124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1114 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_1114  tryptophan halogenase  100 
 
 		 502 aa  1049    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.650107  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2064  tryptophan halogenase  60.97 
 
 		 500 aa  663    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0180513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1839  tryptophan halogenase  55.49 
 
 		 501 aa  589  1e-167  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.703806  hitchhiker  0.00201458 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03613  tryptophan halogenase  56.11 
 
 		 509 aa  587  1e-166  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1096  tryptophan halogenase, putative  55.82 
 
 		 498 aa  570  1e-161  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000328239  normal  0.607723 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2724  tryptophan halogenase  54.49 
 
 		 510 aa  569  1e-161  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.262395  normal  0.0424923 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2734  tryptophan halogenase  51.89 
 
 		 504 aa  553  1e-156  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.816599 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1786  tryptophan halogenase  53.54 
 
 		 507 aa  545  1e-154  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1121  tryptophan halogenase  51.52 
 
 		 503 aa  546  1e-154  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3181  tryptophan halogenase  51.31 
 
 		 503 aa  545  1e-154  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.025127 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1209  tryptophan halogenase  51.31 
 
 		 503 aa  545  1e-154  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.312484  normal  0.925152 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1889  tryptophan halogenase  53.91 
 
 		 504 aa  543  1e-153  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.140819  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1176  tryptophan halogenase  51.31 
 
 		 503 aa  544  1e-153  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1290  tryptophan halogenase  52.93 
 
 		 503 aa  544  1e-153  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0275906 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1309  tryptophan halogenase  50 
 
 		 495 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1882  tryptophan halogenase  52.2 
 
 		 501 aa  537  1e-151  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0761286  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2828  tryptophan halogenase  50.6 
 
 		 498 aa  535  1e-151  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000300055  hitchhiker  0.0040734 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2037  tryptophan halogenase  51.11 
 
 		 499 aa  535  1e-151  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.112783  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1840  tryptophan halogenase  50.2 
 
 		 506 aa  536  1e-151  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.105646  hitchhiker  0.00205784 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4092  tryptophan halogenase  52.3 
 
 		 497 aa  536  1e-151  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.683477 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1140  tryptophan halogenase  49.5 
 
 		 500 aa  535  1e-151  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2030  tryptophan halogenase  51.93 
 
 		 497 aa  533  1e-150  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2301  tryptophan halogenase  50.71 
 
 		 499 aa  533  1e-150  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.315145  normal  0.236324 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2084  tryptophan halogenase  50.91 
 
 		 499 aa  531  1e-150  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1104  hypothetical protein  50.71 
 
 		 740 aa  528  1e-149  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.181023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0740  tryptophan halogenase  51.2 
 
 		 505 aa  528  1e-148  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.726405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3277  tryptophan halogenase  50.2 
 
 		 510 aa  519  1e-146  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2723  tryptophan halogenase  48.98 
 
 		 509 aa  512  1e-144  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.189353  normal  0.019057 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2208  tryptophan halogenase  48.79 
 
 		 502 aa  513  1e-144  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0422503  hitchhiker  0.00145511 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3700  putative tryptophan halogenase  49.7 
 
 		 494 aa  509  1e-143  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1842  tryptophan halogenase  51.7 
 
 		 505 aa  511  1e-143  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00202997  hitchhiker  0.000756616 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0992  putative tryptophan halogenase  47.46 
 
 		 496 aa  503  1e-141  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.259329  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2733  tryptophan halogenase  49.6 
 
 		 505 aa  504  1e-141  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3228  tryptophan halogenase  52.39 
 
 		 511 aa  501  1e-140  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1401  IspG protein  48.69 
 
 		 496 aa  499  1e-140  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041365 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3734  putative tryptophan halogenase  46.48 
 
 		 496 aa  496  1e-139  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1607  tryptophan halogenase  48.58 
 
 		 505 aa  495  1e-139  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01880  putative tryptophan halogenase  48.26 
 
 		 506 aa  496  1e-139  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.198232  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1853  tryptophan halogenase  47.61 
 
 		 497 aa  496  1e-139  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.930503 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02802  tryptophan halogenase  48.88 
 
 		 523 aa  493  9.999999999999999e-139  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0918  tryptophan halogenase  49.7 
 
 		 503 aa  491  1e-137  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4289  tryptophan halogenase  47.39 
 
 		 492 aa  486  1e-136  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.737452  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0182  tryptophan halogenase  48.67 
 
 		 502 aa  474  1e-132  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.736989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3817  tryptophan halogenase  47.57 
 
 		 497 aa  474  1e-132  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.270075  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2721  tryptophan halogenase  47.49 
 
 		 507 aa  473  1e-132  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0000284489  normal  0.0465531 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3278  tryptophan halogenase  45.71 
 
 		 518 aa  471  1.0000000000000001e-131  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.943732 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2807  tryptophan halogenase, putative  45.71 
 
 		 503 aa  465  9.999999999999999e-131  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000313891 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1866  tryptophan halogenase  46.76 
 
