More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_C5909 on replicon NC_007336
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007336  Reut_C5909  luciferase-like  100 
 
 
342 aa  697    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5641  luciferase family protein  74.92 
 
 
327 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.632716  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2485  hypothetical protein  75.7 
 
 
327 aa  508  1e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0221825  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1981  luciferase family protein  73.27 
 
 
327 aa  489  1e-137  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.960936  hitchhiker  0.00581741 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2367  luciferase family protein  66.98 
 
 
322 aa  456  1e-127  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.184521  hitchhiker  0.000901573 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2814  Luciferase-like monooxygenase  53.18 
 
 
314 aa  348  8e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0572  Luciferase-like monooxygenase  53.9 
 
 
316 aa  337  9.999999999999999e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01680  hypothetical protein  50.32 
 
 
319 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10203  hypothetical protein  45.66 
 
 
316 aa  286  2.9999999999999996e-76  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3417  luciferase family protein  43.31 
 
 
320 aa  278  8e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3086  luciferase family protein (alkanal monooxygenase, FMN-linked)  43.31 
 
 
317 aa  277  2e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3167  luciferase family protein (alkanal monooxygenase (FMN-linked))  43.31 
 
 
317 aa  276  3e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.282639  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3185  luciferase family protein  42.99 
 
 
317 aa  276  5e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3436  luciferase family protein  42.99 
 
 
317 aa  276  5e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3405  luciferase family protein  42.99 
 
 
317 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0001  Luciferase-like monooxygenase  46.67 
 
 
304 aa  274  1.0000000000000001e-72  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4193  hypothetical protein  42.24 
 
 
339 aa  257  2e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.598863  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49090  hypothetical protein  41.9 
 
 
339 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00002313 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1694  luciferase family protein  44.27 
 
 
334 aa  248  9e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1816  luciferase family protein  45.88 
 
 
313 aa  247  2e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00324647  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1334  luciferase-type oxidoreductase  44.37 
 
 
306 aa  245  8e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.450235  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0758  luciferase family protein  44.23 
 
 
319 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.556053  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3622  Luciferase-like monooxygenase  40.49 
 
 
342 aa  243  3.9999999999999997e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3318  luciferase family protein  42.19 
 
 
346 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3198  bacterial luciferase family protein  41.46 
 
 
328 aa  238  1e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.339171  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2282  Luciferase-like monooxygenase  45.95 
 
 
312 aa  237  2e-61  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0554594  normal  0.109814 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3382  luciferase-type oxidoreductase  43.15 
 
 
307 aa  236  4e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3064  luciferase  42.55 
 
 
325 aa  233  3e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.666797  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0230  luciferase family protein  43.59 
 
 
359 aa  229  7e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4731  Luciferase-like monooxygenase  38.75 
 
 
335 aa  227  2e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.329388  normal  0.73766 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7093  luciferase family protein  38.7 
 
 
340 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2279  Luciferase-like monooxygenase  40.79 
 
 
311 aa  212  9e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.463796  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1559  luciferase  37.74 
 
 
322 aa  211  2e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00179064 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0928  putative luciferase-like monooxygenase  39.22 
 
 
325 aa  208  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.187538  normal  0.76333 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4679  luciferase family protein  39.47 
 
 
319 aa  205  7e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4654  Luciferase-like monooxygenase  39.6 
 
 
326 aa  204  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.334317  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5288  luciferase family protein  36.94 
 
 
313 aa  203  4e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.537455  normal  0.0470255 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2188  flavin-dependent oxidoreductase  38.94 
 
 
319 aa  200  3e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.182489  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4462  luciferase-like  37.22 
 
 
319 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.119072  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3623  luciferase family protein  37.22 
 
 
319 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.378915 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3904  luciferase family protein  37.22 
 
 
319 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02793  monooxygenase  37.13 
 
 
302 aa  197  3e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5536  luciferase family protein  37.7 
 
 
313 aa  196  7e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0197176 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5297  luciferase-like monooxygenase  38.49 
 
 
316 aa  194  3e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.564159 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4752  luciferase family protein  38.24 
 
 
316 aa  191  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.110568  normal  0.446131 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3798  luciferase-like monooxygenase  37.21 
 
 
319 aa  189  4e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.628153  normal  0.318951 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3279  luciferase family protein  36.54 
 
 
321 aa  186  4e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5451  luciferase-like  36.91 
 
 
316 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5411  luciferase family protein  36.91 
 
 
316 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.841448  decreased coverage  0.00286902 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4859  luciferase family protein  36.91 
 
