More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5545 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B5545  regulatory protein, IclR  100 
 
 		 251 aa  506  9.999999999999999e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5543  regulatory protein, IclR  67.6 
 
 		 241 aa  320  9.999999999999999e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.452687  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2316  IclR family transcriptional regulator  61.04 
 
 		 246 aa  296  2e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.812394  normal  0.959704 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1624  transcriptional regulator, IclR family  30.95 
 
 		 275 aa  132  5e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2308  transcriptional regulator, IclR family  30.52 
 
 		 255 aa  131  9e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  31.87 
 
 		 259 aa  127  2.0000000000000002e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2309  transcriptional regulator, IclR family  28.33 
 
 		 253 aa  123  3e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2702  transcriptional regulator, IclR family  28.57 
 
 		 254 aa  120  1.9999999999999998e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 260 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3644  regulatory protein, IclR  31.05 
 
 		 260 aa  119  7e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4095  IclR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 269 aa  117  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.129203  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3027  IclR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 260 aa  116  3e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000289902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 254 aa  115  7.999999999999999e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4172  transcriptional regulator, IclR family  32.66 
 
 		 249 aa  114  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.102148  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1239  IclR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 252 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0364  IclR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 265 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3102  transcriptional regulator, IclR family  30.47 
 
 		 260 aa  112  6e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0656  transcriptional regulator, IclR family  29.88 
 
 		 260 aa  112  7.000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000253097  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0669  transcriptional regulator, IclR family  29.88 
 
 		 260 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4595400000000001e-34 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  28.99 
 
 		 255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1477  IclR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 255 aa  109  3e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0759  IclR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 261 aa  110  3e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.46118e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0813  IclR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 255 aa  109  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2130  IclR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 255 aa  109  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.671477  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2078  transcriptional regulator, IclR family  29.6 
 
 		 270 aa  109  4.0000000000000004e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.341471 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0283  IclR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 257 aa  108  6e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2064  IclR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 259 aa  108  7.000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.740052 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2833  IclR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 260 aa  107  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000013624  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1826  IclR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 255 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0370  IclR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 265 aa  107  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.470614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  28.23 
 
 		 265 aa  107  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  30.08 
 
 		 280 aa  107  2e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3712  IclR family transcriptional regulator  30 
 
 		 269 aa  107  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.382183  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3729  IclR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 268 aa  107  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0497  IclR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 255 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3456  transcriptional regulator, IclR family  29.6 
 
 		 269 aa  107  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0399  IclR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 255 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.425473  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3546  regulatory protein, IclR  30.65 
 
 		 265 aa  106  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000366663  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  26.1 
 
 		 252 aa  106  3e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3109  IclR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 257 aa  106  4e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  26.72 
 
 		 254 aa  106  4e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2890  transcriptional regulator, IclR family  29.72 
 
 		 266 aa  105  5e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2912  transcriptional regulator, IclR family  29.72 
 
 		 266 aa  105  5e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.138911  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13060  transcriptional regulator, IclR family  31.44 
 
 		 264 aa  104  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3586  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  34.67 
 
 		 569 aa  104  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.63579  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  24.9 
 
 		 256 aa  104  1e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5378  IclR family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 295 aa  104  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.60703 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  32.92 
 
 		 256 aa  105  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3542  IclR family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 295 aa  104  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0451  transcriptional regulator, IclR family  29.1 
 
 		 252 aa  104  2e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6466  transcriptional regulator, IclR family  31.51 
 
 		 266 aa  103  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185933  normal  0.684135 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0453  transcriptional repressor IclR  30.04 
 
 		 277 aa  103  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0122119  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4726  IclR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 300 aa  102  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3637  IclR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 300 aa  102  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0792944  normal  0.338947 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1381  transcriptional regulator, IclR family  32.37 
 
 		 259 aa  102  7e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0265697  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6634  IclR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 283 aa  102  7e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0992864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3670  IclR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 267 aa  102  7e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6599  putative transcriptional regulator, IclR family  30.96 
 
