More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1914 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A1914  isochorismatase hydrolase  100 
 
 
203 aa  410  1e-114  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2225  isochorismatase hydrolase  82.14 
 
 
202 aa  324  7e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.19915  normal  0.0825967 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42820  isochorismatase family hydrolase  49.74 
 
 
198 aa  178  4.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0336  isochorismatase hydrolase  52.91 
 
 
223 aa  176  2e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.499522  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3595  hypothetical protein  48.19 
 
 
198 aa  171  5.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.181748  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5288  hypothetical protein  52.06 
 
 
198 aa  168  5e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.202745 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23720  Isochorismatase hydrolase protein  48.97 
 
 
197 aa  160  1e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1404  isochorismatase hydrolase  45.18 
 
 
196 aa  158  7e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00231254  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1826  isochorismatase superfamily hydrolase  44.67 
 
 
196 aa  156  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.436754  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3885  isochorismatase hydrolase  44.67 
 
 
196 aa  156  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.421083 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1434  isochorismatase hydrolase  44.16 
 
 
196 aa  155  4e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0935045  normal  0.33777 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1718  isochorismatase hydrolase  42.93 
 
 
196 aa  151  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.854731  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2741  isochorismatase hydrolase  47.94 
 
 
198 aa  151  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0122139  normal  0.603247 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1616  isochorismatase hydrolase  53.23 
 
 
206 aa  150  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.743005  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0052  isochorismatase hydrolase  38.97 
 
 
201 aa  149  2e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.450021 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2039  isochorismatase family protein  43.32 
 
 
196 aa  149  3e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22229  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0044  isochorismatase hydrolase  38.14 
 
 
201 aa  149  4e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1849  isochorismatase hydrolase  42.78 
 
 
196 aa  145  5e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.605673 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0481  isochorismatase hydrolase  55.56 
 
 
210 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.694975  hitchhiker  0.0021355 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3884  isochorismatase hydrolase  44.92 
 
 
199 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0813  isochorismatase hydrolase  45.12 
 
 
199 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.255569 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0675  putative isochorismatase  39.49 
 
 
200 aa  132  3e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.286103  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1197  isochorismatase hydrolase  39.8 
 
 
207 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.788349  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4163  isochorismatase hydrolase  43.08 
 
 
199 aa  128  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.256944 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2540  isochorismatase hydrolase  37.06 
 
 
198 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.417405  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3854  isochorismatase hydrolase  42.56 
 
 
199 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.320846  normal  0.278018 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2477  isochorismatase hydrolase  42.39 
 
 
193 aa  123  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00508365  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3990  isochorismatase hydrolase  43.4 
 
 
199 aa  122  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3931  isochorismatase hydrolase  43.4 
 
 
199 aa  122  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.835033  normal  0.1743 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3916  isochorismatase hydrolase  43.4 
 
 
199 aa  122  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.664242  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2042  isochorismatase hydrolase  42.05 
 
 
207 aa  116  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.40855  normal  0.158127 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1742  isochorismatase hydrolase  41.81 
 
 
193 aa  115  3.9999999999999997e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4313  isochorismatase hydrolase  42.56 
 
 
199 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.168777  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0290  isochorismatase hydrolase  36.36 
 
 
181 aa  112  3e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5247  isochorismatase hydrolase  39.06 
 
 
196 aa  111  7.000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.860702 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2275  isochorismatase hydrolase  41.22 
 
 
199 aa  110  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.799433 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4420  isochorismatase hydrolase  41.49 
 
 
199 aa  110  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0721  isochorismatase hydrolase  39.78 
 
 
182 aa  110  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000150785 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3108  isochorismatase hydrolase  35.64 
 
 
228 aa  110  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.390914 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3945  isochorismatase hydrolase  45.03 
 
 
200 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1488  isochorismatase hydrolase  39.55 
 
 
182 aa  109  3e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.151105 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0296  isochorismatase family protein  36.78 
 
 
187 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0280  isochorismatase (isochorismatase hydrolase) (2,3 dihydro-2,3 dihydroxybenzoate synthase)  36.78 
 
 
187 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0283  isochorismatase (isochorismatase hydrolase) (2,3 dihydro-2,3 dihydroxybenzoate synthase)  36.78 
 
 
187 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0311  isochorismatase family protein  36.78 
 
 
187 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0342  isochorismatase family protein  36.78 
 
 
187 aa  108  5e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1846  isochorismatase hydrolase  39.2 
 
 
187 aa  108  6e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0255835  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2598  isochorismatase hydrolase  35.67 
 
 
181 aa  108  7.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4964  isochorismatase family protein  35.63 
 
