More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4757 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4757  lipid-transfer protein  100 
 
 		 395 aa  807    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5826  lipid-transfer protein  92.13 
 
 		 394 aa  733    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5768  lipid-transfer protein  79.95 
 
 		 397 aa  657    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1512  lipid-transfer protein  72.59 
 
 		 409 aa  576  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.427208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1541  lipid-transfer protein  72.59 
 
 		 395 aa  575  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1564  lipid-transfer protein  72.59 
 
 		 395 aa  575  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3986  lipid-transfer protein  70.74 
 
 		 394 aa  576  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0155  lipid-transfer protein  68.19 
 
 		 395 aa  555  1e-157  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2474  lipid-transfer protein  68.19 
 
 		 394 aa  547  1e-154  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.093907 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3832  lipid-transfer protein  65.99 
 
 		 394 aa  528  1e-149  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5025  lipid-transfer protein  65.32 
 
 		 395 aa  526  1e-148  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000479532  normal  0.301328 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4167  lipid-transfer protein  65.23 
 
 		 396 aa  519  1e-146  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2725  lipid-transfer protein  65.65 
 
 		 394 aa  518  1e-146  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4071  lipid-transfer protein  68.56 
 
 		 395 aa  516  1.0000000000000001e-145  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0178  lipid-transfer protein  66.16 
 
 		 395 aa  518  1.0000000000000001e-145  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.925449 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0932  lipid-transfer protein  62.82 
 
 		 393 aa  511  1e-144  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4078  lipid-transfer protein  63.73 
 
 		 394 aa  509  1e-143  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.254094 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3814  lipid-transfer protein  63.73 
 
 		 394 aa  503  1e-141  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0363497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2529  lipid-transfer protein  62.88 
 
 		 397 aa  498  1e-140  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.46014  normal  0.613077 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2532  lipid-transfer protein  63.78 
 
 		 395 aa  498  1e-140  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.101901  normal  0.217151 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1611  lipid-transfer protein  62.09 
 
 		 394 aa  499  1e-140  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3722  lipid-transfer protein  63.29 
 
 		 394 aa  497  1e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.408823  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2740  lipid-transfer protein  62.88 
 
 		 395 aa  494  1e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.527886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5103  lipid-transfer protein  61.48 
 
 		 393 aa  491  1e-137  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4119  lipid-transfer protein  62.82 
 
 		 401 aa  481  1e-135  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0450  lipid-transfer protein  63.66 
 
 		 396 aa  473  1e-132  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.607099  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0669  lipid-transfer protein  57.14 
 
 		 389 aa  448  1e-125  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0743  lipid-transfer protein  56.19 
 
 		 389 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12803  lipid-transfer protein  54.66 
 
 		 401 aa  435  1e-121  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00155026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4174  lipid-transfer protein  54.82 
 
 		 397 aa  436  1e-121  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.942812  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4240  lipid-transfer protein  54.82 
 
 		 397 aa  436  1e-121  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.256435  normal  0.231931 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4396  lipid-transfer protein  54.82 
 
 		 397 aa  436  1e-121  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.46375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2025  lipid-transfer protein  52.27 
 
 		 395 aa  424  1e-117  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.957629  normal  0.210871 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2338  lipid-transfer protein  54.77 
 
 		 396 aa  419  1e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544781 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4694  lipid-transfer protein  50.12 
 
 		 406 aa  406  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04353  sterol carrier protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G06380)  51.93 
 
 		 458 aa  392  1e-108  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.784343  normal  0.238789 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2149  lipid-transfer protein  52.02 
 
 		 397 aa  366  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01840  conserved hypothetical protein  47.36 
 
 		 466 aa  347  2e-94  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.680862  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4690  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  57.08 
 
 		 234 aa  248  1e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3483  Thiolase  39.49 
 
 		 383 aa  239  5.999999999999999e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1472  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  36.98 
 
 		 417 aa  229  7e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4205  thiolase  37.5 
 
 		 413 aa  228  2e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2744  thiolase  38.35 
 
 		 412 aa  227  3e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00569153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6395  thiolase  39.01 
 
 		 413 aa  223  7e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0582995  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1529  thiolase  36.34 
 
 		 390 aa  218  1e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.380974 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5033  thiolase  38.67 
 
 		 413 aa  216  4e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0302064  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5827  thiolase  38.67 
 
 		 413 aa  216  4e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2602  thiolase  36.36 
 
 		 382 aa  216  8e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.263214 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4352  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  38.67 
 