 		 273 aa  102  7e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0547312  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0416  regulatory proteins, IclR  28.17 
 
 		 246 aa  102  8e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000505949  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0223  Transcriptional regulator IclR  31.96 
 
 		 246 aa  101  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.093608  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5057  IclR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 292 aa  101  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.864293  normal  0.0584294 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4604  regulatory proteins, IclR  33.19 
 
 		 251 aa  101  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3853  IclR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 263 aa  100  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  hitchhiker  0.00959131 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  26.51 
 
 		 261 aa  100  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3302  transcriptional regulator, IclR family  30.17 
 
 		 289 aa  100  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0769  IclR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 260 aa  100  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0526753  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4762  transcriptional regulator, IclR family  29.66 
 
 		 248 aa  100  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 272 aa  100  3e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1407  transcriptional regulator, IclR family  28.57 
 
 		 257 aa  99.4  5e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4432  transcriptional regulator, IclR family  28.57 
 
 		 292 aa  99  7e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.560872  normal  0.259471 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6631  IclR family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 281 aa  99  7e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000095727  normal  0.978308 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2335  transcriptional regulator, IclR family  30.19 
 
 		 249 aa  98.6  8e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1186  transcriptional regulator, IclR family  25.79 
 
 		 264 aa  98.2  1e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134584  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2873  transcriptional regulator, IclR family  28 
 
 		 257 aa  97.8  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0130818 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2252  transcriptional regulator, IclR family  30.83 
 
 		 263 aa  98.2  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.128917  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0297  transcriptional repressor IclR  27.47 
 
 		 280 aa  97.4  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0438568  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1949  transcriptional regulator, IclR family  29.13 
 
 		 263 aa  97.1  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00482853  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3924  transcriptional repressor IclR  27.47 
 
 		 280 aa  97.4  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2055  transcriptional regulator, IclR family  28.7 
 
 		 263 aa  97.1  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0903474  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0367  transcriptional repressor IclR  27.47 
 
 		 280 aa  97.4  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.504781  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1462  transcriptional regulator, TrmB  29.22 
 
 		 261 aa  97.4  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3881  transcriptional regulator, IclR family  30.24 
 
 		 254 aa  96.7  3e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0445714  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3776  transcriptional repressor IclR  27.9 
 
 		 276 aa  96.3  4e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2760  IclR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 261 aa  96.3  5e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  27.09 
 
 		 267 aa  95.9  5e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  31.53 
 
 		 277 aa  95.9  5e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2325  transcriptional regulator, IclR family  30.69 
 
 		 258 aa  95.9  6e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1993  IclR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 264 aa  95.9  6e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.321176  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03890  DNA-binding transcriptional repressor  28.26 
 
 		 274 aa  95.5  7e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3979  transcriptional regulator, IclR family  28.26 
 
 		 274 aa  95.5  7e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4254  transcriptional repressor IclR  28.26 
 
 		 274 aa  95.5  7e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.084393  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4562  transcriptional repressor IclR  28.26 
 
 		 274 aa  95.5  7e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4471  transcriptional repressor IclR  28.26 
 
 		 274 aa  95.5  7e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.215784  normal  0.0860899 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5488  transcriptional repressor IclR  28.26 
 
 		 274 aa  95.5  7e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.901357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4012  transcriptional repressor IclR  28.26 
 
 		 274 aa  95.5  7e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.992009  normal  0.0359052 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03850  hypothetical protein  28.26 
 
 		 274 aa  95.5  7e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0751  IclR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 292 aa  95.5  8e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.388214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1604  IclR family transcriptional regulator  25.94 
 
 		 259 aa  95.1  9e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.379428  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0549  DNA-binding transcriptional repressor AllR  24.29 
 
 		 256 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3857  transcriptional regulator, IclR family  30.59 
 
 		 287 aa  94.4  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>