More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0830 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A0830  YceI  100 
 
 		 199 aa  399  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0387934  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0815  hypothetical protein  76.3 
 
 		 197 aa  277  8e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.090251 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0736  YceI family protein  60.94 
 
 		 187 aa  221  4e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.193865  normal  0.716983 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0806  YceI family protein  59.9 
 
 		 187 aa  219  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0790  signal peptide protein  57.29 
 
 		 189 aa  218  6e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.534784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3508  periplasmic protein  42.94 
 
 		 196 aa  144  1e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.234261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1028  YceI family protein  43.33 
 
 		 191 aa  131  5e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0457  YceI family protein  38.97 
 
 		 189 aa  129  4.0000000000000003e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3509  hypothetical protein  40.48 
 
 		 198 aa  123  2e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.137598  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0469  YceI family protein  42.51 
 
 		 211 aa  121  6e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.730302  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3505  YceI family protein  41.78 
 
 		 191 aa  120  9.999999999999999e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.781833 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3578  YceI family protein  38.32 
 
 		 192 aa  120  9.999999999999999e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.728206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3736  YceI  40.24 
 
 		 218 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.192641 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2226  YceI family protein  34.69 
 
 		 192 aa  117  7e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000678562  decreased coverage  0.00447323 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3992  YceI family protein  33.68 
 
 		 188 aa  117  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1519  YceI family protein  31.28 
 
 		 191 aa  114  6.9999999999999995e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0912  YceI  32.12 
 
 		 188 aa  112  3e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.580537  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3154  YceI  36.36 
 
 		 192 aa  112  4.0000000000000004e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0257242  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2796  YceI  35.12 
 
 		 189 aa  111  7.000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.552984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0704  YceI family protein  39.63 
 
 		 193 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.203879  normal  0.494453 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1031  hypothetical protein  31.98 
 
 		 196 aa  107  1e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.608738  normal  0.0254223 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4183  YceI family protein  38.55 
 
 		 192 aa  105  5e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3681  YceI  35.14 
 
 		 201 aa  103  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.844775  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3995  hypothetical protein  40.52 
 
 		 189 aa  103  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0645736  normal  0.347265 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1782  YceI  31.02 
 
 		 204 aa  102  3e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0100028 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1859  YceI family protein  31.33 
 
 		 192 aa  102  5e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2217  YceI family protein  30.68 
 
 		 199 aa  101  6e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0275332  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2530  YceI family protein  37.35 
 
 		 189 aa  101  7e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2066  hypothetical protein  37.09 
 
 		 192 aa  100  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0648985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5860  YceI family protein  37.41 
 
 		 192 aa  100  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0683  YceI family protein  38.96 
 
 		 193 aa  99  5e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.246292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0232  YceI  38.96 
 
 		 193 aa  99  5e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.145864  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0716  YceI family protein  38.96 
 
 		 193 aa  99  5e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.943663  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3804  hypothetical protein  39.35 
 
 		 211 aa  95.9  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1150  periplasmic protein  31.38 
 
 		 206 aa  95.5  5e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.138125  normal  0.79265 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0631  YceI family protein  37.66 
 
 		 193 aa  95.1  6e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0607  YceI family protein  37.66 
 
 		 195 aa  95.1  6e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1092  YceI family protein  31.14 
 
 		 237 aa  94  1e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.346981  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1273  YceI-like family protein  37.09 
 
 		 187 aa  94.4  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7381  YceI  39.19 
 
 		 187 aa  93.2  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.398085  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2669  YceI family protein  37.66 
 
 		 193 aa  93.2  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.115653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3333  YceI  36.6 
 
 		 192 aa  93.6  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2961  YceI family protein  33.53 
 
 		 198 aa  93.2  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1126  hypothetical protein  30.64 
 
 		 237 aa  93.2  2e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0634937  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2382  YceI-like family protein  36.42 
 
 		 187 aa  92.4  3e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.946039  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3377  YceI-like family protein  36.42 
 
 		 187 aa  92.4  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2568  hypothetical protein  36.42 
 
 		 192 aa  92.4  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3367  hypothetical protein  36.42 
 
 		 192 aa  92.4  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1160  YceI-like family protein  36.42 
 
 		 192 aa  92.4  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0298  hypothetical protein  36.42 
 
 		 192 aa  92.4  4e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2717  signal peptide protein  32 
 
