More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_C6215 on replicon NC_007336
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007336  Reut_C6215  ABC transporter related  100 
 
 		 250 aa  493  9.999999999999999e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0197  ABC transporter related  49.36 
 
 		 234 aa  214  8e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1048  ABC transporter related  46.78 
 
 		 236 aa  212  4.9999999999999996e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3456  ABC transporter related  45.92 
 
 		 236 aa  210  1e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2306  ABC transporter related protein  46.35 
 
 		 236 aa  208  8e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0641  ABC transporter related  47.41 
 
 		 234 aa  202  3e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2891  ABC transporter related protein  42.98 
 
 		 240 aa  202  3e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3208  ABC transporter related  41.95 
 
 		 231 aa  202  6e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.365386  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3391  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.83 
 
 		 234 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2496  ABC transporter related protein  46.55 
 
 		 235 aa  200  1.9999999999999998e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.558412  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3532  ABC transporter related  44.39 
 
 		 236 aa  200  1.9999999999999998e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.10442  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0615  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  45.49 
 
 		 231 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2979  ABC transporter related  44.49 
 
 		 237 aa  198  5e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2028  ABC transporter related  45.69 
 
 		 235 aa  199  5e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2269  ABC transporter related  43.97 
 
 		 233 aa  198  7e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0655  ABC transporter related  45.73 
 
 		 231 aa  198  9e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.139364 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0661  ABC transporter related  45.73 
 
 		 231 aa  198  9e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.579097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0790  ABC transporter-related protein  43.64 
 
 		 239 aa  197  1.0000000000000001e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.166269 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4658  ABC transporter related  47.77 
 
 		 236 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.387595  normal  0.829022 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1946  ABC transporter related protein  43.53 
 
 		 233 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.987949  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4218  ABC transporter related  42.49 
 
 		 234 aa  196  2.0000000000000003e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.110724 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1895  branched-chain amino acid ABC transporter ATPase  42.67 
 
 		 234 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.250393  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1896  ABC transporter related  44.49 
 
 		 237 aa  196  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.02479 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4307  branched-chain amino acid transport protein BraG  45.26 
 
 		 233 aa  196  3e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1988  ABC transporter related  41.63 
 
 		 236 aa  195  5.000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.69422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50560  branched-chain amino acid transport protein BraG  44.83 
 
 		 233 aa  195  6e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0125838 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1819  ABC transporter related  43.83 
 
 		 253 aa  194  8.000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0395  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.49 
 
 		 234 aa  194  1e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4112  high-affinity amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.97 
 
 		 233 aa  194  1e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0754039  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3029  ABC transporter related  44.55 
 
 		 232 aa  193  2e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.157633  normal  0.844581 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  44.4 
 
 		 235 aa  193  2e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4335  ABC transporter related  44.63 
 
 		 236 aa  192  3e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.150909  normal  0.128098 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4185  ABC transporter related protein  45.3 
 
 		 238 aa  192  3e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0263202  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4268  ABC transporter related  42.98 
 
 		 234 aa  193  3e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3849  ABC transporter  43.22 
 
 		 233 aa  192  4e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2654  ABC transporter-like protein  43.83 
 
 		 237 aa  192  4e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00480746  hitchhiker  0.00390953 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1660  ABC transporter related  42.06 
 
 		 234 aa  192  5e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19610  high affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP binding component  44.83 
 
 		 233 aa  192  5e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0847602  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4207  ABC transporter related  43.35 
 
 		 232 aa  192  6e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.391697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3639  ABC transporter related  44.21 
 
 		 233 aa  191  6e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.400597  normal  0.0302985 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0803  ABC transporter related  44.49 
 
 		 252 aa  192  6e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2298  ABC transporter related  44.21 
 
 		 234 aa  191  7e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.644067  normal  0.429574 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3751  ABC transporter related  43.78 
 
 		 234 aa  191  7e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0490  ABC transporter related  46.64 
 
 		 244 aa  191  7e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0438645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3146  ABC transporter related  45.49 
 
 		 236 aa  191  8e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.823087 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1127  ABC transporter related  46.12 
 
 		 235 aa  191  8e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0844  ABC transporter related  46.15 
 
 		 234 aa  191  9e-48  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3373  ABC transporter related  45.06 
 
 		 236 aa  191  9e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.710585  normal  0.0235657 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0419  ABC transporter-like protein  46.78 
 