 		 501 aa  464  1e-129  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2138  tryptophan halogenase  46.56 
 
 		 501 aa  464  1e-129  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.903949  normal  0.0562186 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2498  tryptophan halogenase, putative  46.57 
 
 		 501 aa  461  9.999999999999999e-129  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02202  tryptophan halogenase  45.64 
 
 		 497 aa  452  1.0000000000000001e-126  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2143  tryptophan halogenase  46.81 
 
 		 512 aa  452  1.0000000000000001e-126  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0261967  normal  0.0242357 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3937  tryptophan halogenase  43.31 
 
 		 502 aa  449  1e-125  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.792717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3936  tryptophan halogenase  43.31 
 
 		 511 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1094  allophanate hydrolase subunit 2  43.82 
 
 		 515 aa  436  1e-121  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.631655  normal  0.20774 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3938  tryptophan halogenase  43.6 
 
 		 505 aa  436  1e-121  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2144  tryptophan halogenase  44.47 
 
 		 504 aa  423  1e-117  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0060883  normal  0.0489946 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0807  tryptophan halogenase  37.68 
 
 		 499 aa  337  3.9999999999999995e-91  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.466418  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5264  tryptophan halogenase  36.03 
 
 		 538 aa  289  9e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4726  tryptophan halogenase  36.03 
 
 		 538 aa  288  2e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2733  tryptophan halogenase PrnA  35.84 
 
 		 538 aa  288  2e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1115  tryptophan halogenase  35.84 
 
 		 538 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2885  tryptophan halogenase PrnA  35.84 
 
 		 538 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6983  tryptophan halogenase  35.06 
 
 		 538 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.448897  normal  0.89609 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6706  tryptophan halogenase  34.98 
 
 		 537 aa  281  1e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.810576 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1841  tryptophan halogenase  34.55 
 
 		 481 aa  275  1.0000000000000001e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.132292  hitchhiker  0.00068545 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1395  tryptophan halogenase  34.22 
 
 		 529 aa  266  5e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1365  tryptophan halogenase  34.01 
 
 		 529 aa  265  1e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0297  tryptophan halogenase  36.26 
 
 		 532 aa  264  2e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.427874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0296  tryptophan halogenase  38.83 
 
 		 524 aa  252  1e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.628963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3216  tryptophan halogenase  33.4 
 
 		 505 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.64533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1939  tryptophan halogenase  32.6 
 
 		 517 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3561  tryptophan halogenase  34.17 
 
 		 522 aa  244  1.9999999999999999e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1079  tryptophan halogenase  33.4 
 
 		 508 aa  244  3e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.488063  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1098  tryptophan halogenase  34.9 
 
 		 508 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0588  response regulator receiver domain-containing protein  31.3 
 
 		 502 aa  243  6e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.917971  decreased coverage  0.00918466 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3023  tryptophan halogenase  33.78 
 
 		 507 aa  243  7.999999999999999e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.172651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3685  tryptophan halogenase  34.16 
 
 		 527 aa  242  1e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3513  tryptophan halogenase, putative  33.98 
 
 		 507 aa  241  2e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2391  tryptophan halogenase, putative  34.1 
 
 		 526 aa  241  2.9999999999999997e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000100477 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0803  tryptophan halogenase  32.45 
 
 		 506 aa  240  4e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1209  tryptophan halogenase  34.24 
 
 		 508 aa  239  6.999999999999999e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.311625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1139  tryptophan halogenase  32.82 
 
 		 508 aa  239  8e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.340428  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2945  tryptophan halogenase  33.69 
 
 		 501 aa  239  1e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1436  tryptophan halogenase  33.83 
 
 		 499 aa  239  1e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.333804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0915  tryptophan halogenase  33.6 
 
 		 505 aa  237  3e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2546  tryptophan halogenase  34.03 
 
 		 517 aa  237  4e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0939  tryptophan halogenase  33.01 
 
 		 507 aa  236  9e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.220698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4005  formylmethionine deformylase  33.83 
 
 		 498 aa  234  3e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.182317 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1400  tryptophan halogenase  33.12 
 
 		 503 aa  234  3e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.879236  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1113  tryptophan halogenase  34.3 
 
 		 508 aa  234  4.0000000000000004e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1172  tryptophan halogenase  33.59 
 
 		 507 aa  233  5e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.146451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1409  tryptophan halogenase  33.26 
 
 		 501 aa  233  6e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3053  tryptophan halogenase, putative  32.19 
 
 		 508 aa  232  1e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1306  tryptophan halogenase  32.02 
 
 		 507 aa  232  1e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.85539 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3837  tryptophan halogenase  33.47 
 
 		 524 aa  232  1e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1604  tryptophan halogenase  33.02 
 
 		 513 aa  229  9e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2406  tryptophan halogenase  33.85 
 
 		 514 aa  226  6e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.699378  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1262  tryptophan halogenase, putative  32.3 
 
 		 524 aa  224  2e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.69859  hitchhiker  0.00000259242 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2707  tryptophan halogenase  31.84 
 
 		 515 aa  224  3e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>