 
181 aa  106  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0340  isochorismatase family protein  36.21 
 
 
187 aa  105  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0383  isochorismatase family protein  36.21 
 
 
187 aa  105  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00790  Isochorismatase hydrolase  38.95 
 
 
187 aa  105  3e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.339277  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0356  isochorismatase family protein  35.06 
 
 
181 aa  105  3e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3627  isochorismatase hydrolase  37.29 
 
 
211 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4740  isochorismatase hydrolase  37.29 
 
 
211 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00707127 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3430  isochorismatase hydrolase  36.52 
 
 
184 aa  103  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000128039 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3936  isochorismatase hydrolase  37.79 
 
 
203 aa  102  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0283  isochorismatase family protein family  37.5 
 
 
216 aa  103  3e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0291  isochorismatase hydrolase  35.06 
 
 
181 aa  102  4e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5543  isochorismatase hydrolase  37.29 
 
 
203 aa  102  5e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.540785  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1215  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 
185 aa  101  6e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1859  isochorismatase family protein  37.21 
 
 
181 aa  101  7e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.188481  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3964  isochorismatase hydrolase  32.95 
 
 
231 aa  101  8e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3781  isochorismatase hydrolase  32.95 
 
 
231 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0487  isochorismatase hydrolase  32.95 
 
 
231 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1017  isochorismatase hydrolase  36.72 
 
 
203 aa  99.8  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.802733  normal  0.0972832 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3440  isochorismatase hydrolase  37.64 
 
 
182 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.410792 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2236  isochorismatase hydrolase  39.77 
 
 
199 aa  99  4e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0018  isochorismatase family protein  35.06 
 
 
185 aa  98.6  6e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.967692 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0170  isochorismatase hydrolase  35.47 
 
 
218 aa  98.2  7e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3837  isochorismatase hydrolase  32.39 
 
 
231 aa  98.2  7e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3208  isochorismatase hydrolase  35.94 
 
 
195 aa  97.8  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.408182  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2676  isochorismatase hydrolase  40.56 
 
 
182 aa  97.4  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.20021  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2098  isochorismatase family protein  33.15 
 
 
188 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4208  isochorismatase hydrolase  31.64 
 
 
234 aa  95.5  5e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1893  isochorismatase hydrolase  33.9 
 
 
188 aa  94.7  7e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.173425  normal  0.472889 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3018  isochorismatase hydrolase  30.9 
 
 
181 aa  94.7  8e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121464  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1917  isochorismatase hydrolase  39.26 
 
 
190 aa  94.4  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4549  isochorismatase hydrolase  32.78 
 
 
289 aa  94  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.520788  normal  0.388724 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1155  hypothetical protein  34.62 
 
 
193 aa  92  5e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0863147  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12730  hypothetical protein  34.48 
 
 
193 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.673629  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04773  isochorismatase  35.52 
 
 
210 aa  89.7  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5042  isochorismatase hydrolase  37.22 
 
 
184 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00512316 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0688  isochorismatase hydrolase  33.71 
 
 
184 aa  88.2  7e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.870626  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2126  isochorismatase hydrolase  33.91 
 
 
182 aa  87.8  1e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.996682  normal  0.575884 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4372  isochorismatase hydrolase  38.52 
 
 
199 aa  86.7  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0306857  normal  0.52694 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0338  isochorismatase hydrolase  34.5 
 
 
183 aa  87  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3130  isochorismatase hydrolase  37.18 
 
 
194 aa  86.7  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.820956  normal  0.361806 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1867  isochorismatase hydrolase  34.88 
 
 
186 aa  85.1  6e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0367476  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1200  isochorismatase family protein  32.76 
 
 
191 aa  85.1  6e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.474191  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1549  isochorismatase hydrolase  36.11 
 
 
185 aa  85.1  6e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.402017  normal  0.200297 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2101  isochorismatase hydrolase  33.91 
 
 
187 aa  84.7  8e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.682407  normal  0.139759 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3075  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 
212 aa  83.2  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2169  isochorismatase hydrolase  32.61 
 
 
211 aa  82.8  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1280  isochorismatase family protein  31.11 
 
 
184 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1382  isochorismatase family protein  31.11 
 
 
184 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.030054  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1523  isochorismatase family protein  30 
 
 
184 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8036  putative isochorismatase hydrolase  32.76 
 
 
201 aa  82.4  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.4542  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2530  isochorismatase hydrolase  29.48 
 
 
190 aa  82  0.000000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1454  isochorismatase family protein  30.56 
 
 
184 aa  82  0.000000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.40872 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>