 		 240 aa  191  1e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3684  ABC transporter related  45.19 
 
 		 246 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.218691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0429  ABC transporter related protein  47.21 
 
 		 236 aa  191  1e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0665376  normal  0.0374167 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0683  ABC transporter related protein  44.86 
 
 		 244 aa  191  1e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000101053  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0335  ABC transporter related  43.5 
 
 		 249 aa  191  1e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3737  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.64 
 
 		 234 aa  190  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.548098  normal  0.605749 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0338  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.31 
 
 		 235 aa  190  2e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0565  ABC transporter related  47.84 
 
 		 238 aa  190  2e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4397  ABC transporter related  41.63 
 
 		 233 aa  190  2e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4367  ABC transporter related  46.43 
 
 		 236 aa  190  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.583666  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2686  ABC transporter-like protein  45.19 
 
 		 484 aa  190  2e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.473658  normal  0.293946 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2236  ABC transporter related  42.24 
 
 		 234 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0732075  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1776  ABC transporter related  45.11 
 
 		 244 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.372719 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1473  ABC transporter related  41.95 
 
 		 236 aa  189  2.9999999999999997e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0475  ABC transporter related  43.72 
 
 		 233 aa  189  2.9999999999999997e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3339  ABC transporter related  45.26 
 
 		 233 aa  189  2.9999999999999997e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0450  ABC transporter related  43.59 
 
 		 234 aa  189  4e-47  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.68217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0477  ABC transporter related  41.77 
 
 		 238 aa  189  4e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1835  ABC transporter  46.55 
 
 		 233 aa  189  4e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.020378  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0761  ABC transporter related  44.02 
 
 		 237 aa  189  4e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1835  ABC transporter related  42.8 
 
 		 238 aa  189  4e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.276103  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4486  ABC transporter related  41.88 
 
 		 260 aa  189  4e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.064197  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1446  ABC transporter related  42.13 
 
 		 234 aa  189  4e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0771597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1284  ABC transporter related  42.13 
 
 		 234 aa  189  4e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.275207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3554  ABC transporter related  42.55 
 
 		 234 aa  189  4e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.256863  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  42.24 
 
 		 234 aa  189  4e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0589  ABC transporter related protein  42.24 
 
 		 259 aa  189  5e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0356  ABC transporter related  42.98 
 
 		 242 aa  189  5e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.435146 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0776  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.96 
 
 		 233 aa  188  5e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.704387  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1617  ABC transporter related  42.06 
 
 		 234 aa  189  5e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.10655  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2042  ABC transporter related  42.8 
 
 		 247 aa  188  5.999999999999999e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000858552 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0537  ABC transporter related  45.26 
 
 		 249 aa  188  5.999999999999999e-47  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.135709  unclonable  0.0000000163343 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0866  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.96 
 
 		 233 aa  188  7e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.173602  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2185  ABC transporter related protein  42.8 
 
 		 247 aa  188  7e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3906  ABC transporter related  41.25 
 
 		 250 aa  188  8e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4754  ABC transporter-related protein  41.63 
 
 		 234 aa  188  8e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1748  ABC transporter component  45.57 
 
 		 240 aa  188  9e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.644006  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0572  ABC transporter related  44.39 
 
 		 239 aa  188  9e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129058  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4943  ABC transporter related  44.49 
 
 		 233 aa  187  1e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4606  ABC transporter related  45.18 
 
 		 235 aa  187  1e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0356  ABC transporter related  46.78 
 
 		 240 aa  187  1e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3627  ABC transporter related  44.49 
 
 		 233 aa  187  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0266  ABC transporter related  42.37 
 
 		 249 aa  187  1e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.084852  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1890  ABC transporter related  42.13 
 
 		 239 aa  187  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.865524  normal  0.522252 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3131  ABC transporter related  42.41 
 
 		 237 aa  187  1e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2963  ABC transporter related  40.65 
 
 		 251 aa  187  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4428  ABC transporter related  44.49 
 
 		 233 aa  187  1e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000693118 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0092  ABC transporter related  40.65 
 
 		 251 aa  187  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2267  ABC transporter related  44.26 
 
 		 238 aa  186  2e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00164993 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0655  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  44.49 
 
 		 233 aa  187  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.279613 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0262  ATPase  42.6 
 
 		 238 aa  186  2e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0092  ABC transporter related  41.06 
 
 		 251 aa  186  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.65269  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>