 		 413 aa  215  9e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1838  thiolase  36.72 
 
 		 413 aa  214  2.9999999999999995e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.687258 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5101  Thiolase  37.66 
 
 		 413 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4309  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  37.63 
 
 		 378 aa  211  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0558  thiolase  35.43 
 
 		 407 aa  206  7e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6295  thiolase  36.14 
 
 		 392 aa  206  8e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4421  Thiolase  37.36 
 
 		 394 aa  202  7e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0806685  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3870  thiolase  35.64 
 
 		 384 aa  202  8e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.28834 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17880  acetyl-CoA acetyltransferase  38.6 
 
 		 382 aa  199  7.999999999999999e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.241643  normal  0.751852 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0596  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  35.52 
 
 		 392 aa  194  2e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0765  acetyl-CoA acetyltransferase  35.18 
 
 		 388 aa  193  3e-48  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.155191  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0790  thiolase  36.88 
 
 		 414 aa  192  8e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1926  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  35.89 
 
 		 392 aa  192  8e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4020  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  36.47 
 
 		 392 aa  192  8e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.469452  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1814  thiolase  31.73 
 
 		 417 aa  191  2e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0550  acetyl-CoA acetyltransferase  35.28 
 
 		 390 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3660  thiolase  33.84 
 
 		 380 aa  190  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.277113  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3733  thiolase  33.84 
 
 		 380 aa  190  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.454317  normal  0.374229 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3673  thiolase  33.84 
 
 		 380 aa  190  4e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.217678  normal  0.677274 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0156  acetyl-CoA acetyltransferase  33.85 
 
 		 388 aa  189  5e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1391  acetyl-CoA acetyltransferase  34.57 
 
 		 387 aa  188  1e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3907  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  33.96 
 
 		 381 aa  187  3e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.114937  normal  0.102476 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4130  hypothetical protein  34.24 
 
 		 384 aa  187  3e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.468644 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4131  putative lipid-transfer protein  34.04 
 
 		 382 aa  187  3e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.386123  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1626  acetyl-CoA acetyltransferase  34.58 
 
 		 387 aa  186  6e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0339  acetyl-CoA acetyltransferase  35.04 
 
 		 388 aa  186  8e-46  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00626565  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0941  lipid-transfer protein  37.84 
 
 		 398 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.303203  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3319  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  33.84 
 
 		 384 aa  182  6e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.16037  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11643  lipid-transfer protein  33.5 
 
 		 402 aa  182  7e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.018312  normal  0.865142 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6746  thiolase  33.25 
 
 		 383 aa  182  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00174625  normal  0.755533 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1933  acetyl-CoA acetyltransferase  32.68 
 
 		 390 aa  181  2e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00196536  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1631  propanoyl-CoA C-acyltransferase  30.52 
 
 		 387 aa  181  2e-44  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3857  thiolase  33.51 
 
 		 383 aa  180  4e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.732346 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2362  acetyl-CoA acetyltransferase  34.25 
 
 		 386 aa  179  5.999999999999999e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2519  thiolase  34.35 
 
 		 384 aa  179  8e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.236528  normal  0.752129 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3523  3-ketoacyl-CoA thiolase  33.16 
 
 		 384 aa  179  1e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1761  thiolase  34.13 
 
 		 381 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0585987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1779  thiolase  34.13 
 
 		 381 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.187266  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4151  thiolase  36.27 
 
 		 386 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0423188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1826  thiolase  34.13 
 
 		 381 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.20856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0040  thiolase  34.81 
 
 		 421 aa  177  3e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3556  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  33.33 
 
 		 383 aa  176  5e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1999  thiolase  33.24 
 
 		 381 aa  176  6e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.915594  normal  0.405565 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4195  Thiolase  35.8 
 
 		 390 aa  176  8e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0815171  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3625  lipid-transfer protein  34.72 
 
 		 393 aa  175  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.595778  normal  0.739146 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3119  lipid-transfer protein  36.84 
 
 		 398 aa  174  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2505  thiolase  33.6 
 
 		 387 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.675059 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8928  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  35.26 
 
 		 394 aa  173  3.9999999999999995e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3030  lipid-transfer protein  34 
 
 		 399 aa  172  9e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.463243  normal  0.246741 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3568  lipid-transfer protein  34.8 
 
 		 399 aa  172  9e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0803413 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3015  lipid-transfer protein  34 
 
 		 399 aa  172  9e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.630367  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3061  lipid-transfer protein  34 
 
 		 399 aa  172  9e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.860453 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>