90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5566 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B5566  hypothetical protein  100 
 
 		 346 aa  681    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.708703  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3625  hypothetical protein  64.22 
 
 		 316 aa  388  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3969  protein of unknown function DUF58  47.69 
 
 		 357 aa  256  3e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.068653 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3855  protein of unknown function DUF58  47.69 
 
 		 357 aa  256  3e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03012  hypothetical protein  51.38 
 
 		 352 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.606349 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1490  hypothetical protein  38.58 
 
 		 326 aa  186  7e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00153565  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0467  hypothetical protein  40.06 
 
 		 321 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2518  hypothetical protein  36.17 
 
 		 316 aa  177  3e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.451759  normal  0.113037 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1838  hypothetical protein  38.21 
 
 		 317 aa  172  6.999999999999999e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3010  protein of unknown function DUF58  37.96 
 
 		 333 aa  172  1e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.29026  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1218  hypothetical protein  37.5 
 
 		 355 aa  169  9e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.892265  normal  0.23692 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2249  hypothetical protein  36.11 
 
 		 327 aa  168  1e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.497774  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1324  protein of unknown function DUF58  36.83 
 
 		 344 aa  165  8e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.12431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2369  hypothetical protein  30.82 
 
 		 323 aa  161  1e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.366253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2530  hypothetical protein  35.49 
 
 		 341 aa  158  2e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1244  hypothetical protein  39.69 
 
 		 336 aa  154  2e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0164654  normal  0.183066 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2280  hypothetical protein  37.22 
 
 		 317 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2054  hypothetical protein  35.09 
 
 		 318 aa  152  1e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.285922  normal  0.509055 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2068  hypothetical protein  30.21 
 
 		 349 aa  148  1.0000000000000001e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.604941 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1576  hypothetical protein  34.7 
 
 		 339 aa  149  1.0000000000000001e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0183217  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2385  hypothetical protein  36.2 
 
 		 344 aa  148  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2075  protein of unknown function DUF58  37.33 
 
 		 315 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0220521  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2449  hypothetical protein  36.53 
 
 		 318 aa  145  1e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.340294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2097  hypothetical protein  39.27 
 
 		 372 aa  144  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3147  hypothetical protein  36.61 
 
 		 337 aa  144  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.210354 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2304  protein of unknown function DUF58  36.56 
 
 		 341 aa  143  4e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2815  hypothetical protein  36.25 
 
 		 341 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.682313  normal  0.278413 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3378  protein of unknown function DUF58  38.11 
 
 		 323 aa  137  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.476103  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1884  hypothetical protein  36.51 
 
 		 323 aa  135  9.999999999999999e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.65449  normal  0.844493 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2162  hypothetical protein  36.88 
 
 		 339 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0151001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26920  hypothetical protein  34.38 
 
 		 318 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1211  hypothetical protein  32.56 
 
 		 319 aa  125  1e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1117  hypothetical protein  32.56 
 
 		 319 aa  125  1e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02437  hypothetical protein  37.75 
 
 		 318 aa  125  1e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0863  protein of unknown function DUF58  38.67 
 
 		 314 aa  125  1e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.344005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2913  hypothetical protein  34.37 
 
 		 362 aa  122  6e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.278272 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1793  transglutaminase-like protein  35.17 
 
 		 943 aa  118  1.9999999999999998e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.634482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2349  hypothetical protein  29.57 
 
 		 417 aa  114  3e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2417  hypothetical protein  30.19 
 
 		 338 aa  113  5e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.479744  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1898  hypothetical protein  29.61 
 
 		 342 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0820  hypothetical protein  34.11 
 
 		 323 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2531  hypothetical protein  28.61 
 
 		 372 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0727  protein of unknown function DUF58  30.77 
 
 		 302 aa  110  3e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1872  hypothetical protein  28.7 
 
 		 316 aa  108  1e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1878  hypothetical protein  31.13 
 
 		 330 aa  107  2e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02556  hypothetical protein  26.87 
 
