		 639 aa  74.7  0.000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2522  decaheme cytochrome c  25.96 
 
 		 720 aa  74.7  0.000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1209  decaheme cytochrome c  25.77 
 
 		 729 aa  73.9  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00658895  normal  0.327868 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3124  decaheme cytochrome c  24.89 
 
 		 741 aa  73.6  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00184772  hitchhiker  0.000042193 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1779  decaheme cytochrome c  24.71 
 
 		 735 aa  72.8  0.00000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1526  decaheme cytochrome c  24.84 
 
 		 738 aa  72.8  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.324001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3588  decaheme cytochrome c  25.41 
 
 		 745 aa  72.8  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2695  decaheme cytochrome c  24.84 
 
 		 719 aa  72.8  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.734788  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0918  decaheme cytochrome c  23.55 
 
 		 764 aa  72  0.00000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.613412  normal  0.552776 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2613  decaheme cytochrome c  26.88 
 
 		 762 aa  70.9  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000355284  hitchhiker  0.00000740819 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0963  hypothetical protein  22.49 
 
 		 816 aa  70.5  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.830117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1210  decaheme cytochrome c  25.39 
 
 		 727 aa  70.5  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.260087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2697  decaheme cytochrome c  25 
 
 		 745 aa  70.1  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0633196  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2764  hypothetical protein  25.11 
 
 		 843 aa  69.7  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.185672  hitchhiker  0.000000808171 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2787  decaheme cytochrome c  25.75 
 
 		 762 aa  69.7  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0256712 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1478  decaheme cytochrome c  26.22 
 
 		 761 aa  69.3  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.174618  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1473  decaheme cytochrome c  26.22 
 
 		 761 aa  69.3  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000262006  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2874  decaheme cytochrome c  26.22 
 
 		 764 aa  69.3  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0594793  hitchhiker  0.00000891097 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1509  decaheme cytochrome c  26.22 
 
 		 764 aa  68.9  0.0000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.130709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2577  decaheme cytochrome c  25 
 
 		 731 aa  67  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00883016  decreased coverage  0.00925289 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1479  hypothetical protein  24.4 
 
 		 833 aa  67  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0424195  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2675  decaheme cytochrome c  25 
 
 		 724 aa  65.1  0.000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000733685  normal  0.0455406 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3125  decaheme cytochrome c  22.81 
 
 		 667 aa  65.1  0.000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00001045  hitchhiker  0.00000606277 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2521  decaheme cytochrome c MtrF  24.65 
 
 		 639 aa  63.9  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2637  decaheme cytochrome c  21.63 
 
 		 653 aa  63.9  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4048  hypothetical protein  22.54 
 
 		 764 aa  63.5  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4254  decaheme cytochrome c  24.76 
 
 		 729 aa  62.4  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.353597  unclonable  0.0000000280036 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2509  decaheme cytochrome c  24.43 
 
 		 731 aa  62  0.00000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000184393  hitchhiker  0.000632353 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1590  decaheme cytochrome c  24.71 
 
 		 730 aa  60.8  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000452412  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1579  decaheme cytochrome c  24.71 
 
 		 730 aa  60.1  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00874065  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1527  decaheme cytochrome c  23.04 
 
 		 722 aa  59.7  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003776  decaheme cytochrome c MtrF  23.06 
 
 		 754 aa  59.7  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1380  decaheme cytochrome c  26.27 
 
 		 765 aa  59.3  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1613  decaheme cytochrome c  24.48 
 
 		 730 aa  58.2  0.0000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000196014  normal  0.166254 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3573  decaheme cytochrome c  24.9 
 
 		 716 aa  57.8  0.0000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1257  hypothetical protein  25.57 
 
 		 762 aa  57.8  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2510  decaheme cytochrome c  23.92 
 
 		 655 aa  56.6  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0178218  hitchhiker  0.000666167 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0998  decaheme cytochrome c  23.42 
 
 		 766 aa  57  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3263  hypothetical protein  40.28 
 
 		 655 aa  56.2  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1778  decaheme cytochrome c  23.74 
 
 		 671 aa  52.4  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1421  hypothetical protein  24.27 
 
 		 657 aa  52  0.00006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.515821 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2990  hypothetical protein  42.62 
 
 		 680 aa  51.6  0.00008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2843  hypothetical protein  31.13 
 
 		 701 aa  51.2  0.00009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2991  hypothetical protein  31.13 
 
 		 701 aa  51.2  0.00009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4517  hypothetical protein  42.42 
 
 		 642 aa  51.2  0.00009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.247929 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2507  hypothetical protein  43.55 
 
 		 700 aa  50.8  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.116766  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1515  hypothetical protein  31.13 
 
 		 701 aa  50.8  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2580  hypothetical protein  40.98 
 
 		 677 aa  49.7  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2862  hypothetical protein  31.13 
 
 		 698 aa  50.1  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4161  hypothetical protein  32.79 
 
 		 785 aa  50.1  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0782432 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0447  hypothetical protein  37.88 
 
 		 612 aa  49.7  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.476837 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0450  hypothetical protein  35.71 
 
 		 687 aa  49.7  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2907  hypothetical protein  34.78 
 
 		 793 aa  48.9  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>