 
316 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18420  hypothetical protein  68.57 
 
 
106 aa  158  1e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4097  luciferase family protein  32.97 
 
 
306 aa  94  4e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.607989  normal  0.480627 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0457  luciferase-like  31.56 
 
 
333 aa  92  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.710485  normal  0.228876 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2560  luciferase family protein  33.8 
 
 
305 aa  92.4  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.0000351517  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4839  luciferase family protein  33.87 
 
 
272 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.343034  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0369  luciferase-like protein  29.53 
 
 
307 aa  90.5  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0907338  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6808  luciferase family protein  35.76 
 
 
324 aa  89  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2248  luciferase family protein  34.59 
 
 
306 aa  89  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1871  luciferase family protein  32.64 
 
 
301 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0338781 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4328  luciferase family protein  32.04 
 
 
299 aa  87.8  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.315112  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4419  Luciferase-like, subgroup  28.8 
 
 
311 aa  87.8  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4864  luciferase family protein  33.65 
 
 
282 aa  87  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0725656  normal  0.117116 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5819  luciferase family protein  32.41 
 
 
274 aa  87  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.762331  normal  0.818563 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4163  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  31.62 
 
 
285 aa  85.5  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.6036  normal  0.953662 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4411  luciferase-like  28.3 
 
 
335 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.356076  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3900  Luciferase-like, subgroup  30.1 
 
 
335 aa  85.1  0.000000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.310372  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2032  luciferase-like protein  33.33 
 
 
308 aa  84.3  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2078  luciferase family protein  33.33 
 
 
308 aa  84.3  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.62194 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4324  luciferase-like protein  32.52 
 
 
282 aa  83.2  0.000000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4410  luciferase family protein  32.52 
 
 
282 aa  83.2  0.000000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.287539  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4704  luciferase family protein  32.52 
 
 
282 aa  83.2  0.000000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.405552  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05590  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  41.96 
 
 
372 aa  83.2  0.000000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.404895  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1017  luciferase family protein  32.74 
 
 
276 aa  82.8  0.000000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2881  luciferase-like protein  28.16 
 
 
334 aa  82  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2017  luciferase family protein  32.95 
 
 
352 aa  82  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4460  luciferase-like protein  32.96 
 
 
344 aa  81.6  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2780  luciferase family protein  31.43 
 
 
298 aa  81.3  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.0000000437181  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5598  luciferase-like protein  29.33 
 
 
294 aa  80.9  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4178  Luciferase-like monooxygenase  33.33 
 
 
344 aa  80.9  0.00000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1987  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  31.73 
 
 
273 aa  81.3  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10971  oxidoreductase  31.73 
 
 
290 aa  80.5  0.00000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0930752  normal  0.92148 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5752  luciferase family protein  31.84 
 
 
288 aa  80.5  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0179397 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2098  luciferase family protein  26.91 
 
 
309 aa  79.7  0.00000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.463112 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3405  luciferase-like protein  29.03 
 
 
333 aa  79.3  0.00000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2015  luciferase family protein  33.77 
 
 
308 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.212649  normal  0.512168 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24560  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  32.03 
 
 
277 aa  79  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.759524 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3219  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  33.17 
 
 
299 aa  78.6  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.58554  normal  0.82683 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0029  Luciferase-like monooxygenase  39.29 
 
 
346 aa  77.8  0.0000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0972  luciferase-like protein  32.75 
 
 
342 aa  77.4  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0396  Luciferase-like monooxygenase  30.7 
 
 
288 aa  77.4  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4755  luciferase family protein  27.46 
 
 
293 aa  76.6  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.757656  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4569  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  27.31 
 
 
288 aa  76.6  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.658744  normal  0.0471725 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0157  Luciferase-like monooxygenase  29.59 
 
 
334 aa  76.6  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.966319 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0164  Luciferase-like monooxygenase  24.85 
 
 
334 aa  77  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4099  luciferase-like protein  30.29 
 
 
334 aa  76.6  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0761616 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4400  Luciferase-like monooxygenase  27.67 
 
 
286 aa  76.6  0.0000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0953  putative luciferase-like monooxygenase  28.57 
 
 
348 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2334  Luciferase-like monooxygenase  36.22 
 
 
304 aa  76.6  0.0000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0649051  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2104  luciferase family protein  30.99 
 
 
353 aa  76.3  0.0000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3549  luciferase-like monooxygenase  28.72 
 
 
343 aa  75.9  0.0000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>