 		 374 aa  106  5e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1863  hypothetical protein  28.1 
 
 		 316 aa  103  3e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2624  hypothetical protein  29.41 
 
 		 329 aa  102  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.681677  normal  0.0502315 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2127  hypothetical protein  28.43 
 
 		 334 aa  97.4  3e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1944  hypothetical protein  26.3 
 
 		 353 aa  97.1  4e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2108  hypothetical protein  28.12 
 
 		 354 aa  93.6  4e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2777  hypothetical protein  23.79 
 
 		 337 aa  91.7  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.668338  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1966  hypothetical protein  27.87 
 
 		 329 aa  89.7  6e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1675  hypothetical protein  25.32 
 
 		 353 aa  79  0.0000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2050  hypothetical protein  27.1 
 
 		 365 aa  72  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2097  hypothetical protein  27.1 
 
 		 365 aa  72  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4562  hypothetical protein  27.1 
 
 		 365 aa  72  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2276  hypothetical protein  27.1 
 
 		 365 aa  72  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2288  protein of unknown function DUF58  27.1 
 
 		 365 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.523334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2043  protein of unknown function DUF58  29.71 
 
 		 267 aa  72  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2243  hypothetical protein  27.16 
 
 		 361 aa  70.1  0.00000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.760307  normal  0.435241 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2151  hypothetical protein  26.75 
 
 		 346 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1855  hypothetical protein  26.85 
 
 		 361 aa  64.3  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.270651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1777  hypothetical protein  26.69 
 
 		 361 aa  63.5  0.000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2425  hypothetical protein  31.91 
 
 		 276 aa  60.8  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00337672  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6585  protein of unknown function DUF58  38.6 
 
 		 380 aa  61.2  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.433364 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1320  protein of unknown function DUF58  31.68 
 
 		 275 aa  60.5  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.5057  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2963  protein of unknown function DUF58  31.06 
 
 		 275 aa  59.3  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.023693 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3417  protein of unknown function DUF58  27.19 
 
 		 384 aa  56.6  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1642  hypothetical protein  28.38 
 
 		 386 aa  55.5  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.656469 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0623  hypothetical protein  32.69 
 
 		 419 aa  55.5  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3160  hypothetical protein  28.19 
 
 		 442 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.491633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2130  protein of unknown function DUF58  27.44 
 
 		 384 aa  52.8  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.66506 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2086  protein of unknown function DUF58  27.44 
 
 		 384 aa  52.8  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3276  hypothetical protein  24.79 
 
 		 294 aa  52.8  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.864378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0929  hypothetical protein  26.28 
 
 		 384 aa  51.6  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.501071  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1633  hypothetical protein  30.4 
 
 		 257 aa  48.9  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000447033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2888  hypothetical protein  28.57 
 
 		 426 aa  47.8  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0601  hypothetical protein  23.39 
 
 		 433 aa  47.8  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.007011  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0290  protein of unknown function DUF58  26.21 
 
 		 428 aa  47.4  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3834  protein of unknown function DUF58  31.43 
 
 		 399 aa  47.4  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00386989  normal  0.0608669 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3233  hypothetical protein  28.87 
 
 		 431 aa  45.8  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.501295  normal  0.0364407 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2053  hypothetical protein  29.49 
 
 		 263 aa  45.1  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0403432  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4604  hypothetical protein  29.67 
 
 		 380 aa  44.7  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3113  hypothetical protein  31.95 
 
 		 391 aa  44.7  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.7351  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2913  hypothetical protein  31.38 
 
 		 387 aa  43.5  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.509906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1279  protein of unknown function DUF58  32.52 
 
 		 491 aa  43.1  0.008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000779401 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1352  hypothetical protein  21.43 
 
 		 433 aa  43.1  0.008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.491685  hitchhiker  0.00000471163 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3459  hypothetical protein  35.34 
 
 		 431 aa  42.7  0.01  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.887952  normal  0.027192 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1182  hypothetical protein  45 
 
 		 422 aa  42.7  0.01  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.114028  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>