 		 198 aa  92  5e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.999831  normal  0.128957 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0612  YceI family protein  35.98 
 
 		 205 aa  92  5e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0392069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03910  YceI like family  31.36 
 
 		 254 aa  91.7  6e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1738  YceI family protein  29.51 
 
 		 188 aa  91.3  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2551  YceI family protein  32.95 
 
 		 198 aa  91.3  8e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.277477  normal  0.298445 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1536  YceI family protein  29.51 
 
 		 191 aa  91.3  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1721  YceI family protein  29.51 
 
 		 188 aa  91.3  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.292781 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2816  YceI  33.33 
 
 		 196 aa  90.5  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3638  YceI family protein  36.11 
 
 		 214 aa  90.9  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.159017 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1799  hypothetical protein  29.27 
 
 		 188 aa  90.1  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2323  YceI  34.05 
 
 		 199 aa  89.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.977653 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1735  hypothetical protein  29.27 
 
 		 188 aa  90.5  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.282306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3203  YceI family protein  32.52 
 
 		 205 aa  89.7  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.422855 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4763  YceI family protein  34.36 
 
 		 213 aa  89.4  4e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2953  hypothetical protein  31.58 
 
 		 196 aa  89  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.386991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0861  YceI family protein  32.57 
 
 		 177 aa  88.6  6e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47771  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2180  YceI family protein  31.35 
 
 		 205 aa  88.2  6e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0890  YceI  30.46 
 
 		 220 aa  87.4  1e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1405  YceI family protein  33.33 
 
 		 201 aa  87  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247492 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14930  hypothetical protein  30.36 
 
 		 182 aa  84.7  9e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0621  YceI family protein  33.01 
 
 		 213 aa  84.3  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0461  YceI-like family protein  33.01 
 
 		 213 aa  84.3  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.151619  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0892  YceI family protein  29.23 
 
 		 193 aa  84  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.228936  normal  0.459809 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1917  hypothetical protein  29.89 
 
 		 207 aa  83.6  0.000000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000543514  hitchhiker  0.00086053 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4751  YceI family protein  32.4 
 
 		 182 aa  83.2  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0110  YceI family protein  32.93 
 
 		 210 aa  82  0.000000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.180246 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25500  hypothetical protein  32.58 
 
 		 181 aa  80.5  0.00000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2208  YceI  29.31 
 
 		 207 aa  81.3  0.00000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.690389  normal  0.024147 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0530  YceI family protein  33.52 
 
 		 186 aa  80.9  0.00000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.456104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2036  YceI family protein  31.55 
 
 		 195 aa  79.3  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460798 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1513  YceI-like family protein  30.91 
 
 		 185 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.137036  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1401  YceI family protein  31.4 
 
 		 190 aa  79  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.845742 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0007  YceI like family protein  30.3 
 
 		 217 aa  78.2  0.00000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1154  putative lipoprotein  30.3 
 
 		 217 aa  78.2  0.00000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1988  YceI family protein  30.99 
 
 		 196 aa  77.8  0.00000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3229  hypothetical protein  32.39 
 
 		 197 aa  77.8  0.00000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.474421  normal  0.780413 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0008  putative lipoprotein  30.3 
 
 		 217 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0009  putative lipoprotein  30.3 
 
 		 199 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.686573  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0872  YceI family protein  30 
 
 		 180 aa  77.8  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.467624  normal  0.0780201 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1933  YceI family protein  31.29 
 
 		 207 aa  77.4  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.962178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3940  YceI family protein  30.59 
 
 		 200 aa  77.8  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0411323 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0008  YceI like family protein  30.3 
 
 		 199 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1434  YceI like family protein  30.3 
 
 		 199 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.311091  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00890  hypothetical protein  32.89 
 
 		 183 aa  76.6  0.0000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3499  YceI family protein  26.56 
 
 		 179 aa  76.3  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0890239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1092  YceI family protein  31.08 
 
 		 195 aa  76.3  0.0000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00011726  normal  0.0389048 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1086  hypothetical protein  30.81 
 
 		 181 aa  75.5  0.0000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0473  hypothetical protein  30.82 
 
 		 189 aa  75.1  0.0000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  1.81293e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8737  YceI  31.49 
 
 		 194 aa  75.1  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0359  YceI family protein  29.76 
 
 		 235 aa  75.1  0.0000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>